高通量

高通量多因子检测赋能胰腺癌生物标志物发现与临床转化

研究背景：胰腺癌作为恶性程度极高的消化系统肿瘤，其死亡率与发病率近乎持平的临床特征始终是医学领域的重大挑战。与多数癌症生存率稳步提升的趋势不同，胰腺癌的诊疗进展长期滞后——超过50%的患者确诊时已处于疾病晚期，对传统放化疗方案呈现显著耐药性。据美国2017年流行病学数据显示，胰腺癌患者5年相对生存率仅8%，尽管男性患者生存率呈现年均0.3%的微弱提升，但整体预后仍处于恶性肿瘤谱系的最底端，临床对创

LabEx·2025-07-01 21:47

python做生物信息学分析_Python从零开始第五章生物信息学①提取差异基因

目前来说，做生物信息学的人越来越多，但是我觉得目前而言做生信的主要有三类人：老本行是做实验的，做生信可能是为了辅助研究或者是为了发paper(有非常多的临床生选择趟生信这波水)主要是做生信的，主要涵盖高通量测序数据分析

吴敬欣·2025-06-28 07:57

“组学”的数据结构与概念

1.组学数据：生命系统的分子层面快照定义：组学数据是指利用高通量实验技术，对生物样本（细胞、组织、个体等）在特定状态下，某一类生物分子全集进行系统性、大规模定量测量所产生的数据集。

不秃的卤蛋·2025-06-25 18:36

Kafka实战进阶：一篇详解与互联网实战PDF指南，带你深入Apache Kafka的世界

该项目旨在为处理实时数据提供一个统一、高通量、低等待的平台。Kafka作为一种分布式的、分区的、多复本的日志提交服务，凭借其独特的设计提供了丰富的消息系统功能。

手把手教你学Java·2025-05-17 11:02

RIP（RNA免疫沉淀）实验技术介绍

本技术利用抗体捕获RNA结合蛋白（RBP）及其结合的RNA，结合高通量测序（RIP-Seq）或qPCR分析，可精准解析RNA-蛋白互作网络，揭示其在基因表达调控、疾病发生及细胞功能中的关键作用。二、实

如期生物·2025-05-16 15:09

DAP-seq文章合集-蓝景科信

100+物种，1000+转录因子的实战经验，高通量鉴定转录因子的下游基因，已助力多篇文章发表知名期刊，例如：MolecularPlant，ThePlantCell，PlantPhysiology，PlantBiotechnologyJournal

蓝景科信·2025-04-29 23:18

人工智能在PET-CT中的应用方向探析

首先，在诊断效率方面，AI能够实现对大规模影像数据的高通量自动分析，显著缩短

Allen_Lyb·2025-04-23 07:57

AI 在酶工程领域的创新应用及实践。

但传统蛋白质设计面临诸多难题，蛋白质结构复杂，序列空间庞大，依赖专家经验和高通量筛选的设计方式，不仅耗时费力，成功率也难以保证。

·2025-04-21 12:07

高光谱相机：温室盆栽高通量植物表型光谱成像研究

传统植物表型测量依赖人工观察与手工记录，存在效率低、主观性强、无法获取多维数据（如生化成分、三维形态）等缺陷。例如，叶片氮含量需破坏性取样检测，根系表型需挖掘植株，导致数据不连续且难以规模化。此外，基因测序技术的快速发展（如全基因组关联分析GWAS）远超表型数据的获取能力，形成“基因型-表型数据鸿沟”，限制了作物育种的精准性。高光谱成像（400-2400nm）技术的成熟，使得非侵入性获取植物生化（

中达瑞和-高光谱·多光谱·2025-04-18 19:15

2025.03.22【读书笔记】| fastq-multx：高效barcode拆分数据解决工具

fastq-multx是一个专门设计用于处理高通量

穆易青·2025-03-22 19:26

生物信息学工作流（Bioinformatics Workflow）：概念、历史、现状与展望？

随着高通量测序技术的普及和生物数据的爆炸式增长，生物信息学工作流在基因组学、转录组学、蛋白质组学等领域中扮演着至关重要的角色。它不仅提高了数据分析的效率，还为生命科学研究提供了新的视角和方法。

lisw05·2025-03-08 06:22

AI驱动的药物设计的优势表现在哪些方面

AI驱动药物发现：通过高通量筛选、虚拟药物设计和预测模型，大幅缩短研发周期。案例：Exscientia利用AI平台在12个月内设计出了一种抗癌药物候选分子，而传统方法通常需要4-5年。

小宝哥Code·2025-02-16 23:30

三甲医院大型生信服务器多配置方案剖析与应用（2024版）

随着高通量测序技术、医学影像技术等的飞速发展，生物医学数据呈爆发式增长，这些数据涵盖了基因组、蛋白质组、代谢组等多个层面的信息，为医学研究和临床诊断提供了前所未有的机遇与挑战。

Allen_LVyingbo·2025-02-02 09:41

高通量测序的数据处理与分析指北(二)--宏基因组篇

博客原文宏基因组篇前言之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理，这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前，我们先来认识一下什么是宏基因组。

lantary·2024-09-14 12:52

极客天成签署 CCLA，携手openEuler社区共拓信创AI新天地

极客天成以高通量分布式集群存储为先锋，围绕软件定义、智能化、安全可靠，全链RDMA构建了完全自主可控的分布式存储产品线和解决方案，主要解决用户海量数据下的高性能低时延数据读写难题，可为用户的数据中心提供

极客天成ScaleFlash·2024-08-31 14:32

高通量测序的数据处理与分析(二)-宏基因组2

博客原文宏基因组数据处理方法数据下载wget下载宏基因组的数据主要分布在两个数据库：1.NCBI的SRA数据库，2.ENA。近年来也有许多研究者将数据上传到中国的数据库：NGDC你可以直接通过网页下载数据，或者是通过各个网站提供的下载工具进行批量下载。也可以到sra-exporter这个网站上输入项目号获得样本的下载链接。用wget或者其他下载工具进行下载，示例的命令如下:wget-cftp://

lantary·2024-03-08 09:58

扩增子质控流程多，专属名词来揭晓

在高通量测序王国中，Rawreads（或rawdata）已不陌生，但在扩增子测序的质控数据中还有Rawtags、Cleantags、Effectivetags等一串的专属名词，这些名词代表什么，分析要关注哪些数据

ee00dc6faab7·2024-02-26 16:53

生信工具 | 测序数据质控与过滤 - fqtrim

fqtrimtrimming&filteringofnext-genreadsfqtrim是一个多功能的独立实用程序，可用于去除高通量测序仪产出的测序数据接头，poly-A尾，末端未知碱基（Ns）和低质量

·2024-02-23 02:36

转录组结果和qRT-PCR结果又不一致？！

转录组测序（RNA-seq）将细胞内某一类型（或全部）的RNA逆转录成DNA，通过高通量测序的方法测定其序列并统计其表达水平的一项技术。是检测基因表达变化的通用方法。

Seurat_·2024-02-20 20:22

2022-01-03

CellReports|高通量可视化DNA修复细节原创图灵基因图灵基因2022-01-0318:15收录于话题#前沿分子生物学技术来自国家癌症研究中心（CNIO）和马萨诸塞州总医院的研究人员开发了包括机器学习和高通量显微镜在内的新方法

图灵基因·2024-02-20 08:08

转录调控研究数据库推荐 | 你要找的ChIP-seq数据都在这里啦！

染色质免疫沉淀、DNase-I超敏反应和转座酶可及性分析结合高通量测序，使染色质动力学、转录因子结合和基因调控的全基因组研究成为可能。

尐尐呅·2024-02-15 04:49

Python 资源大全（七）

官网bcbio-nextgen：这个工具箱为全自动高通量测序分析提供符

忘了呼吸的那只猫·2024-02-14 05:46

06高通量测序-RPKM,FPKM,and TPM

RPKM,FPKM,andTPMRNA-seq标准我们过去使用RPKM(ReadsPerKilobaseMillion)或FPKM(FragmentsPerKilobaseMillion)这些均一化的read计数如下:测序仪深度(Million)测序越深，就有越多的read比对到基因上。基因长度(kilobase)基因越长，就有越多的read比对到基因上。现在他们想让我们使用TPM——(Trans

不到7不改名·2024-02-13 20:56

2019-07-15

科研人员通过高通量药物筛选将虾青素鉴定为一种新

晓夜子谈·2024-02-13 05:11

高通量测序的前世今生

“高通量测序”这词我想大部分人都不会感到陌生，因为现如今它算得上是一个比较热门的领域，但是您又知道多少关于高通量的知识呢？接下来小编来聊聊它的前世以及今生，带您走进高通量测序的世界。

南博屹生物医学·2024-02-11 21:53

腾讯AI大佬详解Apache Kafka实战

该项目的目标是为处理实时数据提供一个统一、高通量、低等待的平台。Kafka是一个分布式的、分区的、多复本的日志提交服务。它通过一种独一无二的设计提供了

笑起来真好看LQQ·2024-02-09 08:53

STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner

SchlesingerF,etal.STAR:ultrafastuniversalRNA-seqaligner[J].Bioinformatics,2012,29(1).ABSTRACTMotivation:高通量

sunlight_yy·2024-02-07 14:29

科技成果：AI在智慧农业中的应用科普

1.2精准投喂：采摘完毕后的放置工作2.通道式多用途智能分选机2.1简介2.2主要技术指标2.3市场前景3.高通量土壤成分智能检测机器人3.1原创性技术成果3.2技术亮点MyThoughtsReference

猛码Memmat·2024-02-07 00:34

14岁的男孩说想学生信，应该给予哪些指导？

前言随着高通量测序技术的发展，越来越多的文章重视湿实验和数据分析结合。

生信宝典·2024-02-05 06:57

高通量测序介绍

高通量测序技术（High-throughputsequencing）又称“下一代”测序技术（“Next-generation”sequencing），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志

基因组分析·2024-02-03 23:19

病原菌共感染研究思路

随着测序的发展，应用高通量转录组测序对于感染多种病原菌的研究也不断深入，今天跟大家分享两篇病原菌共培养研究共感染过程的相互作用，希望能给研究共感染的老师一些样本准备设计的思路的参考

爱基百客·2024-02-02 15:43

使用MAKER进行基因注释(高级篇之GeneMark-ET模型训练）

真核生物基因组预测主要会用到GeneMark-ES/ET,其中GeneMark-ES可用于无监督自训练，也就是只要提供一个基因组序列即可，而GeneMark-ET则是在GeneMark-ES的基础上整合了高通量的

xuzhougeng·2024-02-01 17:40

2021-12-27

近年来，随着高通量测序技术的发展，人类已经可以从单碱基

图灵基因·2024-01-31 23:49

外源赤霉素保护高粱幼苗免受精异丙甲草胺药害的机制研究

ThemechanismofexogenousgibberellinA3protectingsorghumshootsfromS-metolachlor Phytotoxicity发表期刊：PestManagementScience影响因子：4.462作者单位：河南农业科学院百趣提供服务：植物激素高通量靶标定量

09eb862dd2cf·2024-01-29 15:52

[基因组学]使用GAMP根据已知CDS序列来进行未知基因组序列的功能注释

后来高通量测序时代，又开发了GSNAP支持高通量数据比对。软件安装我采用的是利用源代码且在无root权限下进行安装。

巩翔宇Ibrahimovic·2024-01-29 14:11

RNA 3. SCI 文章中基于T CGA 差异表达基因之 DESeq2

在比较高通量测序分析中，一项基本任务是分析计数数据，如RNA-seq中每个基因的Readcount，以获得跨实验条件的系统性变化的证据。离

90066456ace6·2024-01-29 12:48

学习小组DAY7笔记--路超杰

思维导图高通量测序二代测序的专业名词flowcell：测序反应的载体/容器，1个flowcell有8个lanelane：测序反应的平行泳道，试剂添加、洗脱等过程的发生位置tile：每次荧光扫描的位置，肉眼是看不到的双端测序

Imimp·2024-01-27 01:24

前沿综述 | 利用机器学习进行多组学数据分析

随着高通量组学平台的发展，生物医学研究大多采取了多组学技术结合的方法，不同组学来源（如遗传学、蛋白质组学和代谢组学）的数据可以通过基于机器学习（MachineLearning，ML）的预测算法进行整合，

尐尐呅·2024-01-26 20:20

全反式维甲酸（ATAR）诱导白血细胞的染色质构象改变而影响分化进程

高通量染色体

d5c9c866171f·2024-01-24 11:45

第06周-高通量药物筛选对Rhabdoid tumors

高通量药物筛选对Rhabdoidtumors文章是:High-ThroughputDrugScreeningIdentifiesPazopanibandClofiliumTosylateasPromisingTreatmentsforMalignantRhabdoidTumors

小梦游仙境·2024-01-23 09:03

3‘aTWAS—3‘adapter-based transcriptome-wide association study

该技术利用高通量测序技术，对大量样本进行转录组测序，并通过对测序数据进行分析，识别与特定表型或疾病状态相关的基因和转录本。3'aT

m1chiru·2024-01-23 09:23

【科研集市】一文带你读懂Hi-C（附高分文献汇总）

High-throughchromosomeconformationcapture)技术源于染色体构象捕获（Chromosomeconformationcapture,3C）技术，以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术

d5c9c866171f·2024-01-22 22:29

linux系统下，将.fastq文件统一改为.fq文件

#高通量测序获得宏基因组/宏转录组进行后续分析的过程中，常碰到.fastq与.fq文件后缀不一致的问题#在Linux系统中，你可以使用rename命令或者mv命令来将文件名中的特定后缀进行修改。

WDPLA·2024-01-22 15:47

生物信息基础：pysam读写基因组文件

Pysam[1]是一个Python模块，它打包了高通量测序库htslib[2]的C-API，可用于读写基因组相关文件，如Fasta/Fastq，SAM/BAM/CRAM，VCF等。

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-22 08:37

2021-05-17 MAGeCK

CRISPR筛选是一种在单一实验中研究多个基因功能的高通量技术。在筛选实验中，sgRNA被设计、合成并克隆到一个慢病毒

谢某丶·2024-01-22 05:08

高通量测序数据质控神器Trimmomatic

简介高通量测序下机的原始数据中存在一些低质量数据、接头以及barcode序列等，为消除其对后续分析准确性产生的影响，在数据下机以后对原始数据进行质控处理就成了至关重要的环节。

kongxx·2024-01-21 15:56

04高通量测序-R实现主成分分析

R实现主成分分析如何使用prcomp()函数来做PCA如何使用基础图形和ggplot2绘制PCA图如何确定每个主成分占多少变动如何检查载荷得分（LoadingScores），以确定哪些变量对图表有最大的影响。构建数据集首先，让我们生成一个可以在演示中使用的假数据集。#我们将用10个样本制作一个数据矩阵，在每个样本中测量100个基因data.matrixstr(pca)Listof5$sdev:nu

不到7不改名·2024-01-21 12:35

学习小组Day7笔记--Monomania

2020年4月20日Day7：测序知识今天学习的主题是测序的相关知识，主要是测序技术的历史、高通量测序的分类以及一些相关的测序基础知识。学习资料有点多，感觉一时半会儿也不能全部理解，得多看看总结总结。

Just_Monomania·2024-01-19 18:46

文献翻译--ASpedia:人类选择性剪切的综合百科全书

通过高通量数据集的差异选择性剪接分析，已经鉴定出数百或数千个剪接区域。然而，很难解释每个拼接事件的功能影响。蛋白质结构域的形成和无义介导的衰退被认为是剪接的主要功能特征。

ECHO1216·2024-01-18 03:06

小白使用GSEA的注意事项

经过不断的试错，我终于找到了目前看过最好的GSEA教程，在细节之处非常贴心，小心心送给你～传送门：ChevyXu的高通量测序数据处理学习记录（三）：Path

墨墨如·2024-01-17 15:26

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