宏基因组分析

Docker的基本使用-Ubuntu18.04

本文以最新的Ubuntu18.04LTS版本为例，学习Docker的使用和布置宏基因组分析
刘永鑫Adam·2020-07-29 07:29

宏基因组公众号征稿、招聘、转载、合作启事

文章目录宏基因组公众号征稿、招聘、转载、合作启事公众号简介征稿宏基因组分析一作解读文献阅读生信经验科普文章招聘、求职关于转载商业合作猜你喜欢写在后面宏基因组公众号征稿、招聘、转载、合作启事注：点击文中蓝色链接
刘永鑫Adam·2020-07-12 15:15

宏基因组理论教程3PICRUSt功能预测

之前分享的加拿大生信网出品的《宏基因组分析教程》，有1万多位朋友阅读，有近2000多小伙伴下载了课程PPT。但不知有多少小伙伴真正仔细学习过。收藏是没有用的，只有真正多学几遍才有收获。
刘永鑫Adam·2020-07-12 15:15

生信 | GeneMark

（参考）基因预测原理：宏基因组分析——基因预测篇宏基因组基因预测一般包括同源预测和从头预测。
rojyang·2020-07-10 01:27

宏基因组分析4-宏基因组组装(MEGAHIT,IDBA)

MegaHithttp://www.l3-bioinfo.com/products/megahit.htmlhttps://github.com/voutcn/megahit安装sudoaptinstallg++zlib1g-devgitmakecmakecd/home/llt/softwaregitclonehttps://github.com/voutcn/megahit.gitcdmegah
l_lightning·2020-07-06 21:16

宏基因组理论教程2扩增子分析

之前分享的加拿大生信网出品的《宏基因组分析教程》，有1万多位朋友阅读，有近2000多小伙伴下载了课程PPT。但不知有多少小伙伴真正仔细学习过。收藏是没有用的，只有真正多学几遍才有收获。
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:00

微生物组—宏基因组分析专题培训开课啦！10月北京

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2018年10月19-21日，北京鼓楼推出《宏基因组分析专题培训》专题培训第二期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:26

微生物组—宏基因组分析专题培训7月开课啦！北京

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2018年7月北京鼓楼推出《宏基因组分析专题培训》，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子、宏基因组实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:26

宏基因组实战8. 分箱宏基因组binning, MqaxBin, MetaBin, VizBin

前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2数据质控fastqc
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:25

微生物组——宏基因组分析专题培训开课啦！！！

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2018年7月北京鼓楼推出《宏基因组分析专题培训》，大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:25

宏基因组分析实战教程2. 数据质控fastqc, Trimmomatic, MultiQC

2017-cicese-metagenomics.readthedocs.io/en/latest/toc.html前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:25

宏基因组实战10. 绘制圈图-Circos安装与使用

前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系列前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2数据质控fastqc
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:25

宏基因组实战4.基因注释Prokka

前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2数据质控fastqc
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:55

2019最后一期—宏基因组分析技术研讨会

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年11月1-3日，北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第六期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:54

微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7，早鸟价仅剩1周)...

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：宏基因组线上直播时间：2020/07/24-2020/07/26扩增子线上直播时间：2020/08/14-2020/08/16报名链接：http://w
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:54

2019微生物组—宏基因组分析技术研讨会第六期

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年11月1-3日，北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第六期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:24

宏基因组实战2. 数据质控fastqc, Trimmomatic, MultiQC, khmer

2017-cicese-metagenomics.readthedocs.io/en/latest/toc.html前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:23

2019微生物组—宏基因组分析技术研讨会第五期

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年8月2-4日，北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第四期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:23

宏基因组实战4. 基因注释Prokka

前情提要如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系统前期文章宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2数据质控fastqc
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:23

2019微生物组—宏基因组分析技术研讨会第四期

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年6月21-23日，北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第四期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析
刘永鑫Adam·2020-07-06 07:23

微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：转录组线上直播时间：2020/06/12-2020/06/14宏基因组线上直播时间：2020/07/24-2020/07/26扩增子线上直播时间：20
生信宝典·2020-07-05 02:19

微生物组-宏基因组分析第8期 (报名直播课免费参加线下2020.7)

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：宏基因组线上直播时间：2020/07/24-2020/07/26扩增子线上直播时间：2020/08/14-2020/08/16转录组线上直播时间：20
生信宝典·2020-07-05 02:19

| 微生物组—宏基因组分析专题研讨会

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组和Python课程的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：宏基因组线上直播时间：2020/05/15-2020/05/17扩增子线上直播时间：2020/05/29-2020/05/31报名链接：www/ehbio.c
生信宝典·2020-07-05 02:19

微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：转录组线上直播时间：2020/06/12-2020/06/14宏基因组线上直播时间：2020/07/24-2020/07/26扩增子线上直播时间：202
刘永鑫Adam·2020-07-04 03:16

微生物组—宏基因组分析专题研讨会（线上课已开通，可以报名，线下课程时间待定）...

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组和Python课程的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：宏基因组线上直播时间：2020/05/15-2020/05/17扩增子线上直播时间：2020/05/29-2020/05/31报名链接：www/ehbio.c
刘永鑫Adam·2020-07-04 03:16

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(1812)

文章目录征稿、转载、合作文章分类导航目录精选文章推荐培训、会议、招聘科研经验软件和数据库扩增子分析宏基因组分析Linux与ShellR统计绘图实验设计与技术基础知识一作解读文献精读综述泛读高分文章套路解读科普视频
刘永鑫Adam·2020-07-01 06:10

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.03)

文章目录征稿、转载、合作文章分类导航目录精选文章推荐会议、招聘广告科研经验软件流程扩增子分析扩增子教程QIIME2最新教程中文(2019.7)易生信-扩增子教程Webserver在线分析平台相关软件和数据库教程宏基因组分析高分文章和图书推荐软件评测和简介教程系列有参分析
刘永鑫Adam·2020-07-01 06:08

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.5)

文章目录征稿、转载、合作文章分类导航目录精选文章推荐会议、招聘广告科研经验软件流程扩增子分析扩增子教程QIIME2教程(2020.2)易生信-扩增子教程Webserver在线分析平台相关软件和数据库教程宏基因组分析高分文章和图书推荐软件评测和简介教程系列有参分析
刘永鑫Adam·2020-07-01 00:42

扩增子和宏基因组分析流程Microbiome Helper

今天发现了一个扩增子分析的流程Comeauetal.,2017MicrobiomeHelper:aCustomandStreamlinedWorkflowforMicrobiomeResearch.mSystems.MicrobiomeHelper相当于一个资源库，整和了很多软件，脚本和教程。主要有以下特点：1.一系列的可用于处理和自动化操作各种微生物组和宏基因组的脚本构成的生物信息工具。2.可用
你猜我菜不菜·2020-06-29 21:11

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(1907)

文章目录征稿、转载、合作文章分类导航目录精选文章推荐培训会议、招聘广告科研经验软件流程扩增子分析宏基因组分析Linux与ShellR统计绘图实验设计与技术基础知识作者解读文献精读科普视频-寓教于乐科普图文写在后面旧文删除综述泛读高分文章套路解读后台关键字列表欢迎点击上方蓝色
刘永鑫Adam·2020-06-29 20:21

Science：病原菌激活植物内生菌群的抑病功能

文章目录病原菌介导植物内生菌群抑病功能的激活译者有话说摘要前言主要结果内生菌群落多样性和网络分析**附图1.本研究实验设计示意图****附图2.内生菌群宏基因组分析流程****附图3.质控后数据基因注释的比例
刘永鑫Adam·2020-06-29 20:20

宏基因组分析1-平台搭建(基于win10子系统安装及更改源)

win10ubuntu子系统安装及配置，我这里选择的版本是ubuntu18.04LTS，https://blog.csdn.net/zhouzme/article/details/78780479https://blog.csdn.net/zhangdongren/article/details/82663977由于默认的软件源在国外，下载速度慢，得改成国内的，按以下连接中的步骤进行。更改软件源需
l_lightning·2020-06-25 23:56

【软件安装】---宏基因组分析软件qiime2的安装及使用

前言：QIIME2是一款强大的、可扩展的、分散的微生物组分分析包，其重点是数据和分析透明度。QIIME2能帮助研究人员分析原始测序数据，并得到出版物质量的数据和统计结果。最新版本Qiime2官方网址：https://docs.qiime2.org/2020.2/about/安装qiime2由于qiime2的配置文件需要使用conda安装很多依赖工具，所以首先需要下载qiime2-2020.2-py
卡布达b1·2020-06-10 17:00

宏基因组分析流程

分析内容如下图所示：宏基因组分析具体分析步骤如下：数据质控，使用kneaddata软件，该软件先调用Trimmomatic过滤数据，然后利用bowtie2或bmtagger比对宿主数据库去除宿主数据(也可以去除核糖体数据
超人立志做国王·2020-04-06 12:59

微生物多样性知识点

微生物多样性或者宏基因组分析中，往往有几个出现频率很高的词，比如OTU，群落结构，alpha多样性，beta多样性。今天就来通过分析思路上（主要围绕微生物多样性）给大家解释一下这些高频词汇。
thinkando·2020-04-05 02:22

宏基因组分析7-binning(Maxbin,metaBAT,CONCOCT)

maxbinhttps://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html安装cd/home/llt/softwarewgethttps://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/getfile.php?MaxBin-2.2.6.tar.gzmv'g
l_lightning·2020-03-28 21:07

宏基因组分析概述

测序数据预处理——质控：Trimmomatic测序数据预处理——质控统计：FastQC序列组装与基因预测——拼接：MEGAHIT序列组装与基因预测——ORF预测：Prodigal拼接和装箱binning——组装拼接：Megahit；组装评估quast；；基因注释：prokka；构建非冗余基因集：CD-HIT；基因组可视化（Circos，Vizbin）；宏基因组中鉴定单菌（分箱bin）：MetaWR
小王的学习杂记·2020-03-01 11:49

宏基因组组装：从what 到how

宏基因组分析教程microPITA|宏基因组测序前，你可以这样筛选样本microPITA加拿大安大略研究所建立的生物信息网1.什么是组装？
周运来就是我·2020-02-05 02:06

一文读懂宏基因组分析套路

今天就从之前解决的1篇nature,2篇science,入手来总结宏基因组分析的基本思路。只有分析思路清楚，结果才更容易説清楚。
刘永鑫Adam·2018-06-03 00:00
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