reads 第14页

RNA-seq(5):序列比对：Hisat2

直接去hisat2的主页下载index文件即可，然后把fastq格式的reads比对上去得到sam文件。

Y大宽·2019-12-16 08:07

第3篇：用MACS2软件call peaks

学习目标：学会用MACS2callpeaks理解MACS2callpeaks的结果PeakCallingPeakcalling即利用计算的方法找出ChIP-seq或ATAC-seq中reads富集的基因组区域

六六_ryx·2019-12-12 05:14

sql server查询IO消耗大的排查sql诊断语句

selecttop50(total_logical_reads/execution_count)asavg_logical_reads,(total_logical_writes/execution_count

游不动·2019-12-11 09:00

分享一段基因组测序数据比对和变异检测的“代码”

代码如下：#比对bwamem-Mref.fasta-t2Z1_R1.fqZ1_R2.fq>aligned_reads_Z1.sam#排序java-Xmx5g-jarpicard.jarSortSamI=

孤独巡礼_435a·2019-12-08 06:27

从《沟通与说服必读12篇》到《影响力》，十大经典沟通类书籍推荐

需要说明的是，在本书单中，除《沟通与说服必读12篇》仅能从12Reads官网获得外，其他书籍各大图书电商平台均有销售。P.S.《沟通与说服必读12篇

code-is-poetry·2019-12-06 00:17

转录组学习八（功能富集分析）

转录组学习一（软件安装）转录组学习二（数据下载）转录组学习三（数据质控）转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究）转录组学习五（reads的比对与samtools排序）转录组学习六（reads计数与标准化

Dawn_天鹏·2019-12-02 10:20

英文底层逻辑分析及整理（5）

一、动词规则变化动词第三人称单数变化规则1、一般情况下，动词后直接加s，如：works,gets,reads等。

败家·2019-11-30 05:59

RPKM、FPKM、TPM详解

简写RPKM:ReadsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedreads(每千个碱基的转录每百万映射读取的reads)FPKM:FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedfragments

NoviceWitch·2019-11-24 01:50

用泊松分布解释 NGS 测序数据的 duplication 问题

什么样的数据算是duplicateduplicate就是一段序列的多个拷贝，以PE测序为例，用比对软件在将测序reads比对到参考基因组之后，如果有两对reads的r

生信杂谈·2019-11-08 18:20

基因组的从头组装

基因组组装一般分为三个层次，contig,scaffold和chromosomes.contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。

麋鹿吃了颗草莓·2019-11-08 16:16

#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表达谱数据整合

miRNA表达谱为例.我们上次已经下载了373个cases的425个表达谱文件,每个样本(case)的表达谱文件格式如下.单个样本miRNA表达谱其他所有样本的格式与上图相同.每列依次是miRNA名称,原始reads

生信杂谈·2019-11-07 05:24

哈佛商业评论 10 Must Reads on Mental Toughness

image.png下载地址：哈佛商业评论10MustReadsonMentalToughness一本免费的电子书，胜过一杯付费的咖啡站点：https://www.91xiazai.site/我的微信：Learning-machine高质量学习资源【亲测能赚钱】城通网盘：别人下载就能赚钱的网盘每1000万下载至少¥400收益https://www.ctfile.com/linker/18764838

伴你阅读·2019-11-06 15:22

重测序之BSA

已有的基因组发表出来以后，重新进行测序就不需要拼接，直接可以对测序reads进行短序列比对。简而言之就是对基因组序列已知的物种个体进行基因组测序。本质就是找变异。通过这种方法，可以比较个体或者

刘小泽·2019-11-04 18:13

(3)转录组之数据质控

一、输入数据的准备fastqc所需要的输入数据是fastq格式的reads数据或者bam/sam比对数据，所以我们需要先将从SRA上用prefetch下载的sra格式文件做下转换。

ZG_N1·2019-11-04 10:07

转录组入门（5）：序列比对

直接去hisat2的主页下载index文件即可，然后把fastq格式的reads比对上去得到sam文件。

_eason_·2019-11-04 01:19

用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头

一般来讲，我们对测序数据进行QC，就三个大的方向：QualitytrimmingAdapterremovalContaminantfiltering当我们是双端测序数据的时候，去除接头时，也会丢掉太短的reads

生信技能树·2019-11-02 03:54

转录组入门三（mac 版）：了解fastqc测序数据

作业，理解测序reads，GC含量，质量值，接头，index，fastqc的全部报告，搜索中文教程，并发在论坛上面。

thinkando·2019-11-01 01:09

oracle 查看实时SQL的CPU使用情况

A.STATUS,A.PROGRAM,A.MACHINE,A.CLIENT_IDENTIFIER,B.SQL_TEXT,B.CPU_TIME,B.SHARABLE_MEM,ROUND((B.DISK_READS

lych528·2019-10-25 17:35

提取未比对序列

将reads比对到参考序列bwaindexR1.fabwamem-t4R1.fa/mnt/e/SCN/FULL/full_k65_cov_TSLR/SCN_tr_1.00.0_0.cor.fastq.gz

nitrostarch·2019-10-22 08:44

经典：基因组测序数据从头拼接或组装算法的原理

基因组测序数据的拼接/组装（图片来源：google）每一个物种的参考基因组序列（referencegenome）的产生都要先通过测序的方法，获得基因组的测序读段（reads），然后再进行从头拼接或组装（

AIPuFu·2019-09-27 10:00

SQL SEVER数据库重建索引的方法

SELECTcreation_timeN'语句编译时间',last_execution_timeN'上次执行时间',total_physical_readsN'物理读取总次数',total_logical_reads

·2019-09-25 01:54

优化mysql之key_buffer_size设置

通过检查状态值Key_read_requests和Key_reads，可以知道key_buffer_size设置是否合理。

·2019-09-24 02:14

来自刘小泽理解的一份诚意满满的单细胞教程

Readcountdatahttps://bioconductor.org/packages/release/workflows/vignettes/simpleSingleCell/inst/doc/reads.html

刘小泽·2019-09-23 18:38

哈佛商业评论管理必读 HBR’s 10 Must Reads 2019

image.png下载地址：哈佛商业评论管理必读HBR’s10MustReads2019一本免费的电子书，胜过一杯付费的咖啡站点：https://www.91xiazai.site/我的微信：Learning-machine高质量学习资源【亲测能赚钱】城通网盘：别人下载就能赚钱的网盘每1000万下载至少¥400收益https://www.ctfile.com/linker/18764838截图为证

伴你阅读·2019-09-22 21:54

innodb命中率评估

Innodb_buffer_pool_read_requests)/(Innodb_buffer_pool_read_requests+Innodb_buffer_pool_read_ahead+Innodb_buffer_pool_reads

秋天的春·2019-08-30 11:33

《管理者必读12篇》如何购买

P.S.其实直接上12Reads全系列更划算。

code-is-poetry·2019-08-14 11:01

【Windows SQL server】查询SQL server 内存瓶颈情况

qs.execution_count,qs.last_elapsed_time,qs.min_elapsed_time,qs.max_elapsed_time,total_worker_time,total_logical_reads

tiankeywu·2019-08-06 18:18

aspera 使用（简版）

T-l200m-i~/miniconda3/etc/[email protected]:/sra/sra-instant/reads

mitoheng·2019-08-02 15:32

企业管理好书推荐，管理类书籍看这些就够了

由于学习和工作方面的原因，笔者本人看过的企业管理书籍不在少数，虽不敢说什么读书破万卷，但也至少有好几十本了吧，而在所有看过的管理书籍中，给笔者印象最深的还是今天要向大家推荐的12Reads系列。

code-is-poetry·2019-08-02 11:40

14本经典商业书籍推荐，经管书籍看这些足够了

1.《12Reads系列》12Reads系列是一整套非常的经典商业管理书籍，领导涵括了企业战略、市场营销、人力资源及领导力等组织管理与自我管理的方方面面。

code-is-poetry·2019-08-02 11:13

如何提高职场说服力？看这本书就对了

当然，12Reads系列的培训教材都很不错，惟一不足之处是包括《沟通与说服必读12篇》在内的所有12Reads系列书籍仅能从12Reads官网获得，并且普遍定价要高于其他

code-is-poetry·2019-08-02 11:58

FastQC数据质控报告的详细解读

BasicStatistics基本信息imageEncoding:测序平台编号，现在Sanger/Illumina1.8以上都是Phred33编码Totalsequences:reads数量（reads

husy_·2019-08-02 10:31

真的不用上EMBA了，看完这套管理书籍就可以了！

从学生时代开始一直到走上管理岗位的这些年来，企业管理类的书籍笔者接触过的不在少数，各式各样的管理培训也参加过很多场，但印象最深的还是12Reads系列。

code-is-poetry·2019-07-31 12:05

2019-07-19-mqtt-mosquitto-服务端源码分析

文章目录1main()主流程1.1mosquitto_main_loop()1.1.1loop_handle_reads_writes()1.1.1.1handle__connect()处理连接1.1.1.2handle

林兴洋·2019-07-27 15:14

biostar handbook|如何模拟NGS测序结果

xuzhougeng·2019-07-26 10:41

js 读取图片路径并预览图片

varreads=newFileReader();varfile=document.getElementById('file').files[0];formData.append('picFile',file);reads.readAsDataURL

Lei_zhen96·2019-07-24 20:17

员工管理书籍推荐，做好员工管理看这些书就够了

《员工管理必读12篇》是12Reads系列培训教材惟一专注人员管理的著述，有了它，员工管理理应简简单单并效率出奇。2、《科学管理原理》泰勒的管理理论看似简单，其实内涵却很丰富，并非能被

code-is-poetry·2019-07-23 11:37

利用RNA velocity来做细胞trajectory inference

【搬运】文章转自：https://www.cnblogs.com/leezx/p/9504896.html单细胞转录组确实是利器，但我们大多只利用了表达的信息，而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了

CuteCurse·2019-07-18 13:59

无参转录组分析（Trinity）

1分析步骤1.1序列延伸(inchworm)--虫-将reads切割为k-mers(kbp长度的短片段)-利用Overlap关系对k-mers进行延伸(贪婪算法)-输出所有的序列(configs)1.2

nnlrl·2019-07-17 09:18

经典管理畅销书籍：《管理者必读12篇》

注：很多朋友发消息给我问如何买这本书，要购买《管理者必读12篇》，请移步12Reads官网，地址请自行百度，目前仅可从官网获得。

translator·2019-07-08 00:28

经典营销管理书籍推荐，你看过哪几本？

translator·2019-07-04 19:52

win10中 deeplab模型在pascal数据集的运行问题整理

问题1：TypeError:__init__()gotanunexpectedkeywordargument'num_parallel_reads'解决办法：函数参数换成files问题2：AttributeError

daliangd·2019-06-26 13:01

学习使用一款数据质控软件（Trimmomatic）

写在前面Trimmomatic工具是用于illumina二代测序数据的reads处理，主要对接头(adapter)序列和低质量序列进行过滤。

喵小媛·2019-06-24 15:29

prometheus PromQL 内置函数

.+"}[2m])/(increase(node_disk_reads_completed[2m])+increase(node_disk_writes_completed[2m]))*1000分析(1

dengxiafubi·2019-06-18 20:13

Oracle 查询当前用户正在执行的SQL

b.sql_text,b.sql_fulltext,b.executions,b.first_load_time,b.last_load_time,b.last_active_time,b.disk_reads

Seandba·2019-06-18 16:05

为什么说《销售管理必读12篇》是值得推荐的销售书籍？

注：作为经典管理类书籍12Reads系列的成员之一，《销售管理必读12篇》同样只能从12Reads的官网获得，并且价格略贵，这是惟一不足之处。销售管理对于一家公司的重要性不言而喻。在《销售管

translator·2019-06-03 18:14

RPKM/FPKM/TPM/CPM说明

唯一的区别是FPKM适用于双端测序文库FPKM(FragmentsPerKilobaseMillion)#而RPKM适用于单端测序文库TPM(TranscriptsPerMillion)RPM/CPM(Reads

装在瓶子里的阳光_2a70·2019-05-16 20:28

有参转录组学习二：数据质控

Author：ligcDate：19/5/151.1fastqc结果解读：测序量：300M左右reads长度：51bpBasicStatistics测序的adapteradapter_content.png

颤抖吧__小虫子·2019-05-15 21:35

优化SQL集一

-->寻找低效的SQL语句,下面的语句主要适用于从视图v$sqlarea中获得当前运行下且耗用buffer_gets较多的SQL语句SELECTexecutions,disk_reads,buffer_gets

子鱼猴·2019-05-13 19:00

从IGV的可视化结果看链特异性建库

readstrand右击，选择Groupalignmentsby，选择first-in-pairstrandigv_snapshot.png上图这两个基因因为转录方向不同，所以Firstinpair的这条reads

佳名·2019-05-06 12:28

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