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高通量
华大基因推出产前筛查产品NIFTY®,助力防控显性单基因病
随着
高通量
测序技术在临床应用的迅速进步,从常见的染色体非整倍体扩展到性染色体和拷贝数变异,全球范围内已经开始将无创产前检测(Non-invasivePrenatalTesting,NIPT)的应用范围逐步扩大
ZAKER科技动态
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2023-11-07 17:55
python
一文解决GEO芯片数据分析80%的工作!建议收藏!
对于大部分的研究者而言,拿公开的
高通量
数据,进行二次分析,是最佳的选择途径。作为与TCGA数据库齐名的一个大型数据库,GEO数据库包罗万象,对于每个领域的科研工作者很有帮助。
Seurat_Satija
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2023-11-06 10:41
单细胞转录组数据分析|| scanpy教程:空间转录组数据分析
长期以来,由于技术的限制我们很难
高通量
地同时获得组织中的位置信息极其状态。2019年以来,这种情况借助
高通量
技术得到了商业化地解决。
周运来就是我
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2023-11-05 00:22
2022-08-22
通过将脱细胞技术与
高通量
定量蛋白质组学方法相结合,对人胃黏膜进行了广泛的表征,揭示了其在肿瘤、正常邻近和正常远处黏膜中的组成和分布。
朗月斋主
·
2023-11-04 22:39
基因组组装数据分析专题
得到一个物种的参考基因组是开展后续结构和功能基因挖掘的前提,通过
高通量
测序可以快速的拼接得到基因组,本文整理了基因组组装相关的数据分析资料。
生信修炼手册
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2023-11-04 13:27
第三代测序技术在微生物研究中的应用
第三代测序技术是一种集
高通量
、快速度、长读长及低成本等多种优点于一身的新型测序技术,它的出现为基因组学、转录组学及DNA甲基化等研究
wangchuang2017
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2023-11-04 09:02
高通量
测序技术和序列拼接算法探析
摘要:
高通量
测序(High-throughputSequencing,HTS)技术是继第一代测序技术之后发展起来的一种新型测序方式,又被称为下一代测序技术。
wangchuang2017
·
2023-11-04 09:31
序列拼接
Apache Doris 开源最顶级基于MPP架构的高性能实时分析数据库
海量数据下返回查询结果仅需亚秒级响应时间,不仅可以支持高并发点查询场景,还可以支持
高通量
复杂分析场景。
yue_stack
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2023-11-04 05:32
apache
开源
架构
doris
2022-04-17
NatBiotech|基因编辑对癌症相关突变进行
高通量
功能评估原创huacishu图灵基因2022-04-1707:03收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:huacishuIF=54.908推荐度:⭐⭐
图灵基因
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2023-11-03 18:45
生信 | 三维基因组技术(三):Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用
写在前面以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记1.Hi-C原理简介1.1Hi-C技术
高通量
染色体构象捕获技术(High-throughputchromosomeconformationcapture
生信卷王
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2023-11-02 20:06
影像组学radiomics学习笔记第三章(一)CT图像包含的特征
影像组学即
高通量
地从医学影像中挖掘图像特征地过程。影像组学地功能工作流程包括:1)获取图像;2)分割感兴趣的区域,例如肿瘤;3)定量地提取图像特征;4)预测模型的建立和验证。
The_root
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2023-11-01 21:28
中科睿芯与北京顺义成立人工智能产业孵化机构 并发布
高通量
人工智能一体机
并与日前发布世界首款基于ARM的
高通量
人工智能一体机。11月8日,高通发布了世界首款10nm服务器芯片。此次高通发布的这款服务器,代表着近年来服务器市场第一次出现了强有力的竞争产品。
whale52hertz
·
2023-10-31 09:02
人工智能资讯
中科睿芯
北京顺义
人工智能产业孵化机构
人工智能一体机
DNA甲基化数据分析(二)
DSS(DispersionShrinkageforSequencingdata),为基于
高通量
测序数据的差异分析而设计的Bioconductor包。
杨博士聊生信
·
2023-10-30 10:21
高通量
测序技术与转基因分子特征
高通量
测序技术与转基因分子特征以下文章来源于核酸检测科学前沿,作者hsjsqy20近年来,随着测序技术的发展,基于
高通量
DNA测序技术的转基因植物分子特征分析为精准解析转基因植物的分子特征提供了新的思路
天明豆豆
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2023-10-29 16:24
代谢组学及网络药理学
网络药理学能够通过计算机模拟算法、运用组学、
高通量
筛选及网络分析等技术揭露药物-靶点-疾病之间复杂的网络信号关系,已经成为揭示生物系统复杂功能和行为的有力工具。1、代谢组学简介及样本的采
桃子0
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2023-10-28 22:39
Chip-seq简介
通过抗原抗体特异性结合的免疫学手段捕获该复合体,然后洗脱蛋白质,得到与目的蛋白结合的DNA片段,将富集到的DNA片段进行上机测序,即形成了一套成熟的分析流程,称之为chip-seq,就是将传统的chip技术和
高通量
测序结合起来
生信修炼手册
·
2023-10-28 16:54
LipidSearch 5.1
限制这些工作流程在
高通量
非靶向脂质组学分析中广泛应用的主要瓶颈之一是缺乏用于自动化数据处理、数据库搜索和复杂脂质组学数据集可视化的集成软件工具。此
技术服务173
·
2023-10-27 12:31
算法
宏基因组学研究—宏基因组Reads的组装与分类/分箱
1.
高通量
测序是探索宏基因组学研究的一个工具1.1与参考基因组进行Mapping来重构宏基因组Reads许多微生物未被分离,数据库中无相关信息;利用宏基因组Reads与当前已知数据库进行比较分析,可以对数据产生新的理解
JarySun
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2023-10-26 09:10
转录组之质量控制(FastQC)[学习笔记通俗易懂版]
更新日期:2023年7月4号本文知乎地址:转录组之质量控制(FastQC)[学习笔记通俗易懂版]fastqc软件简介FastQC是一个用于
高通量
序列数据的质量控制程序。
CYH-BI
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2023-10-25 12:07
转录组学习
学习
笔记
学习方法
linux
高通量
测序中的接头(adapter)到底是什么
首先放一张测序示意图,在DNA片段两端所加的序列即接头序列,也就是我们今天要讲述的主角。image1基本概念1.1adapter接头,为一段已知的短核苷酸序列,用于链接未知的目标测序片段1.2index或barcode几个碱基组成的寡核苷酸链,用于在混合测序时,区分不同样本1.3insert待测序的目标序列,位于两个adapter之间image测序片段包括几个部分:universal_adapte
云养江停
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2023-10-24 18:52
2022-04-14
EPIC-seq可以实现无创、
高通量
的组织起源表征,具有诊断、预后和治疗潜力。2022年3月31日,naturebiot
图灵基因
·
2023-10-23 05:17
用IGV判断NGS链特异性
现在很多人都从NCBI上下载
高通量
测序的SRA文件重新分析利用,想要更加准确地利用这些数据,首先要明确SRA的特征。测序的目的是一方面,建库的类型是一方面,链特异性也是很重要的一方面。
木制品_1125
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2023-10-23 00:49
文献翻译--转录因子对可变剪接调控网络的多层控制
我们描述了一个
高通量
系统,用于系统地将反式作用因子与内源性RNA调节事件联系起来。利用这个系统,我们确定了数百个与不同调控层相关的因子,这些调控层积极或消极地控制
ECHO1216
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2023-10-22 22:37
RNA_seq生物分析学习--RNA-seq介绍
发展历史第四课关于基因的概念第一课课程介绍RNAseq捕获了细胞某一状态下所有的转录信息DNA是静态信息、RNA是动态信息,是某一时刻DNA表达谱的快照课程大纲RNAseq的应用第二课RNAseq技术转录组概念中心法则(
高通量
测序验证了中心法则是正确的
Drone_xjw
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2023-10-21 20:42
生物信息学
机器学习
其他
2022-04-02
CancerCell|
高通量
单细胞分析胶质母细胞瘤异质性原创骄阳似我图灵基因2022-04-0207:03收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:骄阳似我IF:31.743推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:作者及其研究团队使用
高通量
单细胞基因组分析方法来描述原发性胶质母细胞瘤以及匹配的患者来源的外植体和胶质球细胞系的遗传和转录组异质性
图灵基因
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2023-10-21 16:12
学习小组Day7笔记--lele
主要参考的资料:先用10分钟看完这两篇:****生信小白第6天-初涉测序(这一篇可以初步理解测序历史,也就是一二三代测序,以及什么是
高通量
测序)****生信小白第8天名词结构化(这一篇从研究对象上给
高通量
测序分类
ELLE0622
·
2023-10-20 18:24
凌恩快讯 | 凌恩生物联手墨卓生物,为中国科研注入国人力量!
图MobiNova®-100
高通量
单细胞测序建库系统单细胞测序技术经过近10年的迅猛发展,已成为破解细胞异质性基因表达、高分辨率精准识别细胞特征的重要科研工具。
SHANGHAILINGEN
·
2023-10-19 18:53
测序
组学
文章必备| 叶绿体基因组高级分析内容汇总
随着
高通量
测序技术的快速发展,利用叶绿体来研究细胞器的起源、结构、进化正受到越来越广泛的关注。图
SHANGHAILINGEN
·
2023-10-19 18:21
测序
组学
“非因线上讲堂”DSP空间多组学系列第一讲——从单细胞到空间转录组
随着肿瘤微环境的深入研究,在有限样本上实现
高通量
、高精度多组学分析已成为未来肿瘤微环境研究的重要方向。
FynnBio
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2023-10-18 23:47
BSA研究方案——如何从容不迫的进行性状定位
具体是利用差异目标性状的两个亲本构建家系,在子代分离群体中选取目标性状个体构建DNA混合池,采用
高通量
测序技术对混池DNA进行建库测序,开发全基因组范围内的SNP、InDel分子标记,以通过计算SNP、
菌小落
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2023-10-18 17:29
测序
kafka
该项目的目标是为处理实时数据提供一个统一、
高通量
、低等待的平台。Kafka是一个分布式消息队列:生产者、消费者的功能。它提供了类似于JMS的特性,但是在设
Carl God
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2023-10-15 10:37
kafka
转录组数据分析在生物医学领域的应用
简介随着第二代测序技术的迅猛发展,其
高通量
、快速、低成本的特点成为越来越多的生物学研究者在解决生物学问题时的首选,尤其在转录组测序方面更显示出极大的潜力。
荞麦agan
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2023-10-15 09:37
生物信息学
数据分析
转录组
生物信息
数据分析
全外显子组测序技术WES简介及结题报告解读
一、外显子组测序技术简介外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后,再进行
高通量
测序的基因组分析方法。外显子组序列仅占全基因组序列的1%左右,与人类85%致病基因突变相关。
Seurat_
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2023-10-15 03:25
病毒组研究新进展 | 当三代测序邂逅宏病毒组研究
高通量
技术的发展为人们获取数据提供了便捷高效的途径,然而,基于短读长测序的NGS技术未能很好的解决复杂微生态群体中病毒组的研究难点——以往的研究手段,人们对病毒基因组数据的获取和组装效果的提升依旧没有更大的突破
SHANGHAILINGEN
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2023-10-14 23:37
测序
组学
产品升级!全球尺度下原核基因组关键基因共进化无标题
微生物是群落型的生存方式,
高通量
测序时代到来后,掀起了针对微生物群落整体研究的高潮,比如基于功能基因/16S/ITS/扩增子、宏基因组等进行群落多样性分析。
SHANGHAILINGEN
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2023-10-14 23:37
测序
组学
基础知识复习之比对
然后根据这个去找变异或者看表达量多少;拼接的话可以拼接转录本或者构建基因组序列比对就是将测序reads重新定位到基因组/转录组上,又叫mapping先说下特点和平常我们常用的blast同源比对不同,这里的序列比对主要指
高通量
刘小泽
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2023-10-14 17:59
NGS-
高通量
测序原理学习笔记
学习教程https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=2247491455&idx=1&sn=d4fb468c36c56f98eddd6bfa021651f0&chksm=ec0ddaf5db7a53e352053fa913b1eb031c2c4412093a2db78f9f4ae290078c0d397a0c3ca3d4&scene=
jiarf
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2023-10-14 17:28
中国航天发射2020年开门红,通信技术试验卫星五号成功发射
通信技术试验卫星五号主要用于卫星通信、广播电视、数据传输等业务,并开展
高通量
技术试验验证。
靳祥虎聊癫痫
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2023-10-14 15:13
【工具速递】使用 Chromap 快速对齐和预处理染色质图谱-Fast alignment and preprocessing of chromatin profiles with Chromap
FastalignmentandpreprocessingofchromatinprofileswithChromap期刊:bioRxiv日期:06,18,2021文章展示了Chromap,这是一种用于对齐和预处理
高通量
染色质图谱的超快速方法
六博说
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2023-10-14 14:54
黑色素瘤的最新研究进展(2021年5月)
随着
高通量
基因测序技术的发展和对肿瘤分子机制认识的加深,人们发现肿瘤异质性和肿瘤微环境多样性影响了肿瘤的形成、耐药和治疗选择,导致了黑色素瘤患者对同种治疗方法的反应和获益不同。
“泽平科技”公众号24h在线答疑
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2023-10-14 11:46
黑色素瘤
黑色素瘤最新
恶性黑色素瘤
高通量
测序中的read、contig和scaffold的关系
高通量
测序平台产生的序列就称为reads。2.什么是Contig?拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。3.什么是Scaffold?
一只烟酒僧
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2023-10-14 00:41
原始数据不仅有GEO, 还有ArrayExpress!
和GEO数据库类似,ArrayExpress是属于EBI旗下的公共数据库,用于存放芯片和
高通量
测序的相关数据,网址如下>https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/数据来源于下图所示的两个部分第一部分是由科研工作者提交的数据
生信修炼手册
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2023-10-13 20:25
数据库
大数据
机器学习
数据分析
java
文献学习笔记丨转录组表达数据的生信挖掘研究
引言基因表达特征:时空特异性转录层面研究基因表达的技术:PCR、基因芯片、转录组测序(RNA-seq)、Nanostring等
高通量
技术:检测样品中的大量基因表达情况,目前的热门研究领域。
生信分析笔记
·
2023-10-13 20:48
数据挖掘
2022-07-29
NatBiotech|
高通量
单细胞蛋白质组学实现单日分析5000个细胞原创存在一棵树图灵基因2022-07-2910:03发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术460个撰文:存在一棵树IF=68.164
图灵基因
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2023-10-13 16:57
寻找ceRNA机制 构建关系网络
通过
高通量
测序或者芯片我们可以找到几百上千个差异表达的lnc/circRNA、mRNA、miRNA。每个分子都可能通过该机制发挥作用。
纪伟讲测序
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2023-10-13 15:55
2022-07-31
Science|纳米药物递送通道的
高通量
筛选原创存在一棵树图灵基因2022-07-3110:10发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术撰文:存在一棵树IF=63.714推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:开发了一种
高通量
筛选方法
图灵基因
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2023-10-13 08:41
二代测序文库构建-概述与挑战(1)
高通量
测序又称NGS,重新定义了基因组学研究。近年来,NGS技术稳步发展,伴随着成本下降以及测序应用呈指数增加。
Juan_NF
·
2023-10-13 03:49
GeneWalk 基因通路分析
高通量
功能基因组学的分析每次能得到成百上千的基因和大量的通路,要在这大量的基因和通路里分析出生物学意义上更重要的部分很依赖于个人的经验和知识,尤其是许多的基因都是多功能的。
BeeBee生信
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2023-10-12 11:51
生信技能-
高通量
测序工具bam、samtools、bedtools及conda的下载和安装
详情:baw是一款将序列比对到参考基因组上的软件,用于
高通量
测序数据处理,包含了BWA-backtrack、BWA-SW、BWA-MEM三种算法:1、BWA-backtrack:适合比对长度不超过100bp
weixin_43664814
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2023-10-12 04:11
生信-测序
conda
转录组测序原理
spm_id_from=333.788.videocard.0定义而转录组测序即是利用
高通量
测序技术,将细胞或组织中的全部或部分mRNA,miRNA,lncRNA进行测序分析的技术。
Peng_001
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2023-10-11 04:32
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