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Linux
cancer
健康最重要
前段时间,朋友妈妈检查出得了
cancer
。
心遥远
·
2021-05-20 21:20
三只蜗牛--自律行动33天
一、日程(每日必做)1.早起到7:30、打卡晨读、做计划✔2.英语自然主义:模仿、角色扮演(复习)
cancer
:癌症network:网络,引申为组织partner:伙伴,配偶ChicagoCancerFamilyNetwork
永宽自律早起
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2021-05-20 10:26
Cancer
基因组研究常见三格式
FASTQ,BAM,VCFFASTQFormatSpecificationIntroductionFASTQformatstoressequencesandPhredqualitiesinasinglefile.Itisconciseandcompact.FASTQisfirstwidelyusedintheSangerInstituteandthereforeweusuallytaketheSa
王诗翔
·
2021-05-18 03:30
文献:Prognostic Genes of Breast
Cancer
Identified by Gene Co-expression Network Analysis
文献时间2018摘要这篇文章的目的是鉴别潜在的与乳腺癌发病相关的基因。使用WGCNA来建立加权共表达网络来探索临床特征和基因集之间的关系,以及来鉴定候选的生物标记基因。使用GSE1561数据集来进行分析,TCGA的数据来进行验证。通过平均连接层次聚类的方法鉴定了18个模块。显著性模块()中共发现48个网络节点基因。基于TCGA数据,5个节点基因(CCNB2,FBXO5,KIF4A,MCM10,TP
康君爱上了蕊酱
·
2021-05-16 18:29
一文重复一篇四分SCI------基于TCGA和geo的circRNA研究(3)
检索词如下:(hepatocellularORhepaticORliverORHCC)and(“
cancer
”OR“tumor”OR“tumour”OR“carcinoma”OR“neoplasm”OR
柳叶刀与小鼠标
·
2021-05-15 20:26
关注肿瘤患者的创伤后应激障碍
图片来自网络2017年11月20日,《
Cancer
》杂志刊登的研究结果显示,约有20%的患者在诊断癌症数月后出现创伤后应激障碍(post-traumaticstressdisorder,PTSD)。
亨利福特健康
·
2021-05-15 14:59
既然不易,更需珍惜
02两年前一切还是很顺利,过着正常的象牙塔生活,可毕业之际我爸身体突然不舒服,去医院检查出来是
cancer
,早期的!真是命运弄人,在我青春岁月就
YISHUL
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2021-05-13 07:27
Day11- Mixture of Safe Chemicals May Cause
Cancer
#21天英语听力学习打卡#
打卡日记Day11——MixtureofSafeChemicalsMayCauseCancerEveryday,peoplecomeintocontactwiththousandsofchemicals.Thesechemicalsaresaidtobeharmlesstohumanhealth.Infact,thechemicalsareconsideredsosafethatwewashwit
Yvanna_15
·
2021-05-12 13:20
单基因免疫分析再现江湖
PrognosticandImmunologicalRoleofFUN14DomainContaining1inPan-
Cancer
:FriendorFoe?
呆呆聊生信
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2021-05-10 12:55
文献翻译Identification of potential
cancer
-related pseudogenes in lung adenocarcinoma based on ceRNA h...
ABSTRACT假基因最初被认为是由于在进化过程中失活基因突变而导致的非功能性基因组。然而最近有研究证明假基因远非沉默,通过体内microRNA海绵的功能调节蛋白质编码基因的表达。我们的研究目的是提出一种综合系统生物学方法,以基于竞争性内源RNA(ceRNA)假说鉴定疾病假基因。在这里,我们将我们的方法应用于来自TCGA的肺腺癌(LUAD)RNASeq数据并鉴定了33个候选假基因。我们描述了候选假
柳叶刀与小鼠标
·
2021-05-10 11:37
2019-12-24 平安夜、平安年,2020要好好的!
5月底,老爸查出有
cancer
,从八医院辗转到中南住院。6月、7月、8月,2个多月在武昌,只能说照看照看家里的老人们。9月,重新开始复习备考。8月31日,我提前面;10月1
大聆儿小空宝
·
2021-05-10 02:38
案例47 小肠梗阻
X线表现:鉴别诊断:导致小肠梗阻的前三大原因排序:1、肠粘连2、疝3、肿瘤“ABC”记忆法:•Adhesions(肠粘连)•Bulge(疝)•
Cancer
(肿瘤)诊断:小肠梗阻(Smallbowelobst
karlfan555
·
2021-05-09 09:16
数据库汇总-2
一、TCGA相关数据库数据库名网址备注计算机$16005手机$1212管线$1234数据库名网址备注TCGA-GDChttps://portal.gdc.
cancer
.gov/TCGA官网GEPIAhttp
oddxix
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2021-04-30 22:32
R语言-生成频数表和列联表crosstable函数介绍
2x2列联表一般长下面这样:TotalObservationsinTable:143|test_
cancer
$diagnosislda.class|0|1|RowTotal|-------------|
·
2021-04-20 16:50
文献阅读 Pan-
cancer
Immunogenomic Analyses Reveal Genotype-Immunophenotype Relationships and Predicto...
今天介绍一篇肿瘤免疫的文献,题目为Pan-cancerImmunogenomicAnalysesRevealGenotype-ImmunophenotypeRelationshipsandPredictorsofResponsetoCheckpointBlockade,2017年发表于CellReport。GraphicalAbstract通过TCGA癌症基因组数据研究免疫相关的三块内容:1.Tu
林枫bioinfo
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2021-03-31 03:13
Extensive heterogeneity in somatic mutation and selection in the human bladder
上的一篇文章,首先看这篇文章的corresondingauthor图片.pngInigoMartincorena是来自于sanger的一个教授,他主要的研究方向是研究癌症中的somaticmutation在
cancer
花生米yangyang
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2021-03-16 19:07
Acupuncture for hot flashes in women with breast
cancer
: A systematic review.
JCancerResTher.2016Apr-Jun;12(2):535-42.doi:10.4103/0973-1482.172716.Acupunctureforhotflashesinwomenwithbreastcancer:Asystematicreview.ChenYP1,LiuT1,PengYY1,WangYP1,ChenH2,FanYF1,ZhangL1.Authorinforma
黄国健博士
·
2021-03-11 19:09
CNS图表复现08—肿瘤单细胞数据第一次分群通用规则
文章的第一次分群按照:immune(CD45+,PTPRC),epithelial/
cancer
(EpCAM+,EPCAM),stromal(CD10+,MME,fiboorCD31+,PECAM1,endo
Seurat_Satija
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2021-03-05 21:43
Tracking
Cancer
Evolution Reveals Constrained Routes to Metastases: TRACERx Renal
今天给大家介绍一篇大名鼎鼎的CharlesSwanton作为correspondingauthor的文章。图片.png这篇文章是在2018年发表在cell上,首先我们看一下这篇文章的通讯作者.图片.pngprofessorCharlesSwantonCharileSwanton是英国癌症研究中心的首席临床医生,他目前在Thefranciscrickinstitute,他的研究队伍致力于研究肿瘤间的
花生米yangyang
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2021-03-04 11:49
Genomic Evolution of Breast
Cancer
Metastasis and Relapse
最近因为做一个基因组的分析,所以就给大家分享写在17到18年发表在cell和cancercell的一些文章。最近,给大家分享一篇探索乳腺癌转移和复发的基因组进化的文章,这篇文章在2017年的cancercell上发表。首先,我们看下这篇文章的通讯作者:peterCampbell的研究方向专注于在我们的一生中,我们细胞中的基因组的改变,以及这些突变如何和我们的年龄,癌症,以及其他的疾病进展有关。他最
花生米yangyang
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2021-02-24 22:10
十二、机器学习算法整合(knn、朴素贝叶斯、决策树、随机森林、线性回归、岭回归、逻辑回归、聚类、支持向量机)
小宇最后完成日期:2021.2.28包含内容:knn、朴素贝叶斯、决策树、随机森林、线性回归、岭回归、逻辑回归、聚类、支持向量机'''fromsklearn.datasetsimportload_breast_
cancer
小宇课堂
·
2021-02-02 17:07
机器学习
决策树
聚类
机器学习
sklearn的使用案例(以load_breast_
cancer
数据集为例)
学习目标:sklearn的使用实例学习内容:1、sklearn的加载数据集2、划分数据集3、数据集的预处理4、归一化特征值学习产出:可执行代码(复制粘贴就可以运行)#@Author:xuXX#@Time:2020/12/31#@environment:python3.8#@Software:pycharm#@notes:scikit-learn的使用示例fromsklearn.datasetsim
Turing's Cat
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2020-12-31 22:26
笔记
机器学习
数据挖掘
python
python数据集获取与基本使用(sklearn自带的数据集、UCI数据集)
数据集介绍二、sklearn自带的小数据集sklearn自带数据集的常规使用鸢尾花数据集:load_iris():用于分类任务的数据集手写数字数据集load_digits()乳腺癌数据集load-barest-
cancer
何为xl
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2020-12-23 11:28
python数据分析
机器学习
数据挖掘
Single cell analysis inform mechanisms of myeloid target therapies in Colon
cancer
今天给大家分享一篇北京大学张泽民老师在2020年4月16号在cell上发表的单细胞的文章,题为SinglecellanalysisinformmechanismsofmyeloidtargettherapiesinColoncancerHighlights:1单细胞RNA-seq分析说明了在人类和小鼠的结直肠癌中存在保守的骨髓细胞子集。2两个完全不同的巨噬细胞显示了炎症和生成血管特性,各自。3两个
花生米yangyang
·
2020-11-27 16:43
python机器学习之随机森林案例——在乳腺癌数据的调参
在乳腺癌数据的调参首先导入所用到的库fromsklearn.datasetsimportload_breast_
cancer
#数据fromsklearn.ensembleimportRandomForestClassifier
黎明之道
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2020-11-26 19:22
机器学习
算法
python
机器学习
深度学习
随机森林
用RNA-SeQC得到表达矩阵RPKM值
尤其是TCGA计划里面的都是用它算的一、程序安装直接在官网下载java版本软件即可使用:http://www.broadinstitute.org/
cancer
/cga/tools/rnaseqc/RNA-SeQC_v1.1.8
生信技能树
·
2020-10-10 20:47
3月week3文献阅读1:Dynamics of breast-
cancer
relapse reveal late-recurring ER-positive genomic subgroup
3月week3文献阅读:Dynamicsofbreast-cancerrelapsereveallate-recurringER-positivegenomicsubgroup乳腺癌复发动态显示晚期复发的ER-阳性基因组亚群摘要:Theratesandroutesoflethalsystemicspreadinbreastcancerarepoorlyunderstoodowingtoalacko
凌桐_fc5c
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2020-10-09 20:46
特朗普打一针花掉230万,药品还包含脑白金?!一文为你解读懂王治疗方案
文|一节生姜FromCC周刊微信号:
cancer
-weekly核心提要1、10月4日,特朗普的健康发言人强调特朗普目前没有吸氧,呼吸没有问题,心脏及肾脏情况正常,亦可如常走动。
INSIGHT视界
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2020-10-05 00:00
老火煲汤为何被称为广东痛风高发的罪魁祸首?
本文来自微信公众号:CC周刊(ID:
cancer
-weekly),作者:云无心(食品工程专业博士),原文标题:《垃圾食品还是养生精华,老火煲汤为何被称为广东痛风高发祸首?》
虎嗅网
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2020-09-29 00:00
两针600元, 国内新冠疫苗定价出炉,全球疫苗中国价格排第几?
本文授权转载自微信公众号“CC周刊”(ID:
cancer
-weekly)文|张洪涛宾夕法尼亚大学医学院副教授核心提要1.国内两款新冠病毒灭活疫苗价格出炉,一针300元、两针600元。
凤凰财经
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2020-09-23 00:00
中国新冠疫苗两针600元,这价格在全球排第几?
本文来自微信公众号:CC周刊(ID:
cancer
-weekly),作者:张洪涛(宾夕法尼亚大学医学院副教授),原文标题:《两针600元,国内新冠疫苗定价出炉,全球疫苗中国价格排第几?》
虎嗅网
·
2020-09-23 00:00
python_数据_knn_分类_1
1startimportnumpyasnpimportpandasaspdfrompandasimportSeries,DataFrameimportmatplotlib.pyplotaspltfromsklearn.neighborsimportKNeighborsClassifier载入文件,查看一下
cancer
sinat_39045958
·
2020-09-16 23:22
classifier
knn
寻找U2OS中表达的基因及其promoter并用于后续annotation
方法1.RNA-seq得到不同表达程度基因方法2.直接downloadU2OS_gene.csvhttps://
cancer
.sanger.ac.uk/cell_lines/download最开始excel
weixin_34405557
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2020-09-15 12:55
XGBoost采用GridSearch调参
importxgboostasxgbfromsklearn.model_selectionimporttrain_test_splitfromsklearn.datasetsimportload_breast_cancerfromsklearn.model_selectionimportGridSearchCV
cancer
听海的石头
·
2020-09-15 04:15
机器学习
算法
用SimpleITK查看医学图像大小与通道数
/hamican/
cancer
/images_train/images/0
hamimelon2020
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2020-09-11 20:45
python
Oracle坏块修复处理实验
给数据库开启归档模式[oracle@
cancer
~]$sqlplus/assysdbaSQL*Plus:Release11.2.0.4.0ProductiononThuOct1517:09:402015Copyright
梓沐
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2020-09-10 23:48
Oracle
做肠镜活检确诊肠癌,揭日本首相安倍第二次辞职之谜
本文来自微信公众号:CC周刊(ID:
cancer
-weekly),作者:虞梦奇,头图来自:视觉中国一、做肠镜活检确诊肠癌,安倍今日正式宣布二次辞职日本首相安倍晋三计划在28日辞去首相职务,并表示不会设代理首相
虎嗅网
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2020-08-28 00:00
Keras 中数据不均衡时,metrics,class_weight的设置方法
www.deepideas.net/unbalanced-classes-machine-learning/主要从两个方面着手:一、loss函数的权重问题训练时,设置的权重:class_weight={1:n_non_
cancer
_samples
小北小白
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2020-08-26 15:23
《经济学人》精读44:
Cancer
is a curse, also a growth market for investors
ProgressindevelopingtreatmentsmakesoncologyresearchafavouritewithinvestorsFeb1st2018CANCERisagrimsortofgrowthmarket.By2030therewillbeover22mnewcasesayear,upfrom14min2012,accordingtotheInternationalAge
VictorLiNZ
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2020-08-25 08:01
sklearn--自带数据集(1)
sklearn.datasets.load_鸢尾花数据集:load_iris():用于分类任务的数据集手写数字数据集:load_digits():用于分类任务或者降维任务的数据集乳腺癌数据集load-barest-
cancer
晨钟暮鼓.安之若素
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2020-08-24 04:30
五、肿瘤全基因组学体细胞结构突变特征(Patterns of somatic structural variation in human
cancer
genomes)
原文链接共有16种特征性基因结构(SV)突变一、典型的结构突变(SV)剪切-粘贴式(左上):1.基因缺失,缺失片段(灰色)前后基因连接2.基因倒序,基因在原位置上首尾倒序(黄色)3.复制+倒序,基因扩增后,倒序(青色)接入原有基因(存在基因缺失-灰色)4.不平衡易位,两段均有缺失的基因相连接5.基因易位,两条基因断裂后,断段互换,接入另一条基因的断点串联重复(右上):一个或多个核苷酸前后相连接的重
dr_yingli
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2020-08-23 10:39
肿瘤全基因组学
《
Cancer
Metastasis Detection With Neural Conditional Random Field》简介
论文地址:https://arxiv.org/pdf/1806.07064.pdf代码地址:https://github.com/baidu-research/NCRF目的病理学家使用Whole-slideImages(WSIs)分析图中的正常细胞和瘤细胞,并定位病变位置。WSIs是一种超级大的图片(100000××200000像素),人工分析会很慢,而且多个病理学家的分析结果只有75.3%的结果
叫什么就是什么
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2020-08-22 13:08
笔记
Cancer
Metastasis DetectionWith Neural Conditional Random Field(NCRF)翻译
摘要:乳腺癌诊断通常需要准确检测癌症转移节点通过划窗整个图像(WSI)。深度卷积的最新进展(CNNs)已经在医学图像分析中显示出显着的成功,特别是在计算机组织病理学方面。由于WSI图像惊人的尺寸,大多数方法都是将一张图片切分成许多小图片并独立的对每个小图片分类(这点和巨型遥感图片类似)。然而,邻近的图片通常共享空间相关性,忽略这些图片的相关性可能会导致错误的预测。在本文中,我们提出了一种神经网络条
qq_22239093
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2020-08-22 13:02
论文翻译
文献【综述】Hallmarks of
Cancer
: The Next Generation 肿瘤的新十大特征
持续的增殖信号(激活增殖)1、体细胞突变激活下游通路Raf构象变化导致MAPK激活;PI3K催化亚基突变导致AKT/PKB激活;2、下调增殖的负反馈失灵Ras突变导致GTP活性下降,MAPK激活;PTEN缺失导致PIP3减少,PI3K激活;3、增值信号过强引起衰老RAS、MYC、RAF等蛋白过表达引起细胞增殖抑制,导致细胞衰老;逃避生长抑制(逃避抑制)1、抑癌基因缺失RB通路缺陷:持续增值p53基
Eric's blog
·
2020-08-21 08:55
癌症现状2018
(以下内容翻译自:www.
cancer
.org)根据美国癌症协会的年度统计报告,美国癌症死亡率在过去2年里稳步下降,其中2017年癌症死亡率下降了1.7%。
道德123
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2020-08-20 09:59
5. 机器学习实战之逻辑回归处理UCI乳腺癌数据集
1.UCIBreastCancer数据集的下载途径Kaggle平台https://www.kaggle.com/uciml/breast-
cancer
-wisconsin-dataUCIMachineLearningRepositoryhttps
坐看云起酱
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2020-08-20 08:49
机器学习
TCGA Barcode
Source:https://docs.gdc.
cancer
.gov/Encyclopedia/pages/TCGA_Barcode/DescriptionTheTCGAbarcodeistheprimaryidentifierofbiospecimendatawithintheTCGAproject.Acopyofthecontentformerlyfoundathttps
浩瀚之宇
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2020-08-20 01:21
数据的概括性度量
数据的概括性度量中所用到的相关知识点词汇:相关的代码实现:importpandasaspdimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltpath="D:\\数据\\wblc\\breast-
cancer
-wisconsin_data.csv"data
DD-Kylin
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2020-08-19 19:29
统计学系列
python pandas中替换数据replace方法
”)我用的方法是简单的importnumpyasnpimportrandomimportpandasaspdio=("/Users/macbook/Desktop/code/xuexi/pandas/
Cancer
_test.csv
愤怒的汽水
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2020-08-19 19:04
python
python
数据分析
人工智能
ACM:
Cancer
's Trial(1)
AMinistryforDefensesentageneraltoinspecttheSuperSecretMilitarySquadunderthecommandoftheColonelSuperDuper.Havinglearnedthenews,thecolonelorderedtoallnsquadsoldierstolineupontheparadeground.Bythemilitar
头秃+呵呵哒+螺旋爆炸
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2020-08-17 04:01
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