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r语言随机森林
SCS【1】今天开启单细胞之旅,述说单细胞测序的前世今生
点击关注,桓峰基因桓峰基因生物信息分析,SCI文章撰写及生物信息基础知识学习:
R语言
学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你123篇原创内容-->公众号今天开启单细胞之旅,单细胞其实我也算接触较早的项目
90066456ace6
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2023-09-28 20:33
R语言
随机波动模型SV:马尔可夫蒙特卡罗法MCMC、正则化广义矩估计和准最大似然估计上证指数收益时间序列...
全文链接:http://tecdat.cn/?p=31162最近我们被客户要求撰写关于SV模型的研究报告,包括一些图形和统计输出(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。相关视频本文做SV模型,选取马尔可夫蒙特卡罗法(MCMC)、正则化广义矩估计法和准最大似然估计法估计。模拟SV模型的估计方法:sim<-svsim(1000,mu=-9,phi=0.97,sigma=0.15)print(sim)
拓端研究室TRL
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2023-09-28 13:25
r语言
开发语言
如何开始着手一篇Meta分析 | Meta分析的流程及方法
R语言
拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制,可以对数据直接进行分析和显示,命令格式简单、结果可读性强,包含众多针对Meta分析软件包,是进行Meta整合分析及评价的有效平台。Meta分
asyxchenchong888
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2023-09-28 09:08
统计学
机器学习
经验分享
实用 Kaggle 竞赛之
随机森林
Random Forrest 的数据预处理、模型实现及可靠性评估EDA
“本文通过Python代码实现的方式来来介绍具体的实现。以Python为基础,调用各种比较基础的库,其中穿插一些Kaggle处理的建议,用引号表示。“1.数据预处理1.1魔术工具及所需要包魔术工具,python的notebook可以自动的更新py文件里的function。%load_extautoreload%autoreload2%matplotlibinline导入全部的模块,如果需要安装包的
Rita_曾小辰
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2023-09-28 04:40
R语言
分析:如何轻松地把数据分为三、四、五等份?
有网友问了,我如何对连续型资料进行分组,常见的有按照中位数分组、四分位数分组,甚至分为5组。这个问题其实很简单的了。用两个函数,一个是quantile函数,另外一个是cut函数1.quantile()函数的应用该函数目的是获得分组界值比如说,求某个百分位比data<-c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,5,6,7,43,9,4,12,46,22,0,14,15,3,5,7,9,4,22)
weixin_44693403
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2023-09-28 03:02
r语言
开发语言
限制性立方样条图还不会画? RCS曲线,现在可以快速搞定了(附教程)
国内学者已经整出3个
R语言
包,简单暴力美现在我希望搞出一个网页版,快速绘制RCS曲线,本来我想把国内几种方法全部都呈现出来,不过实在精力有点限制,先画一种吧,希望下个
weixin_44693403
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2023-09-28 03:31
R语言
学习.6---绘图
R语言
绘图是生信技能树生信爆款入门课程
R语言
部分Day6的讲到的一个重要知识点。为加深理解,现在做下练习巩固。
Seurat_
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2023-09-28 00:49
西瓜书+南瓜树第八章 集成学习
集成学习8.1个体与集成8.2Boosting8.2.1Boosting介绍8.2.2AdaBoost算法8.3Bagging与
随机森林
8.3.1Bagging8.3.2
随机森林
8.4多样性增强8.1个体与集成集合个体应该和而不同
煞拉一Q
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2023-09-28 00:52
组队学习吃瓜教程
集成学习
机器学习
人工智能
GEO生信数据挖掘(一)数据集下载和初步观察
GSE1297为例目录GEOquery简介安装并加载GEOquery包getGEO函数获取数据(联网下载)更换下载数据源对数据集进行初步观察处理GEOquery简介GEOquery是一个在生物信息学中常用的
R语言
包
人工智能学术前沿(真)
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2023-09-27 22:54
生信分析
GEO数据挖掘
基因数据分析
跟着Science学画图:
R语言
ggplot2作小提琴图展示NLRs基因的拷贝数(copy number)
论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本
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2023-09-27 22:25
跟着Nature Plants学作图:
R语言
ggplot2画分组折线图和置信区间
论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一
小明的数据分析笔记本
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2023-09-27 22:17
R语言
逻辑回归、决策树、
随机森林
、神经网络预测患者心脏病数据混淆矩阵可视化...
全文链接:https://tecdat.cn/?p=33760众所周知,心脏疾病是目前全球最主要的死因。开发一个能够预测患者心脏疾病存在的计算系统将显著降低死亡率并大幅降低医疗保健成本。机器学习在全球许多领域中被广泛应用,尤其在医疗行业中越来越受欢迎。机器学习可以在预测关键疾病(例如心脏病)的存在或不存在方面发挥重要作用(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。相关视频如果能提前准确预测这些信息,
拓端研究室TRL
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2023-09-27 22:27
r语言
逻辑回归
决策树
随机森林
神经网络
【机器学习】AdaBoost
与
随机森林
对比
随机森林
中,每个树的贡献相同。AdaBoost中,不同树的贡献不同。
小丫么小阿豪
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2023-09-27 21:17
机器学习
人工智能
【机器学习】
随机森林
(Random Forest)、GBDT(Gradient Boosting Decision Tree)、XGBoost(eXtreme Gradient Boosting)
随机森林
步骤bootstrappeddataset:创建一个引导数据集根据引导数据集创建决策树,每一步用变量的一个随机子集(列的随机子集)创建不断重复上述两个过程bagging:bootstrapping
小丫么小阿豪
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2023-09-27 21:47
机器学习
随机森林
boosting
ggplot2绘制箱式图(并叠加小提琴图和点图)
本文使用基因表达数据绘制箱式图,并叠加小提琴图和点图(geom_boxplot绘制箱式图,geom_violin绘制小提琴图,geom_dotplot和geom_jitter绘制点图).了解一下
R语言
中箱式图的术语
钿璎纍纍佩珊珊
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2023-09-27 20:17
介绍一位网络爬虫工程师
他系一名软件开发工程师,在工作之余,热爱Python编程,专注于网络爬虫与数据分析(
R语言
、水晶易表)。
IT农民工1
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2023-09-27 18:32
介绍一位零基础学Python网络爬虫的工程师
他系一名软件开发工程师,在工作之余,热爱Python编程,专注于网络爬虫与数据分析(
R语言
、水晶易表)。
IT农民工1
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2023-09-27 18:02
常用植被物候提取方法 (TIMESATE/
R语言
/Python)
文章内容仅用于自己知识学习和分享,如有侵权,还请联系并删除:)(一)Background这篇文章介绍的非常全面!!物候的提取通常包含两个步骤:(1)曲线的重构拟合(curvefitting)和(2)物候矩阵的提取(phenologicalmetricsextraction)(1)曲线拟合的方法通常有3种方法:(S-G)滤波法(Savitzky-Golay),双逻辑斯蒂函数拟合法(DoubleLog
柚柚柚子爱吃葡萄柚
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2023-09-27 12:17
陆面过程模型学习
r语言
python
经验分享
r语言
作业:基于线圈数据的交通流密速分析
目录1.数据读取:提取全部NHNX40(1)检测器的数据。2.冗余和缺失处理3.数据聚集4.可视化与分析5.选择第一天的数据分析6.总体代码1.数据读取:提取全部NHNX40(1)检测器的数据。通过Excel打开几个文件并查找后,确认仅有tmp02和tmp04中含有NHNX40(1)监测器结果,因此将两个文件合并为data文件,并针对data文件进一步通过函数过滤监测器NHNX40(1)的数据至新
苏瑾年sakuralen
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2023-09-27 12:43
r语言
开发语言
R语言
逻辑回归Logistic选股因素模型交易策略及沪深300指数实证|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=32071原文出处:拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于交易策略的研究报告,包括一些图形和统计输出。随着中国的证券市场规模的不断壮大、市场创新不断深化、信息披露不断完善、市场监管不断强化,随着现代投资组合理论的发展和计算机技术的进步,投资者为了在股票交易中取得更多的收益,就需要有合理有效的投资策略,因素模型的基础上发展出众多量化研究模型。对
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2023-09-27 11:56
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
用标准最小二乘OLS,广义相加模型GAM ,样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类...
原文链接:http://tecdat.cn/?p=21379本文我们对逻辑回归和样条曲线进行介绍(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。logistic回归基于以下假设:给定协变量x,Y具有伯努利分布,目的是估计参数β。回想一下,针对该概率使用该函数是(对数)似然函数对数似然其中。数值方法基于(数值)下降梯度来计算似然函数的最大值。对数似然(负)是以下函数negLogLik=function(b
拓端研究室TRL
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2023-09-27 08:40
r语言
逻辑回归
分类
开发语言
算法
数据分享|
R语言
分析上海空气质量指数数据:kmean聚类、层次聚类、时间序列分析:arima模型、指数平滑法...
本文向大家介绍
R语言
对上海PM2.5等空气质量数据(查看文末了解数据免费获取方式)间的相关分析和预测分析,主要内容包括其使用实例,具有一定的参考价值,需要的朋友可以参考一下(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据
拓端研究室TRL
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2023-09-27 08:34
r语言
聚类
开发语言
数据挖掘
机器学习
学习小组-day4笔记-htt1996
一、下载R和Rstudio下载R和Rstudio教程:https://mp.weixin.qq.com/s/NdHIFrfJVDsHIUDc5SItyA二、
R语言
基本操作plot(rnorm(50))#
Htt_1996
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2023-09-27 01:11
R语言
包lemon
具体都有什么作用暂时还不知道,可以操作ggplot2作图的坐标轴,比如下图dsamp<-diamonds[sample(nrow(diamonds),1000),]library(lemon)library(ggplot2)p<-ggplot(dsamp,aes(x=cut,y=price,colour=clarity))+geom_point(position=position_jitter(w
小明的数据分析笔记本
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2023-09-27 01:40
深度学习理论
《BriefHistoryofMachineLearning》介绍:这是一篇介绍机器学习历史的文章,介绍很全面,从感知机、神经网络、决策树、SVM、Adaboost到
随机森林
、DeepLearning.
Alec-Wong
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2023-09-27 00:03
Computer
Vision
Artificial
Intelligence
Scientific
Research
Sparse
如何用
R语言
读取Excel、PDF和JSON文件?
转自:微点阅读https://www.weidianyuedu.com导读:本文将讨论Excel、PDF等文件的读取,以及相应函数的参数设置。如需转载请联系大数据下图总结了主要程序包,希望读者在日常练习和工作中遇到不同格式的文件时,能够瞬间反应出读取该格式所需的包及对应的函数。(限于篇幅,本文未包含图中“平面文档格式”这部分的内容,如果你有兴趣,可以继续关注大数据后续文章。)▲不同格式的数据文件读
ysds20211402
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2023-09-26 22:54
编程语言
JavaScript
r语言
json
开发语言
Python 用ARIMA、GARCH模型预测分析股票市场收益率时间序列
相关视频:时间序列分析:ARIMAGARCH模型分析股票价格数据时间序列分析模型ARIMA-ARCHGARCH模型分析股票价格数据相关视频:在Python和
R语言
中建立EWMA,ARIMA模型预测时间序列前言在量化金融中
拓端研究室
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2023-09-26 15:12
python
概率论
开发语言
ARIMA
garch
Python实战实例代码-网络爬虫-数据分析-机器学习-图像处理
图像处理Python实战实例代码1.网络爬虫1.1爬取网页数据1.2爬取图片1.3爬取动态数据(使用Selenium)2.数据分析2.1数据清洗2.2数据变换2.3数据聚合3.机器学习3.1线性回归3.2
随机森林
华为奋斗者精神
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2023-09-26 09:38
Python
Linux
ARM
MCU
python
爬虫
数据分析
开发语言
机器学习
图像处理
Python实现贝叶斯优化器(Bayes_opt)优化
随机森林
回归模型(RandomForestRegressor算法)项目实战
说明:这是一个机器学习实战项目(附带数据+代码+文档+视频讲解),如需数据+代码+文档+视频讲解可以直接到文章最后获取。1.项目背景贝叶斯优化器(BayesianOptimization)是一种黑盒子优化器,用来寻找最优参数。贝叶斯优化器是基于高斯过程的贝叶斯优化,算法的参数空间中有大量连续型参数,运行时间相对较短。贝叶斯优化器目标函数的输入必须是具体的超参数,而不能是整个超参数空间,更不能是数据
胖哥真不错
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2023-09-26 09:46
机器学习
python
python
贝叶斯优化器
Bayes_opt
机器学习
随机森林回归模型
基于MODIS数据的2000-2021年中国植被生物量数据集
简介中国植被生物量分布图集由航天宏图实验室提供,利用MODIS地表反射率数据和植被指数(MCD43A4、MCD12Q1),与美国农业部FIA项目提供的地上生物量数据结合进行
随机森林
机器学习,训练得到各种植被类型的地上生物量估算模型
此星光明
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2023-09-26 08:12
PIE-engine遥感云计算
前端
服务器
javascript
gee
生物量
agb
中国
R语言
中更改R包安装路径
看到这些包下载到我的C盘,我蛮不爽的:所以决定毫不犹豫的改到D盘:首先,我们需要在RStudio中新建一个初始启动文件:file.edit('~/.Rprofile')然后去你喜欢的环境新建一个文件夹存放安装的包的位置,我喜欢这里:接着:(注意路径的反斜杠的方向!).libPaths("D:/D_downloads1/R_libaray").libPaths(myPaths)保存完了之后,重启RS
每天都是被迫学习
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2023-09-26 08:38
R
r语言
Neo4j - CQL使用
3.1Neo4j-CQL简介Neo4j的Cyphe
r语言
是为处理图形数据而构建的,CQL代表Cypher查询语言。像Oracle数据库具有查询语言SQL,Neo4j具有CQL作为查询语言。
Q z1997
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2023-09-26 06:12
Neo4j
知识图谱
数据库
java
基于
R语言
分位数回归丨线性回归假设与分位数函数、线性分位数回归 、贝叶斯分位数回归、超越线性分位数回归等
目录专题一线性回归假设与分位数函数讲解专题二线性分位数回归【代码实践】专题三贝叶斯分位数回归【代码实践】专题四超越线性分位数回归(一)【代码实践】专题五超越线性分位数回归(二)【代码实践】更多应用回归是科研中最常见的统计学研究方法之一,在研究变量间关系方面有着极其广泛的应用。由于其基本假设的限制,包括线性回归及广义线性回归在内的各种常见的回归方法都有三个重大缺陷:(1)对于异常值非常敏感,极少量的
WangYan2022
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2023-09-26 05:38
R语言
r语言
分位数回归
线性回归
非线性分位数回归
电池寿命预测(Python代码,K最近邻回归模型(KNN)、支持向量机回归模型(SVM)和
随机森林
回归模型(Random Forest)三种模型,添加了中文注释)
1.数据集来源:可以在这里找到公共数据集:BatteryArchive.org从HNEI来源中选择了14个数据库。.csv文件数据是来自名为'HNEI_18650_NMC_LCO_25C_0-100_0.5/1.5C_'的时间序列。(夏威夷自然能源研究所研究了14节NMC-LCO18650电池,其标称容量为2.8安时,这些电池在25°C下以C/2充电速率和1.5C放电速率进行了1000次循环充放电
深度学习的奋斗者
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2023-09-26 04:18
python
回归
支持向量机
R语言
_data.frame()函数用法
前言:微博参与话题#给你四年时间你也学不会生信#DataFrames|数据框data.frame()函数创建数据框,紧密耦合的变量集合,这些变量共享了矩阵和列表的许多属性,它们被大多数R的建模软件用作基本的数据结构。dataFrame一般被翻译为数据框,感觉就像是R中的表,由行和列组成,与Matrix不同的是,每个列可以是不同的数据类型,而Matrix是必须相同的。Usagedata.frame(
谢俊飞
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2023-09-26 02:59
R语言
多元(多变量)GARCH :GO-GARCH、BEKK、DCC-GARCH和CCC-GARCH模型和可视化|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=30647最近我们被客户要求撰写关于GARCH的研究报告,包括一些图形和统计输出。从Engle在1982发表自回归条件异方差(ARCH)模型的论文以来,金融时间序列数据的波动性就倍受关注。同时,近几年又出现了研究股票市场的波动传递性多市场的多维广义自回归条件异方差模型及其在不同条件下的扩展与变形,它们不仅包含了单变量的波动特性,而且很好的描述了不同
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2023-09-26 00:17
数据挖掘深度学习
R语言
用普通最小二乘OLS,广义相加模型GAM ,样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类|附代码数据
原文链接:http://tecdat.cn/?p=21379原文出处:拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于回归的研究报告,包括一些图形和统计输出。本文我们对[逻辑回归和样条曲线进行]()介绍。logistic回归基于以下假设:给定协变量x,Y具有伯努利分布,目的是估计参数β。回想一下,针对该概率使用该函数是(对数)似然函数对数似然其中。数值方法基于(数值)下降梯度来计算[似然函数]()的[
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2023-09-26 00:17
数据挖掘深度学习人工智能算法
R语言
文本挖掘:kmeans聚类分析上海玛雅水公园景区五一假期评论词云可视化|附代码数据
全文链接:http://tecdat.cn/?p=32307原文出处:拓端数据部落公众号互联网时代,大量的新闻信息、网络交互、舆情信息以文本形式存储在数据库中,如何利用数据分析和文本挖掘的算法,将海量文本的价值挖掘出来,成为我们团队近期的一个研究方向,本案例就是我们的一个尝试。文本聚类其实也就是聚类分析在文本方向上的应用,首先我们要把一个个文档的自然语言转换成数学信息,这样形成高维空间点之后再去计
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2023-09-26 00:47
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
用线性模型进行臭氧预测: 加权泊松回归,普通最小二乘,加权负二项式模型,多重插补缺失值|附代码数据
原文链接:http://tecdat.cn/?p=11386原文出处:拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于线性模型的研究报告,包括一些图形和统计输出。在这篇文章中,我将从一个基本的线性模型开始,然后从那里尝试找到一个更合适的线性模型。数据预处理由于空气质量数据集包含一些缺失值,因此我们将在开始拟合模型之前将其删除,并选择70%的样本进行训练并将其余样本用于测试:data(airqualit
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2023-09-26 00:46
数据挖掘深度学习人工智能
在线平台如何做单细胞测序分析全套?有它so easy!
在线工具也能追上单细胞作者:白介素2单细胞测序技术是一个越来越Popular的技术,这不前两天还有小伙伴来找白介素同学,说是老板想分析单细胞测序的数据,喜欢追热点,让他们去学
R语言
,然后小伙伴自然是懵逼
医科研
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2023-09-25 23:24
[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析(PCA)
本期内容为[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析(PCA)主成分分析:PCA(PrincipalComponentAnalysis)是一种常用的数据分析方法。
小杜的生信筆記
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2023-09-25 22:46
R语言
机器学习与临床预测模型26--综合判别改善指数
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】01什么是综合判别改善指数?
科研私家菜
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2023-09-25 22:07
python和
r语言
做大数据_R和python大数据
数据科学界华山论剑:R与Python巅峰对决如果你是数据分析领域的新兵,那么你一定很难抉择——在进行数据分析时,到底应该使用哪个语言,R还是Python?在网络上,也经常出现诸如“我想学习机器语言,我应该用哪个编程语言”或者“我想快速解决问题,我应该用R还是Python”等这类问题。尽管两个编程语言目前都是数据分析社区的佼佼者,但是它们仍在...文章小旋风柴进2017-05-02878浏览量Pyt
股民好多
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2023-09-25 21:23
python和r语言做大数据
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R语言
分析QQ群聊天记录
某小区业主群QQ聊天记录,时间跨度将近一年半,历经从业委会选举到换物业公司全过程,应该还是比较有代表性和戏剧性的一段时期。聊天记录通过QQ消息面板导出为文本格式。1、读取并整理数据>library(pacman)>p_load(dplyr,stringr)>>dtsep="\n",encoding="UTF-8",>header=F,blank.lines.skip=T)>head(dt)##V1
wonphen
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2023-09-25 20:22
2021-09-27-day4-重点是
作业四、
R语言
基础在课程之前已经接触到了
R语言
,在这里就不多说了,放一张之前练手时做的草图。目前我的水平只能达到使用大佬写好的代码,修改一些参数跑流程。
重点是
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2023-09-25 19:41
R语言
陆胖的数据分析之旅02
问题如何绘制散点图?方法使用plot()函数可绘制散点图(见图2-1),运行命令时依次传递给plot()函数一个向量x和一个向量y。plot(mtcars$wt,mtcars$mpg)图2-1基础绘图系统绘制的散点图对于ggplot2系统,可用qplot()函数得到相同的绘图结果(见图2-2):library(ggplot2)qplot(mtcars$wt,mtcars$mpg)图2-2使用ggp
Larrylu007
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2023-09-25 15:00
STA304
R语言
分析
ADDADESCRIPTIVETITLESTA304-Fall2023-Assignment1ADDYOURNAMEHERE-STUDENTNUMBERInsertDateHerePart1:DesigningasurveyGoalProcedure”brackets.>Showcasingthesurvey.//www.surveymonkey.co.uk/r/99CGC3B[1].>quest
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2023-09-25 12:30
算法
跟着Plos Biology学作图:
R语言
ggplot2双Y轴折线图
论文Largevariationintheassociationbetweenseasonalantibioticuseandresistanceacrossmultiplebacterialspeciesandantibioticclasses数据代码链接https://github.com/orgs/gradlab/repositories今天的推文重复一下论文中的FigureS3,双Y轴的折
小明的数据分析笔记本
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2023-09-25 10:31
生信必备技巧之
R语言
基础教程--R包安装和载入
R语言
是数学研究工作者设计的一种数学编程语言,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。
R语言
是解释运行的语言(与C语言的编译运行不同),它的执行速度比C语言慢得多,不利于优化。
生信师兄
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2023-09-25 09:16
点云从入门到精通技术详解100篇-机载 LiDAR 点云滤波及分类(下)
目录5.2.2准确率与召回率5.2.3Kappa系数5.3实验区概况5.4
随机森林
分类实验
格图素书
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2023-09-25 09:11
分类
人工智能
数据挖掘
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