snp

Vue2和Vue3项目引入ElementUI组件方式不同

也会报错，不能正常显示（在安装之后我们都将使用Vue2进行构建前端Vue项目）创建一个新的项目element-ui-project当前项目下打开终端,安装依赖包,执行下面的命令npmielement-ui-Snp
云梦归遥·2023-12-15 16:52

使用VEGAS2（Versatile Gene-based Association Study）进行gene based的关联分析研究

gene-based关联分析研究是SNP-based关联分析研究的一个补充。目前有很多工具支持gene-based关联分析研究，比如GCTA，VEGAS2等。
橙子牛奶糖·2023-12-14 18:45

单行命令

利用plink进行数据预处理（修剪SNP集）！！！
琴酒martini·2023-12-06 19:52

生信软件8 - bedtools进行窗口划分、窗口GC含量、窗口测序深度和窗口SNP统计

使用bedtools进行窗口划分、窗口GC含量、窗口测序深度和窗口SNP变异位点数量统计软件安装1.conda安装condainstallbedtools-y2.源码安装wgethttps://github.com
生信与遗传解读·2023-12-04 06:18

跟着Nature Genetics学画图：R语言ggbio包画基因结构图

Pan-genomeanalysishighlightstheextentofgenomicvariationincultivatedandwildriceimage.png今天重复的图是来自于论文中的figure3bimage.png下半部分表示SNP
小明的数据分析笔记本·2023-12-03 02:24

C语言——一些处理脚本(3)——(待完善)

for(i=0;isnp0
病树前头·2023-12-02 03:08

2021-01-04根据SNP验证自然选择—XPEHH分析

转载自https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcIw背景选择清除分析是常用于鉴定群体基因组水平受选择区域的一种方法，其背后的理论是：在受选择群体中，会出现有利等位基因的频率快速上升，与其相邻位点的多态性快速下降的现象。基于此，我们可以通过计算群体内基因组区域的等位基因频率的变化情况来鉴定受选择基因组区域。常用群体内检测指标的计算方法大致分为三种：
麦冬花儿·2023-11-29 17:22

2021-08-25

vcf文件格式：VCF格式用于记录变异位点（SNP/InDel）的文件格式。#开头注释部分无#开头主体部分，主体部分包含10列数据，主体部分每一行代表一个变异位点信息。
小灯哇11·2023-11-28 19:16

GWAS：plink进行meta分析

命令如下所示：plink--meta-analysisgwas1.plinkgwas2.plinkgwas3.plink+logscaleqt--meta-analysis-snp-fieldSNP--
橙子牛奶糖·2023-11-27 00:04

2020.11.10丨BSA基础知识及产品介绍

1.1研究目的基因定位1.2基本概念BulkedSegregantAnalysis，分离群体分组分析法定义：在性状分离的遗传群体中，选择表型极端差异个体将其DNA等量混合，分别构建DNA混池，与性状相关SNP
穆易青·2023-11-23 18:42

BSA分析详解

），也称分离群体分组分析，是指利用目标性状存在极端表型差异的两个亲本构建分离群体，在子代分离群体中，选取两组表型差异极端的个体分别构建混合池，结合高通量测序技术对混合样本测序，比较两组群体在多态位点（SNP
awk_bioinfo·2023-11-23 18:38

9.3 GWAS：关联分析——EMMAX

EMMAX认为，每一个SNP对复杂性状的解释率都很低，每个组件的方差在运算中都只计算一次，从而达到简化计算的目的。
Wei_Sun·2023-11-23 16:22

PheWAS(全表型组关联分析)----GWAS and PheWAS(一)

GWAS通常关注SNP与性状之间的关联，可以用于人，也可以用于其他生物体。
bcl_hx·2023-11-23 14:59

R绘图|染色体SNP指数图绘制

该配图一共由三个图组成，不同染色体的SNP-index[2]对其位置作整图、单一染色体的SNP-index对其位置作细节图以及对应的
小汪Waud·2023-11-23 07:06

ADS村田电感.mod（spice netlist文件）和.s2p模型导入与区别

ADS村田电感.mod（spicenetlist文件）和.s2p模型导入与区别环境ADS2020过程使用了这一型的电感模型LQW15AN3N9C00#有两种模型的，一种是spicenetlist一种是snp
秋风知我意i·2023-11-20 19:29

R语言实现多变量孟德尔随机化分析（1）

某个暴露相关的SNP，往往与某个或者某几个混杂因素相关。可以控制混杂偏倚。3、如何解释结果？若该暴露的P值小于0.05，则可以说明该暴露独立于其他暴露对结局产生影响。否则是通过其他因素对结局产生影响。
weixin_49320263·2023-11-20 08:08

2020-10-05 genotype calling

Genotype-callingalgorithmsusenormalizedmeasuresofDNAbindingtoallelespecificprobestoascertainthegenotypeofanindividualatagivenSNP.基因型调用算法使用DNA与等位基因特异性探针结合的标准化测量来确定给定SNP
我们一起舔过铁栏杆·2023-11-20 08:05

GWAS全基因组关联分析实战——基于Plink转换vcf数据为二进制

1数据准备首先，使用plink将原始的SNP数据（snps_fil.recode.vcf）转换为二进制数据（bim、bed、fam）：格式转换：mkdirGWAs_rawnohupplink--vcfsnps
Odd_guy·2023-11-15 22:15

亲测好用! 全局使用less 定义的变量 （vue）- 实现换肤等功能，解决@变量 提示undefined 问题

less-loader(建议安装固定匹配版本，要不容易出错）"less":"^4.0.0",//这是我的less版本"less-loader":"^8.0.0",安装命令：[email protected]Snp
qq_40569574·2023-11-15 07:55

2021.12.19【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章 高级数据库搜索 下）

对比对工具要求越来越高能在基因组DNA中找到外显子比对时考虑基因组DNA包含的测序错误有相应的算法解决相关物种的基因组在比对中出现删除、重复、倒置或移位的问题有相应的算法解决DNA序列之间的小差异，如SNP
穆易青·2023-11-14 01:42

2021.11.22【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章第五节 用类似于BLAST的比对工具快速搜索基因组DNA）

对比对工具要求越来越高能在基因组DNA中找到外显子比对时考虑基因组DNA包含的测序错误有相应的算法解决相关物种的基因组在比对中出现删除、重复、倒置或移位的问题有相应的算法解决DNA序列之间的小差异，如SNP
穆易青·2023-11-14 01:12

SNP应邀参加2023中国企业数字化转型峰会暨赛意用户大会

SNP应邀参加2023中国企业数字化转型峰会暨赛意用户大会。大会以“AI驱动数智创新”为主题，邀请了10
snpgroupcn·2023-11-10 08:38

针对目标重识别的大规模训练集搜索：Large-scale Training Data Search for Object Re-identification

这篇文章主要介绍了澳大利亚国立大学新推出的训练集搜索任务，和相应的训练集搜索算法（SnP）。
学术菜鸟小晨·2023-11-09 05:22

基因型数据正负链怎么翻转(snp flip)

在合并数据过程当中，经常会发现不同来源的数据正负链不是统一的，这是一件很头疼的事。正负链没有统一的情况下直接合并在一起会产生什么后果呢。举个最简单的例子，假如我们从小明和小红分别拿到了一批基因型数据。那么存在以下几种可能：1）小明的基因型数据统一好正链或者负链；2）小红的基因型数据统一好正链或者负链；3）小明和小红都不知道他们的数据有没有统一好，反正数据拿给你了，你自己解决。在我们不知道这两人的基
weixin_30315435·2023-11-03 04:18

iOS提取文本中链接添加高亮点击，String NSString 对于表情NSRange计算长度不同，YYTextHighlight手势冲突问题

label.backgroundColor=.redlabel.numberOfLines=0label.preferredMaxLayoutWidth=200view.addSubview(label)label.snp.makeConstraints
再好一点点·2023-11-03 02:29

swift中Masonry的布局

但如果用纯代码来设置约束就很麻烦了OC里面，我们常用的有Masonry，SDAutoLayoutSwift里，我们有SnapKit：GitHub下载链接image一、项目集成pod'SnapKit'importSnapKit通过snp.makeConstraint
单线程Jack·2023-11-01 05:53

SnpEff结果解读

SnpEff结果文件的解读根据上一篇中SnpEff结果产生的4个文件进行解读1571303034(1).png第一个文件：positive.snp.eff.vcf其实positive.snp.eff.vcf
LiuYueRR·2023-11-01 02:51

关于call SNP无变异位点的解决方法

本次使用bcftoolscallSNPcd~/SC/zaohongsource/gss1/env/bwa_v0.7.17.envbwaindexref.fastasamtoolsfaidxref.fastasource/gss1/env/picard.env#数据质控cd~/SC/datasource/gss1/env/fastqc.envmkdirzaohong_qcfastqczaohong_
17号小行星·2023-11-01 01:22

简短介绍下如何用GCE确定GWAS阈值

GWAS大家都很熟悉了，随着目前越来越多的重测序文章的发表，可见如今SNP数据是非常的丰富，以及GWAS也发展了15年了，如今到了一个后GWAS时代。
只看不写_nathan·2023-10-28 23:57

群体遗传学习笔记：NGS结构变异检测原理

随着测序的成本越来越低，测序技术越发先进，除了研究单核苷酸多态性(SNP)。研究者们开始慢慢将目光转向了各位复杂，但是也同样非常常见的结构变异(SV)。
lakeseafly·2023-10-27 06:49

RNA-seq 保姆教程：差异表达分析（一）

RNA-seq不仅能够分析样本之间基因表达的差异，还可以发现新的亚型并分析SNP变异。本教程将涵盖处理和分析差异基因表达数据的基本工作流程，旨在提供设置环境和运行比对工具的通用方法。
冷冻工厂·2023-10-25 15:43

检测snp和InDel的工具：snippy~可用于检测两条fasta序列之间的变异生成vcf格式文件

github主页对软件的介绍image.png通常利用二代测序数据检测单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失（InDels）变异的基本流程是1测序数据与参考基因
小明的数据分析笔记本·2023-10-23 00:47

基因型数据正负链怎么翻转(snp flip)

在合并数据过程当中，经常会发现不同来源的数据正负链不是统一的，这是一件很头疼的事。正负链没有统一的情况下直接合并在一起会产生什么后果呢。举个最简单的例子，假如我们从小明和小红分别拿到了一批基因型数据。那么存在以下几种可能：1）小明的基因型数据统一好正链或者负链；2）小红的基因型数据统一好正链或者负链；3）小明和小红都不知道他们的数据有没有统一好，反正数据拿给你了，你自己解决。在我们不知道这两人的基
橙子牛奶糖·2023-10-22 20:07

孟德尔随机化：Steiger Test避免反向因果关系

在暴露A->结局B的孟德尔随机化因果关系分析时，SNP与暴露A的相关性要比结局B的大，否则会产生反向因果关系，即SNP不能作为
皮肤科大白·2023-10-19 03:37

孟德尔随机化 LDSC基因评分

基于遗传连锁不平衡（LD）的概念，通过估计每个SNP的LDScore来推断其与复杂性状之间的关联强度。LDScore是一种衡量SNP与周围SNP之间LD关联程度的统计量。
皮肤科大白·2023-10-19 03:37

BSA研究方案——如何从容不迫的进行性状定位

具体是利用差异目标性状的两个亲本构建家系，在子代分离群体中选取目标性状个体构建DNA混合池，采用高通量测序技术对混池DNA进行建库测序，开发全基因组范围内的SNP、InDel分子标记，以通过计算SNP、
菌小落·2023-10-18 17:29

iOS键盘高度适应

KeyboardHelper.shared.keyboardHeight.bind{[weakself]heightinguardletself=selfelse{return}self.bottomView.snp.updateConstraints
霸哥终结者·2023-10-18 09:45

R语言处理基因芯片测序得到的SNP数据的一个简单小例子~进化树和PCA

最终拿到的数据格式如下image.png第一列是探针id第二列是染色体编号第三类是染色体位置第四列是第一个样本的基因型接下来依次是每个样本的基因型相当于是每行是一个位点，每列是一个样本这个数据集下载自链接https://popgen.nescent.org/StartSNP.htmlimage.png今天推文的主要内筒也是参考自这个链接，这个链接的数据集是500多个样本，3000多个位点，我只选取
小明的数据分析笔记本·2023-10-17 06:50

2022-06-21

NatGenet|组合S2G策略预测5095个高可信度因果SNP-基因-疾病关联原创huacishu图灵基因2022-06-2109:18发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：huacishuIF
图灵基因·2023-10-14 20:28

宏转录组测序数据菌株层面的分析软件总结

我做的是菌株层面(StrainLevel)的数据分析，Strainlevel是Specieslevel的下一层级的分类；而宏基因组/宏转录组涉及到菌株分析的内容，主要包括三块：SNPCalling,就是找SNP
Candle_light·2023-10-10 18:10

重测序分析

重测序分析内容：SNP，INDEL,SV,SNV进化分析，群体结构：LD,FST分析数据和流程。
每天都想睡觉的阿源·2023-10-10 13:41

遗传图谱的绘制

目前大多是三代遗传图谱，基于SNP来做。部分
wo_monic·2023-10-08 07:15

使用metaCCA进行单/多个SNP与多表型的典型相关性分析

欢迎来到"bio生物信息"的世界新年的第一篇更文。祝大家新春快乐！身体健康！18号回家以后，经历了如下过程。20号喉咙痛21号喉咙痛22号喉咙痛咳嗽23-24号咳嗽25号咳嗽为主鼻塞夜间咳嗽加剧26号咳嗽为主鼻塞流鼻涕夜间咳嗽加剧27号咳嗽为主鼻塞流鼻涕打喷嚏夜间咳嗽加剧28号咳嗽为主鼻塞流鼻涕打喷嚏夜间咳嗽加剧换了多种药物，均不见效。索性也少关注新型病毒肺炎的事了，缓解些焦虑感。好了，以上是交代
橙子牛奶糖·2023-10-07 12:35

GWAS-1 简介-翻译

其思想是利用覆盖全基因组的高度密度SNP标记，通过对每个SNP标记或SNP单倍型与性状的关联分析，直接找到影响性状的QTN或与数量性状核苷酸(quantitativetraitnucleotide,QTN
Hello育种·2023-10-07 03:42

SNP Glue：SAP数据导入到其他系统的多种方式

SAP是一款功能强大的企业资源计划（ERP）软件，许多企业依赖SAP来管理和处理其核心业务数据。然而，有时候企业需要将SAP中的数据导入到其他系统中，以实现更广泛的数据共享和集成，便于企业实现数据智能。本文将介绍几种常见的方式，帮助企业了解如何将SAP数据导入到其他系统中。批量导出与导入：通过SAP的数据导出功能，可以将数据以批量方式导出为常见的数据格式，如CSV、Excel等。然后，可以使用其他
snpgroupcn·2023-10-07 01:59

SAP国内金牌合作公司有哪些？

SAP金牌合作伙伴上海艾斯恩培数据技术有限公司（SNP）原名为哈通咨询
snpgroupcn·2023-10-06 08:55

【直播回顾】应对数智化时代下SAP用户的系统转型挑战——SNP TDO

2023年8月31日，在由ENI经济和信息化网与SNP联合主办的“系统刷新，数据拆分：SAP用户如何敏捷应对系统挑战赋能业务及发展“
snpgroupcn·2023-10-06 08:55

SNP 分享：SAP S/4HANA Cloud 私有云版本及其独特优势

近几年来，SAP一直强调其愿景是帮助客户达成智慧型企业(IntelligentEnterprise)，为此其相关产品也在不断进行快速迭代，其核心就是S4HANA。同时SAP一直强调其要成为一家云计算公司，近些年也一直在推行云优先战略(CloudFirst)。因此SAP一直在努力帮助客户向云上迁移，虽然近些年SAP的云业务发展迅速，但其庞大的存量客户系统还是坚持运行在自己的Datacenter中，结
snpgroupcn·2023-10-06 08:54

iOS Snpkit、Masonry与tableHeaderView布局解决方案

Swift代码)布局，一般代码写法overridefuncviewDidLoad(){super.viewDidLoad()self.view.addSubview(listView)listView.snp.makeConstraints
帅气影中人·2023-10-05 16:18

iOS 安全布局封装

UIViewExtensions.swiftimportUIKitimportSnapKitpublicstructSafeArea{letview:UIViewvartop:ConstraintItem{if#available(iOS11,*){returnview.safeAreaLayoutGuide.snp.top
linx214·2023-10-04 00:44
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