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Dicom医学影像处理
使用VTK和Matlab读取
DICOM
图像数据失真问题
最近在处理
DICOM
数据时,发现使用VTK的vtk
DICOM
ImageReader类以及使用Matlab的
dicom
read函数读取到的
Dicom
图像存在像素值失真的问题,即使用上述两种方式读取到的图像像素值与使用
Skyline_98
·
2022-12-28 10:49
医学影像处理
vtk
itk
dicom
Python JPG转DCM,DCM转JPG,DCM转NRRD,NRRD转NII
在
医学影像处理
中,常用到MASK掩膜,即勾画病灶区域,以进行病理分析预测,将DCM文件转换为JPG格式后,就可以利用OpenC
渺邈
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2022-12-27 20:46
python
python
dicom
unet_使用U-Net进行肺结节分割案例分析:DSB3Tutorial
使用U-Net进行肺结节分割案例分析:DSB3Tutorial本文要分析的代码作者是jonrmulholland,这里是其链接地址数据集:LUNA2016,这里是LUNA2016数据集详细说明链接重要文件介绍:LUNA_mask_extraction.py,LUNA_segment_lung_ROI.py,LUNA_train_unet.py第一步:运行LUNA_mask_extraction.p
weixin_39539684
·
2022-12-26 16:26
python
dicom
unet
Matlab 批量CT图像进行肺实质分割
这不是对
dicom
格式的CT图进行分割的,是对png、jpg等格式的CT图进行分割的。
红枣参须水
·
2022-12-26 16:55
python 多线程数据处理——处理图片获取时间,提取正面xray图片
commonutilsimportosimportmathimportitertoolsimportwarningsimportnumpyasnpimportpandasaspdfromcollectionsimportCounterimportmultiprocessingimportpy
dicom
TTS56
·
2022-12-25 19:22
生物医学深度学习实战
python-多线程数据处理(一)——将
dicom
数据转化为jpg文件输出头文件
commonutilsimportosimportmathimportitertoolsimportwarningsimportnumpyasnpimportpandasaspdfromcollectionsimportCounterimportmultiprocessingimportpy
dicom
TTS56
·
2022-12-25 19:51
生物医学深度学习实战
MATLAB下载处理.nii文件资源包(NIfTI_20140122zip)
大部分医学领域导出
dicom
格式,但是太复杂了
小柴狗
·
2022-12-23 07:34
MATLAB
医学图像处理
nii格式和nii.gz格式详解
文章目录nii基础hdr/headerExtensionImage坐标体素转换矩阵转换矩阵内部参数概念转换矩阵组成转换矩阵应用nii格式最后nii基础大部分医学领域导出
dicom
格式,但是太复杂了。
三丰杂货铺
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2022-12-23 07:34
医学影像处理
nii
医学图像
nii.gz
dicom
格式
利用python把dcm格式转化为jpg格式
dcm文件是
DICOM
(DigitalImagingandCommunicationsinMedicine)即医学数字成像和通信中记录医学图像和相关信息的文件,在用于医学图像处理的时候我们需要将·.dcm
壹万1w
·
2022-12-22 23:05
目标检测
python
开发语言
机器学习
目标检测
LEADTOOLS 入门教程: 使用 H264 视频创建
DICOM
文件 - 控制台 C#
LEADTOOLS是一个综合工具包的集合,用于将识别、文档、医疗、成像和多媒体技术整合到桌面、服务器、平板电脑、网络和移动解决方案中,是一项企业级文档自动化解决方案,有捕捉,OCR,OMR,表单识别和处理,PDF,打印捕获,归档,注释和显示功能。利用业界领先的图像处理技术,能够智能识别文件,可以用来识别任何类型的扫描或传真形式的图像。LEADTOOLS最新下载(qun:731259648)http
爱分享的小妮子
·
2022-12-22 10:45
Leadtools系列教程
c#
音视频
开发语言
leadtools
医疗影像
基于SPM8或CAT12进行的VBM分析
基于SPM8或CAT12进行的VBM分析需要的工具:Matlab及SPM8/SPM12一、SPM8/12的VBM分析1)首先将
DICOM
格式转换为NIFTI格式;2)用display查看图像,可以手动进行
mollyue
·
2022-12-20 07:32
SPM
VBM
CAT12
matlab
SimpleITK
Dicom
序列数据读取
importsysimportosimportnumpyasnpimportSimpleITKassitkdefsitk_dcms_read2(dcm_dir):reader=sitk.ImageSeriesReader();seriesIDs=reader.GetGDCMSeriesIDs(dcm_dir)dcm_series=reader.GetGDCMSeriesFileNames(dcm_
mikeyNa
·
2022-12-16 07:20
ITK学习笔记
ITK数据读取
SimpleITK、py
dicom
的安装使用——踏上python生物医学图像处理的初学之路
一、两个库的安装pip均可直接安装。这里说说conda怎么安装SimpleITK。首先这个库是不在默认的channel里面的所以不能够直接安装。因此需使用:来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/SimpleITK这个"channel/package"的项目。然后:来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/Sim
hdpai2018
·
2022-12-16 07:44
安装SimpleITK
python利用SimpleITK来读取
DICOM
文件在命令中输入:python-mpipinstallSimpleITK
iamcfb_
·
2022-12-16 07:14
卢家峰课程系列-- advanced rs-fmri analysis 1/6 基本介绍与
DICOM
advancedrs-fmrianalysis1/6基本介绍与
DICOM
提示:本系列课程的目录第一章基本介绍与
DICOM
第二章SPM预处理与batch第三章SPMbatch修改第四章groupICA与Q
馒头没有馅儿yolo
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2022-12-13 20:24
MRI数据分析
matlab
医学图像查看软件Micro
Dicom
官网
这软件很多人推荐用,但网上搜到的担心有病毒,找了官网半天,终于找到了,地址放在这里,大家可以点进去下载Micro
Dicom
-Free
DICOM
viewerandsoftware
wwee1223
·
2022-12-12 20:25
医学图像
数据仓库
学习笔记|fmri_1 任务态 SPM数据分析 部分概念理解
1拿到数据,后缀是IMA格式什么意思,以及如何打开,和分析软件提到的
DICOM
有什么区别?
Ten years old
·
2022-12-12 15:25
高性能零售IT系统的建设08-9年来在互联网零售O2O行业抗黑产、薅羊毛实战记录及打法
前言2012年左右转入互联网应用,由于本身在学校时就涉足过远程医疗影像中的
DICOM
安全领域这块,因此也是机缘巧合我进入互联网第一年就遇上了一次亿级的DDOS攻击以及千万级CC攻击短信系统的对抗。
TGITCIC
·
2022-12-11 08:43
架构师修练之道
薅羊毛
安全
零售
安全
dicom
2nifti配置
1、安装pcreLinux安装PCRE库-掘金2、下载GDCMlinux系统安装gdcm的python库_工药叉的经文-CSDN博客_python安装gdcm注意,安装swig后,如swig-version报错,可参考swig:errorwhileloadingsharedlibraries:libpcre.so.1:cannotopensharedobjectfile亲测解决方法_墨理学AI-C
emergency_rose
·
2022-12-07 02:38
工具
医学图像
3DSlicer入门操作教程
目录简介用户界面数据探针应用程序菜单工具栏状态栏查看加载的数据选择显示的数据与视图交互查看交叉引用鼠标模式3D视图切片视图数据格式
DICOM
格式NIFTI格式
DICOM
和NIFTI的区别Nrrd格式.mhd
luemeon
·
2022-12-06 23:20
医学图像
图像处理
人工智能
医学图像处理(一)
dicom
数据转换为nii
dicom
数据转换为nii可以用SPM12自带的
DICOM
Import转换,也可以使用MRIConvert软件转换。
哈哈哈懒婷
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2022-12-06 23:04
医学图像
医学图像
SPM
dicom
nii
MRIconvert
MATLAB——直方图操作
直方图均衡化代码:I=
dicom
read('img');%img为输入的图像文件[h]=imhist(I);I1=histeq(I,256);[h1]=imhist(I1);subplot(2,2,1)
Sandyzz
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2022-12-06 12:33
matlab操作
matlab
图像处理
关于肺部医学影像数据集
如今智能医疗正逐步走入人们的生活,并潜移默化地改善着现代医疗系统,医学影像领域上的研究与智能算法结合的也愈加密切,基于深度学习的
医学影像处理
问题也成为研究热点。
阿飞没有花福蝶
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2022-12-04 16:17
深度学习
人工智能
深度学习
Nii转png,Nii转dcm,Dcm转png
,Dcm转png前言Nii转PNGNii转DCMDCM转PNG完整代码结束语前言这篇文章主要是对之前使用的nii文件进行一些格式的转换,nii文件是之前用的LITS数据集,因为需要将其转为png图片和
DICOM
沉默的前行者
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2022-12-01 20:29
深度学习
python
经验分享
Learning-Deep-Learning(学习深度学习)
学习深度学习)TherearelotsofawesomereadinglistsorpoststhatsummarizedmaterialsrelatedtoDeepLearning.Sowhywoul
dIcom
mitanotherone
coderpai
·
2022-11-29 13:34
人工智能
人工智能
医学三维重建 实记
基本知识基于面绘制的MC算法以及基于体绘制的Ray-casting实现
Dicom
图像的三维重建(python实现)无论是面绘制还是体绘制都需要一定的VTK知识,所以先了解VTK的一些基础知识才能帮助你更好的掌握这些方法
爱学习的卡比兽
·
2022-11-29 11:01
计算机医学成像
计算机视觉
Qt5使用QGrahicsView显示
Dicom
图像
二、程序1、所需头文件#include#include"ui_
Dicom
ToMat.h"#include"itkImageFileReader.h"#include"itkGDCMImageIO.h"#
CHENxiaoni_
·
2022-11-27 23:52
Dicom图像显示
visual
studio
c++
qt
LUNA16结节可视化及世界(CT)坐标与体素(图像)坐标的转换
DICOM
医学图像读取涉及到的医学坐标体系_sunyao_123的博客-CSDN博客_
dicom
坐标系关于坐标名称,看了许多博文,有像素坐标,真实坐标,体素坐标,图像坐标,世界坐标搞得一头雾水。
CHENxiaoni_
·
2022-11-27 23:22
python
python
开发语言
ITK(InsightToolkit)简介
这个Toolkit提供在了1D、2D、3D图像分析中最前沿的分割与配准算法,主要用于
医学影像处理
。ITK是开源并且跨平台的,使用CMake管理配置过程,它使用C++语言开发,
Skyline_98
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2022-11-27 18:36
医学影像处理
医学影像处理
itk
SimpleITK使用深度学习识别肺癌CT
DICOM
数据集
肺癌数据集
DICOM
:https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/LIDC-IDRI首先用SimpleITK把mhd图片读入,对每个切片使用
普通网友
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2022-11-27 18:05
TCIA (The Cancer Imaging Archive)--医学影像数据集
TheCancerImagingArchive):是一个包含常见肿瘤(肺癌、前列腺癌等)医学图像及相应临床信息(治疗方案细节、基因、病理等)的大规模公用数据库,其影像模态包括MRI、CT等,图像格式均为
DICOM
彭素华
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2022-11-27 18:34
人工智能
学习
深度学习
医学图像处理——DeepDrr工具CT生成DRR
医学图像处理——DeepDrr工具CT生成DRR一、DeepDrr工具介绍二、DeepDRR工具使用三、测试DeepDRR工具3.1测试数据集3.1.1阿里云数据3.1.2LIDC-IDRI肺结节
dicom
吃胡萝卜的兔酱
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2022-11-26 03:29
医学图像处理
图像处理
python
人工智能
基于matlab生物
医学影像处理
,基于MATLAB的医学图像处理
基于MATLAB的医学图像处理届别2012届学号200814350135毕业设计(论文)基于MATLAB的医学图像处理姓名唐涛系别、专业计算机科学系、通信工程专业导师姓名、职称朱卫平、副教授完成时间2012年5月1日目录摘要IABSTRACT.II1绪论.11.1课题背景11.2本文研究目的和意义11.3本文主要研究工作22MATLAB技术.32.1调用程序设计原理.32.2调用MATLAB程序的
考试点
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2022-11-25 21:39
医学图像笔记(一)
dicom
数据格式
医学图像笔记(一)
dicom
数据格式1、
dicom
数据格式2、读取一张
dicom
数据可以获取那些信息:3、
DICOM
格式的细节1、
dicom
数据格式
DICOM
表示“医学数字成像和通讯”。
落花逐流水
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2022-11-25 16:42
医学图像
医学图像
8月26日计算机视觉理论学习笔记——医疗影像分割
文章目录前言一、影像存储方式1、
DICOM
医学数字成像和通信标准2、MHD/RAW3、NRRD二、医学影像任务三、改进的U-NET1、目标函数-Dice系数2、U-NET未能解决的一些问题四、3DU-NET
Ashen_0nee
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2022-11-25 16:39
计算机视觉
学习
深度学习
【笔记】医疗影像图像格式
1.
Dicom
扩展名:.dcm来源:ACR/NEMA协会
Dicom
属于最常见的格式之一,一个
Dicom
文件包含了基本的病人信息以及图像信息病人信息病人ID姓名检查日期......图像数据数据位数符号位宽高最大最小值
客官可满意
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2022-11-25 16:09
医学图像处理学习笔记
人工智能
图像处理
医学CT图像三维重建代码
要了解DCM格式,可参考医疗CT断层图像
DICOM
标准和工业CT断层图像DICONDE标准。在使用DCM格式文件进行三维重建时,实际上是要从若干DCM文件中,获得到三维结构信息。
做个好男人!
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2022-11-24 22:29
python
三维重建
CT图像
面绘制
体绘制
DICOM
医学图像处理:
DICOM
存储操作之 “多幅JPG图像数据存入DCM文件”
背景:本专栏“
DICOM
医学图像处理”受众较窄,起初只想作为自己学习积累和工作经验的简单整理。
小的熊
·
2022-11-23 16:48
DICOM
DCMTK
DICOM
图像处理
JPEG
Multi-frame
WPF中如何使用fo-
dicom
解析多帧
dicom
数据并显示
在
Dicom
标准中,PixelData存放在tag(7FE0,0010)中。
weixin_42304210
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2022-11-23 16:14
fo-dicom应用
c#
DICOM
:
DICOM
三大开源库对比分析之“数据加载”
背景:上一篇博文
DICOM
:
DICOM
万能编辑工具之Sante
DICOM
Editor介绍了
DICOM
万能编辑工具,在日常使用过程中发现,“只要Sante
DICOM
Editor打不开的数据,基本可以判定此
weixin_34261415
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2022-11-23 16:42
数据库
python
javascript
ViewUI
使用DCMTK实现
DICOM
文件浏览器
dicom
explorer
之前一直使用别人的免费浏览工具来浏览DCM图像,或多或少都存在小的问题,要么完全免费但是功能不全不好用,要么就是收费需要定期下载版本申请试用,折腾来折腾去很是费心,决定最近自己写个简单的,不求功能强大只求自己用起来得心应手。底层文件的读取使用DCMTK3.6.3的DCMData包;考虑支持跨平台,上层显示使用QT来做。在Linux和windows两个平台下编译DCMTK生成的Config文件夹中的
weixin_30267691
·
2022-11-23 16:41
DICOM
图像显示-DCMTK-处理多帧图像
一般US和DSA图像较常见多帧图像应用层代码//为节省内存,通过fcount设置多帧图像一次处理的帧数量
dicom
Img=new
Dicom
Image(dcmParse->GetDataSet(),
DICOM医学影像
·
2022-11-23 16:40
DICOM图像高级应用
opencv
音视频
人工智能
DICOM
图像显示-DCMTK-image转
dicom
dcmdata模块包含以下命令行工具: cda2dcm:将CDA文件封装成
DICOM
文件格式 stl2dcm:将STL文件封装成
DICOM
文件格式 pdf2dcm:将PDF文件封装成
DICOM
文件格式
DICOM医学影像
·
2022-11-23 16:40
DICOM图像高级应用
c++
dicom
dcmtk
DICOM
图像层级分类-DCMTK-元素读取
dcmtk官网 dcmdata主要功能为解析
dicom
图像,对
dicom
图像进行编码和解码。主要的几个类为 要对检查图像进行按序列顺序分类,首先需要读取
DICOM
图像中的相应元素。
DICOM医学影像
·
2022-11-23 16:39
DICOM图像高级应用
dicom
图像处理
计算机视觉
c++
vtk
DICOM
图像显示-DCMTK-图像显示和源码分析
上篇文章讲了dcmtk的dcmimgle模块的
Dicom
Image类的像素数据的多个处理过程,最终通过
Dicom
Image类的getOutputData()获取Pvalues值,即最终显示的灰度值。
DICOM医学影像
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2022-11-23 16:39
DICOM图像高级应用
图像处理
计算机视觉
dicom
vtk
c++
DCMTK、ITK、VTK读取
dicom
信息
DCMTK、ITK、VTK读取
dicom
影像数据的方法直接上代码,调用不同的医学影像库读取
dicom
影像信息1.DCMTK读取影像中的pixelData//参数list:为输入的图像文件名列表boolDCMTKRead
Dicom
s
m_Higher
·
2022-11-23 16:35
c++
开发语言
DCMTK遍历
DICOM
文件Tag
DCMTK遍历
DICOM
文件数据最近在开发一个基于MFC对话框的DCM编辑器,最基础的功能是将DCM文件中的所有数据按列表的形式进行显示,这里涉及到对DCM文件数据元素进行遍历的操作目前网上只找到一篇介绍遍历
MoreThinker
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2022-11-23 16:35
DICOM
DICOM文件
DCM文件
遍历Tag
标签
dcmtk读取
DICOM
并进行体绘制渲染
今天的内容分为两个部分,一部分是使用dcmtk对
dicom
文件进行分析并且提取,第二个部分是使用vtk对
dicom
文件中的数据进行体绘制。
混元太极马保国
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2022-11-23 16:04
VTK
vtk
dicom
3d渲染
c++
渲染管线
DICOM
文件解析
dicom
是一种神奇的格式,可以用dcmtk这个第三方库进行解析。但是,dcmtk的编译实在令人头大,还要用到opencv库。不就是把图片读出来嘛,吾辈当自强,我们自己也可以!!(注意!!
TGTSTTG
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2022-11-23 16:04
c++
DICOM
笔记-使用cmake编译DCMTK
一、安装Cmake你可以在这里:https://cmake.org/download/找到Cmake的安装程序,下载后按照提示把它装在自己的电脑上。二、DCMTK的下载和编译1.想编译肯定要先下载在源码你可以在这里:https://dcmtk.org/dcmtk.php.en得到你想要的东西下面两个选择,取其一;还有这个:我使用了win32的库,所以下载了dcmtk-3.6.5-win32-sup
黑山老妖的博客
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2022-11-23 16:01
DICOM
DCMTK
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