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转录组学习七(差异基因分析)
转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(
reads
的比对与samtools排序)转录组学习六(
reads
计数与标准化
Dawn_天鹏
·
2018-03-29 20:47
转录组学习六(
reads
计数与标准化)
转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(
reads
的比对与samtools排序)转录组学习六(
reads
计数与标准化
Dawn_天鹏
·
2018-03-29 20:05
转录组学习五(
reads
比对)
转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(
reads
的比对与samtools排序)转录组学习六(
reads
计数与标准化
Dawn_天鹏
·
2018-03-29 20:16
RNASEQ分析入门笔记2-下载原始数据
AKAP95regulatessplicingthroughscaffoldingRNAsandRNAprocessingfactors.NatCommun2016Nov8;7:13347.PMID:27824034根据文献,原始数据下载地址如下:ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/
reads
括囊无誉
·
2018-03-22 05:31
C++ 线程编程
#include#include#includestd::mutexmtx;voidprintMultipleChar(inttimes,charc);intmain(_In_intargc,_In_
reads
CS_Zero
·
2018-03-08 22:08
C++
Mysql-锁定读(Locking
Reads
)
关于读锁mysql官方文档地址:https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/innodb-locking-
reads
.html与一致性非锁定读(普通读、快照读)对应的就是锁定读
cxm19881208
·
2018-03-08 17:44
服务器端
数据库
[MySQL Status] Queries,Questions,read/s区别,Com_Commit和handle_commit
包括存储过程内部的查询Questions:这个状态变量表示,mysql系统接收查询的次数,但是不包括存储过程内部的查询showengineinnodbstatus->[RowOperations]->
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Fanr_Zh
·
2018-02-28 08:00
oracle数据库顶级(TOP) sql查询
1、查找使用资源最多的SQL语句:(较高的磁盘读取(disk_
reads
消耗I/O)和较高的逻辑读取(buffer_gets消耗CPU)被用作衡量标准)selectsql_textfrom(selectsql_text
heguanghuicn
·
2018-02-27 23:04
笔记
转录组学习二(数据下载)
转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(
reads
的比对与samtools排序)转录组学习六(
reads
计数与标准化
Dawn_天鹏
·
2018-02-27 21:18
转录组学习一(软件安装)
转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(
reads
的比对与samtools排序)转录组学习六(
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计数与标准化
Dawn_天鹏
·
2018-01-17 14:33
MySQL监控项一些指标
Innodb_pages_read从InnoDBbufferpool中读取的page数量.Innodb_pages_written向InnoDB表中写入的page数量.Innodb_buffer_pool_
reads
知止内明
·
2017-12-20 10:20
MySQL
监控项
一些指标
数据库
Nginx缓存的两种方式
第一种情况来个例子:$curl-Ihttp://www.12
reads
.cnHTTP/1.1200OKServer:JSP3/2.0.4Date:Fri,31Oct201407:28:20GMTContent-Type
code-is-poetry
·
2017-11-23 11:03
NGINX
测序与平台
学员分享-Chip-seq实战分析流程从fasta序列里面模拟测序的
reads
走SNP-calling流程浅谈Blast&Blat
王诗翔
·
2017-10-23 18:08
htseq-count的使用
htseq-count是一款用于
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计数的软件,他能对位于基因组上的一些单位的
reads
数进行统计,这里所说的单位主要是指染色体上的一组位置区间(我们常见的就是geneexon)。
高锦-生信
·
2017-10-17 10:20
NGS
mysql5.6之key_buffer_size优化设置
通过检查状态值Key_read_requests和Key_
reads
,可以知道key_buffer_size设置是否合理。
wjw555
·
2017-09-28 15:06
mysql
key
buffer
MySQL
转录组入门(3):了解fastq测序数据
作业,理解测序
reads
,GC含量,质量值,接头,index,fastqc的全部报告来源于生信技能树:http://www.biotrainee.com/forum.php?
_eason_
·
2017-09-11 22:40
ORACLE实际执行计划与预估执行计划不一致性能优化案例
使用下面SQL找出DISK_READ最高的TOPSQL分析时,分析过程中,有一条SQL语句的一些反常现象,让人觉得很奇怪:SELECTSQL_ID, SQL_TEXT, DISK_
READS
潇湘隐者
·
2017-08-19 16:00
转录组入门(6):
reads
计数
作业要求1.实现这个功能的软件也很多,还是烦请大家先自己搜索几个教程,入门请统一用htseq-count,对每个样本都会输出一个表达量文件。2.需要用脚本合并所有的样本为表达矩阵。参考:生信编程直播第四题:多个同样的行列式文件合并起来。3.对这个表达矩阵可以自己简单在excel或者R里面摸索,求平均值,方差。看看一些生物学意义特殊的基因表现如何,比如GAPDH,β-ACTIN等等。来源于生信技能树
lxmic
·
2017-08-13 15:12
转录组入门(3):了解fastq测序数据
作业,理解测序
reads
,GC含量,质量值,接头,index,fastqc的全部报告,搜索中文教程,并发在论坛上面。
lxmic
·
2017-07-23 09:23
转录组入门(5): 序列比对
直接去hisat2的主页下载index文件即可,然后把fastq格式的
reads
比对上去得到sam文件。
徐洲更hoptop
·
2017-07-19 12:03
转录组入门(3):质量控制
作业,理解测序
reads
,GC含量,质量值,接头,index,fastqc的全部报告,搜索中文教程,并发在论坛上面。
徐洲更hoptop
·
2017-07-11 18:35
log_bin_trust_function_creators变量解释
This function has none of DETERMINISTIC, NO SQL, or
READS
SQL DATA in its declaration and binary logging
Hooper_Hu
·
2017-06-09 12:53
服务器
数据库
master
linux学习
nodeJS之事件events
例如,一个net.Server对象会在每次有新连接时触发一个事件;一个fs.
ReadS
jjjssswww
·
2017-06-06 09:17
触发器
events
stream
InnoDB缓冲池命中率(书摘备查)
Innodb_buffer_pool_read_requests)/(Innodb_buffer_pool_read_requests+Innodb_buffer_pool_read_ahead+Innodb_buffer_pool_
reads
wzy0623
·
2016-12-28 13:00
MYSQL经常挂,怀疑内存不够,加SWAP优化
如题,最近http://www.12
reads
.cn/的MYSQL经常挂,最近挂的LOG:Attime:WedDec709:15:01CST2016:MySQLerrorstop.Attime:WedDec709
code-is-poetry
·
2016-12-24 13:49
mysql
This function has none of DETERMINISTIC, NO SQL, or
READS
SQL DATA in its declaration and binary log
mysql复制数据库到其他主机时,报:ThisfunctionhasnoneofDETERMINISTIC,NOSQL,orREADSSQLDATAinitsdeclarationandbinaryloggingisenabled(youmightwanttousethelesssafelog_bin_trust_function_creatorsvariable)错误。错误原因:MySQL设置默
最是那
·
2016-11-09 14:47
mysql
mysql lock in share mode 和 select for update
接触到以下两个mysqlsql语法:selectlockinsharemodeselectforupdate从官网上查找到对应的章节,属于LockingReads里面的内容,具体链接如下:locking-
reads
ZzzCrazyPig
·
2016-09-28 10:32
mysql
事务
行锁
mysql
【生信训练营-3】IRanges入门
生信分析中时时处处离不开ranges,比如:gene的注释文件(GTF,GFF3,BED),就是ranges的集合,一个range可以表示gene或exon在chromosome上的位置
reads
的alignment
Rapp
·
2016-09-01 08:47
ERROR 1418 (HY000): This function has none of DETERMINISTIC, NO SQL, or
READS
SQ L DATA in its decla
ERROR1418(HY000):ThisfunctionhasnoneofDETERMINISTIC,NOSQL,orREADSSQLDATAinitsdeclarationandbinaryloggingisenabled(you*might*wanttousethelesssafelog_bin_trust_function_creatorsvariable)错误的原因:Mysql配置了复制
长江某菜鸟
·
2016-08-30 13:18
mysql
1418 - This function has none of DETERMINISTIC, NO SQL, or
READS
SQL DATA in its declaration a
mysql恢复备份数据库的时候提示:[Msg]1418-ThisfunctionhasnoneofDETERMINISTIC,NOSQL,orREADSSQLDATAinitsdeclarationandbinaryloggingisenabled(youmightwanttousethelesssafelog_bin_trust_function_creatorsvariable)问题原因:因为
maweiba163
·
2016-07-13 10:02
mysql
sql性能相关语句
1.查看消耗资源最多的SQLSELECThash_value,executions,buffer_gets,disk_
reads
,parse_calls,sql_fulltextFROMV$SQLAREAWHEREbuffer_gets
热恋Oracle
·
2016-05-20 11:14
oracle实用
LeetCode 157: Read N Characters Given Read4
TheAPI:intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersread.Forexample
github_34333284
·
2016-05-06 04:00
POJ-1201-Intervals(差分约束)
Writeaprogramthat:
reads
qq978874169
·
2016-05-04 13:00
C++
ACM
poj
oracle 查询当前占用cpu及时间最长的sql语句
A.STATUS,A.PROGRAM,A.MACHINE,A.CLIENT_IDENTIFIER,B.SQL_TEXT,B.CPU_TIME,B.SHARABLE_MEM,ROUND((B.DISK_
READS
zmx729618
·
2016-04-27 17:00
查看需要优化的sql
视图查看最糟糕的查询(最消耗磁盘读的sql语句)selectb.username, a.disk_readsreads, a.executionsexec, a.disk_
reads
huhu307
·
2016-04-19 22:00
优化
查询
select
消耗
需要优化的sql
windows多线程系列006 WaitForMultipleObjects详解
WaitForMultipleObjects()这个函数,在这里我们简单了解一下该函数的使用,先看函数原型:DWORDWINAPIWaitForMultipleObjects(_In_DWORDnCount,_In_
reads
DaveBobo
·
2016-04-11 17:08
多线程网络数据库
windows多线程系列006_WaitForMultipleObjects详解
WaitForMultipleObjects()这个函数,在这里我们简单了解一下该函数的使用,先看函数原型:DWORD WINAPI WaitForMultipleObjects( _In_DWORDnCount, _In_
reads
DaveBobo
·
2016-04-11 17:00
python 实现iotop
/usr/bin/python importsys,os,time,signal,re classDiskIO: def__init__(self,pname=None,pid=None,
reads
fuchao1
·
2016-03-27 11:11
python
监控
LeetCode Read N Characters Given Read4 II - Call multiple times
leetcode.com/problems/read-n-characters-given-read4-ii-call-multiple-times/题目:TheAPI: intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersrea
Dylan_Java_NYC
·
2016-03-26 05:00
LeetCode Read N Characters Given Read4
原题链接在这里:https://leetcode.com/problems/read-n-characters-given-read4/题目:TheAPI: intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersread.Forexample
Dylan_Java_NYC
·
2016-03-26 04:00
[leetcode] 158. Read N Characters Given Read4 II - Call multiple times 解题报告
leetcode.com/problems/read-n-characters-given-read4-ii-call-multiple-times/TheAPI: intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersread.Fore
qq508618087
·
2016-03-20 07:00
LeetCode
String
查看sqlserver 2008中性能低下的语句
SELECTcreation_timeN'语句编译时间' ,last_execution_timeN'上次执行时间' ,total_physical_readsN'物理读取总次数' ,total_logical_
reads
davidhou
·
2016-03-12 10:00
[leetcode] 157. Read N Characters Given Read4 解题报告
题目链接:https://leetcode.com/problems/read-n-characters-given-read4/TheAPI: intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersread.Forexample
qq508618087
·
2016-03-09 05:00
LeetCode
String
Facebook
查看最耗资源的SQL语句、或者最占CPU的SQL
total_elapsed_time/1000N'总花费时间ms',total_worker_time/1000N'所用的CPU总时间ms',total_physical_readsN'物理读取总次数',total_logical_
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将才
·
2016-03-05 08:00
查看sqlserver 2008中性能低下的语句
SELECTcreation_timeN'语句编译时间' ,last_execution_timeN'上次执行时间' ,total_physical_readsN'物理读取总次数' ,total_logical_
reads
davidhou
·
2016-02-20 13:00
[LeetCode] Read N Characters Given Read4 II - Call multiple times 用Read4来读取N个字符之二 - 多次调用
TheAPI:intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersread.Forexample
Grandyang
·
2016-02-04 15:00
[LeetCode] Read N Characters Given Read4 II - Call multiple times 用Read4来读取N个字符之二 - 多次调用
TheAPI:intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersread.Forexample
Grandyang
·
2016-02-04 15:00
Oracle TopSQL
--top10sql SELECT* FROM(SELECTb.usernameusername, a.disk_
reads
/DECODE(a.executions,0,1,a.executions
tooby
·
2016-02-02 09:32
[LeetCode] Read N Characters Given Read4 用Read4来读取N个字符
TheAPI:intread4(char*buf)
reads
4charactersatatimefromafile.Thereturnvalueistheactualnumberofcharactersread.Forexample
Grandyang
·
2016-02-01 02:00
pymongo "ServerSelectionTimeoutError: No servers found yet" 错误的解决
报这个错误报错提示:File"/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pymongo/mongo_client.py",line748,in_socket_for_
reads
dipolar
·
2016-01-26 18:00
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