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单细胞转录因子分析
mRNA新冠疫苗会制造“转基因人”?没那么容易被“转”
这两天,一段聊天记录在网上热传,聊天记录中,名为“姜凯NY”者称,mRNA新冠疫苗可以通过逆
转录
,将病毒的基因插入人体染色体,接种者将因此变成转基因人。一时间,引发很多人的担忧。
BBCearth
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2024-02-08 14:56
中国电子学会2020年06月真题C语言软件编程等级考试一级(含解析答案)
中国电子学会考评中心历届真题(含解析答案)C语言软件编程等级考试一级2020年06月编程题五道总分:100分一、鸡尾酒疗法(20分)鸡尾酒疗法,指“高效抗逆
转录
病毒治疗”。
CC编创
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2024-02-08 12:33
中国电子学会历届真题C语言
算法
c语言
数据结构
c++
每天一个数据分析题(一百五十六)
C.
因子分析
通常不适用于预测类模型,因为它更侧重于变量的可解释性而非预测准确性。D.奇异值分解专门用于方阵数据的维度归约,不适用于非方阵情况。题目来源于CDA模拟题库点击此处获取答案
紫色沙
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2024-02-08 09:51
数据分析题库
数据分析
数据挖掘
CRNN介绍:用于识别图中文本的深度学习模型
用于识别图中文本的深度学习模型CRNN介绍:用于识别图中文本的深度学习模型CRNN的结构组成部分工作原理CRNN结构分析卷积层(ConvolutionalLayers)递归层(RecurrentLayers)
转录
层
kadog
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2024-02-08 07:50
By
GPT
深度学习
人工智能
rnn
笔记
Gut Microbes+ Microbiome | 揭示太空环境对微生物的影响
借助16S扩增子、宏基因组、
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组等生物学技术,我们一起来探究在太空环境下,微生物所发生的变化。航天飞行期间,小鼠肠道微生物和宿主代谢的变化[1]肠道微生物通
ee00dc6faab7
·
2024-02-08 05:16
R统计绘图 - 柱状图
39个
转录
组分析工具,120种组合评估(
转录
组分析工具哪家强-导读版)中提到了较多堆积柱状图的
生信宝典
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2024-02-08 01:35
DNA replication stress --DNA 复制压力
有许多原因会导致复制压力,其中有:1.核糖核苷酸的错误掺入2.不寻常的DNA结构3.复制和
转录
同时进行的问题4.基本复制因子不足5.染色质处于压缩状态(Chromatininaccessibility)
寒山梦绮
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2024-02-07 18:58
STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner
ultrafastuniversalRNA-seqaligner[J].Bioinformatics,2012,29(1).ABSTRACTMotivation:高通量RNA-seq数据的准确比对是一个具有挑战性但尚未解决的问题,因为
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结构不连续
sunlight_yy
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2024-02-07 14:29
Q30与Phred值
转录
组测序数据中,经常会出现Q30或Phred值,它们究竟是什么含义?Q30表示一个碱基的质量值,也表示该碱基错误率百分比。Q30指碱基质量值为30,错误率为0.1%,正确率为99.99%。
新欣enjoy
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2024-02-07 10:57
学习:StatQuest-RNA-seq技术重复
概念首先我们先辨析一下生物学重复和技术重复,我们的RNA-seq的data产生差异是正常的,关于差异来自于几个方面:生物学多样性,个体间差异,即便是同一物种(基因组相同),其
转录
本也未必都相同image.png
小潤澤
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2024-02-07 09:11
2021-12-10
2021-12-1007:02收录于话题#前沿分子生物学机制撰文:楠烟不可言IF=53.242推荐度:⭐⭐⭐⭐亮点:这篇文章介绍了诱导多能干细胞(iPSC)存在线粒体单核苷酸变异(mtSNV),近年来的
单细胞
分析表明
图灵基因
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2024-02-07 08:30
前沿Perspective | 空间
转录
组数据分析方法最新进展
空间
转录
组学是一个迅速发展的领域,有望以
单细胞
或亚细胞分辨率全面表征组织结构。
尐尐呅
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2024-02-07 08:31
因子分析
1——python因子的异常值处理、标准化、市值/行业中性化
文章目录基本数据清洗流程1.异常值处理(绝对中位差)2.数据标准化3.市值中性化4.行业中性化完整示例程序基本数据清洗流程下面都是对截面数据的一些基本处理流程,方便后续的分析与建模。基于截面数据的建模并不是说:当前截面的情况对应了未来就会如何如何,而是后验的去描述,未来表现如何如何时,历史上的截面数据大概有什么样子的表现1.异常值处理(绝对中位差)原始数据的分布在使用一些拟合的方法时,异常值(超大
呆萌的代Ma
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2024-02-07 08:33
【量化策略】系列文章
量化
单细胞
分析——深入理解 AnnData 数据结构
新手,纯搬运工【内容出自https://cloud.tencent.com/developer/article/1817039】一、环境准备:搭建Python高效开发环境:Pycharm+Anaconda二、安装scanpypipinstallscanpy三、AnnData1、AnnData介绍与结构AnnData是用于存储数据的对象,一般作为scanpy的数据存储格式。image.png下面我们
春娃赛如花
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2024-02-07 05:15
scanpy 教程 1:预处理和聚类 3k PBMCs
推荐先按顺序阅读往期内容:文献篇:1.文献阅读:SCANPY:大规模
单细胞
基因表达数据分析2.文献阅读:scverse项目为
单细胞
组学数据分析提供了计算生态系统目录1预处理2主成分分析3计算邻域图4嵌入邻域图
Tiger Z
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2024-02-07 03:02
程序人生
【
单细胞
】Python
单细胞
分析数据结构AnnData
1AnnData数据结构参考文献[1][2]Python
单细胞
分析数据结构——AnnData[3]scanpy
单细胞
分析包图文详解01|深入理解AnnData数据结构[4]Scanpy(一)AnnData
一穷二白到年薪百万
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2024-02-07 03:32
生物信息
单细胞
Seurat
单细胞
转录
组测序数据分析教程(三)——python(scanpy)
Seurat
单细胞
转录
组测序数据分析教程(二)——python(scanpy)文章参考至scanpy官网,做了一个更详细的解读。
coffeeii
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2024-02-07 03:31
python
数据分析
python小白入门
单细胞
分析scanpy
Scanpy和Seurat基本上完全一样,Scanpy构建的对象叫做AnnData对象,他的数据存储是以4个模块存储(如下图)如果你不理解scanpy这种数据结构的话,可以对比学习一下seurat中数据结构
单细胞
直播三
生信小博士
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2024-02-07 03:01
scanpy
python
开发语言
最全的Scanpy教程笔记 Preprocessing and clustering 3k PBMCs
最全的Scanpy教程笔记代码来源scanpy的官方教程代码的解释来源web本人也在学习scanpy分析
单细胞
数据,但是网络上对于scanpy的流程并没有太多详细的解释。
Pandora qiu
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2024-02-07 03:01
scanpy
单细胞分析
笔记
python
10X
单细胞
(10X空间
转录
组)多种通讯软件联合分析之liana
hello,今天我们分享一个简单的,将最近流行的细胞通讯分析软件整合在一起,分析我们的
单细胞
数据,直接看看代码部分注意一个名词,cell-cellcommunication(CCC),细胞通讯的软件方法很多了
单细胞空间交响乐
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2024-02-06 21:15
2021-11-02
CancerCell|
单细胞
测序检测揭示CAR-T脱靶效应(2)原创风不止步图灵基因今天收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:风不止步IF=31.743推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:研究利用
单细胞
分析报告了CAR
图灵基因
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2024-02-06 20:51
PCA图
首先,要准备好要分析的
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组数据。
呼啦啦可爱的Sherry雪莉
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2024-02-06 17:39
2022-08-14
我想完善一下,会使用Linux,会使用R语言,学了
转录
组分析的流程和
佳奥
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2024-02-06 09:00
谈谈数次生信线下活动的收获和体会
http://blog.genesino.com/2018/03/ampliconseqsumamry/从2017年11月份到2018年3月份,共进行了5次培训研讨活动,内容依次为
转录
组高级分析、生物信息作图系列
生信宝典
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2024-02-06 08:48
六个样本+
转录
组标准分析=IF5.81——最新项目文章:氟苯尼考抑制P19干细胞增殖和分化的分子机制
近些年,
转录
组测序凭借其周期短,价格低,普适性高等优势,备受科研人员的青睐。
ee00dc6faab7
·
2024-02-06 02:30
文献分享-Cas9系统中引导RNA的研究进展
本文是一篇中文综述,于2018年12月发表于《生物技术通报》,文章对CRISPR/Cas9系统中的引导RNA研究进展进行了综述,围绕引导RNA的序列组成、结构特征以及
转录
产生方式这3方面内容,展望引导RNA
去学习一下啊
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2024-02-05 23:40
Paper_7: Natural killer/T cell淋巴瘤的基因组、
转录
组特征
HighlightsIntegratedanalysisprovidesinsightintothemolecularclassificationinNKTCLEBVlyticgenesplayanimportantroleonNKTCLpathogenesisGenomicalteration-basedmolecularsubtypesassociatewithclinicaloutcomes
TOP生物信息
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2024-02-05 23:47
单细胞
CUT&Tag 分析复杂组织中的组蛋白修饰和
转录
因子
单细胞
CUT&Tag分析随着10X、BD等平台技术的推进,
单细胞
层面解析表达和开放染色质水平的研究方法已经得到很好的建立,并且在动植物种中都得到了很好的尝试。
felix108
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2024-02-05 19:17
RNA-seq
转录
组数据分析
B站:RNA-seq
转录
组数据分析入门实战1linux常用命令touchtext.txt#新建文件rm-rf/var/log/httpd/access#将会删除/var/log/httpd/access
医学小白学生信
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2024-02-05 15:35
单细胞
分析常用包
安装基础包install.packages("devtools",dependencies=T)install.packages("BiocManager",dependencies=T)install.packages("tidyverse",dependencies=T)install.packages('Seurat',dependencies=T)设置国内镜像options(BioC_mi
Drgexy
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2024-02-05 10:18
20200814(287)生存空间
从
单细胞
生物到多细胞生物,从无脊椎动物到脊椎动物,从鱼类到爬行动物到我们的祖先猿人,所能存活的生存空间越来越小。
Larus_317b
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2024-02-05 01:55
2021-10-14
NatGenet|
单细胞
表观遗传组学研究肿瘤细胞异质性和可塑性原创楠烟不可言图灵基因今天收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:楠烟不可言IF=38.33推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:本文分析了近期两项表征了神经胶质瘤的
单细胞
图灵基因
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2024-02-05 01:12
2022-08-25
细胞级表达图谱匹配测序和病理图像,发现更多结构细节原创骄阳似我图灵基因2022-08-2513:19发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术撰文:骄阳似我IF:47.99推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:①空间分辨
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组学
图灵基因
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2024-02-04 23:21
每日paper - 20211111 - 哺乳动物基因表达调控的全局定量分析
基因表达是一个多步骤的过程,包括
转录
、翻译和信使RNA与蛋白质的周转(turnover,应该是类似于代谢、降解的意思?)。
阿芃
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2024-02-04 21:49
基因重排
基因重排基因重排是指将一个基因从远离启动子的地方移到距启动子很近的地方从而启动
转录
的方式。目录1简介▪基因内重排▪基因间重排2应用介绍3其他简介基因重排分基因内重排和基因间重排。
Seurat_Satija
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2024-02-04 03:22
借助NMF的力量对
单细胞
RNA和
单细胞
ATAC进行联合分析
hello,大家好,礼拜天了,明天又要上班了,但是很想写一点东西,留下点足迹,但是又不想太动脑子,所以分享一篇代码文,分享给大家,
单细胞
转录
组和ATAC的联合分析。
单细胞空间交响乐
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2024-02-03 20:19
scRNA-seq | Windows下的R、RStudio下载和安装
2020/5/25,下定决心用R语言了,Python虽然顺手但是生物信息学尤其是
单细胞
测序领域主要还是R的天下。(发现一篇Naturecommunication居然用R调用了Tensorflow!
切瓜少年
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2024-02-03 20:37
200826 Circ之旅3-构建人类基因组索引
RNA-seq(5):序列比对:Hisat2人类基因组hg19、hg38构建bwa索引生物信息学习——bowtie2使用手册bwabowtie2salmonsubreadhisat2建索引和比对史上最快的
转录
组流程
dicklim
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2024-02-03 15:13
单细胞
scRNA-seq测序基础知识笔记
单细胞
scRNA-seq测序基础知识笔记scRNA-seq技术scRNA-seq分析流程数据预处理聚类标准化数据筛选有用的数据数据降维聚类Clustering注释细胞类型scRNA数据分析结尾该笔记来源于
是土豆大叔啊!
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2024-02-03 05:38
AI4Science
笔记
数据分析
单细胞
scATAC-seq测序基础知识笔记
单细胞
scATAC-seq测序基础知识笔记
单细胞
ATAC测序前言scATAC-seq数据怎么得出的?
是土豆大叔啊!
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2024-02-03 05:36
AI4Science
笔记
生物信息
数据分析
scATAC文献:人类大脑皮质
单细胞
水平染色质和基因调控的动态发育图谱---方法
文献名:Chromatinandgene-regulatorydynamicsofthedevelopinghumancerebralcortexatsingle-cellresolutionsingularvalue:一scATACprocessing使用“cellrangeratacmkfastq”(10x基因组学,v.1.2.0)将原始测序数据转换为fastq格式。scATAC-seqrea
科研菜鸟
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2024-02-03 05:20
学习小组Day7——宣Xuanan
因为课题就是做
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组测序的,所以基础知识有一些了解,接下来从数据处理部分开始进行笔记。数据初步分析:使用fastqc进行质量分析,这是一款Java软件,支持多线程。
宣Xuanan
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2024-02-03 05:04
EVM 对预测结果进行整合
从头预测,同源注释和
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组整合都会得到一个预测结果,EVidenceModeler(EVM)可以对上述结果进整合软件安装wget-4https://github.com/EVidenceModeler/
斩毛毛
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2024-02-03 03:52
2023-04-10
NatRev|
单细胞
和空间多组学的方法和应用原创夏天图灵基因2023-04-1011:52发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文:夏天IF=59.581推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:1、文章主要介绍了
单细胞
和空间多组学技术
图灵基因
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2024-02-03 02:37
美国PJ&A 黑客事件超过HCA Healthcare事件成为 2023 年美国医疗数据泄露事件之首
针对医疗
转录
公司PerryJohnson&Associates(PJ&A)的攻击后来成为2023年美国卫生部门最大的数据泄露事件。
网安老伯
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2024-02-03 00:21
web安全
学习
网络安全
网络
xss
sql
ddos
答读者问(1):非模式物种找marker;如何根据marker定义细胞类型
第一位读者做的是非模式物种的
单细胞
。
TOP生物信息
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2024-02-03 00:42
了解和绘制火山图
首先,什么是火山图火山图是
转录
组分析中经常能够见到的一类统计图,常用于反映差异表达基因概况。例如肿瘤组织与正常组织相比,那些基因存在过表达或被抑制,可以是编码基因、蛋白表达水平,也可以
纪伟讲测序
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2024-02-02 21:39
可变剪接
可变剪接事件产生不同
转录
本和蛋白可变剪接事件的分类可变剪接可分为7种基本类型:image.pngES(Exonskipping,外显子跳跃)指一个外显子从初始
转录
物上被剪
evolisgreat
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2024-02-02 21:20
AnnData:
单细胞
和空间组学分析的数据基石
AnnData:
单细胞
和空间组学分析的数据基石今天我们来系统学习一下
单细胞
分析的标准数据类型——AnnData!AnnData就是有注释的数据,全称是AnnotatedData。
Dream of Grass
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2024-02-02 18:31
生物信息
单细胞和空间组学
python
生物信息学
单细胞
空间组学
LUC项目文章|14-3-3蛋白BdGF14a增加了BdbZIP62的
转录
调控活性,从而在烟草中赋予了抗旱和抗盐能力
如何验证
转录
因子与靶基因启动子互作?》中,我们介绍了几种验证
转录
因子与靶基因启动子互作的方法:ChIP-qPCR、双荧光素酶报告实验(LUC)、酵母单杂交(Y1H)点对点验证和凝胶阻滞实验EMSA。
爱基百客
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2024-02-02 15:16
客户文章
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