宏基因组分析教程-Analysis of Metagenomic Data

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宏基因组数据分析培训

2016年6月22-24日，在温哥华举办了宏基因组数据分析专题培训，我们可以点击主页中宏基因组专题栏目的 “Access Content” 访问这次培训的材料。

课题内容简介

本次课题一共分为7节，简要介绍了背景、扩增子、宏基因组、宏转录组的分析思路和基本原理。同时提供全套的课件(PDF+PPT)和讲解视频(Youbute)在线。

注：本次课程以基础知识、原理讲解为主，非常适合刚入行的小伙伴认真学习。

更高级的数据分析实战课程，过几天就陆续分享给大家。

课程目录：

1. 宏基因组学简介
2. 扩增子分析物种组成
3. 基于16S预测宏基因组
4. 宏基因组物种组成
   
   • 比较16S与宏基因测序
   • 各种分析宏基因组物种组成方法
   • Metaphlan2分析宏基因组样品
   • STAMP统计组间物种差异
5. 宏基因组功能组成
   
   • 功能与物种组成区别
   • 了解功能相关数据库
   • 理解宏基因组基因拼接的优缺点
   • HUMANN注释功能基因
   • STAMP统计组间功能差异
6. 宏转录组
   
   • 理解宏转录组的机遇和挑战
   • 宏转录组的适用范围
   • 样品准备与实验设计
   • 数据处理的关键步骤
   • 处理简单的宏转录组示例
7. 微生物组生物标记物挖掘
   
   • 生物标记物的定义和应用
   • 如何从微生物组数据中鉴定生物标记物
   • 分析实战
   • 理解分析的原理

资料下载

这是网站的速度特别慢，打开个PDF都要等好久，视频在Youtube上需要才能观看，这两天要开十八大，各种工具基本都难用，小编花了大约一天的时间，将课题全套的课件PPT、PDF，以及高清版视频 720p mkv进行下载、重命名整理，并保存至百度云。

不想自己下载和整理的朋友，请分享此文至朋友圈，让更多需要的人看到，并截图发送至后台，24小时内会有小编回复您下载链接。

Youbute视频链接

1. https://youtu.be/s_MnbWohcBM
2. https://youtu.be/fZNdWbr6xEA
3. https://youtu.be/0eK2ycMgVmY
4. https://www.youtube.com/watch?v=YhjSDG5mMjE&feature=youtu.be
5. https://youtu.be/zhHE7vbmLSE
6. https://youtu.be/841EZb3GOs8
7. https://youtu.be/9AZM9y7niXs

Reference

1. 加拿大生信网 https://bioinformatics.ca/
2. 宏基因组专题培训 https://bioinformatics.ca/workshops/2016/analysis-metagenomic-data-2016#material

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