nii

python 读取.nii格式图像实例

我就废话不多说了，大家还是直接看代码吧~#encoding=utf8'''查看和显示nii文件'''importmatplotlibmatplotlib.use('TkAgg')frommatplotlibimportpylabaspltimportnibabelasnibfromnibabelimportnifti1fromnibabel.viewersimportOrthoSlicer3Dex
·2020-07-01 12:03

matlab 读取nii格式的医学影像CT数据

请移步修改版本：matlab,python读取nii格式的医学影像CT数据-最近想用LiTS-LiverTumorSegmentationChallenge的数据集做些事情，下载数据后发现是nii格式的
悟空宝宝真帅·2020-07-01 04:04

nii图像保存成png格式（Ubuntu+python）

这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。
无宠不惊过一生·2020-06-29 08:03

读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像

读取nii或者nii.gz文件中的信息，并且输出图像。
无宠不惊过一生·2020-06-29 08:03

批量nii文件转换成png格式（用于处理胰腺数据）

这篇博客代码在胰腺数据中可以用，但是用于ADNI数据保存的图像都是噪声，不能用。下面的链接是用于ADNI数据集的代码，个人觉得还是下面链接中的代码稍微好用些，因为不会报错：https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89576759fromPILimportImageimportnumpyasnpimportosimportnibab
无宠不惊过一生·2020-06-29 08:03

深度学习模型的数据读取(python+torch.utils.data.Dataset)

在这之前已经将BraTS2018的nii格式文件保存为png格式：https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89576759下面的代码是我最近写
无宠不惊过一生·2020-06-29 08:03

批量nii文件转换为png图像

之前介绍过单个nii文件转换成png图像：https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89501865这里介绍将多个nii文件（保存在一个文件夹下
无宠不惊过一生·2020-06-29 08:03

SimpleITK读取医学图像 .nii 数据（2D显示）

【环境】win10+python3.6+SimpleITKnii文件是NIFTI格式的文件，出现的原因是原来一种图像格式是ANALYZE7.5format，但是这个图像格式缺少一些信息，比如没有方向信息，病人的左右方位等，如果需要包括额外的信息，就需要一个额外的文件，比如ANALYZE7.5就需要一对文件来保存图像的完整信息。因此，解决这个问题DataFormatWorkingGroup(DFWG
猴毛与叫喊·2020-06-29 00:45

网络安全信息与动态周报 2010年12 期

#*#jixo安徽省安庆市&N+`O)$地市级nII#uI/!qhttp://fgw.ahhfly.gov.cn/hex.htm,w9|?%S安徽省合肥市Aho*E9VW地市级/eXiWasQhtt
weixin_33874713·2020-06-28 07:09

基于区域生长的图像分割 matlab 源码

基于区域生长的图像分割算法clear；clcglobalRBWcounterrowcol%读取图像，初始G用于保存分割后的文件nii=load_nii('a00d15.nii');a=nii.img;G
田问渠Carlnait·2020-06-26 11:17

在matlab 2017b 中显示与保存nii图像

一、显示nii图像ToolsforNIfTI(ANALYZE)MRimage下载地址：http://www.rotman-baycrest.on.ca/~jimmy/NIFTI/下载后将文件解压后放到matlab
一位初学者·2020-06-26 01:06

使用SimpleITK读取和保存Nii.gz文件

/nifti.nii.gz')img=sitk.GetArrayFromImage(itk_img)print("imgshape:",img.shape)##saveout=sitk.GetImageFromArray
Wisley.Wang·2020-06-25 02:56

python处理nii文件

可以使用命令：pipinstallnibabel之后：fromnibabel.viewersimportOrthoSlicer3Dasosdimportnibabelasnibfilename='image.nii'img
回忆瞬间·2020-06-24 08:00

Spm12 入门教程

每个NIfTI格式的图像是一个扩展名为“.nii”的文件。“.nii”文件包括：-一个包含图像中所有数据的位图；-一个将位图套入3D坐标体系的变换矩阵（称为仿射变换：如旋转，平移，缩放和/或裁剪）。
小小脸庞·2020-06-21 22:34

Pytorch 使用 nii数据做输入数据的操作

使用pix2pix-gan做医学图像合成的时候，如果把nii数据转成png格式会损失很多信息，以为png格式图像的灰度值有256阶，因此直接使用nii的医学图像做输入会更好一点。
·2020-05-26 18:02

使用bet2工具进行颅骨去除操作

使用FSL下的bet2工具$bet2[options]$bet2T1.nii.gzskull_brain.nii.gz-f0.15使用linux下parallel操作,并行去除颅骨操作parallel-
reallocing·2020-04-13 19:23

JSON WEB TOKEN (JWT)

有三部分组成，他们之间用.分隔，这三部分分别是Header、Payload、Signature，结构如下Header.Payload.Signature在jwt.io给予的实例eyJhbGciOiJIUzI1NiI
WindrunnerMax·2020-04-08 12:00

【方谈美国】迈克尔·尼尔森：“未来全球领袖”

1991年戈尔推动史称“戈尔法案”的“高性能计算法案”，后来演变成为影响全球的信息高速公路（NII）倡议，成为90年底推动互联网商业化和全球化的最重要理念。
62474c0b60b9·2020-03-27 12:23

怎样打开并查看.nii和DICOM格式的医学图像

本文主要介绍在医学图像处理领域，常见的两种医学图像格式.nii和DICOM文件怎么查看。
棉花糖灬·2020-03-17 20:15

SNH48 TEAM NII新公演《以爱之名》首演 完美诠释爱的五部曲

10月7日，SNH48TEAMNII全新原创公演《以爱之名》迎来浪漫首演，整场公演紧紧围绕永恒的主题“爱”展开，这一次，美少女们用精彩纷呈的演出引领粉丝尽情感悟爱的五部曲：从憧憬爱情到体会爱的百态，再到爱到深处迷失自我、难以忘怀，到最终一别两宽彻底释怀。激励每个人“去爱吧！”随着overture响起，《以爱之名》公演正式拉开序幕。TEAMNII成员身着嫩粉色校园风裙装元气登场，热情饱满的献唱激励人
SNH48·2020-03-01 08:29

SNH48星梦剧院生日公演回顾：冯薪朵TEAM NII队魂般的存在

7月8日，SNH48TEAMNII的队长冯薪朵迎来了自己的生日公演，TEAMNII大家庭与喜爱冯薪朵的粉丝齐聚星梦剧院为朵朵庆生。当天的生日公演气氛感人而热烈，很多粉丝远道而来，星梦剧院座无虚席。当天冯薪朵精心准备，为所有粉丝奉上了最具诚意的精彩表演。Unit曲环节，冯薪朵搭档赵粤、陈问言为大家带来一首经典的《Don'ttouch》，眼神迷离，动作妩媚，充满诱惑；生日公演特别环节，冯薪朵自弹自唱，
SNH48·2020-02-26 09:17

使用SimpleITK进行nii 数据处理 2019-11-15

【SimpleITK】胸部CT数据3Dspace归一化，以及3Dplot1.读取文件读取DICOM序列医学图像中一个CT序列包含很多张图片，即一个case包含许多slice，使用SimpleITK可以直接读取一个序列，并方便地得到各种参数，将图像数据转换成numpyArray：importSimpleITKassitkimportnumpyasnpreader=sitk.ImageSeriesRe
一只大南瓜·2020-01-07 23:19

把.nii文件转为.nii.gz格式

image.pnggzip('niftifilename.nii')%thiswillreturnniftifilename.nii.gzgzip('*.nii')%formultipleniifilestocreateone.nii.gzReference
Galory·2020-01-06 22:02

matlab,python读取nii格式的医学影像CT数据

最近想用LiTS-LiverTumorSegmentationChallenge的数据集做些事情，下载数据后发现是nii格式的，使用imageJ可以直接读取并且显示还可以进行3D渲染，但是要做处理的话还是需要用
悟空宝宝真帅·2020-01-06 06:11

修改dcm2nii.ini的默认配置来控制影像数据格式转换

关于dcm2nii软件格式转换的配置文件说明可以参照这个网页，很详细，https://people.cas.sc.edu/rorden/mricron/dcm2nii.html我的问题也很简单，在对DTI
Galory·2019-12-24 07:55

Market Risk Modeling

MarketRiskModelingMarketRiskinterest-raterisksequityrisksexchangerateriskscommodityrisksTraditionalriskmesurementtoolsGapanalysisIdeasofinterest-rateriskexposureΔNII
Magic Ktwc37·2019-11-09 22:58

浅谈电子商务

电子工具包括从初级的电报、电话到NII、GII和互联网等。第二，狭义的电子商务定义：在技术、经济高度发达的现代社会里，掌握信息技术和商务规则
kevinzhon·2019-11-03 12:55

3d slicer 替代软件——ITK-SNAP

download网址：https://sourceforge.net/projects/itk-snap/网页界面： 显示3d的操作方式1）保存原始图像、预测图像、mask的nii文件defcolorize
Always_ease·2019-07-19 10:40

Ubuntu+python将nii图像保存成png格式

这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。
无宠不惊过一生·2019-07-18 15:55

python实现批量nii文件转换为png图像

之前介绍过单个nii文件转换成png图像：https://www.jb51.net/article/165693.htm这里介绍将多个nii文件（保存在一个文件夹下）转换成png图像。
无宠不惊过一生·2019-07-18 14:17

pytorch实战-Unet3d（LiTS）

本文采用Unet3d进行LiTS腹部CT肝脏肿瘤分割数据集的train集合一共130个样例，都为nii格式，原始CT数据为volume-*.nii，分割的groundtruth为segmentation
炼丹师·2019-07-16 21:19

医学图像处理 小知识

以前我在处理医学图像数据时，往往都是处理nii的数据。我要需要对图像进行切片时。直接读出矩阵时就可以了。最近有一批新的数据是dcm类型的。由于dcm数据的独特性。每一个文件基本就是一个切片。
skyfengye·2019-06-12 20:21

Matlab批量将.nii文件保存为.mat文件

参考：用MATLAB批量修改文件名首先我有19个.nii文件，需要转成.mat文件进行输出查看。
不吃饭就会放大招·2019-06-02 11:33

Matlab批量修改文件名

想要把文件夹下面所有的.nii文件名全改成类似于3_i.nii的文件，i按照文件顺序从1递增。
不吃饭就会放大招·2019-06-02 11:07

脑图像分析基本环境配置：MATLAB + SNAP + DiffusionKit + SPM12 + CAT12

安装SNAP用于查看.nii图像，此处版本为ITK-SNAP3.8。3、使用DiffusionKit进行图像配准。
-Cooper-·2019-05-19 18:17

医学图像预处理（三）——windowing(ct对比增强）

常见的对应如下（w代表ct值width，L代表ct值level,即[level-width/2,level+width/2]为其窗口化目标范围）：2019-7-24更新其实无论对于dcm还是nii格式的图片
normol·2019-03-07 17:25

医学图像预处理（二）——重采样(resampling)

但医学图像例如dcm或nii格式，都会带有SliceThickness，PixelSpacing类似的属性，可以利用这些属性去尽量还原真实物体。
normol·2019-03-05 15:38

医学图像预处理（一）——读取图片(dcm,nii,PIL,skimage,cv2)

2019/7/7更新，写在最前：关于图片读取出来宽、高顺序问题（文中nii读取图片那节也有提到图片读取出来的w,h先后问题。）有这样的疑问是看得多了之后发现有时候图片是(
normol·2019-03-05 13:46

机器学习中数据清洗&预处理

数据预处理是建立机器学习模型的第一步，对最终结果有决定性的作用：如果你的数据集没有完成数据清洗和预处理，那么你的模型很可能也不会有效第一步，导入数据进行学习的第一步，我们需要将数据导入程序以进行下一步处理加载nii
范中豪·2019-03-02 20:00

利用matlab将图像矩阵转换为Nifti(.nii)格式的文件并保存至本地

问题描述:已知图像矩阵,想要输出该矩阵为.nii(nifty)格式的图像并保存.解决办法:利用matlab进行编程,载入nii格式文件,然后更改头文件并写出,最后导出目标文件.注:需要在matlab下加载
云端浅蓝·2018-12-21 00:18

复制文件至另一个文件夹并同时重命名文件

schizophrnia_DTI_mriconvert/`filename=/root/user/xiangyademo1/FA_01fordirin${filelist};doif[-d${dir}];thencd${dir}cpdata_FA.nii.gz
novenine9·2018-08-08 11:56

单张或多张jpg格式图像转换成dcm图像格式 。

在进行医学图像操作时，可以发现医学图像格式一般为dcm或者nii格式的3D图像。因为dcm文件包含的信息比一般的jpg文件多很多。这里可以发现单个dcm文件中包含了很多病人的信息。
skyfengye·2018-07-23 15:23

【ADNI】对 nii 3D 数据进行裁剪（Matlab）待完善...

filelistname,save_path,label)%%%%%%脚本说明%1）对ADNI-825灰质的3Dnii图像进行裁剪%2）裁剪部分：没有信息或信息量很少的部分%3）裁剪要求：得到一个3D方阵；nii.hdr.dime.dim
Houchaoqun_XMU·2018-03-02 17:01

NIFTI格式(.Nii)数据version 1格式分析

NIFTI格式(.Nii)数据格式分析NIFTI出现原因NIFTI出现的原因是原来一种图像格式是ANALYZE7.5format，但是这个图像格式缺少一些信息，比如没有方向信息，病人的左右方位等，如果需要包括额外的信息
DoronLee·2017-11-27 20:44

Linux命令： cut命令的使用方法

d：制定字段分隔符，默认是空格-f：制定要显示的字段-f1：显示第一个字段-f1,3显示第一个和第三个-f1-3显示第一个到第三个-b:显示字节数-c:显示字符2、示例现在有一个test.c文件如下：nii
静水流深之鑫·2017-11-26 13:02

JavaFX的ResourceBundle使用

packagecom.nii.desktop.ut
小小火车·2017-02-12 19:16

机器学习发展简史

0引言20世纪90年代初，当时的美国副总统提出了一个重要的计划——国家信息基本设施计划(NationalInformationInfrastructure,NII)。
孙彦辉·2017-01-16 11:42

PANDA pipeline的安装与使用-使用（5）实验室操作流程规范

2.接下来因为我们得到的T1图像一般是dicom格式的，所以需要利用utilities中的Dicom->NIfTI，生成nii或者Nii.gz格式的T1图像。
u013576018·2016-05-10 14:00

PANDA pipeline的安装与使用-使用（3）输入及参数设置

2.如果输入的是NifTI文件，将放在一个成像的文件夹下B值，B向量，.nii或.nii.gz的文件。子文件夹书一定与扫描的次数相同（如果每个人有不同的扫描次数）。这三个东西可以用DICO
u013576018·2016-03-23 21:00

机器学习综述

关键字:机器学习，科学依据，发展脉络0引言20世纪90年代初，当时的美国副总统提出了一个重要的计划——国家信息基本设施计划(NationalInformationInfrastructure,NII)。
帅气的弟八哥·2016-03-07 23:18
上一页 1 2 3 4 5 6 7 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他