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Patchwork
科研绘图系列:R语言组合堆积图(stacked barplot with multiple groups)
加载R包knitr::opts_chunk$set(warning=F,message=F)library(tidyverse)library(cowplot)library(
patchwork
)导入数据数据可从以下链接下载
生信学习者2
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2024-09-02 01:45
R语言可视化
r语言
数据可视化
ggplot2批量生成图片并组合图片
这是某次血常规的数据(经过了修改),将数据整理成下面这种形式:分组情况如下:library(rio)library(ggplot2)library(
patchwork
)rawdata0.05",size
钿璎纍纍佩珊珊
·
2024-02-19 22:42
Seurat4.0 系列教程1 分析流程
library(dplyr)library(Seurat)library(
patchwork
)#LoadthePBMCdatasetpbmc.data<-Read10X(data.dir="G:/practice
zhengxj_
·
2024-02-09 09:11
Seurat
4.0
几何学
R语言绘制棒棒糖图
的那一部分,geom_segment()函数绘制“棒棒”那一部分,就可轻松绘制出这种图形image基础棒棒糖图横坐标的值可以为数值变量或者分类变量#加载包library(ggplot2)library(
patchwork
Seurat_
·
2024-01-31 20:34
R 数据可视化 —— 图形排列之
patchwork
前言上一节讲的是如何使用cowplot包来对图形进行排列对齐,今天要讲的是,如何使用
patchwork
包来排列图形
patchwork
包主要针对的是ggplot2图形,也可以是其他图像系统绘制的图形。
名本无名
·
2024-01-18 11:29
R语言中使用ggplot2绘制散点图箱线图,附加显著性检验
加载R包与数据library(ggpubr) library(
patchwork
) library(ggsci)library(tidyverse)# 使用R语言自带的iris数据集,
生信分析笔记
·
2023-12-23 07:07
程序人生
神器!使用 patchworklib 库进行多图排版真棒啊
如果想把多个图合并放在一个图里,如图,该如何实现好在R语言和Python都有对应的解决方案,分别是
patchwork
包和patchworklib库。
Python数据挖掘
·
2023-12-03 09:26
机器学习
数据分析及可视化
python
python
人工智能
深度学习
机器学习
数据分析
03.查看不同粒度下的分群走向
Seurat)#devtools::install_github('satijalab/seurat-data')library(SeuratData)library(ggplot2)library(
patchwork
科研小徐
·
2023-12-02 20:56
R语言:利用rhdf5包分别创建单组学,多组学.h5文件
最近在跑的方法需要.h5作为输入文件,就学习了一下怎么创建.h5文件,原有数据结构如下:生成单组学.h5文件的代码如下:library(rhdf5)library(dplyr)library(
patchwork
hyena_7
·
2023-11-30 08:04
R
数据分析
r语言
生物信息
2021-05-16 scRNA基础分析:差异基因富集分析
基因差异表达分析#基因差异表达分析library(Seurat)library(tidyverse)library(
patchwork
)l
学习生信的小兔子
·
2023-11-28 18:03
用R来拼图和排版,告别AI和PS(五):插图
前面我们已经通过四期的内容来讲解了如何使用R包
patchwork
来拼图,排版,添加注释信息和布局。
生信交流平台
·
2023-11-27 04:12
今天介绍的拼图包名为“
patchwork
”
简介tidyverse可以说是追求代码“易读”的典范,今天介绍的拼图包名为“
patchwork
”,作者是tidyverse团队成员--ThomasLinPedersen,长得帅的大佬可以拥有寄几的大照,
Seurat_
·
2023-11-26 05:23
patchwork
:R里面一个挺厉害的拼图函数
官方网址:TheComposerofPlots•
patchwork
(data-imaginist.com)官网提供两种下载方式:#Firstinstall.packages('
patchwork
')#Secondinstall.packages
BINBINCC
·
2023-11-26 03:03
6_ggplot可视化addmodule得到的炎症评分自己选择颜色 自定义更改显示的颜色 seurat得到的单细胞数据
6_ggplot可视化addmodule得到的炎症评分自己选择颜色ggplot自定义更改显示的颜色library(Hmisc)library(
patchwork
)library(ggplot2)library
生信小博士
·
2023-11-03 01:15
笔记
python
seurat
r语言
r
addmodule
ggplot 拼图
R|ggplot2拼图——
patchwork
尘世中一个迷途小书僮关注22019.11.2313:53:08字数813阅读4,991在Y叔公号(biobabble)看到cowplot乃旧爱,
patchwork
ChrisJO
·
2023-10-24 06:04
【细胞通讯】PlantPhoneDB(2)
install.packages(c("devtools","Seurat","tidyverse","ggplot2","ggsci","pheatmap","ggpubr","RColorBrewer","
patchwork
jjjscuedu
·
2023-10-23 05:35
R语言快速实现图片布局(1)
(1)简单的一排或者对称的多排,使用
patchwork
即可。
weixin_49320263
·
2023-10-10 13:44
绘图
r语言
合并图形并共享同一个图例的三种方法
主要介绍三种方法,参考资料如下:cowplot、ggpubr、
patchwork
。绘制示例图形这里以mpg数据集为例,前几行数据预览如下:以dis
庄闪闪
·
2023-09-25 02:02
数据库
Seurat4.0系列教程7:数据可视化方法
您可以从这里下载此数据集SeuratData::InstallData("pbmc3k")library(Seurat)library(SeuratData)library(ggplot2)library(
patchwork
Seurat_Satija
·
2023-09-13 10:57
用R来拼图和排版,告别AI和PS(四):布局
前面我们已经通过三期的内容来讲解了如何使用R包
patchwork
来拼图,排版和添加注释信息。
生信交流平台
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2023-09-07 14:26
ggplot2 + 截断y轴
利用
patchwork
可以做出坐标轴截断的样子。
吴十三和小可爱的札记
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2023-09-05 10:43
单细胞多样本整合-GSE162631
library(dplyr)library(Seurat)library(
patchwork
)dirs=dir(pattern="^R")f="dat.Rdata"if(!
小洁忘了怎么分身
·
2023-08-20 16:35
Patchwork
黑客组织瞄准我国大学和研究机构
据知道创宇404高级威胁情报团队近期发现,名为“
Patchwork
”的黑客组织正以中国的大学和研究机构为目标进行活动,部署名为EyeShell的后门。
FreeBuf_
·
2023-08-02 22:14
APT
库存分析R语言实现方法
R脚本绘制折线图和条形图library(tidyverse)library(readxl)library(
patchwork
)df1%mutate(month=cut(`出售年月(年月日)`,breaks
新欣enjoy
·
2023-08-01 15:24
地面分割--
Patchwork
文章目录1问题定义2同心区域模型3按照区域划分的平面拟合4地面点似然估计(GLE)总结
patchwork
是一种比较优秀的地面分割方法。
xinxiangwangzhi_
·
2023-07-30 23:28
点云
地面滤波
算法
机器学习
人工智能
点云地面滤波--
patchwork
++
文章目录1前言2反射噪声去除RNR3区域垂直平面拟合(R-VPF)4自适应地面似然估计(A-GLE)5时序地面恢复TGR总结1前言
patchwork
++是在
patchwork
的基础上进行改进的,主要有2
xinxiangwangzhi_
·
2023-07-30 23:28
点云
地面滤波
人工智能
深度学习
机器学习
跟着Molecular Systems Biology学作图:R语言ggplot2多图拼接工具
patchwork
论文Agenome-scaleTF-DNAinteractionnetworkoftranscriptionalregulationofArabidopsisprimaryandspecializedmetabolismhttps://www.embopress.org/doi/full/10.15252/msb.202110625image.png论文中提供了figure1中4个柱形图的数据和代
小明的数据分析笔记本
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2023-07-19 01:15
2022-06-16
Thecoverofplanetreestreegreenshallots,
patchwork
.ThegrasslookslikeagreencarpetlwaslyingonthegrassylawnLookingupattheskyAwhitecloudpassedovertheskyHowlwishedIcouldbecomeawhitecloud
玉关情
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2023-06-18 08:21
linux下进不去adb
linux进不去adbcat/sys/kernel/debug/usb/devices查看是否有adb口首先查看adb是否被识别成串口option如果被识别成串口方法1:https://
patchwork
.kernel.org
雨落风暖晴
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2023-06-17 15:17
usb
驱动开发
R语言绘图包02--热图pheatmap
R语言绘图包系列:R语言绘图包01--优秀的拼图包
patchwork
热图输入的数据是数值型矩阵/数据框,颜色的变化展示数值的大小。
Hayley笔记
·
2023-06-07 07:15
2021-05-11 scRNA基础分析: 降维与聚类
寻找高变基因##寻找高变基因library(Seurat)library(tidyverse)library(
patchwork
)library(dplyr)rm(list=ls())#加载数据scRNA
学习生信的小兔子
·
2023-04-20 15:43
ggplot2绘制带误差线的折线图(经典版)
本节来介绍如何通过ggplot2绘制带误差线的折线图,介绍2种方法一种传统方法&经典方法加载R包library(tidyverse)library(ggsci)library(
patchwork
)传统方法传统方法依然是先整理数据
R语言数据分析指南
·
2023-04-05 20:48
R语言ggplot2画个月饼送给你,祝你中秋节快乐!
今天的推文就简单画一个月饼吧,没有想到太好的办法,基本的逻辑就是用ggplot2添加已经做好的图片实现代码library(ggimage)library(ggplot2)library(
patchwork
小明的数据分析笔记本
·
2023-03-14 04:55
多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony
library(Seurat)library(harmony)library(tidyverse)library(
patchwork
)rm(list=ls())一.多个单细胞样本
Hayley笔记
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2023-02-18 10:06
2021生信技能树R语言终极练习题
生信入门线上课笔记,需要结合课程讲解服用1.使用循环,对iris的1到4列分别画点图(plot)方案1:我的答案参考https://www.jianshu.com/p/4b7f3b9e4cf2>library(
patchwork
超级可爱的懂事长鸭
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2023-01-27 01:18
技巧 | 如何使用R语言的基础绘图系统的拼图功能
我们知道ggplot2工具包有很多方便的拼图拓展包,如cowplot、
patchwork
等,而本篇就来介绍在使用R语言的基础绘图系统如何进行拼图。
R语言学堂
·
2022-12-19 17:21
css
编程语言
数据可视化
html
python
数字水印 改进的
patchwork
算法 实现
一、算法原理1、参考论文甘霖,杨榆.基于变换域的
Patchwork
水印改进算法[J].成都信息工程大学学报,2017,32(06):623-627.2、理论基础(1)离散余弦变换在水印算法中引入图像的变换域用于嵌入水印
夏荷影
·
2022-12-14 11:38
信息隐藏
信息隐藏
数字水印
算法
改进的
Patchwork
数字水印算法——C++实现
Patchwork
数字水印算法基础原理
Patchwork
原意为一种用各种颜色和形状拼接成的布料。
Atrix·M
·
2022-12-14 11:28
信息安全
算法
c++
安全
Seurat PBMC教程理解分享
1.读取数据library(dplyr)library(Seurat)library(
patchwork
)#LoadthePBMCdatasetpbmc.data<-Read10X(data.dir="
自认是大佬眼中level1的菜鸟
·
2022-12-07 04:01
seurat
Python可视化必备,在Matplotlib/Seaborn中轻松玩转图形拼接!
本次分享一个Python轮子patchworklib:通过|、/轻松实现图形排列;比matplotlib、seaborn等自带子图功能更加灵活;灵感源于R中的
patchwork
。
qq_21478261
·
2022-12-05 12:24
matplotlib
python
开发语言
数据分析
可视化
Patchwork
++论文阅读——基于3D点云的快速鲁棒地面分割算法
文章目录摘要1.介绍2.相关工作A.基于学习的地面分割方法B.传统的地面分割方法C.地面分割的应用3.
PATCHWORK
++:快速、稳健、自适应的地面分割A.问题定义B.RNR:反射噪声消除C.R-VPF
泽渊20
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2022-11-25 11:28
环境感知
自动驾驶
论文阅读
3d
算法
PatchWork
组织Herbminister行动武器库大揭秘
知道创宇404实验室APT高级威胁情报团队,K&NaN01概述
Patchwork
是自2015年12月以来一直活跃的南亚APT组织。
知道创宇KCSC
·
2022-11-20 23:07
windows
安全
python
github
hadoop
超详细的激光点云地面分割(可行驶区域提取)方案
模型拟合法2.4面元网格法3.几种优秀的开源方案3.1linefit_ground_segmentation3.2plane_fit_ground_filter3.3depth_clustering3.4
Patchwork
zllz0907
·
2022-11-09 20:49
感知
机器人
自动驾驶
人工智能
Patchwork
++:基于点云的快速、稳健的地面分割方法
文章:
Patchwork
++:FastandRobustGroundSegmentationSolvingPartialUnder-SegmentationUsing3DPointCloud作者:SeungjaeLee1
Being_young
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2022-11-09 20:18
算法
编程语言
机器学习
人工智能
深度学习
3.19学习汇报
1.比赛程序测试:(1)
Patchwork
:方法来源:
Patchwork
:ConcentricZone-BasedRegion-WiseGroundSegmentationWithGroundLikelihoodEstimationUsinga3DLiDARSensor
菜鸟路人甲
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2022-11-09 20:18
人工智能
机器学习
计算机视觉
深度学习
自动驾驶
【自动驾驶】使用同心区域模型改进地面点云快速分割算法
文章目录1、linefit_ground_segmentation2、使用
Patchwork
改进第1部分3、激光深度聚类算法depth_clustering运行环境:Ubuntu18.04,ROS环境运行
小哈里
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2022-11-09 20:45
#
机器学习
自动驾驶
算法
【包】seurat-1 细胞分类
,读出来是行为特征,列为细胞的矩阵CreateSeuratObject构建seurat对象,用于后续分析(稀疏矩阵、节省空间)library(dplyr)library(Seurat)library(
patchwork
JamesMori
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2022-10-30 11:47
ggplot2实现一页多图的三种方法
一页多图的三种方法cowplot包简单示例修改每张图所占的比例留出空白区域
patchwork
包(最简单)gupubr包如果你只用plot函数的话,那么用`par函数就能实现了,不过本文讲的是ggplot2
阿强真
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2022-07-06 07:53
ggplot2
r语言
开发语言
R-ggplot2-箱图系列(1) basic
jianshu.com)https://www.leansigmacorporation.com/box-plot-with-minitab/0、加载包和示例数据library(ggplot2)library(
patchwork
小贝学生信
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2022-07-03 17:45
单细胞之富集分析-4:分组水平GSVA
数据和基因集准备library(Seurat)library(msigdbr)library(GSVA)library(tidyverse)library(clusterProfiler)library(
patchwork
Hayley笔记
·
2022-07-01 10:15
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