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samtools整合sam转
bam
/sort和index命令
使用bwa,hisat2等比对软件,常会得到sam文件,此文是对多个sam转化/排序/建立index的命令vimsam2
bam
.sh#按一下i进入编辑模式,写入以下内容!
王梓维
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2023-03-09 18:16
LeetCode 删除排序链表中的重复元素
1,2]示例2:示例2的图示输入:head=[1,1,2,3,3]输出:[1,2,3]提示:链表中节点数目在范围[0,300]内-100<=Node.val<=100题目数据保证链表已经按升序排列我的
算法实现
为
吴敬悦
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2023-03-09 12:08
PPQ库中KLD
算法实现
代码解析
PPQ量化工具库KLD算法解析前言PPQ
算法实现
NVIDIA的PPT中KLD算法流程KLD算法PPQ实现版本PPQ与NVIDIA的区别:前言这是对PPQ库中KLD
算法实现
代码解析,关于PPQ库安装与使用详情见专栏上一篇博客
是江姑娘呀
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2023-03-09 10:27
模型量化
算法
iOS 用扫描线种子填充
算法实现
涂鸦的功能
扫描线种子填充算法基本步骤:初始化一个空栈用于存放种子点,将种子点(x,y)入栈判断栈是否为空,如果栈为空则算法结束,否则取出栈顶元素作为当前扫描线的种子点(x,y),y是当前的扫描线从种子点(x,y)出发,沿当前扫描线向左向右两个方向填充,直到边界。分别标记区段的左右端点为xLeft,xRight分别检查与当前扫描线相邻的y-1和y+1两条扫描线在区间[xLeft,xRight]中的像素,从xL
lkkwxy
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2023-03-09 06:40
基于Python实现抢注大词的提词工具
假设通过爬虫获得了一个自媒体.txt想要从这些关键词中提取流量最大的关键词可以通过如下
算法实现
:fromsmoothnlp.algorithm.phraseimportextract_phraseimportreclass_name
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2023-02-28 15:38
ML之R:通过数据预处理(缺失值/异常值/特殊值的处理/长尾转正态分布/目标log变换/柱形图-箱形图-小提琴图可视化/构造特征/特征筛选)利用
算法实现
二手汽车产品交易价格回归预测之详细攻略
ML之R:通过数据预处理(缺失值/异常值/特殊值的处理/长尾转正态分布/目标log变换/柱形图-箱形图-小提琴图可视化/构造特征/特征筛选)利用
算法实现
二手汽车产品交易价格回归预测之详细攻略目录二手汽车产品交易价格预测赛题背景字段说明通过数据预处理利用
一个处女座的程序猿
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2023-02-28 07:31
DataScience
ML
算法
汽车
回归
Golang实现AES对称加密算法实例详解
使用密文在一定程度上可避免信息落入他人之手,本文介绍Golang的对称加密
算法实现
。前置知识在正式学习加密解密之前,首先看看如何生成随
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2023-02-27 18:57
【自然语言处理】基于句子嵌入的文本摘要
算法实现
基于句子嵌入的文本摘要
算法实现
人们在理解了文本的含义后,很容易用自己的话对文本进行总结。但在数据过多、缺乏人力和时间的情况下,自动文本摘要则显得至关重要。
皮皮要HAPPY
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2023-02-27 18:31
自然语言处理
自然语言处理
人工智能
文本摘要
句子嵌入
文本挖掘
【数据结构】【栈】括号匹配算法(可直接运行)
文章目录1.算法问题2.算法思路3.
算法实现
4.完整代码5.运行结果1.算法问题假设表达式中允许包含三种括号:()、[]、{},其嵌套的顺序任意,即([]{})或[()[]{}]等均为正确的格式,实现一个算法
Silver Star
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2023-02-26 07:48
数据结构
算法
算法
数据结构
c++
栈
括号匹配
cv中的注意力机制论文:CBAM and
BAM
阅读理解
BAM
:https://blog.csdn.net/xiewenrui1996/article/details/105760359Abstract我们提出了卷积-块-注意力-模块(CBAM),这是一种用于前馈卷积神经网络的简单而有效的注意力模块
听我的错不了
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2023-02-25 07:37
文献翻译
学习日常
分类算法 - k近邻算法(原理、kd树)
算法概述2.模型三要素2.1距离度量2.2k值选择2.3分类规则2.算法流程3.优缺点分析4.算法优化4.1距离加权4.2kd-tree4.2.1kd树的构造4.2.2利用kd树进行近邻搜索5.模型参数6.
算法实现
qq602683200
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2023-02-25 07:32
机器学习算法
机器学习
机器学习实战-knn_手写识别
这个是《机器学习实战》的第二个实例,用kNN
算法实现
手写识别,识别0-9这几个数字;要实现手写识别功能,首先将图像数据转换为矩阵或者向量形式,本例使用32*32的二值图像,转化成1*1024的数组,具体代码如下
z0905073007
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2023-02-24 07:59
机器学习
knn
python
机器学习
手写识别
【布局优化】基于鲸鱼
算法实现
3D无线传感器网(WSN)覆盖优化 Matlab源码
一、WSN模型1.1动机近年来,随着对等网络、云计算和网格计算等分布式环境的发展,无线传感器网络(WSN)得到了广泛的应用。无线传感器网络(WSN)是一种新兴的计算和网络模式,它可以被定义为一个由称为传感器节点的微小、小型、昂贵和高度智能化的设备组成的网络。传感器节点位于被观测空间内的不同位置,通过无线通信信道交换从监测领域收集的数据。收集的数据被发送到sink节点,sink节点要么本地处理数据,
Matlab科研辅导帮
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2023-02-22 13:49
无线传感器
matlab
算法
机器学习
【安全加密】通信加密算法介绍
文章目录一、介绍1.单向散列/哈希算法2.对称加密算法3.非对称加密算法二、加密
算法实现
1.造轮子AES算法SM4算法RSA算法MD5SHA-1sm32.openssl3.crypto++AES算法:DES
Frank学习路上
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2023-02-22 08:35
后台开发
安全
网络
网络协议
面试无忧:源码+实践,讲到MySQL调优的底层
算法实现
面试无忧:源码+实践,讲到MySQL调优的底层
算法实现
2020-11-3010:40·代码熬夜敲不知道大家有没有参与过系统重构或者代码调优的工作,有幸,最近我接触了一个公司N久前的一个项目的重构工作,目的就是为了提升一下响应速度
程序员万京游
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2023-02-21 12:06
mysql
面试
基于FPGA的图像实时缩放
使用插值
算法实现
图像缩放是数字图像处理算法中经常遇到的问题。我们经常会将某种尺寸的图像转换为其他尺寸的图像,如放大或者缩小图像。
vegetable_birds123
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2023-02-21 08:57
verilog
FPGA
双线性插值
图像缩放
图像裁剪
雪花
算法实现
文章目录原理引入依赖SnowflakeManager生成IDSnowflakeProperties配置注册SnowflakeManagersnowflake的yaml测试原理分别有三部分(其中第一位保留位,暂时没用):第一部分:时间戳(毫秒级),这里为41bit第二部分:工作机器id,一般为==5bit数据中心id(datacenterId)+5bit机器id(workerId)==组成,10位的
Forever Nore
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2023-02-20 16:54
分布式
分布式
鸢尾花数据集(KNN、决策树、朴素贝叶斯分析)
目录1、问题描述2、数据准备与数据预处理2.1收集数据2.2划分数据集3、数据可视化4、模型基本原理与
算法实现
4.1KNN算法基本原理及主程序4.2决策树模型算法及基本原理4.3朴素贝叶斯算法及基本原理
keeeeeenon
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2023-02-19 01:20
fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、
bam
生信分析常见文件格式查看
在分析的过程中还会有众多中间文件的生成,如bed、bed12、sam、
bam
、wig、bigwig、bedgraph等。
笺牒九州的怪咖
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2023-02-18 22:37
Etcd 读请求如何执行
API:client访问etcdserver的api,server之间访问,节点间通过Raft
算法实现
数据复制和Leader选举等功能。
一生逍遥一生
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2023-02-18 15:27
如何基于Python深度图生成3D点云详解
目录前言二维RGB图像成像原理数据准备图片加载
算法实现
生成点云点云显示完整代码总结前言废话不多说,直接开造。这里的话我们有两个目标,第一个是如何把一个2维图片上的点映射到3维空间。
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2023-02-18 01:51
Matlab利用随机森林(RF)
算法实现
回归预测详解
目录1分解代码1.1最优叶子节点数与树数确定1.2循环准备1.3数据划分1.4随机森林实现1.5精度衡量1.6变量重要程度排序1.7保存模型2完整代码本文分为两部分,首先是对代码进行分段、详细讲解,方便大家理解;随后是完整代码,方便大家自行尝试。另外,关于基于MATLAB的神经网络(ANN)代码与详细解释,我们将在后期博客中介绍。1分解代码1.1最优叶子节点数与树数确定首先,我们需要对RF对应的叶
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2023-02-18 01:08
TE的鉴定
从头预测算法denovo包括:基于基因组序列比对的方法、K-mer方法、基于结构特征的方法基于同源性的方法包括:基于同源序列比对的方法、基于隐马尔柯夫模型(HMM)的方法不同的
算法实现
的目标有所不同,如从头算法主要是为了发现新的转座子
ytbao
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2023-02-18 01:39
基于 Redis 的分布式锁实现
1.前言关于分布式锁的实现,目前常用的方案有以下三类:数据库乐观锁;基于分布式缓存实现的锁服务,典型代表有Redis和基于Redis的RedLock;基于分布式一致性
算法实现
的锁服务,典型代表有ZooKeeper
爱情小傻蛋
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2023-02-17 22:05
【图像隐藏】基于DCT
算法实现
数字水印嵌入+检测+攻击含Matlab源码
1简介介绍了数字水印的产生、发展及其应用,讨论了数字水印的分类,提出了图像的预处理思想,利用MATLAB中的剪切函数、缩放函数,以及调整图像直方图的方法对图像进行预处理,并用MATLAB进行了仿真.实验结果表明:预处理在DCT数字水印算法的前期工作中有较好作用.随着计算机网络的迅猛发展,信息安全越来越受关注.信息隐藏技术是一种重要的信息安全技术,而数字图像水印算法又是信息隐藏技术研究的一个热点.水
matlab科研助手
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2023-02-17 12:25
图像处理
matlab
算法
图像处理
基于Matlab的数字水印设计—基于DCT域的水印
算法实现
基于MATLAB的数字水印
算法实现
一、课题介绍数字水印(DigitalWatermark)技术是指用信号处理的方法在数字化的多媒体数据中嵌入隐蔽的标记,这种标记通常是不可见的,只有通过专用的检测器或阅读器才能提取
TuTu998
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2023-02-17 12:24
算法
数据安全
计算机视觉
边缘检测
信号处理
R-loop数据分析之R-ChIP(样本间
BAM
比较和可视化)
样本间相关性评估上一步得到各个样本的
BAM
文件之后,就可以在全基因组范围上看看这几个样本之间是否有差异。也就是先将基因组分成N个区间,然后用统计每个区间上比对上的read数。
xuzhougeng
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2023-02-17 11:15
java面试LruCache 和 LinkedHashMap及
算法实现
目录LruCacheLinkedHashMapAndroid的LruCache源码分析resizegetputremove容量计算总结常见算法题LruCache保存对有限数量值的强引用的缓存。每次访问一个值时,它都会移动到队列的头部。当一个值被添加到一个完整的缓存中时,该队列末尾的值将被逐出并且可能有资格进行垃圾回收。LeastRecentlyUsed,最近最少使用,是一种常用的算法。LRUCac
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2023-02-17 05:36
转录组分析1 各种生信数据格式fq、fa、sam、
bam
等
sra和fq1sra或fq(fastq),都是测序格式的文件。通俗理解:sra是把双端测序的2个文件合成了1个,而fq文件是2个。因为后续很多分析仪fastq格式文件进行,所以一般下载下来sra都要转换为fastq(可以用软件fastq-dump)。从ensmble上截的图,提供这2种格式的数据下载fastq文件特点(以二代测序为例):4行为1个单位,第一行是@开头的解释信息,第二行是序列read
八段锦1134
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2023-02-17 03:45
限流器
算法实现
(JUC原子类使用实践)
系列文章目录和关于我一丶限流器存在的意义在高并发系统中,出于系统保护角度考虑,通常会对流量进行限流。限流*的目的是在遇到流量高峰期或者流量突增(流量尖刺)时,通过对流量速率进行限制,当达到限制速率时,可以拒绝服务(定向到错误页或告知资源没有了)、排队或等待(比如秒杀、评论、下单)、降级(返回兜
Cuzzz
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2023-02-16 22:00
简要描述HashMap和HashSet的实现原理
HashMapHashMap基于Hash
算法实现
的,我们通过put(key,value)存储,get(key)来获取。
天外飞鲜橙子哥
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2023-02-16 22:57
面试
java
哈希算法
数据结构
ChIP-seq 分析:Mapped 数据可视化(4)
1.Mappedreads现在我们有了
BAM
文件的索引,我们可以使用idxstatsBam()函数检索和绘制映射读取的数量。
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2023-02-16 22:03
程序员
OpenCV: 加噪滤波
算法实现
加噪滤波算法题目:选择一幅灰度图像,分别添加高斯噪声和椒盐噪声;分别用均值滤波和中值滤波器对两类噪声图像去噪,分析、比较各滤波器对各类噪声的去噪效果。椒盐噪声???饿了,也叫脉冲噪声1.库函数medianBlur是中值滤波,blur是均值滤波。注意:blur的第二参数,即ksize,要求是tuple,滑动窗口可以取矩形。我自己写的是没有进行padding的,所以最边缘是处理不到的,当然可以自己给边
_朝闻道_
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2023-02-16 21:00
机器视觉
如何用Python 实现景区安防系统
智能视觉交互涉及算法1、目标检测算法2、目标跟踪算法3、人群密度估计算法4、姿态估计算法本设计中,利用YOLO目标检测算法、Openpose姿态识别算法、deepsort跟踪算法、MSCNN人群密度估计
算法实现
了火灾监测
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2023-02-16 20:55
算术解码
算法实现
数字图像处理冈萨雷斯第三版8.18题一个简单的解题脚本(Python)importwarningsimportnumpyasnpdefarith_decode(code_map,encoded_num):assert0>1lower_idx=0upper_idx=len(codes)-1lower_idx,mid_idx,upper_idx=0,0,0init_idxes()decode_idxe
Starry-OvO
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2023-02-07 12:14
Python
python
算法
数据结构实用教材推荐
除了严蔚敏、李春葆老师的数据结构外,给大家推荐一本比较实用,适合作为本科生教材和自学的数据结构图书,强调
算法实现
,理论与算法并重,有完整
算法实现
、PPT课件和视频讲解。
数据结构与算法学习、智能算法
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2023-02-07 08:45
数据结构
计算机编程语言
算法
数据结构
【STL切片算法文献笔记】基于STL数据模型动态拓扑重构的快速切片算法
3D打印模型切片算法研究文章目录3D打印模型切片算法研究前言论文介绍论文目录1.引言2.基于STL文件的切片算法3.动态拓扑重构的算法思想4.动态拓扑重构的
算法实现
5.软件系统和应用实例总结前言随着3D
会走路的胖虎
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2023-02-07 08:04
3D打印切片算法研究
c++
拓扑学
矩阵
【Pycharm】Harris 角点检测
算法实现
过程!
Harris角点检测算法一、算法原理哈里斯角点是在任意方向上移动(u,v),都会有很明显的变化。如下图一个局部很小的区域,如果是在图片区域中移动灰度值没有变化,那么窗口内不存在角点。如果在某一个方向上移动,一个发生很大变化而另一侧没有变化,那么说明这个区域是位于该对象的边缘区域。二、代码#-*-coding:utf-8-*-frompylabimport*fromPILimportImagefro
一位不知名的科研人
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2023-02-07 08:03
python
pycharm
算法
python
决策树算法(实战篇——基于 sklearn 库)
决策树算法(实战篇——基于sklearn库)决策树算法(实战篇——基于sklearn库)一、sklearn库对决策树
算法实现
的简介二、分类树实战三、回归树实战四、剪枝参考文献决策树算法(实战篇——基于sklearn
不知道叫什么丸
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2023-02-07 08:53
机器学习
机器学习
决策树
3.5 决策树
文章目录3.5.1认识决策树3.5.2决策树分类原理详解1.原理2.信息熵的定义3.决策树的划分依据之一------信息增益4.决策树的三种
算法实现
3.5.3决策树API使用决策树对鸢尾花数据集进行分类
Aurora-boo
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2023-02-07 08:48
python机器学习入门
决策树
机器学习
算法
目标追踪——光流法optical flow
光流法简介光流光流法光流的物理意义光流场光流法基本原理金字塔方法基于光流的运动目标检测(前景检测)
算法实现
原理光流光流(opticalflow)是空间运动物体在观察成像平面上的像素运动的瞬时速度。
黑洞是不黑
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2023-02-07 07:17
计算机视觉
目标跟踪
机器学习
算法
人工智能
GC算法
垃圾搜集算法的实现涉及太多细节,而且各个平台虚拟机操作内存的方法又各不相同,因此本文不会太多的讨论
算法实现
,而是介绍几种算法的思想以及其发展过程。
kylinxiang
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2023-02-07 01:12
ZUC加密
算法实现
-软件版本Java
ZUC加密
算法实现
参考资料https://max.book118.com/html/2017/0716/122521494.shtm一.运行结果展示二.程序源码importjava.util.
西瓜刀盹了
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2023-02-06 14:35
密码学
java
Python网络爬虫摘文-理解网络爬虫
简单的来说,网络爬虫就是根据一定的
算法实现
编程开发,主要通过URL实现数据的抓取和发掘。
刘哩子不会写代码
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2023-02-06 11:35
Python网络爬虫
图形学:Opengl圆和多边形的绘制
1、采用中点Bresenham
算法实现
带颜色的圆绘制,同时采用OpenGL库函数实现带颜色的圆的绘制。
lml spq
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2023-02-06 08:26
算法
图形渲染
c#
【内推】字节跳动-NLP算法实习生(线上面试 + 转正机会 + 长期有效)
结合数据挖掘的方法构建广告知识库;2、利用nlp技术,不断加强对于广告素材文案的内容理解,应用于ctr、cvr、相关性模型和投放策略,帮助广告主提升投放效果;3、基于百亿级素材创作、投放数据,优化广告文案自动化生成的
算法实现
八刀一闪
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2023-02-06 07:18
实习内推
nlp
字节跳动
JVM CMS和G1执行过程比较
应用主要集中在互联网网站以及基于浏览器的B/S系统的服务端,这类应用通常会较为关注服务的响应速度,希望系统的停顿时间尽可能少,CMS收集器就非常符合这类应用的需求从名字可以知道,CMS收集器是基于标记-清除
算法实现
的
CoderZS
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2023-02-06 05:20
LRU-缓存算法
1.2.实现最常见的实现是使用一个链表保存缓存数据,详细
算法实现
如下:新数据插入到链表头部;每当缓存命中(即缓存数据被访问),则将数据移到链表头部;当链表满的时候,将链表尾部的数据丢弃。
yunpiao
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2023-02-05 23:29
目标检测
算法实现
(六)——Yolov5训练-服务器部署训练
首先我要感慨一下linux系统的强大,真的是windows上一堆操作到linux上就一行命令,反正就绝了。自己也真的是蠢极了,前一两天瞎摸索,走了很多的弯路,干了好多蠢事,不列举了。还好在ZHY大佬的帮助下,顺利完成了服务器的部署训练,并且学习了一些小Tips,在此记录下来,记录并分享自己的学习步骤,也可以供给需要的同学参考~1.安装miniconda(选择是否安装)1.1下载conda(如果已有
是刺猬吖
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2023-02-05 16:44
YOLO算法
1024程序员节
腾讯叶聪:朋友圈爆款背后的计算机视觉技术与应用
分享嘉宾:叶聪腾讯技术专家编辑整理:张智跃内容来源:DataFunAITalk「智能技术前沿实践分享」出品社区:DataFun导读:本次分享系统介绍计算机视觉的基础知识,如何利用这些识别
算法实现
一个应用
DataFunTalk
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2023-02-05 15:24
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