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细胞周期
跟着Cell学单细胞转录组分析(四):单细胞转录组测序UMAP降维聚类
在《cell》文章中,作者还计算了
细胞周期
评分,因为我们收集到的细胞可能处于不同的分裂时期,所以看周期是很有必要的,尤其是针对具体的研究目的。在示例数据中,可以看到,各个样品
细胞周期
基本一致。s.g
TS的美梦
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2022-11-21 07:23
单细胞
聚类
数据挖掘
r语言
数据分析
哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 (八)
Explorationofqualitycontrolmetrics为了确定我们的细胞亚群是否可能是由于诸如
细胞周期
阶段或线粒体表达之类的假象引起的,可以对不同
生信宝典
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2022-11-20 21:42
可视化
聚类
大数据
编程语言
数据可视化
活性氧(ROS)分析——总ROS检测试剂盒方案
CellMeter检测试剂盒是一类用于检测细胞功能的系列工具,包括细胞活性、细胞毒性、细胞凋亡、细胞膜电位以及
细胞周期
等方面的指标。每种检测方案均能提供不同荧光颜色的检测方案。
Sylvia_sc
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2022-11-03 19:35
线粒体基因组组装
除了为细胞供能外,线粒体还参与诸如细胞分化、细胞信息传递和细胞凋亡等过程,并拥有调控细胞生长和
细胞周期
的能力。
佳名
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2022-09-07 21:54
ATAC-seq
染色质,染色体在
细胞周期
的不同时期,DNA的浓缩程度不同,间期表现为染色质具有转录活性,而中期染色体是转录惰性。
ytbao
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2022-08-16 22:41
Seurat的打分函数AddMouduleScore
在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokinescore或inflammatoryscore使用了Seurat包的AddMouduleScore函数,在计算
细胞周期
的CellCycleScoring
Hayley笔记
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2022-07-01 10:40
Seurat之
细胞周期
评分
1.
细胞周期
背景介绍
细胞周期
(cellcycle)是指细胞从一次分裂完成开始到下一次分裂结束所经历的全过程,分为间期与分裂期两个阶段。在
细胞周期
过程中,细胞的遗传物质复制并均等地分配给两个子细胞。
Hayley笔记
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2022-07-01 10:47
凋亡及
细胞周期
数据如何看
1.X轴选择FSC-A,Y轴选择SSC-A。分析凋亡的细胞选择上图所示的细胞群体进行分析。细胞碎片不予分析。2.在SSC/FSC图中双击“分析的细胞群体”,X轴选择FITC,用来表示AnnexinV-FITC。Y轴选择PE-Texas,用来表示PI。用四分门设门工具界定活细胞和凋亡细胞。Q1(UL):(AnnexinV-FITC)-/PI+,此区域的细胞为坏死细胞。也可能有少数的晚期凋亡细胞在其中
旋风芝士小土豆
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2022-03-08 14:09
生竞系列------细胞生物学Chap.13
细胞周期
与细胞分裂
有丝分裂首先在蚕豆根尖中被阐述
细胞周期
的长短取决于G1期G0期细胞多在G1期转化来G1期晚期有一个特定的时间点,在芽殖酵母中称为起始点(开始出芽、dna复制)其他真核生物中叫做限制点(R点)或检验点这个点的内在因素主要是
生竞圣剑
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2022-02-18 01:25
生物钟紊乱还想保持健康?“进食法则”了解一下!
一般哺乳动物体内的细胞都以24小时为周期运行,这个周期被称为昼夜节律——亦即
细胞周期
。这种周
晚夜星辰
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2022-02-11 09:49
单细胞scRNA-seq学习笔记4-
细胞周期
推断
p=11不同类型的细胞哪怕是在同一个时间点的
细胞周期
状态,它们的
细胞周期
相关基因表达也是不同的。更重要的是,还有很多非直接
细胞周期
相关基因也需要考虑。
细胞周期
是利用基因来推断
天涯清水
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2022-02-08 13:31
溶酶体和线粒体共存的可能性
Lysosomesandmitochondriamightcoexistjustlikesomekindofgram-negativebacteriumengulfedbyoriginaleukaryoticcellsandcoexistbillionsofyearsago在正常情况下,大部分肝细胞处于G0期,很少分裂,但是当受到某些机械,病毒,药物等刺激时,G0期细胞可以进入G1期,启动
细胞周期
Y大宽
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2022-02-05 10:10
单细胞学习之
细胞周期
分析
一、
细胞周期
鉴定https://teachmephysiology.com/biochemistry/cell-growth-death/cell-cycle/https://www.genome.gov
小贝学生信
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2022-02-05 02:30
Ki-67与BrdU染色的区别
Ki-67与BrdU染色的区别imageKi-67几乎在所有类型的细胞都有表达,通常在
细胞周期
的活跃期(G1,S,G2,M)可以检测到,而在静止期(G0)检测不到。
天涯清水
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2021-06-27 15:36
手把手带你迈过“
细胞周期
”流式检测的门槛
开始讲周期检测前先带大家回忆一下
细胞周期
的基本知识(高手可自行跳过)。
天涯清水
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2021-06-14 06:39
《癌生物学》—珠江肿瘤
《癌生物学》第八章(1)
细胞周期
控制时钟
细胞周期
时钟是一些相互作用的蛋白质网络,它们接收胞内和胞外的各种不同来源的信号,对其进行整合后决定细胞的命运。
世界很大_我想去体验
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2021-05-08 22:16
真的!维生素D可以帮你远离癌症风险
目前最新的体外研究和动物实验中已经证实,维生素D可以通过多种信号通路,比如
细胞周期
阻滞、细胞凋亡、血管生成和炎症抑制等多种信号通路抑制肿瘤的发生和发展。
健康界传媒
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2021-04-20 09:13
普通生物学 陈阅增 第5章 细胞的分裂和分化
5.1
细胞周期
与有丝分裂5.1.1原核细胞以二分分裂增殖细菌染色体分裂时如何会移动仍未查明。5.1.2有丝分裂可分为5期
细胞周期
包括一个有丝分裂期和一个分裂间期。
墨羽濛雪
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2021-03-28 15:42
Ferroptosis as a p53-mediated activity during tumour suppression
摘要:虽然p53介导的
细胞周期
停滞、衰老和凋亡是癌症发展的关键障碍,但新的证据表明p53的代谢活性也很重要。
一个没有感情的文献阅读机
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2021-01-16 20:16
【方法篇】研究RNA互作结合蛋白(RBPs)的方法
此实验方法大概耗时3天,并且该方法可以用在不同生物状态下,包括代谢、
细胞周期
、分化、发育或者对药物的
Aimsmass
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2020-12-31 08:52
2018-05-25 90天如何吃出“婴儿”般肌肤(摘录自妙说营养公开课)
90天如何吃出“婴儿”般肌肤一、皮肤结构(一)皮肤从外到内为:表皮层(光滑细腻)、真皮层(紧致红润、水润)、皮下组织(皮下脂肪)(二)
细胞周期
:4周(三)去角质(针对表皮层):油性皮肤、1周2次;其他肤质
余味的天
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2020-08-24 17:30
ATAC-seq基础知识(资源整理)
1、简介
细胞周期
的不同时期,DNA的浓缩程度是不同的。间期染色体表现为染色质具有转录活性。而中期
皈依yyy
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2020-08-18 23:55
酵母菌的介绍
是子囊菌、担子菌等几科单细胞真菌的通称,一般泛指能发酵糖类的各种单细胞真菌,可用于酿造生产,有的为致病菌,是遗传工程和
细胞周期
研究的模式生物。酵母菌是人类文明史中被应用得最早的微生物。
画屏凉
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2020-07-16 07:41
Day11 Day12 Day13
《癌生物学》汇总贴第八章成视网膜母细胞蛋白与
细胞周期
8.1外部信号影响细胞进入活化的
细胞周期
细胞周期
image.pngimage.png检查点确保
细胞周期
的每一步顺利完成后,再进行下一步image.png
王子狐
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2020-07-13 20:04
PI3K/Akt/mTOR细胞学与信号转导
一、PI3K/Akt/mTOR介绍PI3K/AKT/mTOR是调节
细胞周期
的重要细胞内信号通路。PI3K/AKT/mTOR信号通路与细胞的休眠、增殖、癌变和寿命直接相关。
0生信使者0
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2020-07-12 16:58
细胞周期
预测 | 单细胞转录组(scRNA-seq)分析 03
文章目录一、介绍二、预处理三、获取
细胞周期
分数四、在数据缩放期间回归出
细胞周期
得分五、备用工作流程一、介绍前置知识:原创Seurat包图文详解|单细胞转录组(scRNA-seq)分析02使用Seurat
白墨石
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2020-07-12 02:14
生信情报站
R
生物信息
生物信息学
生物学
细胞周期
R
单细胞转录组
K-均值聚类(K-means clustering)
该算法原理简单并便于处理大量数据,在基因表达数据分析中得到广泛应用,如Tavazoie等应用K-means聚类酵母
细胞周期
表达数据。
nuoline
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2020-07-07 18:02
mahout
CCB02 是一种选择性的 CPAP-tubulin 相互作用抑制剂
CCB02对其他的蛋白没有抑制作用,包括与
细胞周期
、中心体相关蛋白,同时对AuroraA,Plk1,Plk2,CDK2和CHK1的磷酸化状态无作用。
MedChemexpress_
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2020-06-28 12:40
Seurat亮点之
细胞周期
评分和回归
其中包括许多个性化的模块,其中我个人比较感兴趣的是Cell-CycleScoringandRegression模块,因为在条件干预的情况下,部分细胞处于非稳定状态下,如增殖类细胞出现由于
细胞周期
相关基因的不同导致细胞聚类发生一定的偏移
生信宝典
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2020-06-24 21:49
R
生物信息
经典文章
白藜芦醇 ® Resveratrol
图片发自App主要功效:有助于保持细胞健康促进正常的
细胞周期
进程有助于保持心血管健康卓越的抗氧化剂,高ORAC值同类产品比较图片发自App详细信息IsotonixResveratrol是一款具有等渗功能的营养补充品
知其然亦知其所以然
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2020-06-24 03:38
无锡名思教育老师告诉你考前必看的六十六项高考生物经典结论
5.洋葱表皮细胞不能进行有丝分裂,必须是连续分裂的细胞才有
细胞周期
。6.
赤霜
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2020-03-31 06:33
SKF-96365 hydrochloride
目录号:HY-100001MembraneTransporter/IonChannelAutophagy|SKF-96365是SOCE的抑制剂,能够在结直肠癌细胞里通过引起
细胞周期
阻滞和凋亡,表现抗肿瘤活性
莫小枫
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2020-03-27 03:49
SGC-GAK-1 是一种有效的选择性
细胞周期
蛋白 G 相关激酶 (GAK) 抑制剂
SGC-GAK-1是一种有效的选择性
细胞周期
蛋白G相关激酶(GAK)抑制剂,Ki为3.1nM。SGC-GAK-1是GAK的化学探针。
MedChemexpress_
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2020-03-18 01:38
InCellis细胞标记鉴定
InCellis细胞标记鉴定中心体是参与
细胞周期
调控的细胞器。在细胞分裂过程中,两个中心体作为锚来引导染色体并将它们分成两个均等的批次以形成两个子细胞。细胞中心体数目异常通常都与癌症有关。
伯齐科技
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2020-03-09 10:42
细胞周期
笔记
1.
细胞周期
的时相分类。一般而言,
细胞周期
可以分为四个时相:G1(DNA合成前期);S期(DNA合成期);G2期(DNA合成后期)和M期(有丝分裂期)。
靑蜓
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2020-02-26 22:38
我国科学家从罗汉果中发现肿瘤防治药物
北京农学院马兰青教授、窦德泉副教授最近的一项研究证实,罗汉果中部分三萜化合物不仅对癌细胞有杀伤力,并且具有阻滞
细胞周期
、抑制肿瘤细胞转移等功效,这为未来开发预防和治疗肿瘤药物提供了新思路。
兴科生物
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2020-02-22 19:04
细胞的体检:体外细胞活力检测方法概述|译
本文介绍各种检测活细胞和死细胞的方法,主要翻译自Abcam的产品手册:Cellhealthassaysguide本手册涉及的细胞活力、细胞毒性、
细胞周期
、细胞增殖和细胞死亡分析对大多数细胞学研究都是很重要的
三叶草的成长
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2020-02-09 03:37
流式细胞术之细胞凋亡检测
细胞凋亡相对
细胞周期
来说,比较省事省时,但是它比较心急,放不久,处理完以后2个小时内一定要检测完毕,不然实验数据可能就偏差较多啦。
华联科生物
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2020-02-01 16:23
2019年流式细胞仪的第二次培训
图片发自App完全的红色,只有细胞核了,没有其他结构图片发自App图片发自App
细胞周期
检测图片发自App图片发自App有可能造成假阳性,有时候两个或多个细胞,当做一个细胞进行检测,所以在一定程度上需要排除黏连体图片发自
五音不全的灵魂歌手
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2020-01-02 05:40
LNCipedia:人类lncRNA数据库
lncRNA在
细胞周期
调控,细胞分化调控,疾病的发生与发展等多种生命活动中发挥着重要作用,是研究的热点之一。
生信修炼手册
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2019-12-25 06:48
1个萝卜一个坑,1个基因n个名
因为一个基因有多个名字那些年我们关注的热点基因自1960年以来,研究最火的可以说当属TP53基因,与它相关的文献数不胜数关于TP53的研究它作为抑癌基因编码的p53蛋白是一种肿瘤抑制因子,可以说是基因组的守护者,它通过激活
细胞周期
停滞和细胞凋亡等几种防御机制来抑制肿瘤发生
刘小泽
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2019-12-24 07:55
年轻蛋白你知道吗?
而年轻蛋白不是单一的蛋白质,而是一组能使细胞增强自我修复能力,保持细胞年轻态的蛋白质,它的多寡和强弱直接影响肌肤细胞的状态,能使肌肤
细胞周期
性的产生大量的胶原蛋
牡丹花开灿烂人生
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2019-12-02 07:01
关于
细胞周期
推断的知识更新
刘小泽写于19.9.22之前学习过单细胞数据
细胞周期
推断,就是用cyclone函数(https://www.jianshu.com/p/46d597d21a16)这次增加一些内容,来自:CancerResearchUKCambridgeInstitute
刘小泽
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2019-09-22 11:59
清除单细胞数据
细胞周期
效应造成的影响
unwantedsourcesofvariation:1.线粒体基因的干扰2.
细胞周期
基因的干扰seurat包里有clearoutcellcyclegeneseffect的影响:https://satijalab.org
CuteCurse
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2019-07-29 20:57
单细胞转录组学习笔记-11-生物学背景知识之
细胞周期
推断
刘小泽写于19.7.9-第二单元第九讲:生物学背景知识之
细胞周期
推断笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在:http://jm.grazy.cn/
刘小泽
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2019-07-09 14:24
【植物学笔记】植物细胞(四)
细胞核结构,随着
细胞周期
的改变而改变,细胞间期的细胞核可以分为:图片发自App核被膜nuclearmembrane(外核膜面向胞质,表面附有大量的核糖体,常与内质网相连。
浪生waver
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2019-04-30 18:16
使用scran包的cyclone函数进行单细胞转录组的
细胞周期
状态推断
GenesetsreflectingfivephasesoftheHeLacellcycle(G1/S,S,G2/M,MandM/G1)werereferredfromWhitfieldetal.(2002).其中一篇提到了scran包的cyclone函数进行单细胞转录组的
细胞周期
状态推断
生信技能树
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2019-04-23 21:26
执业兽医资格证——动物解剖学、组织学与胚胎学
细胞周期
:从前一次分裂结束到下一次分裂完成,称为一个
细胞周期
。
细胞周期
分为分裂间期和细胞分裂期。分裂间期又分为DNA合成前期(G1期)、DNA合成期(S期)与DNA合成后期(G2期)。
牛仔裤的春天
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2019-04-06 18:48
细胞增殖的检测方法之ATP检测
一个完整的
细胞周期
包括分裂间期和分裂期,
细胞周期
是一个细胞的整个生命过程,细胞增殖的循环过程构成了一个
细胞周期
。
medicilon
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2019-03-19 10:54
细胞实验技术之
细胞周期
检测
一、
细胞周期
简介主要分为以下2大过程:分裂间期:间期又分为三期、即DNA合成前期(G1期)、DNA合成期(S期)与DNA合成后期(G2期);分裂期M期:细胞分裂期,指细胞分裂开始到结束。
华联科生物
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2019-03-15 16:17
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