r语言随机森林

跟着PNAS学作图：R语言ggplot2作图展示多序列比对结果

论文Theevidenceremainsclear:SARS-CoV-2emergedviathewildlifetradehttps://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2214427119在饶毅科学公众号看到的推文美国科学院院刊：逐条反驳新冠是实验室产物的错误说法其中有一个图是image.png今天的推文我们来试着复现一下这个图首先是一个多序列比对文件image.p
小明的数据分析笔记本·2023-09-21 21:17

R语言贝叶斯非参数模型：密度估计、非参数化随机效应meta分析心肌梗死数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=23785原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯非参数模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。概述最近，我们使用贝叶斯非参数（BNP）混合模型进行马尔科夫链蒙特卡洛（MCMC）推断。在这篇文章中，我们通过展示如何使用具有不同内核的非参数混合模型进行密度估计。在后面的文章中，我们将采用参数化的广义线性混合模型，并展示如何切换到非
·2023-09-21 21:32

R语言贝叶斯非参数模型：密度估计、非参数化随机效应meta分析心肌梗死数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=23785原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯非参数模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。概述最近，我们使用贝叶斯非参数（BNP）混合模型进行马尔科夫链蒙特卡洛（MCMC）推断。在这篇文章中，我们通过展示如何使用具有不同内核的非参数混合模型进行密度估计。在后面的文章中，我们将采用参数化的广义线性混合模型，并展示如何切换到非
·2023-09-21 21:29

R语言贝叶斯MCMC：GLM逻辑回归、Rstan线性回归、Metropolis Hastings与Gibbs采样算法|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=23236原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯MCMC的研究报告，包括一些图形和统计输出。什么是频率学派？在频率学派中，观察样本是随机的，而参数是固定的、未知的数量。概率被解释为一个随机过程的许多观测的预期频率。有一种想法是"真实的"，例如，在预测鱼的生活环境时，盐度和温度之间的相互作用有一个回归系数？什么是贝叶斯学派？在贝
·2023-09-21 21:29

R语言和Stan,JAGS：用rstan,rjags建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21978原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于Stan,JAGS的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文将介绍如何在R中用rstan和rjags做贝叶斯回归分析，R中有不少包可以用来做贝叶斯回归分析，比如最早的（同时也是参考文献和例子最多的）R2WinBUGS包。这个包会调用WinBUGS软件来拟合模型，后来的JAGS软件也使用与
·2023-09-21 21:58

R语言贝叶斯推断与MCMC：实现Metropolis-Hastings 采样算法示例|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21545原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯推断的研究报告，包括一些图形和统计输出。示例1：使用MCMC的指数分布采样任何MCMC方案的目标都是从“目标”分布产生样本。在这种情况下，我们将使用平均值为1的指数分布作为我们的目标分布。所以我们从定义目标密度开始：target=function(x){if(x0&x2&x1))
·2023-09-21 21:58

箱线图进行方差分析并添加显著性标记

欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何在计算多样性指数的基础上来进行显著性标记，可在文末找到获取数据的方式加载R包library(tidyverse)library(vegan)library(magrittr
R语言数据分析指南·2023-09-21 20:37

机器学习第十课--提升树

一.Bagging与Boosting的区别在上一章里我们学习了一个集成模型叫作随机森林，而且也了解到随机森林属于Bagging的成员。本节我们重点来学习一下另外一种集成模型叫作Boosting。
好人cc·2023-09-21 18:52

R语言进行孟德尔随机化+meta分析（1）---meta分析基础

R语言进行进行meta分析咱们就做最基本的部
天桥下的卖艺者·2023-09-21 18:49

R语言ggpubr包优雅绘制带统计数据的箱线图

ggpubr包是个很经典的R包，能绘制专业的论文绘图，它是对ggplot2进行了加强，R包的说明也是介绍用于创建和自定义基于“ggplot2”的出版物绘图，就是个为SCI而生的R包呀，今天咱们使用ggpubr绘制专业的论文需要的带统计数据的箱线图下面咱们开始，先导入R包和数据，使用R软件自带的ToothGrowth数据library(ggpubr)data("ToothGrowth")df<-To
天桥下的卖艺者·2023-09-21 18:18

R-Newton牛顿法解方程

转载自：用R语言求解非线性方程-R爱好者-博客园(cnblogs.com)仅用于学习image.pngimage.pngimage.pngimage.png
淡水鱼Ada·2023-09-21 17:29

跟着Science学画图：R语言ggplot2作热图展示基因存在缺失

论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本·2023-09-21 11:49

发布gridgame游戏包

R语言作为统计学一门语言，一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发，R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入，R语言的社区在迅速扩大成长。
Fens·2023-09-21 11:16

机器学习第九课--随机森林

这个其实不难理解，因为随机森林或者提升树模型其实是基于决策树的，
好人cc·2023-09-21 09:11

实验篇——根据群体经纬度提取环境数据（先导）

实验篇——根据群体经纬度提取环境数据（先导）文章目录前言一、获取数据文件1.1.经纬度文件1.2.环境数据的tif文件二、R语言代码实现三、环境文件介绍3.1.bio3.2.prec3.3.elev3.4
星石传说·2023-09-21 08:56

R语言风险价值：ARIMA，GARCH，Delta-normal法滚动估计VaR（Value at Risk）和回测分析股票数据...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=24492此分析的目的是构建一个过程，以在给定时变波动性的情况下正确估计风险价值。风险价值被广泛用于衡量金融机构的市场风险。我们的时间序列数据包括1258天的股票收益（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。介绍为了解释每日收益率方差的一小部分，我们使用Box-Jenkins方法来拟合自回归综合移动平均(ARIMA)模型，并测试带下划线的假设。稍后
拓端研究室TRL·2023-09-21 05:09

R语言绘制图例legend()

目录一、legend()函数介绍二、par()函数：将多幅图形组合成一幅总括图形示例：三、par()函数：图形尺寸与边界尺寸四、legend()函数示例参考：一、legend()函数介绍当图形中包含的数据不止一组时，图例可以帮助你辨别出每个条形、扇形区域或者折线各代表哪一类数据。我们可以使用函数legend()来添加图例。其格式为：legend(location,title,legend,...)
饮食有度的元气少女·2023-09-21 04:19

R语言-关于颜色

目录颜色示例R颜色板参考：颜色什么场景会用到颜色？比如在绘图过程中，为了让图更好看，有的时候，需要选择使用不同的颜色进行绘制或者填充。本文提供了R颜色的相关参数。在R中，可以通过颜色下标、颜色名称、十六进制的颜色值、RGB值或HSV值来制定颜色。举例来说，col=1,col="white"，col="#FFFFFF"，col=rgb(1,1,1)和col=hsv(0,0,1)都是表示白色的等价方式
饮食有度的元气少女·2023-09-21 04:44

R语言logistic回归的细节解读

医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。
医学和生信笔记·2023-09-21 04:28

R语言实现高级的韦恩图可视化（UpSetR）

hello,大家好，不知道下面这张图大家还有印象么图片.png在我之前分享的文章10X单细胞（10X空间转录组）之细胞通讯软件之间的分析比较中，大量采用这样的图进行展示，后来呢，在文章文章中的哑铃图复现（基础知识）尝试完全实现，可惜半路停止，今天就给大家展示如何实现这样的图，不带一点折扣。其实这个图有个专业的名词，叫韦恩图，但是大家熟悉的韦恩图应该是长下面的样子：图片.png少量的情况下非常美观，
单细胞空间交响乐·2023-09-21 01:33

R语言连接MySQL读写中文数据乱码问题解决方案

R语言在对中文的读写上是有点不友好，估计也是众多R语言使用者吐槽的点。
LEEBELOVED·2023-09-21 01:15

R语言爬虫豆瓣高评分电影（喝最烈的酒，熬最深的夜，吃最好的胃药，敷最贵的面膜）

豆瓣电影TOP250抓取下了那么多包没用多少东西，看着黑人，反正pradaprada的赶紧逃，赶紧的，你会炸的这里面主要用到R/Rstudio里面的RCurl、XML、wordcloud、stringr、jiebaR勒几个包，熟悉的娃晓得R里面爬虫明星般的包就是RCurl和Rvset了，不过对于更强大的Rselenium、Rwebdriver什么的先不要管了，别把自己玩疯了，作文本处理的wordc
LEEBELOVED·2023-09-21 01:44

R语言stringr包字符串、文本数据处理函数（数据清洗、正则表达式）

最近一直在忙于数据清理、整理，分析、可视化都不多，想来把数据处理中的一些方法分享给大家！本篇是对你接到一个烫手山芋时，如何将它们一并拿下！stringr包函数处理脏数据可谓是屡试不爽，例如：网络爬取的数据、平台反馈数据、用户数据、医疗数据由于时间比较赶，下面写到的都是常用的数据处理函数1、最基础的就是字符串拼接函数：str_c、str_join2、数据匹配函数：inner_join、right_j
LEEBELOVED·2023-09-21 01:44

R语言dbplyr包实现R与SQL语句无缝衔接

注：并不支持所有R函数语句转换为SQL，例如：dplyr包的with_groups1、cop_to函数适用于少量数据复制到数据库（通常创建为临时表），然后使用R语句计算并转换为SQL语句；不建议直接复制数据到库再进行操作，大量数据复制会耗费较长时间，使用src_memdb将极大节省时间（并不会创建新的数据在R中，而是存储在src_memdb）。copy_to(src_x,#远程数据源链接，例如sr
LEEBELOVED·2023-09-21 01:14

R语言-高效数据处理-泛函数化@灵魂走风的江湖

本文主要运用apply函数族、map函数族、自定义函数的数据处理。将同类数据处理函数化，极大提升数据处理效率！1、自定义函数-含变量、参数#通用函数说明#data_eg为传入的数据集，var1为传入的变量，para1、para2为传入的参数#此函数便于计算任意变量在指定的范围内的计算结果eg_function%filter(between({{var1}},para1,para2))%>%grou
LEEBELOVED·2023-09-21 01:14

R语言data.table包高效处理/提升大数据效率@灵魂走风的江湖

目录1、data.table包中特殊符号.SD（通过.SDcols选择的变量作处理）、.SDcols（变量列选择）、.I（返回位置）、.N（计数）、.BY、J、CJ、SJ、:=2、分组计数（单一方法）比较：3、多分组情况下比较：4、if_else和fifelse函数比较：5、row_number、with_groups与order、by综合比较：6、字段拆分函数tstrsplit与str_spli
LEEBELOVED·2023-09-21 01:13

R语言dplyr包高效处理数据-补充函数

dplyr包补充用到的实用函数：1、函数cur_group_：数据分组组内标记#使用常见的R语言内置数据集iris#可以明确的知道当前数据属于哪个分组iris%>%group_by(Species)%>
LEEBELOVED·2023-09-21 01:42

R语言中多线程运行程序

R代码的运行效率不高，因此有时候可以考虑并行运行程序。#apply系列函数实际不是并行apply(X,MARGIN,FUN,...)lapply(X,FUN,...)sapply(X,FUN,...,simplify=TRUE,USE.NAMES=TRUE)vapply(X,FUN,FUN.VALUE,...,USE.NAMES=TRUE)##lapply()接受一个向量或者列表作为处理对象，返回
JeremyL·2023-09-20 21:35

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=20828最近我们被客户要求撰写关于非凸惩罚函数回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是最小最大凹度惩罚函数(MCP)和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“弹性网络”）。还提供了用于执行交叉验证以及拟合后可视化，摘要，推断和预测的实用程序。我们研
·2023-09-20 21:16

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=20828最近我们被客户要求撰写关于非凸惩罚函数回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是最小最大凹度惩罚函数(MCP)和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“弹性网络”）。还提供了用于执行交叉验证以及拟合后可视化，摘要，推断和预测的实用程序。我们研
·2023-09-20 21:44

R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24334最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯线性回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。像任何统计建模一样，贝叶斯建模可能需要为你的研究问题设计合适的模型，然后开发该模型，使其符合你的数据假设并运行1.了解Stan统计模型可以在R或其他统计语言的各种包中进行拟合。但有时你在概念上可以设计的完美模型，在限制了你可以使用的分布和复杂性的软件包或程序中很难
·2023-09-20 21:13

R语言RStan MCMC：NUTS采样算法用LASSO 构建贝叶斯线性回归模型分析职业声望数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24456原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于RStan的研究报告，包括一些图形和统计输出。如果你正在进行统计分析：想要加一些先验信息，最终你想要的是预测。所以你决定使用贝叶斯。\但是，你没有共轭先验。你可能会花费很长时间编写Metropolis-Hastings代码，优化接受率和提议分布，或者你可以使用RStan。Hamilto
·2023-09-20 21:13

R语言非线性方程数值分析生物降解、植物生长数据：负指数方程、幂函数曲线、米氏方程、逻辑曲线、Gompertz、Weibull曲线

全文链接：https://tecdat.cn/?p=33742原文出处：拓端数据部落公众号简介在选择最佳拟合实验数据的方程时，可能需要一些经验。当我们没有文献信息时该怎么办？我们建立模型的方法通常是经验主义的。也就是说，我们观察过程，绘制数据并注意到它们遵循一定的模式。例如，我们的客户可能观察到一种植物对某种毒性物质的反应是S形的。因此，我们需要一个S形函数来拟合我们的数据，但是，我们如何选择正确
·2023-09-20 21:12

kappa一致性检验教程_R语言中的试验一致性检验分析 kappa检验和McNemar检验

我们今天就来介绍下R语言如何实现临床化验结果的一致性与否的检验。在R语言中有两个函数
weixin_39638188·2023-09-20 19:04

R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类分析中药专利复方治疗用药规律网络可视化...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=30605应用关联规则、聚类方法等数据挖掘技术分析治疗的中药专利复方组方配伍规律（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。方法检索治疗中药专利复方，排除外用中药及中西药物合用的复方。最近我们被要求撰写关于用药规律的研究报告，包括一些图形和统计输出。对入选的中药专利复方进行术语规范化等处理，抽取信息、建立表，应用数据分析软件R对数据进行关联规则分析，
拓端研究室TRL·2023-09-20 14:34

基于随机森林+小型智能健康推荐助手(心脏病+慢性肾病健康预测+药物推荐)——机器学习算法应用(含Python工程源码)+数据集（三）

它利用了随机森林机器学习模型，通过对这些特征进行训
小胡说人工智能·2023-09-20 14:50

基于随机森林+小型智能健康推荐助手(心脏病+慢性肾病健康预测+药物推荐)——机器学习算法应用(含Python工程源码)+数据集（二）

它利用了随机森林机器学习模型，通过对这些特征进行训练，能够预测是否患有这些疾病。不仅如此，该项目还会根据患者的症状或需求，提供相关的药物推荐，从而实现
小胡说人工智能·2023-09-20 14:49

基于随机森林+小型智能健康推荐助手(心脏病+慢性肾病健康预测+药物推荐)——机器学习算法应用(含Python工程源码)+数据集（一）

目录前言总体设计系统整体结构图系统流程图运行环境Python环境依赖库模块实现1.疾病预测1）数据预处理心脏病数据集预处理慢性肾病数据预处理2）模型训练及保存定义模型结构心脏病数据集定义模型慢性肾病数据集定义模型保存模型心脏病模型保存慢性肾病数据集定义模型3）模型应用慢性肾病模型应用创新慢性肾病模型应用创新其它相关博客工程源代码下载其它资料下载前言本项目基于Kaggle上公开的数据集，旨在对心脏病
小胡说人工智能·2023-09-20 14:18

分类预测 | Matlab实现GA-RF遗传算法优化随机森林多输入分类预测

分类预测|Matlab实现GA-RF遗传算法优化随机森林多输入分类预测目录分类预测|Matlab实现GA-RF遗传算法优化随机森林多输入分类预测效果一览基本介绍程序设计参考资料效果一览基本介绍Matlab
机器学习之心·2023-09-20 10:01

AIGC入门 - LLM 信息概览

LLMOPTLLaMaAlpacaVicunaMosschatGLMBaichuanOpenbuddy一、OPT1、背景OPT全称OpenPre-trainedTransformerLanguageModels，即“开放的预训练Transformer语言模型
TFATS·2023-09-20 09:30

PYTHON用户流失数据挖掘：建立逻辑回归、XGBOOST、随机森林、决策树、支持向量机、朴素贝叶斯和KMEANS聚类用户画像...

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24346在今天产品高度同质化的品牌营销阶段，企业与企业之间的竞争集中地体现在对客户的争夺上（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。“用户就是上帝”促使众多的企业不惜代价去争夺尽可能多的客户。但是企业在不惜代价发展新用户的过程中，往往会忽视或无暇顾及已有客户的流失情况，结果就导致出现这样一种窘况：一边是新客户在源源不断地增加，而另一方面是辛辛苦苦
拓端研究室TRL·2023-09-20 08:59

ggraph优雅的绘制环状网络图

欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何使用ggraph绘制圆形网络图，这里使用了一个R包ccgraph，各位观众老爷细细体会，下面通过一个小例子来进行展示加载R包library(tidygraph)library
R语言数据分析指南·2023-09-20 07:40

数据分享|R语言逻辑回归、线性判别分析LDA、GAM、MARS、KNN、QDA、决策树、随机森林、SVM分类葡萄酒交叉验证ROC...

全文链接:http://tecdat.cn/?p=27384在本文中，数据包含有关葡萄牙“VinhoVerde”葡萄酒的信息（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。介绍该数据集（查看文末了解数据获取方式）有1599个观测值和12个变量，分别是固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧化硫、总二氧化硫、密度、pH值、硫酸盐、酒精和质量。固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧
拓端研究室TRL·2023-09-20 07:34

rexp() R函数，生成服从指数分布的随机数

x<-rexp(100,1/10)#生成100个均值为10的指数分布随机数参考：R语言【rexp】__BANA的博客-CSDN博客
饮食有度的元气少女·2023-09-20 06:17

R语言自学笔记-----R的系统函数

R基础包中含有的函数种类很多，从计算功能上可以分为数学函数、概率函数、统计函数、矩阵运算函数、字符串函数、数据管理函数、逻辑判断函数、文件管理函数等。现在对上述函数进行简单的介绍，具体的更加复杂的操作可以自行参考R的帮助文档。一、数学函数数学函数在R中用于基础的数学运算，是统计分析的重要函数之一函数名称及书写格式函数用途abs(x)计算x的绝对值sqrt(x)计算x的平方根ceiling(x)输出
月月我媳妇·2023-09-20 06:16

实验设计——R语言（DAY02：R语言基础操作）

R语言基础操作1.基础操作#文件读取geted()seted()file.choose()read.csv(file.choose())#保存文件save()#加载R文件load()#加载某个包的数据集
cyt—srhloveyou·2023-09-20 06:16

2021-07-09：细数我在GO注释时遇到的那些报错

上回说到，我废了九牛二虎之力，终于拿到了百十来个GB的GOEVIDENCE数据，你猜怎么着，接着往下进行的时候发现，R语言根本读不了。。。。
wangyantao1991·2023-09-20 05:09

呜呜呜我哭出声来

今天在R语言上栽了跟头。
蓬举举·2023-09-20 03:05

【R语言】——相关性分析和热图绘制

本期介绍了利用R语言进行相关性分析和数据的可视化的方法。一、什么是相关性分析？相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。
在打豆豆的小潘学长·2023-09-20 03:07

r语言 相关性作图_R语言学习指南(6) 初探相关性热图

相关性热图，顾名思义就是根据数据之间的相关性系数来绘制热图，可分为2类：组内相关性热图与组间相关性热图组内相关性热图，即由一组数据内部的相关性系数绘制而成，废话不多说直接看代码相关性矩阵可视化library(tidyverse)library(corrplot)cor(mtcars) %>% corrplot(method = "circle",order = "hclust",type = "l
PP鲁·2023-09-20 03:35
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