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dplyr
R语言【
dplyr
】——case_when()是一般向量化的 if-else(),该函数允许您将多个 if_else() 语句矢量化
Packagedplyrversion1.1.4Parameterscase_when(...,.default=NULL,.ptype=NULL,.size=NULL)参数【...】:一组两面公式(two-sidedformulas)。公式左边(lefthandside,LHS)决定了哪些值符合这种情况。公式右边(righthandside,RHS)提供了替换值。LHS输入的结果必须是逻辑向量。
ALittleHigh
·
2023-12-24 11:59
R语言
r语言
R语言【
dplyr
】——right_join(x, y)将y在x中找到的匹配项传回y
Packagedplyrversion1.1.4right_join(x,y,by=NULL,copy=FALSE,suffix=c(".x",".y"),...,keep=NULL)##S3methodforclass'data.frame'right_join(x,y,by=NULL,copy=FALSE,suffix=c(".x",".y"),...,keep=NULL,na_matches
ALittleHigh
·
2023-12-23 12:36
R语言
r语言
R语言【tidyselect】——all_of,专门在select函数中传递字符型向量,比如select(all_of(vars)),必须保证所有传入值都有用,否则报错
all_of()用于配合类似
dplyr
::select()的函数使用,以便达到在数据集中按照列名获取子集的效果。Examplelibrary(tidyverse)#Forb
ALittleHigh
·
2023-12-23 02:15
R语言
r语言
R语言【
dplyr
】——filter保留符合筛选条件的行,以数据的行为单位,创建子集
Packagedplyrversion1.1.4Parametersfilter(.data,...,.by=NULL,.preverse=FALSE)参数【.data】:一个数据集(dataframe),数据集扩展(比如:tibble),或者lazydataframes(比如:来自dbplyr或dtplyr)。参数【...】:数据过滤表达式(data-maskingexpression),返回的
ALittleHigh
·
2023-12-23 02:14
R语言
r语言
[13] 《R数据科学》使用
dplyr
进行数据转换
一般来说,如果你需要创建一些新变量或者摘要统计量,并且对变量进行重命名或者对观测值进行重新排序,以便数据更容易处理,那么可以用
dplyr
包来转换数据,并创建一个新的数据集。
灰常不错
·
2023-12-21 13:39
Seurat用自定义的 cell type 做差异表达
//Rcodemarkers%
dplyr
::glimpse()Formalclass‘Seurat’[package“SeuratObject”]with13slots…@assays:Listof1…
Janine_1991
·
2023-12-21 01:19
R
生物信息
r语言
分面中添加不同表格
教程library(ggpp)library(
dplyr
)library(tibble)数据介
庄闪闪
·
2023-12-17 16:38
R可视化
r语言
PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化
shpc_100828/Pyscenic/")#加载分析包library(SCopeLoomR)library(AUCell)library(SCENIC)#可视化相关包,多加载点没毛病library(
dplyr
KS科研分享与服务
·
2023-12-17 00:23
如何解决报错信息:Error in UseMethod(“filter_”) 在使用
dplyr
包的filter() 时候
报错信息如下:ErrorinUseMethod("filter_"):noapplicablemethodfor'filter_'appliedtoanobjectofclass"character"Calls:%>%...freduce->->filter->filter.default->filter_Inaddition:Warningmessage:`filter_()`isdepreca
土豆西红柿青椒
·
2023-12-16 21:33
报错
生物信息学
《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 6
这次介绍的是10XGenomics的数据分析数据读取#构建Seurat对象library(Seurat)library(
dplyr
)#读取PeripheralBloodMononuclearCells(
小潤澤
·
2023-12-16 19:44
利用ggplot绘制密度散点图(同时附带spearman的R和P值)
正式操作首先,加载一些必须的包library(ggplot2)library(
dplyr
)library(viridis)#使用viridis提供的翠
Kevin_Hhui
·
2023-12-14 15:49
R语言学习----
dplyr
包中的join系列函数学习
1.
dplyr
包介绍对于数据分析工作者来说,前期数据的清洗、处理及变换等占据了整个工作流程一大半的时间。因此,为了提高工作效率,R语言包
dplyr
应运而生。
bcl_hx
·
2023-12-02 05:05
R语言中重命名数据框(dataframe)的列名
R语言提供了多种方法来重命名数据框的列名,包括使用基本的向量赋值方法、
dplyr
包中的rename()函数和data.table包中的setnames()函数。
程序设计创梦引领者
·
2023-12-02 00:13
r语言
python
开发语言
R语言
ggplot2绘制PCA图(1)
12个组,每组3个重复,一共36个样品的主成分分析图1、导入包和数据处理library(tidyr)library(
dplyr
)library(ggplot2)data_odata_oS1S2S3S4S5S6S7M17.395760e
Zhigang_Han
·
2023-11-30 16:35
R语言:利用rhdf5包分别创建单组学,多组学.h5文件
最近在跑的方法需要.h5作为输入文件,就学习了一下怎么创建.h5文件,原有数据结构如下:生成单组学.h5文件的代码如下:library(rhdf5)library(
dplyr
)library(patchwork
hyena_7
·
2023-11-30 08:04
R
数据分析
r语言
生物信息
南丁格尔玫瑰图
1.加载包library(
dplyr
)library(ggplot2)2.生成数据set.seed(1234)temp0=data.frame(city=LETTERS[1:26],patients=round
R语言与SPSS学习笔记
·
2023-11-29 15:00
一行命令批量修改染色体和位置为RS号
假定数据是test.txt,内容如下:现在希望根据第一列chr:pos找到对应的RS号,实现以下的效果:则可以用
dplyr
::left_join参数,具体实现过程如下所示:install.packages
橙子牛奶糖
·
2023-11-27 00:18
GWAS
QTL
生物信息学
GWAS
全基因组关联分析
计算生物学
r语言
R语言之数据清洗与准备
library(funModeling)#探索性数据分析工具包,本节内容中将会使用到它的status()函数,打印整体数据质量library(tidyverse)#数据转化工具包,本节内容中将会使用它包含的
dplyr
侍伟
·
2023-11-26 12:00
r语言
单细胞多样本整合之harmony
GSE1175701.下载和读取数据rm(list=ls())library(stringr)library(Seurat)library(
dplyr
)f=dir("GSE117570_RAW/");f
小洁忘了怎么分身
·
2023-11-24 09:46
R语言常用的数据分析包
dplyr
:数据处理和转换
dplyr
是一个流行的数据处理包,提供了一组简洁而强大的函数,用于对数据进行筛选、排序、汇总和变换。它使用直观的语法,使数据操作变得简单易懂。
领域征途探险
·
2023-11-23 07:21
r语言
数据分析
开发语言
R语言
R语言报错:could not find function “last“
跑DLCAnalyzer代码的时候,出现了报错:couldnotfindfunction“last”解决方法:需要安装包
dplyr
并且把它导入install.packages("
dplyr
")library
煦煦向前
·
2023-11-23 04:28
r语言
开发语言
使用R语言删除数据框(dataframe)中的列
下面将介绍三种常用的方法:使用索引、使用列名和使用
dplyr
包。方法一:使用索引我们可以使用列的索引来删除数据框中的列。
前端设计家
·
2023-11-21 13:20
r语言
开发语言
R语言
学习笔记Day7 by康康
Day7学习R包.png一些辅助学习的网站R与tidyverse——数据分析入门使用
dplyr
管道操作处理数据框《R数据科学》使用
dplyr
进行数据转换
ReneeeeKKKK
·
2023-11-21 05:09
DAY6--如晤
学习R包,以
dplyr
为例1.配置镜像你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗?
如晤_ea28
·
2023-11-20 11:15
【R】基础语法
vector矩阵matrix列表数据框因子factor缺失数据字符串日期和时间获取数据读入文件写入文件读写Excel文件读写R格式文件数据转换数据转换-reshape2包数据转换-tidyr包数据转换-
dplyr
Cqw、
·
2023-11-19 16:20
r语言
随机森林算法(Random Forest)的二分类问题
二分类问题1.数据导入2.RF模型构建2.1调参:mtry和ntree2.2运行模型3.模型测试4.绘制混淆矩阵5.绘制ROC曲线6.参考1.数据导入library(
dplyr
)#数据处理使用library
Amyniez
·
2023-11-19 11:15
R语言
1024程序员节
随机森林
分类
机器学习
算法
经验分享
人工智能
dplyr
::bind_rows整合多个数据框
高效的整合多个数据框在base包中可以通过cbind,rbind按行或列连接数据框,这个我们不多解释了
dplyr
中有更高级的函数bind_rows,bind_cols,能用于高效的连接多个数据框其实这套高级函数是
医科研
·
2023-11-19 01:15
13 对发生拷贝数变异的基因进行 KEGG 注释
我们同样用VEP注释后的maf文件,然后取出需要用到的几列rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)library(
dplyr
)library(stringr)#读入数据
正在输入中…………
·
2023-11-16 11:28
生信
使用R语言提取DataFrame数据中指定列和多行位置的数据
首先,我们需要确保已经加载了所需的数据包(如
dplyr
或tidyverse),以便使用DataFrame和相关函数。接下来,我们可以使用操作符和c函数来提取数据。以下
HackDyno
·
2023-11-10 16:38
r语言
开发语言
R语言
dataframe安装某种标准过滤行
dplyr
gsub filter slice grep str_detect
x%filter(grepl('Guard|Forward',player))playerpointsrebounds1PGuard1252SGuard1573SForward1974PForward2212#filteroutrowsthatcontain'Guard'intheplayercolumndf%>%filter(!grepl('Guard',player))playerpoints
生信小博士
·
2023-11-06 10:39
java
前端
服务器
识别并删除R中的重复数据
您将学习如何使用以下Rbase和
dplyr
函数:1)R基础函数duplicated():用于标识重复的元素和unique():用于提取唯一元素,2)distinct()[dplyrpackage]删除数据框中的重复行
小白_加油
·
2023-11-05 00:45
readxmls r语言_R语言 | 数据操作
dplyr
包
[更新~]Python网络爬虫与文本数据分析公众号只带着Python字眼,却分享着R语言,不务正业,任性了~
dplyr
简介
dplyr
是R语言的数据分析包,很像python中的pandas,能对dataframe
weixin_39633807
·
2023-11-04 09:04
readxmls
r语言
seurat提取表达矩阵_Seurat
library(
dplyr
)library(Seurat)#10X的数据可以使用Read10X这个函数,会返回一个UMIcount矩阵,其中的每个值表示每个基因(行)在每个细胞(列)的分子数量pbmc.data
weixin_39628551
·
2023-11-03 01:48
seurat提取表达矩阵
6_ggplot可视化addmodule得到的炎症评分自己选择颜色 自定义更改显示的颜色 seurat得到的单细胞数据
(ggplot2)library(ggalluvial)library(svglite)library(Seurat)library(openxlsx)library(harmony)library(
dplyr
生信小博士
·
2023-11-03 01:15
笔记
python
seurat
r语言
r
addmodule
R语言也有管道符%>%
%>%来自
dplyr
包的管道函数,其作用是将前一步的结果直接传参给下一步的函数,从而省略了中间的赋值步骤,可以大量减少内存中的对象,节省内存。
香波地海
·
2023-11-01 09:43
【R画图学习2.2】火山图-ggplot篇
library(ggplot2)library(
dplyr
)library(ggrepel)data=0.5&data$pvalue%通道符来实现。
jjjscuedu
·
2023-11-01 07:15
2021-09-30-day6-重点是
今天的作业是学习R包,以
dplyr
为例子。我昨天已经学习了
dplyr
的部分功能,今天就前两天搜集到的关于SRA数据的下载方式。
重点是
·
2023-10-25 11:44
R操作符——%in%
实际在
dplyr
中的应用:library(
dplyr
)#将cyl向量值去匹配c(4,6),并将符合要求的行提取出来,重新生成一个新的data.fram。
lxmic
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2023-10-24 02:32
[24] 《R数据科学》EDA缺失值
将带有可疑值的行全部丢弃:library(
dplyr
)library(ggplot2)diamonds2%filter(between(y,3,20))但并不建议采用这种方式,因为一个无效测量不代表所有测量都是无效的
灰常不错
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2023-10-23 08:56
学习小组Day6 ---小陈
*包的使用一通百通(以
dplyr
为例学习R包)*R平台细节:*Rversion4.0.3(2020-10-10)*Platform:x8
shine_9457
·
2023-10-20 03:07
GEO数据挖掘之使用clusterProfiler进行GO/KEGG富集分析
library(clusterProfiler)>library(
dplyr
)>library(ggplot2)>library(stringr)Warningmessage:程辑包‘stringr’是用
Seurat_
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2023-10-15 06:12
TCGA下载数据(药物信息)步骤-2022-01-10
获取临床信息cancer_type="TCGA-LIHC"clinical%as.data.frame()View(tcga_expr[1:10,])#更换基因名字tcga_expr$Ensembl_ID%
dplyr
小白兔和小毛驴
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2023-10-09 09:28
2022-01-17 cellmarker注释
细胞类型自动化注释#数据来源:http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/download.jsplibrary(
dplyr
)library(openxlsx)####1.
徐添添
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2023-10-08 18:57
Data Transformation with
dplyr
: : CHEAT SHEET
QQ图片20190420181407.pngQQ图片20190420181552.pngQQ图片20190420181642.png
迪瑟洛克
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2023-10-07 11:16
ggplot误差棒添加
RGraphicsCookbook》本文针对ggplot2添加误差棒的一种方法:使用geom_errorbar()语法library(ggplot2)library(gcookbook)library(
dplyr
ChrisJO
·
2023-10-05 13:52
【R】常用的包
软件包“
dplyr
”包含许多主要使用的数据操作功能,例如应用过滤器,选择特定列,排序数据,添加或删除列以及聚合数据。这个包的另一个最重要的优点是学习和使用
dplyr
函数非常容易。
南谛走心
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2023-10-03 14:53
学习小组Day6笔记--郭晶晶
我们可以通过精学一部分,一通百通,花花和小泽老师以
dplyr
为例,讲了一下R包,对于安装和加载R包我总结下:1.镜像设置:我用的是推荐的高级模式:a.首先用file.edit()来编辑文件:file.edit
GJJDr
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2023-10-01 03:21
R中选择数据框的行
在本教程中,您将从
dplyr
包中学习以下R函数:slice():按位置提取行filter():提取满足特定逻辑条件的行。
小白_加油
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2023-09-28 00:40
59-R语言分析QQ群聊天记录
1、读取并整理数据>library(pacman)>p_load(
dplyr
,stringr)>>dtsep="\n",encoding="UTF-8",>header=F,blank.lines.skip
wonphen
·
2023-09-25 20:22
R-ggpmisc|回归曲线添加回归方程,R2,方差表,香不香?
一载入数据和R包使用内置数据集library(ggplot2)#加载ggplot2包library(
dplyr
)#加载
dplyr
包library(ggpm
生信补给站
·
2023-09-22 18:02
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