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生物信息数据库开发之单
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数据库scrna db(一)
单
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数据库构建优质已整合的单
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数据库背景知识需求分析数据库类型数据库构建过程优质已整合的单
细胞
数据库如果读者只想获得一个现成的内容丰富的单
细胞
数据库加入至自己的PC或linux服务器,可以跳过下面的详细理论教程数据库下载链接
北京生信课堂
·
2025-02-23 04:18
数据库
生物信息学
r语言
python
护肝明星桑黄:从酒精肝到脂肪肝的全周期保护
二、桑黄的护肝机制:从纤维化抑制到
细胞
再生1.三萜类化合
桑黄研究员
·
2025-02-21 16:44
健康医疗
人工智能
centos操作系统安装R包单
细胞
拟时序分析CytoTRACE2
探序基因肿瘤研究院整理作者操作系统为centosstream8,R版本为4.3.3devtools::install_github("digitalcytometry/cytotrace2",subdir="cytotrace2_r")中途出现错误:*installing*source*package‘RcppGSL’...**成功将‘RcppGSL’程序包解包并MD5和检查**usingstag
探序基因
·
2025-02-20 15:56
centos
linux
运维
基于python使用scanpy分析单
细胞
转录组数据
探序基因肿瘤研究院整理相关后缀的格式介绍:.h5ad:是一种用于存储单
细胞
数据的文件格式,可以通过anndata库在Python中处理.loom:高效的数据存储格式(.loom文件),使得用户可以轻松地存储
探序基因
·
2025-02-20 15:26
单细胞分析
python
开发语言
单
细胞
轨迹分析-monocle包的使用
探序基因肿瘤研究院整理安装:monocle源码下载:https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/monocle.htmlR版本,4.2.0BiocManager::install("monocle")不过在安装过程中还是报错了:Warning:无法在https://bioconductor.org/packages/3.15/bi
探序基因
·
2025-02-20 15:26
r语言
知识管理成功:关键指标和策略,研究信息的投资回报率
大量的可用信息,知识工作者不仅仅是超负荷工作;他们感到不知所措,他们倾向于浪费时间(和脑
细胞
)来应付他们被大量的数据抛向他们,挣扎着试图筛选出重要的信息数据来自一堆不重要和重复的数据。
清风徐徐de来
·
2025-02-19 00:03
其他
深度学习在蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)领域的研究进展(2022-2025)
一、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的定义与生物学意义蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-ProteinInteraction,PPI)是指两个或多个蛋白质通过物理结合形成复合物,进而调控
细胞
信号传导
AndrewHZ
·
2025-02-17 10:23
深度学习
人工智能
transformer
算法
科技
土壤分析:土壤养分分析_(14).土壤养分与植物生长的关系
植物通过根系从土壤中吸收养分,这些养分对于植物的光合作用、
细胞
分裂、蛋白质合成等生理过程至关重要。因此,了解土壤养分与植物生长的关系对于提高作物产量、优化土壤管理具有重要意义。
zhubeibei168
·
2025-02-16 11:55
农业检测
opencv
人工智能
计算机视觉
无人机
图像处理
农业检测
单
细胞
分析(11)——scRNA-seq数据整合
单
细胞
RNA-seq数据整合:SeuratIntegrationandHarmony1.研究背景在单
细胞
RNA测序(scRNA-seq)研究中,批次效应(batcheffect)是不可忽视的问题。
生信小鹏
·
2025-02-16 01:15
生信技能学习
scRNA
单细胞测序
经验分享
基因组之全局互作热图可视化
Hi-C技术是一种能够检测染色体三维结构的实验方法,它能揭示DNA在
细胞
核内的三维组织结构。为了更好地展示和解释这些复杂的数据,PlotHiC可以帮助用户方便地绘制Hi-C数据的热图。
·
2025-02-14 01:59
后端
R中单
细胞
RNA-seq分析教程 (6)
引言本系列开启R中单
细胞
RNA-seq数据分析教程,持续更新,欢迎关注,转发!简介现在,很少有人只进行一次单
细胞
RNA测序实验并仅产生一份数据。
·
2025-02-13 20:18
后端
神经网络的基本构成和功能
以下是神经网络的基本构成及其功能的详细解释:1.神经元定义:神经元是神经网络的基本单元,通常由一个或多个
细胞
体、树突和轴突组成。功能:接收输入信号。处理输入信号,通过电化学信号传递给下一层神经元。
西洲啊
·
2025-02-12 04:56
AI
人工智能
深度学习
计算机视觉
单
细胞
数据整合-解决AnnData合并时ValueError: cannot reindex from a duplicate axis问题
项目场景:使用scanpy包进行单
细胞
数据分析时,往往需要整合多个样本的数据,也就是将多个AnnData对象合并为一个AnnData对象。
bamboo_shoot_kk
·
2025-02-11 00:20
单细胞数据分析
python
Vue.js组件开发终极指南:从入门到实战
一、组件基础:从
细胞
开始构建1.1组件定义(选项式API)点击次数:{{count}}//脚本部分:定义组件逻辑exportdefault{//组件名称(推荐PascalCase)name:'ButtonCounter
小哈CS
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2025-02-10 01:07
vue.js
前端
javascript
前端框架
Java实现生命游戏Plus
回合变动更新方法2设置棋盘初值(初始态)方法3绘制棋盘的方法源代码1Cell.java2Board.java3Panel.java生命游戏生命游戏是一种零玩家的数学游戏,它的前身是约翰·何顿·康威发明的
细胞
自动机
公众号:重生之成为赛博女保安
·
2025-02-08 18:24
Java
java
AI大模型探秘:核心能力与应用场景深度解析
参数就是脑
细胞
,脑
细胞
越多通常这个人越聪明,参数越多的LM通常越智能。分类语言大模型:Ch
程序员辣条
·
2025-02-06 08:53
人工智能
java
AI大模型
大模型
spring
单
细胞
数据h5ad格式转换成seurat
探序基因肿瘤研究院整理比如宫颈癌单
细胞
文章:Multiomicanalysisofcervicalsquamouscellcarcinomaidentifiescellularecosystemswithbiologicalandclinicalrelevance
探序基因
·
2025-02-06 04:20
单细胞分析
python
一个经典机器学习案例——良/恶性乳腺癌肿瘤预测
良/恶性乳腺癌肿瘤预测良/恶性乳腺癌肿瘤预测问题是一个十分经典的机器学习问题,简单来说我们需要利用肿块厚度和
细胞
尺寸这两个特征来判断肿瘤的类型(良性或者是恶性)。
曹文杰1519030112
·
2025-02-05 04:22
python机器学习及实践
人工智能
机器学习
平铺(tile)--tile,设计师必学!AI 绘图无缝拼接神技,甲方看了秒点头
屏幕突然闪烁起来,刚刚还死气沉沉的牡丹花纹开始像
细胞
分裂般无限延伸,每一块
我:yueda
·
2025-02-03 00:01
人工智能
midjourney
AI作画
全覆盖路径规划-精准
细胞
覆盖算法
今天,咱们来聊聊这个传统的精准
细胞
覆盖算法,算法的描述挺抽象的,这里尽量用易于理解的语言来讲解一下,它就像是给机器人安排一个任务,让它把一块地方仔仔细细地走一遍,下面详细说说它是怎么做的。
码厂一粒沙
·
2025-02-02 12:40
记录
算法
aggr代码 cellranger_单
细胞
实战(四) Cell Ranger流程概览
实战演练这个栏目就是带大家从头到尾完整复现单
细胞
文献分析流程。好了,干货多,屁话少,我们来看实战流程。希望大家能有所收获!
龙宫里的乙民
·
2025-02-02 07:55
aggr代码
cellranger
深度学习基因组学+机器学习单
细胞
分析,当下最火热研究方向!
深度学习已经被广泛应用于基因组学研究中,利用已知的训练集对数据的类型和应答结果进行预测,深度学习,可以进行预测和降维分析。深度学习模型的能力更强且更灵活,在适当的训练数据下,深度学习可以在较少人工参与的情况下自动学习特征和规律。调控基因组学,变异检测,致病性评分成功应用。深度学习可以提高基因组数据的可解释性,并将基因组数据转化为可操作的临床信息。深度学习通过强大的深度神经网络模型从高维大数据中自动
qwmb919
·
2025-02-02 07:25
人工智能
深度学习
机器学习
python
单
细胞
分析基础-第一节 数据质控、降维聚类
scRNA_pipeline\1.Seurat生物技能树可进官网查询添加链接描述分析流程准备:R包安装options("repos"="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")if(!require("BiocManager"))install.packages("BiocManager",update=F,ask=F)options(BioC_mirror="htt
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-02-02 06:51
单细胞分析
聚类
数据挖掘
机器学习
【单
细胞
-第三节 多样本数据分析】
文件在单
细胞
\5_GC_py\1_single_cell\1.GSE183904.RmdGSE183904数据原文1.获取临床信息筛选样本可以参考临床信息rm(list=ls())library(tinyarray
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-02-01 04:30
单细胞分析
数据分析
数据挖掘
【单
细胞
第二节:单
细胞
示例数据分析-GSE218208】
GSE2182081.创建Seurat对象#untar(“GSE218208_RAW.tar”)rm(list=ls())a=data.table::fread("GSM6736629_10x-PBMC-1_ds0.1974_CountMatrix.tsv.gz",data.table=F)a[1:4,1:4]library(tidyverse)a$`alias:gene`=str_split(a
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-01-31 09:20
单细胞分析
数据分析
mysql
数据库
单
细胞
-第五节 多样本数据分析,打分R包AUCell
文件在单
细胞
\5_GC_py\1_single_cell\3.AUCell.Rmd1.基因rm(list=ls())load("g.Rdata")2.AUCellhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-01-31 09:20
单细胞分析
数据分析
r语言
windows
bulk-seq数据和单
细胞
数据的联合分析
作者,EvilGenius随着现在研究的不断深入,越来越多的情况需要我们对多种数据的联合分析,其中在单
细胞
没有出来之前,普通转录组(bulk-seq)的测序结果是非常多的,也解决了我们很多的生物学问题,
追风少年ii
·
2025-01-31 09:50
python
算法
人工智能
(一)单
细胞
数据分析——单
细胞
数据预处理
由于毕业设计是单
细胞
数据的处理,所以把整个过程所用到的方法进行一个整理,这是第一个部分,对得到的单
细胞
数据进行质控、降维、聚类等预处理。
Kevin丶大牛
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2025-01-31 08:13
单细胞数据分析
数据分析
数据挖掘
r语言
利用MetaNeighbor验证重复性和跨物种分群
library(ggplot2)library(MetaNeighbor)library(SingleCellExperiment)library(dplyr)导入数据这里以海豚和两个公开人的PFC脑区单
细胞
转录组数
木与长清
·
2025-01-27 14:41
单细胞空间整合工具学习
r语言
数据分析
矩阵
【NOIP普及组】
细胞
分裂
现在,他正在为一个
细胞
实验做准备工作:培养
细胞
样本。Hanks博士手里现在有N种
细胞
,编号从1-N,一个第i种
细胞
经过1秒钟可以分裂为Si个同种
细胞
(Si为正整数)。
我就是南山
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2025-01-20 12:34
C++题目
#
NOIP普及组
算法
Python小项目:利用U-net完成
细胞
图像分割
利用U-Net完成
细胞
图像分割的详细指南在生物医学领域,
细胞
图像分割是一个关键步骤,能够帮助研究人员分析
细胞
结构和功能。U-Net作为一种强大的卷积神经网络结构,广泛应用于医学图像分割任务。
·
2025-01-16 17:22
鸡的营养价值
蛋白质是构成人体
细胞
和组织的基本成分,对于身体的生长发育、修复和维护起着关键作用。经常食用鸡肉,有助于增强肌肉力量,提高身体免疫力。鸡肉中还含有丰富的维生素和矿物质。
·
2025-01-16 17:13
node.js
Cell Insight | 单
细胞
测序技术又一新发现,可用于HIV-1和Mtb共感染个体诊断
国家感染性疾病临床医学研究中心/深圳市第三人民医院张国良团队携手深圳华大生命科学研究院吴靓团队,共同研究得出单
细胞
测序
尐尐呅
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2024-09-16 10:28
2023-07-24
感谢中心联谊过程当中,他们在唱诵读者上面1.一边流泪,感觉自己的内在灵魂太长,时间没有得到这样了,所以一边唱手一边在流泪,我分不清楚自己是感动了,还是被呼唤的灵魂所能看到,但我就是哭了,泪流满面,我全身
细胞
在放松
DXZHY
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2024-09-16 08:18
2019-08-05
天地是长生的,我们的心要虚心实腹,这样才能像天地一样在每秒每分钟不断的自我更新中长生不死,生理的
细胞
有衰落有新生,人的心理和精神也在发生着更新交替,每一天都是新的每一秒都是新的,只要心不死,一切都是那么的奇妙
你站在桥上看风景_2ae1
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2024-09-16 00:52
钙片
母亲的小蓝圆
细胞
癌似乎并不满足于被囿于左侧肺部的支气管,而吞噬了髋部的骨质以后,已经让她行走都出现了困难,添置了拐杖,她希望用自己的意志力与病魔抗争,因此迟迟不用,而轮椅更是上了灰一般,她说现在还没有到用那个的年纪呢
阿哈牧童
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2024-09-15 23:06
阅读,一个人的避难所
作者写一本书时,脑中数百亿神经
细胞
建立复杂奇妙的神经路线,并以字符串表达出来,并使读者脑海中建立相似的线路,通过这种生物学方面的理解,我们与古人相通了,这宛如一个奇迹,由此我们可以同样感受到那“牧人驱犊返
南南去
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2024-09-15 17:59
远离导致贫穷的习惯
02.过度饮酒醉酒会影响脑
细胞
中神经传导接收器的工作,长期过度饮酒,会导致反应迟钝。影响人的记忆力和思考能力。
小强聊成长
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2024-09-15 17:56
用了这么多年的PCA可视化竟然是错的!!!
本文启发于上周开的单
细胞
转录组课程,本次课程由资深单
细胞
算法研究者戴老师主讲,深入浅出,各部分分析原理从理论到应用层面解释透彻,最新流程,最新代码,绝对值得学习。
生信宝典
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2024-09-15 14:27
9.单
细胞
RNA-seq:聚类分析
学习目标:利用多种方法来评估聚类选择的PC基于重要的PC执行单
细胞
聚类单
细胞
RNA-seq聚类分析现在我们已经整合了高质量的
细胞
,我们想知道我们的
细胞
群中存在的不同
细胞
类型。
denghb001
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2024-09-15 02:52
hulk能量来源?
绿巨人形成原因是由于班纳受到了大量的伽马射线的照射,使其体内
细胞
基因发生变异,导致班纳的
细胞
能在过度活跃的情况下变成绿巨人的
细胞
。那么问题来了,绿
fourtwo
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2024-09-14 20:48
你还停留在缺啥不啥观念吗?
我跟很多人交流过
细胞
营养,营养补充的事。大多人会提出:“我认同要补充营养,那我缺啥,应该补啥吧,吃这么多营养素,不用吧?”事实真是如此吗?你想通过体表特征看出来缺乏什么,针对性的补什么。
青可可
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2024-09-14 16:30
食品检验师职业资格试题附答案
改变,指示剂离解常数改变,发生色变(B)随pH改变,指示剂结构发生改变,引起色变(C)随pH改变,指示剂起化学反应,引起色变:(D)随pH改变,指示剂发生物理化学反应,引起色变2、下列哪种微生物具有典型
细胞
核结构
安建资小栗子
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2024-09-14 15:39
其他
十二个养生小知识汇总集(二十)
4、杀灭癌
细胞
!5、让人心情愉悦,减少抑郁!……二、多吃这一绿一黑一黄,让肝、肾
营养师茶茶
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2024-09-14 14:48
宇宙公民高效阅读营-《被讨厌的勇气》
实在是太费脑
细胞
了。但是当我夜里完成这张思维导图时,连我自己都惊呆了。这是三天前的自己吗?对我来说简直就是天书一般。那种喜悦是全身心的放松。完全没有了白天时的那种压力和懊恼。思维导图是什么?
宇宙公民刘燕
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2024-09-14 09:20
2023-09-27
三个“突出”,建强基层党员队伍党员是党的肌体的
细胞
,是党的活力的源泉。
xdyggy
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2024-09-14 08:52
骨神经纤维瘤应该怎么治疗
骨神经纤维瘤是生长在神经干处的以纤维
细胞
为主的良性肿瘤,是皮肤、深部软组织、神经和骨的一种复杂性肿瘤。瘤体并非都与大神经干相连,亦可起于很小的无髓纤维。外有疏松透亮薄包膜,其外有或无轻反应区。
乐一_d7c7
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2024-09-14 02:34
seurat自学笔记1.0 单
细胞
数据导入
Python读取.h5ad文件importanndataimportpandasaspdadata=anndata.read("/home/R/R_data/Seurat/PBMC10/output/adata.h5ad")#adata.X.todense()#将稀疏矩阵转成普通矩阵#X=pd.DataFrame(adata.X.todense())#cell_name=adata.obs.ind
Sanye2022
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2024-09-14 01:36
python
pandas
怎样欣赏孟浩然的《过故人庄》,为什么说其“淡到看不到诗”?
要讲清楚第二个问题,那就颇费脑
细胞
了。因为说孟浩然的诗“
梧桐树边羽
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2024-09-13 23:17
爱你一千年(28)
连博士将研制出来的DNA
细胞
克隆在仿生猴子体内,设置程序将小猴子进行速冻,等待收到DNA搜索器扫描信号时才可以被唤醒。原来是仿生猴。贝司阳看了看眼前
江南深白
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2024-09-13 18:45
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