r语言随机森林第49页

R语言-13数据标准化与初步统计

将数据标准化或中心化#标准化，减去均值再除以均方根，scale设为FALSE的时候是中心化，也就不除均方根scmean<-scale(allmean[,2:17],center=TRUE,scale=TRUE)求第2列的方差、平均值sd(data[,2])mean(data[,2])简单分类统计引入plyr包library(plyr)按pic列和audios列分类统计count(data1,c(d

周一ing·2023-09-17 06:45

R语言实战分析预测海藻数量

********************预测海藻数量R语言脚本************************---加载数据包library(DMwR)head(algae)---对于数据给出行名称algae

hao1175513356·2023-09-17 04:47

R语言预测海藻频率（多元线性回归、回归树、组合随机森林）

结合刚刚学习R语言，进行分析数据集加载通过DMwR包来对海藻数据进行加载，并设定表头等数据。如

QQ未来星·2023-09-17 04:17

“对称散点图”的绘制（R语言）

R语言绘制基因表达基因的“对称散点图转录组分析中，计算了两组间差异表达的基因后，通常怎样表示？您可能第一时间想到可以使用火山图。

纪伟讲测序·2023-09-17 03:05

16S rRNA&rDNA测序分析

16SrRNA/rDNA测序分析，qiime操作，linux命令，系统发育树构建，venn图，heatmap热图，主分析RDA（Redundancyanalysis），典范对应分析CCA等R语言作图网易云课堂上有视频讲解

宁生信·2023-09-16 22:23

对偏态数据进行对数变换的方法及R语言代码实现

对偏态数据进行对数变换的方法及R语言代码实现在实际的数据分析中，我们经常会遇到一些偏态分布的数据。为了满足统计分析的前提条件或使数据更符合某些模型的假设，我们可以采用对数变换来处理这些数据。

Code_GO_GO·2023-09-16 17:11

R语言学习-1-Basic Building Blocks

介绍R中的一些基本模块，所有的命令都可以在R的console里交互式进行。推荐使用Rstudio进行学习变量R最简单的应用，是可以作为交互式的计算器，在console里输入5+7然后回车:>5+7#输入，R的控制台里输入的前方会有>标志[1]12#输出结果默认情况下，R仅打印结果12。但是，R是一种编程语言，通常我们使用一种编程语言而不是计算器的原因是为了使某些过程自动化或避免不必要的重复。在这种

星轨无尽·2023-09-16 14:43

R语言&Python GEO DataSets多个Series进行差异基因表达分析以及导入Excel到R的问题

引入GEODataSets上，某些Series是由多个series组成的，比如GSE6834,由六个Series组成：ThisSuperSeriesiscomposedofthefollowingSubSeries:Less…Less…GSE6771TemporalCortexControl(mesialtemporallobeepilepsycontrol)GSE6773Temporalneoc

twentyonepilots·2023-09-16 12:43

R语言使用getGEO()直接进行差异表达分析并显示Entrez_id和Symbol_id

引入平常我们利用GEODatasets的表达量数据进行基因表达分析的时候，常常是下载表达矩阵，利用limma包进行分析，如果能找到注释包，那就把探针注释成Entrez_id或者是Symbol_id，如果找不到，那就下载对应GPL提供的注释文件，但是很可能还是不好注释，比如今天拿来做例子的GSE15222对应的GPL2700：我们看到这个GPL只提供了GB_ACC也就是Genebank的一个号码，我

twentyonepilots·2023-09-16 12:43

R语言中的数据框和列表

手动创建一个数据框(数据框每一列的数据类型必须相同，列与列之间可以不同patientID<-c(1,2,3,4)age<-c(25,34,28,52)diabetes<-c("Type1","Type2","Type3","Type2")status<-c("poor","Improved","Excellent","poor")patientsData<-data.frame(patientID

UlissesJr·2023-09-16 09:22

R语言用逻辑回归预测BRFSS中风数据、方差分析anova、ROC曲线AUC、可视化探索

全文链接：https://tecdat.cn/?p=33659行为风险因素监测系统（BRFSS）是一项年度电话调查。BRFSS旨在确定成年人口中的风险因素并报告新兴趋势（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频例如，调查对象被询问他们的饮食和每周体育活动、HIV/AIDS状况、可能的吸烟情况、免疫接种、健康状况、健康日数-与健康相关的生活质量、医疗保健获取、睡眠不足、高血压认知、胆固醇认知

拓端研究室TRL·2023-09-16 06:07

Meta分析核心技术

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。本内容从文

_遇见jia·2023-09-16 06:05

数据分享|R语言逻辑回归、线性判别分析LDA、GAM、MARS、KNN、QDA、决策树、随机森林、SVM分类葡萄酒交叉验证ROC...

全文链接:http://tecdat.cn/?p=27384在本文中，数据包含有关葡萄牙“VinhoVerde”葡萄酒的信息（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。介绍该数据集（查看文末了解数据获取方式）有1599个观测值和12个变量，分别是固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧化硫、总二氧化硫、密度、pH值、硫酸盐、酒精和质量。固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧

拓端研究室TRL·2023-09-16 05:06

数据分享|R语言分析上海空气质量指数数据：kmean聚类、层次聚类、时间序列分析：arima模型、指数平滑法...

本文向大家介绍R语言对上海PM2.5等空气质量数据（查看文末了解数据免费获取方式）间的相关分析和预测分析，主要内容包括其使用实例，具有一定的参考价值，需要的朋友可以参考一下（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据

拓端研究室TRL·2023-09-16 04:50

机器学习——入门

机器学习算法分类：监督学习：目标值是类别->分类问题k-近邻算法、贝叶斯分类、决策树与随机森林、逻辑回归目标值是连续型的数据->回归问题线性回归、岭回归无监督学习：没有目标值->无监督学习聚类

王王仙贝~·2023-09-16 04:02

用R语言从数据库SQL中导入数据

具体实现安装数据库SQLServer2016,在其中创建一个名叫123的数据库，并且在里面创建一个Table_1的表，用于查询操作具体R语言代码如下：//首先下载RODBC包，RODBC包允许R和一个通过

Pang_ling·2023-09-16 03:38

R语言并行计算提高速度丨parallel包和foreach包

并行计算提高R语言速度今天与大家分享的是R语言中的并行计算的内容，将探讨如何使用parallel和foreach包在R中进行并行计算，以及在不同情况下提高计算效率的方法。目标：让计算等待时间缩短！

生信分析笔记·2023-09-16 01:03

R语言用列数据画PCA带椭圆图

之前找了很多信息，见到的都是用行画PCA，用列的大多都是使用fviz_pca_var这个函数，但这个函数椭圆我又死活加不上，再加上画椭圆时的分组信息又没法加在原数据里，纠结了很久。但最后还是被我试出来了。先放个原数据格式：datagrouplibrary("FactoMineR")library("factoextra")library("dplyr")data=read.csv("G:/TPTN

清珺·2023-09-15 23:17

R语言ggplot2作图如何去掉图例中的NA

遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树的时候，我想给进化树的枝分组映射颜色第一步是准备进化树文件(((T1:0.4861354076,T2:0.2834595428):0.942360715,(((T3:0.3184458097,T4:0.9622228269):0.4969661732,T5:0.6340993682):0.5032551708,(T6:0.4230469938,(T7

小明的数据分析笔记本·2023-09-15 19:41

跟着 Cell 学作图 | 3.箱线图+散点+差异显著性检验

“复现是学习R语言的最好办法。”2021.4.12_1DOI:10.1016/j.cell.2020.05.032这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。

木舟笔记·2023-09-15 18:24

R语言学习-单因素方差分析与多重比较

单因素方差分析-aov()单因素方差分析中，我们感兴趣的是比较分类因子定义的两个或多个组别中的因变量均值以multcomp包中的cholesterol数据集为例，50个患者均接受降低胆固醇药物治疗(trt)五种疗法中的一种疗法。其中三种药物相同，分别是20mg一天一次（1time），10mg一天两次（2times）和5mg一天4次（4times），剩下两种方式代表候选药物>library(mult

邱俊辉·2023-09-15 18:51

[NLP]TRL 正式推出，来训练你的首个 RLHF 模型

这是一个超全面的全栈库，包含了一整套工具用于使用强化学习(ReinforcementLearning)训练transformer语言模型。

舒克与贝克·2023-09-15 09:38

CS3103代做、C/C++编程代写、代做Operating Systems、C/C++语言代写帮做R语言编程|代做Process

CS3103OperatingSystemsSemesterA2018/19Project:DynamicMemoryAllocationDueDate:Friday,December7th,2018.TurninhardcopyinclassandsubmitsourcecodeinCanvas.I.ProjectOrganizationInthisproject,you’llwriteadyn

qmhds63·2023-09-15 08:15

数据分享|R语言逻辑回归、Naive Bayes贝叶斯、决策树、随机森林算法预测心脏病...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=23061这个数据集（查看文末了解数据免费获取方式）可以追溯到1988年，由四个数据库组成。克利夫兰、匈牙利、瑞士和长滩。"目标"字段是指病人是否有心脏病。它的数值为整数，0=无病，1=有病（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。数据集信息：目标:主要目的是预测给定的人是否有心脏病，借助于几个因素，如年龄、胆固醇水平、胸痛类型等。我们在这个问题上

拓端研究室TRL·2023-09-15 07:13

H2O操作记录分布式随机森林

数据集下载数据集可以从这个网址进行下载：https://s3.amazonaws.com/h2o-public-test-data/smalldata/flow_examples/ad.data.gz。数据集导入2018-05-08-11-26-41.jpg数据集解析2018-05-08-11-28-26.jpg点击Parse：2018-05-08-11-29-02.jpg点击View查看数据集2

yaoleiroyal·2023-09-15 05:52

【机器学习中的参数：随机种子（random_state）】

random_state可以用于很多函数，我比较熟悉的是用于以下三个地方：1、训练集测试集的划分2、构建决策树3、构建随机森林1、划分训练集和测试集的类train_test_split随机数种子控制每次划分训练集和测试集的模式

佛系人僧·2023-09-15 04:43

基于Python的数据处理与可视化（学习笔记1）

基于Rstudio的Python环境配置至今，Python和R语言是当前众多科研工作者青睐的两种数据处理与可视化的分析语言。

magus_BRI·2023-09-15 03:40

输电线路故障诊断（Python代码，逻辑回归、决策树、随机森林、XGBoost和支持向量机五种不同方法诊断）

效果视频：输电线路故障诊断（Python代码，逻辑回归、决策树、随机森林、XGBoost和支持向量机五种不同方法诊断）_哔哩哔哩_bilibili1.数据仿真平台仿真模型分别获取单相接地故障、两相接地故障

深度学习的奋斗者·2023-09-15 03:06

R语言CalibrationCurves包绘制带可信区间的校准曲线

校准曲线图表示的是预测值和实际值的差距，作为预测模型的重要部分，目前很多函数能绘制校准曲线。一般分为两种，一种是通过Hosmer-Lemeshow检验，把P值分为10等分，求出每等分的预测值和实际值的差距。一种是绘制连续的校准曲线。我们既往已经通过多篇文章介绍了校准曲线绘制，连续的和等分的都有介绍，今天咱们来介绍一下CalibrationCurves包，看名字就知道它是个绘制校准曲线的R包，它的特

天桥下的卖艺者·2023-09-15 01:28

R语言多元时间序列滚动预测：ARIMA、回归、ARIMAX模型分析

拓端研究室·2023-09-14 20:14

《R数据科学》学习笔记|Note11:使用forcats处理因子

相较于其他R语言教程来说，本书一个很大的优势就是直接从实用的R包出发，来熟悉R及数据科学。更新过程中，读者朋友如发现错误，欢迎指正。如果有疑问，也可以后台私信。希望各位读者朋友能学有所得！

木舟笔记·2023-09-14 18:25

R语言-错误分析-Error in .Call.graphics(C_palette2, .Call(C_palette2, NULL)) : invalid graphics state

问题描述：plot时，出现的错误01>ggplot(religions_long,+aes(State,value,fill=variable))++geom_bar(stat="identity")++coord_flip()>Errorin.Call.graphics(C_palette2,.Call(C_palette2,NULL)):invalidgraphicsstate解决方案：可能是

玄武灌汤包·2023-09-14 17:23

Python用正则化Lasso、岭回归预测房价、随机森林交叉验证鸢尾花数据可视化2案例|数据分享...

复杂模型，如随机森林、神经网络和XGBoost，更容易出现过

拓端研究室TRL·2023-09-14 11:26

跟着Nature学作图：R语言ggplot2画误差线展示广义线型模型的比值比（odds ratio）

论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的

小明的数据分析笔记本·2023-09-14 11:23

R语言入门section3

百分位数quantile()quantile()和fivenum()的本质差别在于,quantile()函数的算法是采用加权平均，fivenum()是算术平均。

JeffreyPaul·2023-09-14 08:21

机器学习（13）---降维实例

目录一、人脸识别降维1.1查看原图1.2降维后的图像二、迷你案例2.1用人脸识别看PCA降维后的信息保存量2.2噪音过滤2.3手写数字降维（随机森林）2.4手写数字降维（KNN）2.4案例总结一、人脸识别降维

冒冒菜菜·2023-09-14 07:23

【R语言】绘制GO富集分析弦图

GO和KEGG富集分析视频讲解☞DAVID进行GO/KEGG富集分析及结果可视化也给大家介绍了☞circleplot展示GO富集分析结果☞【实战】circleplot展示GO富集分析结果—附R代码☞【R语言

生信交流平台·2023-09-14 03:08

Scikit-Learn快速生成分类数据集

本文通过示例详细说明，并结合随机森林分类算法进行验证。make_classification函数

梦想画家·2023-09-13 23:22

一文看懂随机森林 - Random Forest（附 4 个构造步骤+4 种实现方式评测+10 个优缺点）

本文首发自产品经理的人工智能知识库原文地址：《一文看懂随机森林-RandomForest（附4个构造步骤+10个优缺点）》一文看懂随机森林随机森林是一种由决策树构成的集成算法，他在很多情况下都能有不错的表现

easyAI人工智能知识库·2023-09-13 23:36

R语言机器学习与临床预测模型76--预测模型验证方法

R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01数据集划分按一定比例划分为训练集和测试集这种方法也称为保留法。

科研私家菜·2023-09-13 12:27

计算古坐标——基于GPlates Web Service的坐标点重建

而rgplates利用R语言提供了直接进行坐标点计算的reconstruct函数，最近看到了GPlatesWebService，即GPlates的API，阅读熟悉该文档的同时用python写一下脚本。

ALittleHigh·2023-09-13 01:28

三个月我要学会R编程

感觉R数据科学这本书的编程部分对于0基础不是很友好，所以决定先看作者推荐的编程入门的书《R语言入门与实践》

枸杞子岛年·2023-09-12 23:34

Day5——车车

R语言数据结构R语言之前有接触过，今天的内容大部分是熟悉的，就挑了一些不太熟悉的内容记录了一下：数据结构内容记录

滴答滴答的小火车·2023-09-12 18:04

生信星球学习小组第29期 Day5

控制台=Linux命令行R的代码都是带括号，英文格式显示工作路径getwd()；设置工作路径setwd(dir="C:/Users/xxx/xxxx/xxx")向量是元素组成，元素可以是数字或字符串表格在R语言中叫

Hannahhao·2023-09-12 18:00

数据分享|R语言武汉流动人口趋势预测：灰色模型GM（1，1）、ARIMA时间序列、logistic逻辑回归模型...

本文帮助客户综合运用R语言灰色预

拓端研究室TRL·2023-09-12 16:53

【胡锡进】大模型量化分析-汇川技术 300124.SZ

接下来，我将使用自回归移动平均模型（ARMA）、Bollinger带、随机森林回归（RandomForestRegression）、自回归移动平均法（ARIMA）和长短期记忆模型（LSTM）来预测汇川技术未来

civilpy·2023-09-12 16:50

R语言统计学DOE实验设计：用平衡不完全区组设计（BIBD）分析纸飞机飞行时间实验数据...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=31010平衡不完全区组设计（BIBD）是一个很好的研究实验设计，可以从统计的角度看各种所需的特征（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。最近我们被客户要求撰写关于BIBD的研究报告，包括一些图形和统计输出。对于一个BIBD有K个观测，重复r次实验。还有第5参数lamda，记录其中每对实验发生在设计块的数目。生成一组BIBD设计，设计行列和每块的

拓端研究室TRL·2023-09-12 12:40

机器学习（10）---特征选择

概述二、Filter过滤法2.1过滤法说明2.2方差过滤2.3方差过滤对模型影响三、相关性过滤3.1卡方过滤3.2F检验3.3互信息法3.4过滤法总结四、Embedded嵌入法4.1嵌入法说明4.2以随机森林为例的嵌入法五

冒冒菜菜·2023-09-12 11:57

2019-nCov疫情查看R语言代码

转自Y叔（1）检索疫情数据（2）各省市的疫情历史数据（3）疫情地图（1）检索疫情数据主要函数：get_nCov2019，summaryremotes::install_github("GuangchuangYu/nCov2019")library(nCov2019)x<-get_nCov2019()#当前最新数据xopen(x)#打开腾讯浏览器全国各省数据画图library(forcats)lib

白云梦_7·2023-09-12 11:42

[R语言学习笔记] - Rstudio更变console的显示信息至英文

场景我是在windows上使用的R及Rstudio。输出到控制台Rconsole的错误信息都是中文。虽然信息比较方便理解，但是在查找相关信息的时候，中文在搜索引擎中并不能很好的定位错误。所以我打算将Rconsole改为英文显示。解决方案在网上查到的就该Rconsole语言的操作。到R目录下的\etc的Rconsole文件，修改language=en。但这样的操作只能让Rgui的显示信息调整为英文。

飞翔的烤鸡翅·2023-09-12 09:05

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