基因第27页

10X空间转录组-----空间高变基因检测之SpatialDE

今天我们来学习一下简单的基础知识，空间高变基因，之前呢，已经分享过Seurat内置的方法计算高变基因，文章在10X空间转录组之基因的空间表达模式，其实有关10X空间转录组计算空间层面的高变基因，还有有很多值得挖掘的分析内容

单细胞空间交响乐·2024-01-20 00:17

人物杂烩身份和来历+第一章预告☺☺☺

在一次注入“组织生成液"的实验中成功，又因基因突变，生成液混入血液并有了永恒的活力，以至于被轰成灰烬还会重生，不会失忆。是业余生物学家。在被侯进行血祭后掌握黑暗血魔法，成为血族一员。

慕容浮梦·2024-01-19 22:55

一个故事一首歌 ▏能工智人2：谁

大约在七万年前，原始智人由于基因突变，认知能力突飞猛进，继而引发认知革命，他们走出非洲，逐步扩张，毁灭了地球约三分之二的物种。更可怕的是，他们同类相残，毫不留情。

妳之国·2024-01-19 22:29

8+生信，肿瘤分型+实验验证，氨基酸代谢正火！

可以用于分型的基因集很多，比如焦亡，坏死性凋亡，铁死亡，自噬，铜死亡，m7G，细胞衰老，各类代谢等等。小编还有一些比较前沿的热点，也是小编出去开会时了解到的，暂时不会公开宣传。

生信小课堂·2024-01-19 21:25

日更第37天：《财富自由之路》第36篇-你以为投资是靠冒险赚钱的吗？

在以下两件事情上一定要注意安全，学习并积累避险经验：资本安全人身安全人类与大自然共处的时间有数十万年，经验丰富，已经是这方面的专家，有些机制都已经刻在基因里了，像没有见过蛇的小孩子见到蛇都会吓的

阳光心屋·2024-01-19 20:19

沙丘六部曲

答:你们这些教士顾虑太多，弗雷曼人传统习俗源自对水的匮乏，我的罪过就在于把这件事当成现象来研究，并且论述了皇帝的心灵异术和遗传基因，是姐妹会寻觅许久并控制在手中的魁萨茨·哈德拉克。

袏枊東洲·2024-01-19 19:55

bedtools intersect用法 (intersectBed)

bedtoolsintersect可以对两个基因组特征(genomicfeatures)进行overlap，找到两者重合的区域。

生信编程日常·2024-01-19 17:20

GenTree：基因进化和功能分析

总共涉及的基因有63152个，蛋白质编码基因有20300个。评估基因年龄用的是UCSC数据库的14个支系。转录组数据调用了HPA,BrainSpan,GTEx。蛋白质组调用了HPM。

橙子牛奶糖·2024-01-19 16:36

“大姐大”养成记(五十四)何为优秀？

我们陈氏家族因为什么归隐到穷山僻野，那根本无从考究，但是优秀的基因却是遗传了下来。我父亲是排行老小，年幼失去双亲，上面有三个姐姐，两个哥哥。大姑妈生在农村，嫁到城

飞扬云淡·2024-01-19 15:36

随想

最近看一些关于基因的书，了解到我们的个人偏好和很多日常习惯源于体内的染色体，很多事情（特指行为）是冥冥之中注定的，这样看来从母胎的受精卵开始其实很多事情也许真的是可以预见的。

cenweiwei·2024-01-19 14:29

2022-05-31

正是因为中华民族这个优良的基因，才使得我们几千年来虽然一直磨难不断，但传承始终没断的原因之一。

草原军哥·2024-01-19 13:25

稻盛和夫“六项精进实践”，第53天—时刻保持开朗乐观

激活基因：要想激活基因，就要做到：(1）为人类、为社会，行利他。(2）拥有感动、感谢之心。(3）积极乐观，主动思考。(4）拥有强烈的目的导向思维，全身心投人。据说这些方法很有效。

46e4fb8aa306·2024-01-19 12:09

时代的悲哀（随笔小诗）

科技给人们带来种种便利也释放了黑暗国度的魔鬼放眼望去这时代所有的低头族们正被手机吮吸着生命与时间的浆液而暂时被迫离开手机的人是一张张失血的脸，空洞的眼神那称之为人的温热躯体正一点点地冷却魔鬼借人的手制造一个巨大的黑洞，无底的深渊并以此来吞噬、垄断人类那些被魔鬼选中的人也许是自小缺爱的家伙或者有一部分魔鬼的基因他们是从十字架上卸下的强盗如果一个

素衣素言·2024-01-19 11:02

今日一笑一尬一新

基因是软件，环境就是输入信息。如果一个孩子整天待在室内，他就容易近视。如果一直生活在特别干净的环境中，他的免疫系统就会有问题。如

彩虹岛主·2024-01-19 10:24

ceRNA：一种全新的基因表达调控模式

竞争性内源RNA（ceRNA）是近几年来备受学术界关注的对象，它代表了一种全新的基因表达调控模式，相比miRNA调控网络，ceRNA调控网络更为精细和复杂，涉及更多的RNA分子，包括mRNA、编码基因的假基因

Seurat_Satija·2024-01-19 08:51

晒猫｜萌萌哒小奶猫

小奶猫快满月了，猫妈妈生了五小只，两只特别像它，完美继承了它的基因了。看起来有点像只小老虎，小小只的，比猫画虎，确实是如此了。摸着它软软的，毛茸茸的，也不害怕人，很乖。

米子沐·2024-01-19 08:53

基因组拼接中常见的名词解释

readsrawdatacleandatascaffoldcontigcontig50scaffold50N50L50pseudomolecules:pseudomoleculesaresuperscaffoldspseudochromosomes基因组拼接中常见的名词解释

灵动的小猪·2024-01-19 07:25

《基因的名义》读书笔记

这本书比较适合我这类入行不久的人来看，里面介绍了很多基因组学方面的应用和相关原理，内容涉及基因组学的发展历程、基因学和测序技术的应用（寻祖，亲人鉴定，性状预测，癌症检测和用药，出生缺陷预防，消费级基因检测等等

TOP生物信息·2024-01-19 07:26

刚需c

玩儿是刚需，因为玩儿是天性，如果说玩儿是天性不好理解的话，好奇心是人类基因中烙印的学习的动力，好奇心驱使探

xx夏小·2024-01-19 07:32

剽悍读书营4连0227剽悍晨读

——彼得·古伯故事不仅更具画面感，更是在一万多年的人类繁衍的社会生活中刻入了我们的基因里。旧时丘吉尔用故事的演

鑫哥_5a25·2024-01-19 07:10

模因学是什么意思，在生活中有什么应用？

问题解答：意思："模因学"源自于英文中的"meme"，是由理查德·道金斯（RichardDawkins）于1976年在他的著作《自私的基因》（TheSelfishGene）中提出的一个概念。

神笔馬良·2024-01-19 07:15

基因可能突变吗

图片发自App完全可以不把所有的事情都搞得一地鸡毛。但是，偶然事件必定有其不可抗拒的必然原因。把事情做得很圆满和把事情彻底搞砸，看似这两个极端，捏在一起比较，是不是很拧巴？其实，能够做到这两个极端，真的是一件很难很难做到的事情。可是偏偏有些人竟然鬼使神差地做到了，而且做得“一丁点儿”都不突兀，一切发生得自然而然，是脸不变色心不跳的那种。如果把事情做到极致的完美，以上的煽情都是一些“残废嗑儿”。我是

乐健君·2024-01-19 06:12

sc.pl.umap 画feature plot

今天有时间尝试测试了这个scanpy的featureplot,其实很简单，就是使用sc.pl.umap(adata,color="genename"),但是这个地方就有一个问题，这个画出来的值是原始的基因值还是

我的心永远是冰冰哒·2024-01-19 06:27

生物学实验--查找基因的序列

查找途径网站一：根据基因的名字查找基因序列https://www.ncbi.nlm.nih.gov/NCBI--选择Gene--输入基因名字--search网站二：根据基因的Loc号码查找基因的序列（水稻

kekoukele777·2024-01-19 06:38

此间不等你第25章许言沫置林沂于死地

林沂尝试挣脱束缚，许言沫拉着椅子将林沂带到一个密闭空间，说道：“我是研究人工智能与基因融合的专家，你的锁铐早都跟你的基因融合了，除非我执行解除命令，否则你解不开，你的两个战友也帮不

翛姼·2024-01-19 05:09

PharmGKB数据库

轻枫柳曳1208·2024-01-19 03:20

2022-05-10

PNAS|视觉皮层编码物体纹理的机制原创骄阳似我图灵基因2022-05-1009:27收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：骄阳似我IF=11.205推荐度：⭐⭐⭐⭐亮点：本文表明人类类别选择视觉皮层的作用不是明确地编码对象

图灵基因·2024-01-19 02:50

关于单倍型和Phasing

单倍型，即单倍体基因型，概念很好理解。image.png单倍型分型的过程就称之Phasing，定相或基因分型。Phasing的意义，在人类疾病遗传和动植物群体遗传中非常重要。

生物信息与育种·2024-01-19 01:32

【家庭教育咨询】第一天课程作业：0-18岁孩子的父母需要做哪些事情？

✍️教育的本质是唤醒和激发孩子内在本自具足的能量和智慧每个孩子一出生，基因中就自带宇宙能量而来。这种能量会因为周围的环境影响而显现或隐藏。

北冥莜虞·2024-01-19 01:29

2024年AI预测报告-医疗卫生

同样，具有潜在治愈效果的可编程药物，如基因疗法，可以重复使用部分组件，

英智未来·2024-01-19 01:21

2018

大刘是个怀有悲悯心肠的科幻巨子，基因工程实现了长生不老也展现着阶级歧视和自私自利；私人财产不可侵犯的贫富差距发展到极致可以造就一个富人和剩下的穷人两种物种；被智能化的蓝鲸轻松躲过缉毒队的中子检测完成毒贩的运货任务

西颜小小·2024-01-19 00:25

不做WB或免疫组化，也能轻松完成蛋白验证 | 蛋白组数据库推荐

分子实验的常规检测内容除了基因就是蛋白啦，ELISA、WB、免疫组化...理论知识很扎实，可是实验结果却很扎心，比如WB，条带总是那么不正常，要么没有，要么弥散，要么非特异。

尐尐呅·2024-01-19 00:30

简单的5分套路——肿瘤微环境相关基因的预后价值

Prognosticvalueoftumourmicroenvironment-relatedgenesbyTCGAdatabaseinrectalcancerTCGA数据库对直肠癌的肿瘤微环境相关基因的预后价值发表期刊

生信学霸·2024-01-19 00:53

具惠善：没了爱情我也能够潇洒的生活

2016年，宋慧乔、宋仲基因为电视剧《太阳的后裔》结缘相

苏格传媒·2024-01-18 23:52

生信技能37 - ClinGen数据库获取单倍剂量不足和三倍剂量敏感基因

ClinGen数据库可进行Gene-DiseaseValidityCurations、DosageSensitivity、ClinicalActionability和VariantPathogenicity相关数据下载，支持人类hg19/hg38版本文件下载，本文涉及剂量敏感剂量属于DosageSensitivitydownloads的下载内容。https://search.clinicalgen

生信与基因组学·2024-01-18 23:08

听书《基因革命》

听书《基因革命》，可以基因测序，进一步了解自己。

梦幻剑晖·2024-01-18 23:40

【卡梅德生物】单B细胞技术：制备鼠单抗

细胞单抗制备，利用每个B细胞只含有一个功能性重链可变区DNA序列和一个轻链可变区DNA序列且只产生一种特异性抗体的特性，从动物的淋巴组织中收集B细胞，通过单克隆化技术从单个抗体分泌B细胞中扩增重链和轻链可变区基因

卡梅德生物·2024-01-18 23:31

焦虑

祖先们生活在野外，随时惊恐野怪猛兽的袭击，焦虑不安的情绪渗到骨髓，溶入血脉，刻进基因，现如今不会因暂时温饱的解决就消失殆尽的。

舒然_ad6f·2024-01-18 21:04

换位思考的重要性

我们人类大部分都是自私的，从出生开始就自带自私基因。因此每一个岗位看待事物的时候，第一反应都会想着对自己是否有利，自己去执行，是否更加的方便，都会有这样的一个弱点。例如管理层领导层对于一件

阿兵云原生·2024-01-18 21:34

精编遗传雀斑秘笈

一、雀斑的成因1.雀斑是一种常染色体显性遗传性色素沉着斑点，在雀斑家族的每个人的基因里都有这种雀斑片段，代代相传。如果父母一方有雀

蓬莱仙子_·2024-01-18 20:24

头发

我家发型基因过于强大，我爷爷，我爸，我都是自然卷，我这次其实还想拉直头发，因为发型我就喜欢两种，要么黑长直，要

不好意思没有昵称·2024-01-18 19:54

成为快速识人的感受（1）

这就得先来说说大脑的运行机制，这也是基因决定的生物本能反应，在面对新东西大脑一般会采用“节能的方式”——把所见的新事物与大脑中已经存在的旧事物关联起来，这样大

曾继承·2024-01-18 18:42

10X单细胞（10X空间转录组）画图操作之二维colorbar

之前一些同学一直问一个问题，如何在一张TSNE或者UMAP展示两个基因的表达情况，但是最直观的思考就是一个点（cell）如果展示两个基因的表达量，那必将填充两种颜色，这明显是不可行的，结果将是两种颜色的叠加

单细胞空间交响乐·2024-01-18 17:16

2022-04-18

小伙子不甘长相丑陋，穿越过去要改变基因，他会成功吗？（1）小贝是一个毫无名气的大文豪。为什么这么说呢？这还要从小贝的长相说起。

岁月巍巍·2024-01-18 16:18

结构变异SV分析(WGS/WES)和融合基因检测（RNA）

69种工具检测SV对比https://www.jianshu.com/p/85ff211b4b4ehttps://zhuanlan.zhihu.com/p/87408242?utm_campaign=rss&utm_medium=rss&utm_source=rss&utm_content=title最终决定使用wham和Manta组合，其实最优组合应该是wham，inGAP-SV组合或者inGA

wo_monic·2024-01-18 16:31

关于heatmap

行为基因，列为样本。

果蝇饲养员的生信笔记·2024-01-18 15:48

05-IF4+从DNA修复基因的角度构建胶质瘤的预后模型

一.研究背景表观遗传时钟，或DNA甲基化年龄，已被证明与年龄高度相关。同时有研究在结直肠癌中观察到表观遗传年龄加速，即DNA甲基化年龄与个体年龄差异。然而，表观遗传年龄加速与结直肠癌肿瘤分子特征、临床特征和患者预后的关系尚未得到系统的研究。此外，结直肠癌(CRC)在美国是第三大癌症死亡原因。结直肠癌具有高度异质性，其5年生存率随肿瘤分期的不同而有很大差异。年龄是预测CRC和其他常见复杂疾病(包括心

AAA肿瘤信息学王协·2024-01-18 15:42

纯生信分析套路甲基转移酶相关因子的预后分析

甲基化是一种可逆修饰，调控这种修饰的蛋白质和基因可以作为肿瘤治疗的候选靶点。然而，在胶质瘤中甲基转移酶相关基因的特征尚不清楚。本文主要是基于TCGA数据和中国胶质瘤基因组图谱RNA测序数据集，通过一

音十千寻·2024-01-18 13:04

人傻开门7件事

既然长这么大发现自己是个傻子，基因改变不了已成既成事实，那么就只能后天努力，多读点书。读点

叽叽咕咕2017·2024-01-18 12:22

人性的弱点有什么作用？

2、《人类简史》这本书里面说了，农业时代开启后，麦子可能是最大的赢家，因为麦子以前只是杂草，农业时代后，得到了栽种和培育，它的基因得到了极大的传递。

Oath似水流年_·2024-01-18 12:46

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