WGBS

iMETHYL : 整合了DNA甲基化, SNP和RNA_seq的多组学联合数据库

在NGS飞速发展的时代，有大量研究通过GSWA的方法，阐述了SNP于疾病之间的关联;也有学者利用WGBS，RRBS,甲基化芯片等方式研究DNA甲基化与疾病之间的关系。
生信修炼手册·2024-02-01 07:13

易基因｜全基因组DNA甲基化测序（WGBS）揭示衰老对肝再生的表观基因组调控机制

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。众所周知，衰老会对肝脏再生产生影响。随着时间的推移，肝脏再生能力显著下降。肝脏体积、血流量和代谢等肝脏生理参数，以及损伤后的再生能力在人类和模型系统中均在老年时表现出下降，其中涉及许多分子机制，包括DNA甲基化依赖性基因组重塑。那么DNA甲基化变化如何介导衰老对肝再生的不利影响呢？2023年02月13日，美国德克萨斯农工健康科学中心Ro
易基因科技·2024-01-16 13:52

易基因： WGBS+RNA-seq揭示黄瓜作物的“源-库”关系受DNA甲基化调控｜项目文章

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。作物产量取决于库（sink，获得同化物）的潜力和源（source，供给同化物）的能力，“源—库”关系的优化对作物产量调控具有重要意义。黄瓜（CucumissativusL.）是世界范围内广泛种植的蔬菜，是我国具有巨大经济价值的七大蔬菜之一，叶片和速生果实属于黄瓜的“源”和“库”器官。黄瓜是典型的棉子糖家族系列寡糖(Raffinosefa
易基因科技·2024-01-16 13:46

甲基化-全基因组甲基化测序WGBS & RRBS

回顾表观基因组中5mC(DNA甲基化)概述：在甲基转移酶的作用下，DNA序列中的胞嘧啶(C)5`碳位结合一个甲基基团形成5`-甲基胞嘧啶的现象。DNA甲基化检测技术包括：基于Bisulfite转化的检测技术、基于限制性内切酶的检测技术、基于免疫共沉淀的检测技术。基于Bisulfite转化的检测技术通过亚硫酸氢盐将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，进行PCR扩增后变成T，而有甲基化修饰的C碱基则
b2ad98a9e7bd·2023-11-30 08:43

WGBS vs RRBS

Howdoesbisulfitesequencing(WGBS/RRBS)work?DNA甲基化分析是NGS技术中越来越广泛的一项应用。
生信start_site·2023-11-01 03:21

易基因：WGBS等揭示植物基因体动态DNA甲基化与基因表达可塑性相关｜Genome Biol

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。在一些真核生物中，DNA甲基化发生在基因编码区，称为基因体甲基化(genebodymethylation，GbM)。尽管DNA甲基化在转座子和重复DNA沉默中的作用已得到很好的表征，但基因体甲基化与转录抑制无关，其生物学重要性尚不清楚。2023年10月12日，美国加州大学伯克利分校植物与微生物生物学系BenP.Williams团队在《G
易基因科技·2023-10-25 10:33

易基因： WGBS等揭示DNA甲基化调控林地草莓植株高度和果实大小的分子机制｜植物发育

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化影响基因组稳定性、转座子沉默和基因表达；它主要发生在对称CG和CHG以及不对称CHH(H=A,C或T)中的胞嘧啶上。RNA介导的DNA甲基化(RNA-directedDNAmethylation，RdDM)通路调控植物中所有三种序列背景下的novoDNA甲基化。RdDM通路非常复杂，由许多蛋白质和非编码RNA组成。尽管RdD
易基因科技·2023-09-18 14:36

精准医学： 应用脑脊液游离DNA全基因组甲基化测序筛选小儿髓母细 胞瘤早期诊断与预后监测的可靠生物标志物｜液体活检专题

儿童脑恶性肿瘤如髓母细胞瘤(MB)致癌基因突变频率较低，但DNA甲基化改变明显，根据MB的这一特点作者使用了WGBS和CMS-IP-seq技术分别进行甲基化与羟甲基化监测，并将实验结果与大型公共数据库（
易基因科技·2023-09-03 00:03

易基因：WGBS等揭示丹参甲基化表征及DNA甲基化在丹参酮生物合成中的调控机制｜科研速递

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。丹参（Salviamiltiorrhiza，S.miltiorrhiza）是一种具有重要经济价值和药用价值的模式药用植物，丹参的根会合成一组称为丹参酮（tanshinone）的二萜类亲脂性生物活性成分。丹参酮的生物合成和调控引起广泛关注。DNA甲基化变化在调控植物种子发育、茎和叶生长、春化、果实成熟和次级代谢等方面发挥着重要作用。然而丹
易基因科技·2023-08-29 13:41

易基因：全基因组DNA甲基化测序（WGBS）揭示儿童哮喘增强子区域的整体低甲基化｜科研速递

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。哮喘（asthma）是儿童期最常见的慢性炎症性疾病，患病率2.6%~30.5%，儿童哮喘是世界范围内的一个主要健康问题。儿童哮喘是遗传和环境因素复杂互作结果，可导致表观遗传和免疫失调、气道炎症和肺功能受损。先前研究利用850K芯片对哮喘的DNA甲基化变化的靶点特异性分析或DNA甲基化微阵列进行了描述，覆盖人类基因组约28MCpG中的27
易基因科技·2023-08-29 13:40

项目集锦 | 易基因DNA羟甲基化5hmC测序研究成果

01宫颈癌WGBS+oxWGBS标题：Anepigenomiclandscapeofcervicalintraepithelialneoplasiaandcervicalcancerusingsingle-baseresolutio
易基因科技·2023-06-17 10:18

表观技术 | 靶基因DNA甲基化和羟甲基化测序 定制精准检测

目前研究中常用的DNA甲基化测序方法包括全基因组（WGBS、oxWGBS等）、简化基因组（dRRBS、RRBS、XRRBS等）、靶向基因组（液相捕获）、靶向基因（扩增子）和850K芯片等，适用于多种不同应用场景
易基因科技·2023-04-17 19:51

PBAT文库

提要：PBAT文库特点PBAT比对率为何如此之低，令人发指PBAT数据如何优雅的比对由于PBAT文库包含大量的嵌合的reads，PBAT文库数据相较于WholeGenomeBisulfite-Seq（WGBS
浩渺予怀·2023-04-13 04:33

项目集锦 | 易基因DNA羟甲基化5hmC测序研究成果

01宫颈癌WGBS+oxWGBS标题：Anepigenomiclandscapeofcervicalintraepithelialneoplasiaandcervical
易基因科技·2023-04-03 12:16

易基因 | 文献速递：微量细胞WGBS技术揭示克隆胚胎异常DNA再甲基化新机制

今天一起来看看发表于CellStemCell期刊的关于DNA甲基化在克隆胚胎发育中的作用研究成果，本文研究了小鼠克隆胚胎早期着床前发育过程中DNA甲基化修饰的重编程过程，并揭示了异常DNA再甲基化（DNAre-methylation）是导致克隆胚胎着床后发育异常的关键因素。标题：InhibitionofaberrantDNAre-methylationimprovespost-implantati
易基因科技·2023-03-18 17:58

易基因｜综合DNA甲基化测序揭示前列腺癌死亡率的预后表观遗传生物标志物 | 文献速递

Comprehensivemethylomesequencingrevealsprognosticepigeneticbiomarkersforprostatecancermortality”的研究文章，通过全基因组DNA甲基化测序技术（WGBS
易基因科技·2022-11-19 11:55

易基因项目文章｜WGBS+RNA-seq揭示PM2.5引起男性生殖障碍的DNA甲基化调控机制

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2022年09月24日，陆军医科大学（第三军医大学）预防医学院毒理学研究所张中豪博士等为第一作者，曹佳教授、刘晋祎教授为通讯作者以"Genome-widealternationandeffectofDNAmethylationintheimpairmentsofsteroidogenesisandspermatogenesisafter
易基因科技·2022-11-19 11:24

易基因｜ctDNA甲基化测序分析（ctDNA-WGBS）用于癌症检测和分子分型 | 精准医学

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。多项研究已证明，循环肿瘤DNA（circulatingtumorDNA，ctDNA）是癌症诊断和预后的潜在标志物。2022年08月23日，中国医学科学院北京协和医学院国家肿瘤中心吴志宏/佟仲生/赫捷/孙英丽团队在《ClinTranslMed》杂志发表了题为“Whole-genomebisulfitesequencinganalysiso
易基因科技·2022-11-19 11:23

Wilson病患者的肝脏和血液中的表观基因组特征包括肝脏特异性增强子的高甲基化

我们使用全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）来检查WD受试者的不同群组，以确定DNA甲基化是否可以区分
机器人会画画·2022-02-18 03:32

背景：全基因组分析造血细胞中的DNA甲基化：WGBS的DNA甲基化分析

全基因组分析造血细胞中的DNA甲基化：WGBS的DNA甲基化分析FirstOnline:23July2017译者注意：文章感觉什么都没说，也就是讲一下背景，测序中的步骤，可以了解一下，中间经过了什么处理
Amy_Cui·2021-06-26 06:59

如何将div中的内容设置为空同时还要保留div本身

https://www.cnblogs.com/wgbs25673578/p/5348125.html将div的innerHTML置为空即可，下面有2类方法可以实现：假设有如下的html片段：这是要删除的内容
NRlovestudy·2020-09-12 18:21

WGBS 全基因组甲基化测序

DNA甲基化是DNA被添加甲基()修饰影响基因功能或者表达。最常见的甲基化是胞嘧啶产生5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5-mC)。有甲基化过程就有去甲基化过程，整个胞嘧啶甲基化循环如下图所示。C甲基化循环在体细胞中5-mC几乎只发生在CpG位点，但是CpG岛(CpGisland)区域往往不是甲基化的，因为许多CpG岛是靠近启动子区域的，甲基化将导致基因无法表达。TheCpGdin
BeeBee生信·2020-07-17 16:59

2020-04-13 WGBS测序质控及分析记录

测序数据质控fastpfastp-i../cleandata/$seq\_R1.fastq.gz-o$seq.R1.clean.fq.gz\##read1-I../cleandata/$seq\_R2.fastq.gz-O$seq.R2.clean.fq.gz\##read2-5--cut_front_window_size4--cut_front_mean_quality20\##from5'-
xiaoguolaile·2020-04-13 11:04

methylKit 进行差异甲基化分析

methylKit是一个用于分析甲基化测序数据的R包，不仅支持WGBS，RRBS和目的区域甲基化测序，还支持oxBS-sq,TAB-seq等分析5hmc的数据。
生信修炼手册·2020-03-14 10:47

全基因组甲基化分析简述

目前，DNA甲基化检测的技术已经比较成熟，例如高通量的WGBS、RRBS、MeDIP-seq、MBD-seq，低通量的BSP、MSP等，其中以WGBS（Wholegenomebisulfitesequencing
浩渺予怀·2020-03-05 01:39

文献阅读：Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer

文献精读见：https://www.jianshu.com/p/922b756a76f6该文章的思维导图.png这篇文章由他们之前实验室的Tribio-seq1.0到2.0,由RRBS变成了WGBS文章总结
liu_ll·2019-12-06 09:27

BS-seq及bismark原理

手写版哈哈ref1:一个非常好的bsseq讲义:点击在线看bsseq讲义ref2:Whole-GenomeBisulfiteSequencing--illuminaref3:WGBS比对工具比较——bismark
苏牧传媒·2018-08-23 15:02
上一页 1 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他