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dplyr
学习小组Day1笔记——The Catcher
这是一级标题这是二级标题这是三级标题这是四级标题这是五级标题字体italic这是斜体这也是斜体这是加粗这是斜体加粗加删除线的文字插入链接与图片visitGithubMarkdown官方tutorial这是R数据科学
dplyr
The_Catcher
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2023-02-07 06:43
非模式生物富集分析实践-创建OrgDb包
非模式生物富集分析文章目录非模式生物富集分析非模式菌株搜索方法创建OrgDb包GO富集分析KEGG富集分析非模式菌株搜索方法library("AnnotationHub")require("AnnotationHub")hub%
dplyr
黑曜、
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2023-02-06 09:47
R语言
生物学
生物信息学
r语言
R语言用列数据画PCA带椭圆图
先放个原数据格式:imageimagelibrary("FactoMineR")library("factoextra")library("
dplyr
")data=read.csv("G:/TPT
Seurat_Satija
·
2023-02-06 03:57
R tidyverse 学习
Tidyverse是一系列优秀R包的合集,其中最常用的7个package包括ggplot2/tibble/tidyr/readr/purrr/
dplyr
/stringr/forcat。
生信小白2018
·
2023-02-05 20:53
将列的元素按类别合并成一行
想要的结果如下代码:library(data.table),library(stringr),library(
dplyr
)tb%group_by(name)%>%summarise(score=paste
重新开始_xy
·
2023-02-05 19:45
2020-10-14 入门小组DAY6-三三
学习R包——以
dplyr
为例R包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。学生信,R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
草莓桃桃茶
·
2023-02-03 12:15
2
数据来源:联合国人口数据库过程:使用R语言、调用ggplot2、animation、
dplyr
、tidyr、xlsx、ggthemes难点:1.数据来源,联合国数据每年的数据没有按照性别分布的,只有每五年数据有分男女性别
让我猜猜有人偷了你的甜甜圈
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2023-02-03 04:22
2021-09-28-day5-重点是
作业五-数据结构以小洁的教程为材料学习了
dplyr
包:小洁-生信星球先使用Rstudio的markdown进行整理,最后粘贴到这里title:"dplyer"author:"thepointis"date
重点是
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2023-02-03 04:34
使用
dplyr
处理数据示例1
dplyr
提供的数据处理方式非常直观且强大,不仅可以处理单个列,也可以同时处理多列或多行。本文通过一个简单示例进行对比不同方式实现,从而让读者体会
dplyr
简单、强大的处理方式。
梦想画家
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2023-02-02 15:57
R语言
r语言
scale
mutate_each
数据处理-5(基于R语言)
ink2,by="id",all=T)#所有数据列都放进来,空缺的补值为NAmerge(ink1,ink2,by="id",all=F)#默认,只取两者的共有的部分runif(n,min=0,max=1)
dplyr
北欧森林
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2023-01-29 20:19
R_柱状图(加误差线,显著性差异)
bar_plot2021/01/19#导入所需的包library(ggplot2)library(ggthemr)library(ggsignif)library(tidyverse)library(
dplyr
奔跑的Forrest
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2023-01-26 22:51
R语言做生存分析
首先我们就是加载要用到的R语言包library(survival)library(survminer)library(
dplyr
)然后我们可以基本先浏览一下数据data(ovarian)glimpse(
Mrrunsen
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2023-01-12 23:22
R语言大学作业
r语言
R语言|
dplyr
()函数(一) ———R语言数据处理系列(一)
dplyr
函数进行数据转换筛选知识铺垫比较运算符逻辑运算符数据准备filter()函数筛选行select()函数筛选列arrange()函数排列行完整代码
dplyr
()函数是R语言数据分析必学的实用包之一
铭记yu心
·
2023-01-09 13:25
R语言——知识星球
数据分析
数据分析
r语言
统计学
R 语言 安装DESeq2,
dplyr
包遇到报错的彻底解决方案
一、问题今天想使用R重新对数据进行差异表达分析,在安装DESeq2的时侯,遇到下面的报错:Error:packageornamespaceloadfailedfor‘GenomeInfoDb’inloadNamespace(j<-i[[1L]],c(lib.loc,.libPaths()),versionCheck=vI[[j]]):不存在叫‘RCurl’这个名字的程辑包library(DESeq
weixin_42083461
·
2023-01-09 13:55
后端
R语言(八)
dplyr
扩展包常用函数介绍与应用
本次介绍的是R语言中非常流行的数据处理包
dplyr
,它主要聚焦于tibble型的数据结构,此结构是对数据框dataframe的重构,在呈现大型数据集时非常友好,具体表现为:附带数据行数和列数,每列数据类型
皖渝
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2023-01-09 13:24
R语言
R
R语言进阶
数据处理
dplyr
R语言中的
dplyr
包
介绍
dplyr
是一个常用的用于数据清洗的R包,其中主要的函数有:select()从数据中选择列filter()数据行的子集group_by()汇总数据summarise()汇总数据(计算汇总统计信息)arrange
zoujiahui_2018
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2023-01-09 13:22
R
r语言
开发语言
【R语言】
dplyr
包
出处:AI入门学习
dplyr
包主要用于数据清洗和整理,主要功能有:行选择、列选择、统计汇总、窗口函数、数据框交集等是非常高效、友好的数据处理包,学清楚了,基本上数据能随意玩弄,对的,随意玩弄,简直大大提高数据处理及分析效率
大火收汁
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2023-01-09 13:52
R语言
r语言
dplyr
包概述
dplyr
包是将原本plyr包中的ddply()等函数进一步分离强化,专注接受dataframe对象,大幅提高了速度,并且提供了更稳健的与其它数据库对象间的接口.0.1.安装install.packages
lanfengchalan
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2023-01-09 13:51
R
dplyr包
R
dplyr包
R语言---下载R包提示00LOCK-
dplyr
解决
R语言—下载R包提示00LOCK-
dplyr
解决1.遇到问题(R版本3.5.1)在使用其他软件的时候会调用R包
dplyr
,当时提示这个软件包版本不够,会影响其他软件的使用。
我是大南瓜
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2023-01-09 13:21
R语言
r语言
开发语言
R语言
dplyr
入门到进阶
文章目录
dplyr
介绍安装数据集:starwars针对单个数据集的操作filter()根据条件筛选行arrange()进行排序slice()根据位置选择行select()选择列mutate()新建列relocate
医学和生信笔记
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2023-01-09 13:20
数据分析
r语言
R语言
dplyr
包
R语言之
dplyr
包1.使用filter()筛选行2.使用arrange()排列行3.使用select()选择列4.使用mutate()添加新变量本文将介绍如何使用tidyverse中的另一个核心R包—
hence..
·
2023-01-09 13:50
R语言数据分析
r语言
数据挖掘
开发语言
【R语言】报错解析:
dplyr
::group_by 后只显示一条记录,实际应多条记录的报错解析
今天遇到个函数失效问题,特地记录下:先上语句library("
dplyr
")zy1=mtcars%>%group_by(cyl)%>%summarise(sum=sum(mpg))zy1正常应该显示如图
看海的四叔
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2022-12-14 11:14
R语言学习
r语言
数据库
Seurat PBMC教程理解分享
1.读取数据library(
dplyr
)library(Seurat)library(patchwork)#LoadthePBMCdatasetpbmc.data<-Read10X(data.dir="
自认是大佬眼中level1的菜鸟
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2022-12-07 04:01
seurat
[R]_使用filter_all(),filter_at(),filter_if()筛选数据框的行
使用过R,尤其是其中
dplyr
包的同学,对filter()这个函数不会陌生,filter_all(),filter_at(),filter_if()其实属于filter()更高级的用法,可以更
吃过了没
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2022-12-06 00:55
前端
大数据
r语言
sql
R语言计算累积平均值(Cumulative Average)、使用
dplyr
包的cummean函数计算data.frame指定数据列的累积平均值、并添加累积平均值数据列
R语言计算累积平均值(CumulativeAverage)、使用
dplyr
包的cummean函数计算data.frame指定数据列的累积平均值、并添加累积平均值数据列目录
statistics.insight
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2022-12-05 22:50
R语言入门课
r语言
人工智能
数据分析
数据挖掘
机器学习
R语言医学数据分析实战(二)数据框的操作
文章目录一、用基本包处理数据框1)查看数据框里的内容2)选取数据框的子集3)将数据框按照某个变量的值排序4)查看和删除重复数据5)在数据框中添加和删除变量6)把数据框添加到搜索路径二、使用
dplyr
包处理数据框
努力学编程的Skye
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2022-12-05 17:53
R语言从入门到放弃
r语言
数据分析
开发语言
R语言进行随机抽样、分层抽样和系统抽样
原始抽样框如下,分别存放与excel不同的sheet中:代码部分:library(readxl)library(
dplyr
)library(sampling)dt%data.frame(
寻小宁
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2022-12-05 11:49
R数据处理
r语言
R语言随机抽样及分层抽样
了吗,没错点它[哈哈]问题>dim(ml_data)[1]20125311场景:20万行数据中,抽取每个月中的任意一天的数据,即,2019-9-6/2019-9-7/2019-9-8…1、计算层次个数
dplyr
小Li先生
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2022-12-05 11:46
数据整理
R语言学习
数据分析
r语言
随机取样
分层随机抽取
R语言数据统计分析与ggplot2高级绘图
一、R语言简介与数据管理1.1R语言介绍1.2R包安装1.3R数据读取与重构1.4
dplyr
包与数据编辑二、试验设计与数据分析2.1试验设计简介2.2RCB设计2.3BIB设计2.4.正交设计2.5析因设计三
zmjia111
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2022-11-26 17:54
机器学习
可视化
R语言
r语言
开发语言
回归
开源软件
深度学习
PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化
shpc_100828/Pyscenic/")#加载分析包library(SCopeLoomR)library(AUCell)library(SCENIC)#可视化相关包,多加载点没毛病library(
dplyr
TS的美梦
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2022-11-26 13:21
r语言
数据分析
单细胞
转录因子
pyscenic
单细胞测序的入门操作
barcode2.features里面包含了基因的特征,ensembleid以及与之相对应的symleid3.matrix里每个细胞基因所对应的count数library(SingleR)library(
dplyr
yuxiang&chenxi
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2022-11-25 00:15
数据库
数据挖掘
r语言
R语言综合数据处理习题分享
内容简介:本文主要聚焦于R语言中tidyverse、
dplyr
、ggplot2、stringr等包进行数据处理及可视化的应用目录习题一:探索nycflights13数据集习题二:探索diamonds数据集习题三
皖渝
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2022-11-23 02:37
R语言
R语言
ggplot
数据处理
可视化
单细胞基础分析 | 对细胞按照基因marker进行分型(ACC脑区)
参考链接:https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html1、加载分析必须的包library(Seurat)library(
dplyr
今天也是个妖精头子呀
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2022-11-21 07:59
生物信息学基础分析
r语言
数据挖掘
机器学习
anaconda配置R详细记录
individual下载MACOS版本安装之后界面如下下一步配置新的运行环境然后在新配置的环境中用MAC的terminal打开终端打开终端后倒入包安装Rpackages命令如下condainstall-crr-
dplyr
JamesFifth
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2022-11-19 20:11
小知识
python
mac
anaconda
linux
r语言
数据处理包
dplyr
的函数
dplyr
专注处理dataframe对象,并提供更稳健的与其它数据库对象间的接口。
weixin_30871293
·
2022-11-18 04:39
数据库
r语言
R语言
dplyr
包summarise_at函数计算dataframe数据中多个数据列(通过向量指定)的方差(使用.符号和~符号指定函数语法purr)
R语言
dplyr
包summarise_at函数计算dataframe数据中多个数据列(通过向量指定)的方差(使用.符号和~符号指定函数语法purr)目录
statistics.insight
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2022-11-18 04:15
R语言入门课
r语言
数据挖掘
人工智能
数据分析
car | 线性回归(三)——残差分析和异常点检验
初始模型如下:library(car)library(
dplyr
)DATA % head()## Mazda RX4 Mazda RX4 Wag Datsun
R语言学堂
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2022-11-01 19:23
python
数据分析
人工智能
机器学习
可视化
R语言中的管道符%>%
%>%:来自
dplyr
包的管道函数,我们可以将其理解为车间里的流水线,经过前一步加工的产品才能进入后一步进一步加工,其作用是将前一步的结果直接传参给下一步的函数,从而省略了中间的赋值步骤,可以大量减少内存中的对象
BINBINCC
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2022-10-31 09:04
【包】seurat-1 细胞分类
GuidedClusteringTutorialRead10X读来自10X的数据,读出来是行为特征,列为细胞的矩阵CreateSeuratObject构建seurat对象,用于后续分析(稀疏矩阵、节省空间)library(
dplyr
JamesMori
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2022-10-30 11:47
R语言基础5--tidyr包的函数及用法
R语言基础系列:R语言基础1--R数据格式:.rds和.rda的区别R语言基础2--数据排序与长宽型数据的转换R语言基础3--tidyverse包总结R语言基础4--
dplyr
包的函数及用法tidyr包的应用
Hayley笔记
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2022-10-08 16:45
R语言基础6--apply函数家族及其应用
R语言基础系列:R语言基础1--R数据格式:.rds和.rda的区别R语言基础2--数据排序与长宽型数据的转换R语言基础3--tidyverse包总结R语言基础4--
dplyr
包的函数及用法R语言基础5
Hayley笔记
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2022-10-08 16:41
R语言基础9--字符串的处理(初步处理+stringr&stringi)
R语言基础系列:R语言基础1--R数据格式:.rds和.rda的区别R语言基础2--数据排序与长宽型数据的转换R语言基础3--tidyverse包总结R语言基础4--
dplyr
包的函数及用法R语言基础5
Hayley笔记
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2022-10-08 16:28
R 语言 安装DESeq2,
dplyr
包遇到报错的彻底解决方案
一、问题今天想使用R重新对数据进行差异表达分析,在安装DESeq2的时侯,遇到下面的报错:*Error:packageornamespaceloadfailedfor‘GenomeInfoDb’inloadNamespace(j<-i[[1L]],c(lib.loc,.libPaths()),versionCheck=vI[[j]]):不存在叫‘RCurl’这个名字的程辑包*library(DES
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2022-10-05 13:03
后端
TCGAbiolinks整理表达数据和临床数据
stringsAsFactors=F)gc()library(TCGAbiolinks)library(scRNAseq)library(data.table)library(limma)library(
dplyr
sayhello1025
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2022-09-13 18:31
TCGA
r语言
开发语言
TCGAbiolinks 下载临床数据
自己安装这个R包TCGAbiolinks点进去安装,下面直接代码library(TCGAbiolinks)library(
dplyr
)library(DT)library(SummarizedExperiment
sayhello1025
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2022-09-13 18:01
TCGA
R语言入门: %>%
本期主要内容是介绍上次预告的中缀函数%>%,该函数封装于"
dplyr
"包中。同时剧透下一期内容为有同学点播要求学习的reshape2包中的melt()函数和cast()函数。
Mrrunsen
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2022-09-07 09:27
R语言
r语言
linq
开发语言
R数据科学整洁之道:使用
dplyr
处理关系数据
忘了vlookup吧,我劝你用
dplyr
处理关系数据。工作中经常有这样的需求,将两张表根据某些列合并起来。有人喜欢用Excel的vlookup函数来处理。
简佐义的博客
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2022-07-18 11:22
python
数据库
人工智能
java
编程语言
DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图
ggplot2优化Seurat绘图scRNAseq灵活的点图绘制:FlexDotPlot富集分析结果雷达图1.使用DoHeatmap绘制Seurat自带热图library(Seurat)library(
dplyr
Hayley笔记
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2022-07-01 10:05
r语言实现岭回归_78-预测分析-R语言实现-岭回归与LASSO回归
>library(pacman)>p_load(
dplyr
,readr,caret)以上一节中未去除离群值的MSE为3619.029,修正R2为0.8603和去除离群值后的MSE为2690.545,修正
叶子粟
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2022-05-23 07:17
r语言实现岭回归
利用ggplot2画发文章级别的TSNE图
直接上代码:1.安装程序包,读取数据package.list=c("ggplot2","pals","
dplyr
")for(packageinpackage.list){if(!
沉迷工作的我
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2022-05-21 21:37
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