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r语言折线图
基于
R语言
的微生物群落组成多样性分析——物种丰度计算及可视化
引言 在对样本的微生物群落组成多样性分析过程中,除了Alpha多样性与Beta多样性的分析,最重要的一个部分就是对样本中微生物具体的群落结构组成情况进行分析。一般我们从门水平及属水平上计算优势物种的相对丰度并通过表格或者柱状堆积图进行展示。正文—代码设置工作目录并加载包rm(list=ls())#clearGlobalEnvironmentsetwd('D:\\桌面\\物种丰度计算及可视化'
科研那点事儿
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2024-02-10 01:26
TCGA新版数据库表达矩阵提取
本文首发于公众号:医学和生信笔记医学和生信笔记,专注
R语言
在临床医学中的使用,
R语言
数据分析和可视化。主要分享
R语言
做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。
医学和生信笔记
·
2024-02-10 00:22
Meta分析入门工具介绍
主要目的是先能够简单的复现一些论文的研究方法,按照计划是了解Revman,stata与
R语言
的相关分析方法即可。
Jabes
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2024-02-09 22:00
DAY5-zzw
6.表格在
R语言
中改名叫数据框_7.别只复制代码,要理解其中的命令、
张纸薇
·
2024-02-09 21:39
R语言
可视化学习笔记之ggridges包
作者:严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,
R语言
爱好者,爱开源。严涛老师的绘图教程还有:gganimate|诺奖文章里面的动图布局教程来了!!
生信宝典
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2024-02-09 21:25
R
生物信息
生物信息
可视化
pyecharts 制图
pyecharts制图制图前所做准备导入各类图的类柱状图、
折线图
、饼图、地图、词云frompyecharts.chartsimportBar,Line,Pie,Map,Grid,WordCloud导入图表配置类
王薇蕴
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2024-02-09 18:04
前端
java
javascript
基于
R语言
如何实现偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)?
偏最小二乘法判别分析,即我常说的PLS-DA(PartialLeastSquaresDiscriminantAnalysis),经常被用来处理分类和判别问题。这种方法和PCA分析方法是比较类似的,区别在于二者是否有监督,一般PCA是无监督的,而PLS-DA是有监督的。 当碰到样本组间差异大而组内差异小的情况,常见的PCA分析方法是可以很好地区分组间差异的,但是遇到样本组间差异不大的情
科研那点事儿
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2024-02-09 17:27
R语言
ggplot2:第九章 数据操作
第9章数据操作9.1plyr包简介plyr包中的ddply()函数能够同时在数据的多个子集上做统计汇总。ddply(.data,.variables,.fun,...):data是用来作图的数据,variables是对数据取子集的分组变量,fun是要在各子集上运行的统计汇总函数。subset()用来对数据取子集的函数,选择数据中前n个(x%)个观测值,或者再某个阈值之上或下的观测值。transfo
王叽叽的小心情
·
2024-02-09 15:45
【echarts实用技巧】echarts图表常用功能总结,
折线图
柱状图折柱混合【持续更新中】
主要用
折线图
和柱状图举例1,X轴刻度信息日期自动排开:我们获取一个日期的开始时间和结束时间,放上去会自动生成中间每一天的日期放在X轴上把这两个函数放methods内。
接口写好了吗
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2024-02-09 11:39
功能实现
前端
vue.js
echarts
echarts数据怎么赋值 vue_在vue中添加Echarts图表的基本使用教程
前言我们在项目中经常需要使用一些
折线图
、柱状图、饼状图等等,之前使用过heightCharts,后来觉得这货不开源,只是做展示的话又点浪费时间,于是看了下eCharts,于是在vue-cli搭建的项目中添加了
对不起对不起
·
2024-02-09 11:39
echarts数据怎么赋值
vue
R语言
中,cbind和rbind区别
cbind:根据列进行合并,即叠加所有列,m列的矩阵与n列的矩阵cbind()最后变成m+n列,合并前提:cbind(a,c)中矩阵a、c的行数必需相符rbind:根据行进行合并,就是行的叠加,m行的矩阵与n行的矩阵rbind()最后变成m+n行,合并前提:rbind(a,c)中矩阵a、c的列数必需相符————————————————Rversion3.6.2(2019-12-12)--"Dark
Seurat_
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2024-02-09 06:55
Canvas实现高性能的瀑布图
废话不多说,先上成品图:再来个迷你动图:可能很多同学不知道频谱图和瀑布图,其实我也不懂…但是咱们前端就是负责把数据按照规则显示出来就好(上方
折线图
为频谱图,下方那一坨为瀑布图)。
codexu_461229187
·
2024-02-09 06:45
前端
javascript
数据可视化
R语言
rmarkdown使用
1、安装install.packages('rmarkdown')library(rmarkdown)install.packages('tinytex')tinytex::install_tinytex()2、新建RMarkdown3、基本框架红色框内为YAML:包括标题、作者和日期等黄色框内为代码块:执行后面的代码,并可以设置展示的结果。蓝色框内为Markdown文本4、运行代码产出结果5、导
weixin_49320263
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2024-02-09 05:50
常用方法
r语言
由内而外释放R的力量||摘自《R大数据分析实用指南》
数据必须读入内存R核心是单线程的R是一种解释语言使用ff和ffbase超越内存限制主要用于大数据的转换聚合与建模:深入ffandffbase
R语言
操作my
周运来就是我
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2024-02-09 05:37
在VUE项目中使用Echarts简单实现
折线图
、柱状图、饼图
$echarts=echarts3、在vue单页面上使用echarts3.1实现
折线图
和柱状图在vive层//必须设置宽和高获取echarts对象getmain(){//获取echar
六卿
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2024-02-09 05:02
#
echarts
#
js
echarts
Canvas绘制坐标轴、
折线图
body{background:black;}canvas{border:1pxsolidsaddlebrown;}varcvs=document.getElementById(“cvs”);varctx=cvs.getContext(“2d”);varpadding={top:10,left:10,right:10,bottom:10}vararrow={width:10,height:20}/
"努力敲代码的朱姝祎i
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2024-02-09 02:34
从列表中删除元素|自学生信Python(第十六天)
了解到生物信息学要有编程基础,尤其是要会一门编程语言,例如:
R语言
、Python、Perl等,还要熟悉Linux系统,作为生信小白,听说Python挺简单的,于是就自学了Python,花了两天时间了解了
天明豆豆
·
2024-02-08 22:40
最新1区9+非肿瘤纯生信,逻辑清晰易懂,机器学习筛选关键基因的纯生信也可以发高水平期刊,抓紧上车!
研究概述:本研究首先使用
R语言
在三个
生信小课堂
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2024-02-08 22:54
openpyxl3.0官方文档(12)—— 散点图
散点图或xy图类似于一些
折线图
。主要的区别是,一系列值与另一系列值相对应。这在值无序的情况下很有用。
Sinchard
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2024-02-08 20:25
r语言
svr模型_使用
R语言
建立一个决策树回归模型
决策树是一种简单但使用广泛的分类算法,根据目标变量的类型,决策树分为分类决策树(目标变量为因子型)与回归决策树(目标变量为连续数值型)。在这里,我们使用R建议一个回归决策树模型。决策树简单介绍对于一个分类问题,我们可能需要多个属性值来构建问题,通过回答这些问题(比如长度大于多少,宽度大于多少,重量大于多少),有序地得到问题的答案,并重复问题到我们得到最后的分类,把上面的过程(问题、答案)有组织的组
weixin_39849888
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2024-02-08 20:22
r语言svr模型
【
R语言
入门与数据分析-2】 数据的读取与写入
使用过程中发现自己的
R语言
基础太差了,回头补课。P28-P33所学视频:https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?
森尼啊
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2024-02-08 13:15
Day4-木婉清-初识R-2024.2.1
一、初识Rplot():主要用于绘制
折线图
,箱型图,直方图等runif():默认生成0-1之间的符合正态分布的随机数生成了10个0-100之间的随机数字plot(rnorm(50)):rnorm(50)
勤奋的马小过
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2024-02-08 12:00
r语言
开发语言
CSP-X模拟赛一王胤皓补题报告
日期:2023.10.1考试时间:9:30---->11:30学号:S07738姓名:王胤皓一、我的题目分数(有点尴尬)T1爬楼梯(stair):(WrongAnswer)0分T2字符
折线图
(sline
Edge_Coduck_S07738
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2024-02-08 09:56
C/C++
编程
算法
数据结构
c++
c语言
学习
[C#] 如何使用ScottPlot.WPF在WPF桌面程序中绘制图表
它是基于ScottPlot库的WPF版本,提供了简单易用的API,使开发人员能够通过简单的代码创建各种类型的图表,如
折线图
、散点图、柱状图、饼图等。
老狼IT工作室
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2024-02-08 08:38
C#
C#
WPF
c#
wpf
ScottPlot
跟着Nature Genetics 学画图:
R语言
ggplot2一次性画好多个饼状图
今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8b,很多个饼状图放到一起image.png最基本的想法就是单独画好多个饼状图,然后通过拼图实现,但是因为之前重复
小明的数据分析笔记本
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2024-02-08 08:56
非约束排序1—概述 (数量生态学:
R语言
的应用第五章)
非约束排序1—概述(数量生态学:
R语言
的应用第五章)在这之前我们已经学习了聚类分析,聚类分析的目的在于寻找数据的间断性,排序的目的就在于寻找数据的连续性(通过连续的排序轴展示数据的主要趋势)。
fafu生信小蘑菇
·
2024-02-08 07:20
in r, 找出所有重复的元素,包括第一个
R语言
|如何筛选所有的重复行(包括第一行重复在内)
library(dplyr)data%group_by(type)%>%#根据你要筛选的列进行分组filter(duplicated(type)|n()!=1)%>%#将该列中有重复的行挑选出来ungroup()方法二#示例向量x<-c(1,2,3,2,4,5,5,6)#找出所有重复的元素(包括第一次出现的)duplicates<-duplicated(x)|duplicated(x,fromLa
生信小博士
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2024-02-08 02:36
r语言
开发语言
docker数据科学与spark镜像源与使用常见问题疑难解答
rocker/tidyverse:此镜像包含用于
R语言
的tidyverse数据科学包。jupyter/scipy-notebook:此镜像包含用于Python语言的SciPy科学计算库。rstudio
DreamNotOver
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2024-02-08 01:16
eureka
java
spring
cloud
2022-04-17
三.项目步骤1.打开onenet平台上可视化配置新建一个可视化项目图片.png2.添加数据源模板图片.png3.编辑可视化组件选择平滑
折线图
图片.png对数据进行编辑图片.png取消数据过滤器配置导入数据源模板图片
腊味煲祖饭
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2024-02-08 01:22
46期生信第五天-一加一等于几
(6)表格在
R语言
中改名叫数据框_(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命
茶黄素
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2024-02-08 00:34
VUE的element-ui+echarts视图可视化
视图可视化官网:https://echarts.apache.org/zh/index.html进入官网后点击快速上手-在项目中引入ECharts-npm安装:我们在之前的项目里面写好柱状图、饼图、和
折线图
三个组件
GGYY丶
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2024-02-07 22:47
跟着Nature Communications学作图:
R语言
ggtern包画三元相图(Ternary plots )
论文Ahighlyconservedcorebacterialmicrobiotawithnitrogen-fixationcapacityinhabitsthexylemsapinmaizeplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31113-w本地pdfs41467-022-31113-w.pdf数据代码链接https://github.
小明的数据分析笔记本
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2024-02-07 22:30
R语言
入门笔记2.3
for循环for循环用于多次执行相似的代码。其基本语法如下:for(variableinsequence){#在每次迭代中执行的代码}其中:variable是一个变量,用于在每次迭代中存储序列中的当前元素。sequence是一个向量,可以是数字序列、字符序列或其他可迭代对象。在每次迭代中,variable会依次取sequence中的每个元素的值,然后执行for循环中的代码块。例1:>n=c(1,2
Mrji1995
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2024-02-07 19:04
笔记
R语言
入门笔记2.2
ifelse语句结构:ifelse(条件,表达式1,表达式2)#满足条件,则进入表达式1,否则为表达式2例1:>a=1>ifelse(a<0,"a小于0",ifelse(a==0,0,"a大于0"))[1]"a大于0"a=1-这行代码给变量a赋值为1。ifelse(a<0,"a小于0",ifelse(a==0,0,"a大于0"))-这是一个嵌套的ifelse语句。它的结构是ifelse(condi
Mrji1995
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2024-02-07 19:03
r语言
笔记
开发语言
ECharts
折线图
实现(前端、后端、数据结构)
文章目录ECharts简介使用场景实现步骤1、引入Echarts并且绘制一个简单的图表(html)2、创建一个
折线图
(js)3、了解ECharts需要的数据结构4、后台将数据整合返回给ECharts5、
小豆的编程世界...
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2024-02-07 17:05
java
js
echarts
数据结构
R语言
机器学习与临床预测模型35--分类回归树
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】[图片上传失败...
科研私家菜
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2024-02-07 14:22
使用Matplotlib创建
折线图
和堆积
折线图
【第61篇—python:Matplotlib绘制
折线图
和堆积
折线图
】
文章目录Matplotlib绘制多彩
折线图
:技巧与实例1.基础
折线图
2.网格
折线图
3.对比
折线图
4.百分比
折线图
5.多条
折线图
6.堆积
折线图
7.百分比堆积
折线图
8.多坐标子图9.3D
折线图
总结:Matplotlib
一见已难忘的申公豹
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2024-02-07 13:08
matplotlib
python
开发语言
信息可视化
折线图
堆积折线图
R语言
基础语法
R语法1.赋值操作符号“a;表示将2赋值给a等于符号,表示方式:a=3;表示将3赋值给a2.输出变量cat()函数:cat('text',var)print()函数:print('text',var)3.变量的数据类型R属于动态类型语言,变量的数据类型取决于输入变量类型函数:class()a=1print(class(a))output:numeric4.查找变量查找所有变量,应使用ls()函数代
地平线上的背影
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2024-02-07 10:06
明天开课 |
R语言
专题班(直播:2023.9.9~9.10)
茗创科技专注于脑科学,涵盖(EEG/ERP,fMRI,结构像,DTI,ASL,FNIRS)等,欢迎留言讨论及转发推荐,也欢迎了解茗创科技的脑科学课程,数据处理服务及脑科学工作站销售业务,可添加我们的工程师(微信号MCKJ-zhouyi或17373158786)咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技
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2024-02-07 07:43
python小白入门单细胞分析scanpy
这里要注意一下,它和
R语言
的不同,Scanpy中的行为样本,列为基因
生信小博士
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2024-02-07 03:01
scanpy
python
开发语言
双序列比对的多路径回溯,
R语言
双序列比对的多路径回溯**这是双序列比对的多路径回溯的
R语言
实现,用类似linux系统中给用户赋权限的方法记录来源方向,感觉比列表储存来源方向好。
琅琊笑笑风
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2024-02-07 03:19
R语言
--12
数组(array)数组是k维的数据表。向量(n=1),矩阵(n=2),高维数组(n>=3)矩阵的生成及基本操作matrix(data=NA,nrow=1,ncol=1,byrow=FALSE,dimnames=NULL):data可以为一个向量,nrow/ncol为指定生成的行数和列数,byrow:设定向量排布成指定的行数和列数时,按照行排列,默认是按列排布。dimnames:设定行名和列名。co
白猫警长ic
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2024-02-06 19:02
R语言
绘图教程 | 双侧条形图绘制教程
写在前面双侧条形图在我们的文章中也是比较常见的,那么这样的图形是如何绘制的呢?以及它使用的数据类型是什么呢?这些都是我们在绘制图形前需要掌握的,至少我们知道绘图的数据集如何准备,这样才踏出第一步。今天的教程,我们会从数据的准备,以及数据如何整理,以及结合自己的绘图过程中遇到问题是如何解决来进行讲解。PS:仅代表个人的观点,以及自己遇到此问题时自己的方法来进行说明。也许,这个并不会死唯一且最好的方法
小杜的生信筆記
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2024-02-06 18:56
R语言精美图形绘制教程
r语言
双侧条形图
条形图
R语言绘图
R语言
学习case12:ggplot 置信区间(多线型)
接上文:多条曲线
R语言
学习case11:ggplot置信区间(包含多子图)在ggplot2中,每个geom函数都接受一个映射参数。然而,并非每个美学属性都适用于每个geom。
早起CaiCai
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2024-02-06 14:12
R语言
r语言
学习
开发语言
数据可视化
数据分析
caTools一个奇特的工具集
R语言
作为统计学一门语言,一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发,
R语言
变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入,
R语言
的社区在迅速扩大成长。
Fens
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2024-02-06 13:11
r语言
人工智能
java
FigDraw 5. SCI 文章绘图之柱状图 (Barplot)
前两期简单介绍了
R语言
基础,比较简单粗略,然后介绍了
R语言
中表格的转换,因为现在绘图基本以及舍弃了基本绘图的方式,都会选择ggplot2来作图,这期SCI绘图介绍一下柱状图!
90066456ace6
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2024-02-06 13:07
r语言
中大小写c的区别吗,
R语言
大小写字母转换
JavaforLeetCode231PowerofTwopublicbooleanisPowerOfTwo(intn){if(n运行,打开运行窗口.2,输入cmd,打开命令行窗口.3,进入cmd,找到orpxllite.ocx和orTrueReuse.ocx的所在的目录4,输入以下命令:regsvr32&...Swift表视图动画教程:Drop-InCardshttp://www.ra
神秘巨星z
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2024-02-06 12:16
r语言中大小写c的区别吗
Python-多段折线Lut拟合工具
用途:给定折断点坐标信息,插值出
折线图
上对应点的y值例如:输入:cut_dots=np.array([[0,0.5],[8,0.65],[18,0.996],[63,0.996]])#needmin/max
陈年小白
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2024-02-06 12:57
代码+视频一步到位:手把手教你
R语言
竞争风险模型建模-列线图-校准曲线-K折验证-外部验证- 决策曲线
我们在既往文章《手把手教你使用
R语言
做竞争
天桥下的卖艺者
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2024-02-06 12:45
R语言
代码+视频系列
r语言
R语言
阈值效应函数cut.tab2.0版发布(支持线性回归、逻辑回归、cox回归,自定义拐点)
阈值效应和饱和效应是剂量-反应关系中常见的两种现象。阈值效应是指当某种物质的剂量达到一定高度时,才会对生物体产生影响,而低于这个剂量则不会产生影响。饱和效应是指当某种物质的剂量达到一定高度后,其影响不再随剂量的增加而增加,即产生饱和现象。这两种效应在药物、毒物、营养物质等剂量-反应关系中都有应用。接下来聊聊RCS阈值函数是干什么用的,随便抓一篇论文给大家看看,粉丝发给我的。L-shapedasso
天桥下的卖艺者
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2024-02-06 12:44
R语言
我写的R包
回归
r语言
线性回归
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