R语言自学笔记

【Python・统计学】威尔科克森符号秩检验/Wilcoxon signed-rank test（原理及代码）

前言自学笔记，分享给对统计学原理不太清楚但需要在论文中用到的小伙伴，欢迎大佬们补充或绕道。
TUTO_TUTO·2024-09-14 13:23

【Python・统计学】Kruskal-Wallis检验/H检验（原理及代码）

前言自学笔记，分享给对统计学原理不太清楚但需要在论文中用到的小伙伴，欢迎大佬们补充或绕道。
TUTO_TUTO·2024-09-14 13:23

【Python・统计学】单因素方差分析（简单原理及代码）

前言自学笔记，分享给对统计学原理不太清楚但需要在论文中用到的小伙伴，欢迎大佬们补充或绕道。
TUTO_TUTO·2024-09-14 13:52

【统计学】参数检验和非参数检验的区别和基本统计学

前言自学笔记，分享给对统计学原理不太清楚但需要在论文中用到的小伙伴，欢迎大佬们补充或绕道。
TUTO_TUTO·2024-09-14 13:22

零配置初始化流程就一直过不去_ZYNQ UltraScale+ MPSoc FPGA自学笔记-启动加载配置...

前言听说最近秋天的第一杯奶茶挺火的，我得赶紧奋发图强写点东西，好赚点赏钱给妹子买奶茶，各位大佬出手大方点，我怕秋天过去了妹子还没喝上奶茶！言归正传，ZYNQUltraScale+MPSoc的配置过程还是挺复杂的，决定写一篇文章来讲一讲，当然我也是初学，如有错讹请轻轻打左脸。一、配置过程Zynq®UltraScale+™MPSoC同时有PS端和PL端，PS又有两种不同的多核处理器可以运行底层代码或者
weixin_40009026·2024-09-14 08:52

seurat自学笔记1.0 单细胞数据导入

Python读取.h5ad文件importanndataimportpandasaspdadata=anndata.read("/home/R/R_data/Seurat/PBMC10/output/adata.h5ad")#adata.X.todense()#将稀疏矩阵转成普通矩阵#X=pd.DataFrame(adata.X.todense())#cell_name=adata.obs.ind
Sanye2022·2024-09-14 01:36

学习小组Day4笔记--王英芳

R语言基础准备工作电脑用户名需要是英文R基础，Rstudio人性化界面资源Rfordatasciencechapter1下载RandRstudio给自己一个全新的R语言环境R是什么一种变成语言，统计计算和绘图的环境
一万万万万·2024-09-13 19:51

R语言 基础笔记

起因:今天不知道要写什么。把之前的笔记复制一下。代码开头，导入:#清除系统变量rm(list=ls())#隐藏警告信息:options(warn=-1)#把当前目录，设置为工作目录。library(rstudioapi)current_folder_path0.0&ideology<10.0)分组聚合，类似groupby()df2<-aggregate(df1KaTeXparseerror:Exp
waterHBO·2024-09-13 15:38

R语言包AMORE安装报错问题以及RStudio与Rtools环境配置

在使用R语言进行AMORE安装时会遇到报错，这时候需要采用解决办法：'''AMORE包安装，需要离线官网下载安装包：Indexof/src/contrib/Archive/AMORE(r-project.org
卡卡_R-Python·2024-09-13 14:29

生态位宽度计算&可视化展示（R语言）

生态位宽度是指物种（或其它生物单位）在群落中所利用的各种不同资源的总和。物种的生态位越宽，该物种的特化程度就越小，倾向于泛化种（generalistspecies）；物种的生态位越窄，倾向于是一个特化种（specialistsspecies）。本篇所使用为生态位宽度指数即**Levins的生态位宽度指数。**（除此之外也有用shannon指数）#安装并加载必要的包if(!requireNamesp
光疏介质·2024-09-12 17:12

R语言多项逻辑回归-因变量是无序多分类

因变量是无序多分类资料（＞2）时，可使用多分类逻辑回归（multinomiallogisticregression）。使用课本例16-5的数据，课本电子版及数据已上传到QQ群，自行下载即可。某研究人员欲了解不同社区和性别之间居民获取健康知识的途径是否相同，对2个社区的314名成人进行了调查，其中X1是社区，社区1用0表示，社区2用1表示；X2是性别，0是男，1是女，Y是获取健康知识途径，1是传统大
医学和生信笔记·2024-09-12 09:22

Protocol Buffer编译器安装

该站点上的大多数示例代码都使用protocolbuffer语言（proto3）的版本3。protocolbuff
雪域迷影·2024-09-12 03:22

R语言自学笔记-2内置数据集

#b站视频——R语言入门与数据分析#内置数据集#固定格式的数据（矩阵、数据框或一个时间序列等）#统计建模、回归分析等试验需要找合适的数据集#R内置数据集，存储在，通过help(package="datasets
实验室长工·2024-09-12 00:36

李沐55_循环神经网络RNN简洁实现——自学笔记

读取《时间机器》数据集!pipinstalld2l!pipinstall--upgraded2l==0.17.5#d2l需要更新importtorchfromtorchimportnnfromtorch.nnimportfunctionalasFfromd2limporttorchasd2lbatch_size,num_steps=32,35train_iter,vocab=d2l.load_da
Rrrrrr900·2024-09-11 20:54

在TCGA上下载数据并且进行处理

使用R语言脚本对数据进行处理，将其提取为genesymbol和样本的数据，推荐看一下该博主处理数据！！真的非常详细！他R语言脚本在这个链接里
Red Red·2024-09-11 09:00

R语言-非结构化数据-文本数据读入

#2.2.2非结构化数据-文本数据读入rm(list=ls())#清空工作空间##1.读入简单文本数据###假如数据包含大量经过结构化的文本数据#只需按照读入csv等标准式数据的方法读入#例：novel=read.csv("novel.csv",fileEncoding="UTF-8")head(novel)##2.用readtable读入文本###文本数据普通读法test=read.table(
pdc31czy·2024-09-10 22:44

Coding and Paper Letter（十四）

1Coding:1.R语言包ungeviz，ggplot2的拓展包，专门用来作不确定性的可视化。ungeviz2.计算机图形学相关开源项目。计算机图形学光线追踪开源项目C++源码。
G小调的Qing歌·2024-09-10 13:10

r语言做绘制精美pcoa图_R语言高级绘图 — ggplot2

2)PCA的作图PCA主成分分析，可以将高维数据进行降维处理。我们的OTU表格就是典型的高维数据，可以对其进行降维处理得到主成分PC1和PC2，然后将所有样品都分解到这两个成分方向，进行散点绘图，可以直观的看出样品间的差异。首先需要一系列的统计处理，然后用ggplot2进行绘图，过程如下：#加载需要的三个包(需要先下载，再加载)>library(ade4)>library(ggplot2)>lib
weixin_39560002·2024-09-10 06:59

科研绘图系列：R语言扩展物种堆积图（Extended Stacked Barplot）

介绍R语言的扩展物种堆积图是一种数据可视化工具，它不仅展示了物种的堆积结果，还整合了不同样本分组之间的差异性分析结果。
生信学习者1·2024-09-09 16:10

科研绘图系列：R语言柱状图分布（histogram plot）

文章目录介绍加载R包读取数据画图介绍柱状图（BarChart）是一种常用的数据可视化图表，用于展示和比较不同类别或组的数据。它通过在二维平面上绘制一系列垂直或水平的柱子来表示数据的大小，每个柱子的长度或高度代表一个数据点的数值。柱状图非常适合于展示分类数据的分布和比较。柱状图的特点：直观比较：柱状图可以直观地展示不同类别之间的数值比较，易于理解。分类展示：数据按照类别或组别进行分组展示，每个类别用
生信学习者1·2024-09-09 15:06

科研绘图系列：R语言富集散点图（enrichment scatter plot）

介绍富集通路散点图（EnrichmentPathwayScatterPlot）是一种数据可视化工具，用于展示基因集富集分析（GeneSetEnrichmentAnalysis,GSEA）的结果。横坐标是对应基因名称，纵坐标是通路名称，图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue，可以简单理解为不同环境下的贡献大小。加载R包导入所需要的R包，在导入前需要用户自己安装。library(readxl)l
生信学习者1·2024-09-09 14:57

Python-Matplotlib安装及简单使用

Matplotlib是一个Python的图形框架，类似于MATLAB和R语言。
riyuexingchen0909·2024-09-09 11:06

sublime安装python库_Mac OS 轻松用 Sublime Text 3 配置Python编译环境

最近在学习数据分析相关的知识，对比Python和R语言在数据分析领域的优劣，Python更胜一筹。要学习Python，首先需要搭建编译环境。
weixin_39603397·2024-09-09 06:34

Tensorflow中Keras搭建神经网络六步法及参数详解 -- Tensorflow自学笔记12

一.tf.keras搭建神经网络六步法1.import相关模块如importtensorflowastf。2.指定输入网络的训练集和测试集如指定训练集的输入x_train和标签y_train，测试集的输入x_test和标签y_test。3.逐层搭建网络结构model=tf.keras.models.Sequential()。4.在model.compile()中配置训练方法选择训练时使用的优化器、
青瓷看世界·2024-09-08 21:00

MacBook Air M1 使用 miniconda 安装python3.11.7 和 tensorflow2.16.1详细 - TensorFlow自学笔记1

1m1mac安装xcode命令工具在Terminal终端执行以下代码：xcode-select--install2下载支持m1芯片arm64的miniconda在miniconda官网，找到下图中保护AppleM1的bash安装包，Miniconda—Anacondadocumentation3安装miniconda在Terminal执行下列代码：1）cd"miniconda下载目录"2）bash
青瓷看世界·2024-09-08 21:30

在linux（ubuntu）中使用网页版的rstudio

RStudio是R语言集成开发环境的应用软件，RStudioServer是一个基于web访问的RStudio云端开发环境，需要安装在服务器上，支持多用户远程访问使用。
Chao_Powell_Hou·2024-09-08 11:46

层的功能及参数详细解释 -- TensorFlow自学笔记6

在Keras中，层（Layer）是构建神经网络的基本组件。Keras提供了多种类型的层，用于处理不同类型的输入数据和执行特定的数学操作。英文版可参考TensorFlow官方文档：Module:tf.keras.layers|TensorFlowv2.16.1一.层的分类‌1.基本网络层‌1.1.Dense层用于执行全连接操作；1.2.卷积层Conv1D、Conv2D、Conv3D层，用于执行一维、
青瓷看世界·2024-09-08 09:42

推荐一份生物信息学入门很好的参考材料

/tutorials-2/这个是康涅狄格大学（UniversityofConnecticut）提供的一份教程，主要的内容包括1、生物信息学中经常用到的文件格式image.png2、linux操作系统和R语言的基础知识
小明的数据分析笔记本·2024-09-08 09:58

Tensorflow2 如何扩展现有数据集(缩放、随机旋转、水平翻转、平移等)，从而提高模型的准确率 -- Tensorflow自学笔记14

实际生活中的数据集，往往不是标准的数据，而是有倾斜角度、有旋转、有偏移的数据，为了提高数据集的真实性，提高模型预测的准确率，可以用ImageDataGenerator函数来扩展数据集importtensorflowastffromtensorflow.keras.preprocessing.imageimportImageDataGeneratorimage_gen_train=ImageData
青瓷看世界·2024-09-08 09:07

R语言基础学习

R与RStudioR语言是数据科学和统计分析的语言，适合数据分析和数据可视化。R是开源的，拥有丰富的包（packages），可以与优化软件进行交互。
weixin_55475210·2024-09-06 19:54

学习小组Day5笔记--森蝶

6.表格在R语言中改名叫数据框7.函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮
松风·2024-09-04 23:42

学习小组Day6笔记--魏麻将

注意：学生信，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。安装和加载R
魏麻将·2024-09-03 08:34

centos7 r语言安装_centos7 R-4.0.2 安装

tar-zvxfR-4.0.2.tar.gzcdR-*yuminstall-ygccyuminstall-ygcc-gfortranyuminstall-ygcc-c++yuminstall-yglibc-headersyuminstall-ylibreadline6-devgfortranyuminstall-yreadline-develyuminstall-ywgetlibXt-devely
weixin_39777404·2024-09-03 03:50

linux下载R语言失败,[已解决]CentOS7下安装rjags失败 installation of package ‘rjags’ had non-zero exit status...

问题CentOS7下安装rjags失败installationofpackage‘rjags’hadnon-zeroexitstatus详细报错>install.packages("gbs2ploidy",dependencies=TRUE)alsoinstallingthedependency‘rjags’tryingURL'https://cran.rstudio.com/src/contri
宁静致远敏·2024-09-03 03:50

Centos 安装R语言环境 3.6

前言目前R语言最新版已经是4.0以上了，所以安装旧版本可以通过下载源码方式安装。
118路司机·2024-09-03 03:19

R语言使用rpart包构建决策树模型实战、使用prune函数按照指定复杂度对决策树剪枝、使用rpart.plot包中的prp函数可视化训练、剪枝好的决策树

R语言使用rpart包构建决策树模型实战、使用prune函数按照指定复杂度对决策树剪枝、使用rpart.plot包中的prp函数可视化训练、剪枝好的决策树、type参数、extra参数、fallen.leaves
statistics.insight·2024-09-02 14:39

r语言变量长度不一致怎么办_C语言，C++常见编译错误

fatalerrorC1003:errorcountexceedsnumber;stoppingcompilation中文对照：错误太多，停止编译分析：修改之前的错误，再次编译fatalerrorC1004:unexpectedendoffilefound中文对照：文件未结束分析：一个函数或者一个结构定义缺少“}”、或者在一个函数调用或表达式中括号没有配对出现、或者注释符“”不完整等fataler
weixin_39624094·2024-09-02 02:46

科研绘图系列：R语言单细胞差异基因四分图（Quad plot）

介绍在单细胞分析领域，为了探究不同分组间同一细胞类型的基因表达差异，研究者们常采用四分图（QuadPlot）作为分析工具。该图形的横轴代表比较组1，而纵轴代表比较组2。通过这种布局，四分图能够有效地展示两组间共有的差异表达基因，从而为深入理解细胞类型在不同条件下的分子特性提供直观的视角。这种可视化方法不仅揭示了组间基因表达的异同，还有助于识别可能在生物学过程或疾病发生中起关键作用的基因。加载R包导
生信学习者2·2024-09-02 01:45

科研绘图系列：R语言组合堆积图（stacked barplot with multiple groups）

介绍通常堆积图的X轴表示样本，样本可能会存在较多的分组信息，通过组合堆积图和样本标签分组信息，我们可以得到一张能展示更多信息的可发表图形。加载R包knitr::opts_chunk$set(warning=F,message=F)library(tidyverse)library(cowplot)library(patchwork)导入数据数据可从以下链接下载（画图所需要的所有数据）：百度云盘链接
生信学习者2·2024-09-02 01:45

科研绘图系列：R语言雷达图（radar plot）

介绍雷达图，又称为蜘蛛网图或星形图，是一种以多轴方式显示数据的图表。它通常用于显示多个定量变量的值，这些变量被表示为从中心点向外延伸的轴。每个轴代表一个变量，而每个变量的值则通过从中心向外延伸的距离来表示。雷达图可以直观地展示多个变量之间的相对大小和关系。雷达图的特点：多维数据比较：可以同时比较多个变量，看它们在不同维度上的表现。综合评价：用于综合评价一个或多个对象在多个方面的表现。趋势分析：可以
生信学习者2·2024-08-31 22:25

科研绘图系列：R语言饼图（pie chart）

介绍饼图是一种常用的数据可视化图表，它通过圆形的扇形区域来展示数据的比例关系。每个扇形的面积大小与其所代表的数据量成正比，从而直观地显示各部分在整体中所占的比重。特点：直观性：通过不同大小的扇形，可以直观地看到各个部分的相对大小。易于理解：圆形的分割使得人们容易理解各部分的相对比例。适合展示比例：特别适合展示各部分在整体中的比例关系。说明的问题：部分与整体的关系：显示每个部分在整体中所占的百分比。
生信学习者2·2024-08-31 22:25

科研绘图系列：R语言径向柱状图（Radial Bar Chart）

介绍径向柱状图（RadialBarChart），又称为雷达图或蜘蛛网图（SpiderChart），是一种在极坐标系中绘制的柱状图。这种图表的特点是将数据点沿着一个或多个从中心向外延伸的轴来展示，这些轴通常围绕着一个中心点均匀分布。特点：极坐标系统：数据点不是在直角坐标系中展示，而是在极坐标系中，围绕一个中心点。多维度数据展示：可以同时展示多个变量的数据，每个变量对应一个轴。视觉集中：所有数据点都围
生信学习者2·2024-08-31 22:55

科研绘图系列：R语言基础图形合集

R语言在可视化方面具有极大的优势，因其本身就是统计学家为了研究统计问题开发的编程语言，因此极力推荐使用R语言可视化数据。
生信学习者2·2024-08-31 22:55

入门力扣自学笔记3 C++ （题目编号385）

385.迷你语法分析器题目：给定一个字符串s表示一个整数嵌套列表，实现一个解析它的语法分析器并返回解析的结果NestedInteger。列表中的每个元素只可能是整数或整数嵌套列表示例1：输入：s="324",输出：324解释：你应该返回一个NestedInteger对象，其中只包含整数值324。示例2：输入：s="[123,[456,[789]]]",输出：[123,[456,[789]]]解释：
DK_Sorhic·2024-08-31 08:24

1区9+非肿瘤纯生信，逻辑清晰易懂，机器学习筛选关键基因的纯生信也可以发高水平期刊，抓紧上车！

两种相关疾病联合分析，包括非肿瘤结合非肿瘤，非肿瘤结合肿瘤或者非肿瘤结合泛癌分析4基于分型的非肿瘤生信分析5单细胞结合普通转录组生信分析目前非肿瘤生信发文的门槛较低，有需要的朋友欢迎交流研究概述：本研究首先使用R语言在三个基因表达
生信小课堂·2024-08-30 17:58

R语言基础-文档检索与环境配置-2019-06-29

R帮助函数`help.start()`，打开帮助文档首页`help.search("foo")`或`??foo，`以foo为关键词搜索本地帮助文档，`?Startup`查看与R有关的启动文件信息；`example("foo")`，函数foo的使用示例（引号可以省略）`RSiteSearch("foo")`，以foo为关键词，查询整个http://search.r-project.org网站的包，例
天涯清水·2024-08-30 15:00

R语言 交互式绘图echarts4r包--3D深探

表面datadplyr::mutate(z=sin(x*x+y*y)*x/3.14)data|>e_charts(x)|>e_surface(y,z,wireframe=list(show=FALSE))|>e_visual_map(z)3维柱状图v<-LETTERS[1:10]matrix<-data.frame(x=sample(v,300,replace=
「已注销」·2024-08-29 15:19

6章2节：认识birthwt数据集，EpiDisplay和Gmodels扩展包的应用

在R语言的广泛应用领域中，数据集的选择与理解起着至关重要的作用。它既为学习R语言奠定了基础数据，又为我们开展统计分析和模型构建提供了强有力的支持。
数据科学和人工智能兴趣组·2024-08-29 13:33

跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):转录因子分析

转录因子分析也是单细胞转录组常见的分析内容，R语言分析一般采用的是SCENIC包，具体原理可参考两篇文章。
KS科研分享与服务·2024-08-28 18:02

在B站看到有人提问说安东尼戴维斯的数据比邓肯好，画个图来比较下

作为R语言数据可视化爱好者，当然得找到邓肯和安东尼戴维斯的数据来可视化比较一番了数据来源https://www.basketball-reference.com/今年是安东尼戴维斯的第10个赛季，赛季刚刚开始
小明的数据分析笔记本·2024-08-28 17:08
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