HIC

高速自动驾驶智慧匝道(HIC)系统功能规范

智慧匝道功能规范HighwayIntelligentChangeFunctionalSpecification文件状态：【√】草稿【】正式发布【】正在修改文件起草分工撰写：审核：编制：签名：日期：审核：签名：日期：批准：签名：日期：版本更改描述更改日期更改人目录1概述...61.1目的...61.2范围...62功能规范...62.1功能描述...62.1.1功能用途...72.1.2基本参数..

电气_空空·2024-02-20 21:30

Fit-hic 2 通过hic数据检测显著性互作

安装官网中提到三种安装方法，可通过conda,pip，gitclone安装该软件.我们这里利用conda,非常简单快速.1.1conda创建环境condacreate-nfithicpython=3.81.2conda安装fithiccondainstallfithic1.3测试fithic-V1.4测试数据svnexporthttps://github.com/ay-lab/fithic/tru

寒山梦绮·2024-02-12 19:48

两天三场读书沙龙

App图片发自App图片发自App每一场读书会都是一份礼物它是一份付出，也是一份收获它是一份给予，也是一份得到[玫瑰]读书让灵魂更美好[玫瑰]锻炼让身体更健康[爱心]美好的灵魂去安放在一个健康的躯壳里感恩HIC

美云间书店·2024-02-09 22:08

使用3D-DNA流程，结果不升反降怎么破？

经@上海欧易生物-鲍志贵的提醒，我检查了genome.0.hic,也就是初步组装的结果，发

xuzhougeng·2024-02-04 12:26

HiC数据分析之-HiC-Pro

软件安装：主要是编辑系统文件：PREFIX=/gpfs02/home/jingjing/software/HiC-Pro-masterBOWTIE2_PATH=/gpfs01/software/bio/

jjjscuedu·2024-01-30 07:01

2020-06-26Hic-pro的使用

1、安装HiC-Pro的安装可参考github：这里2、具体使用其实HIiC-Pro的使用方法简单来讲主要有三个参数:$/usr/local/bin/HiC-Pro_2.11.1/bin/HiC-Pro-ipath

坚持天天吃早餐·2024-01-17 00:29

如何将HiC-pro的 *.allValidPairs变为.hic文件，然后导入juicerbox进行观察？

我们在完成HiC-pro之后，会在hic_results看到一个.allValidPairs的文件，这个文件代表了HiC(orHiChIP)数据中所有的交互情况，有的文章中需要用热图的形式得以展示，因此我们需要对这一部分数据进行可视化

坚持天天吃早餐·2024-01-14 08:20

【基因组组装】HiC挂载软件以及如何用Juice_box手工纠错？

1.常用HiC挂载软件ALLHiC张兴坦老师专为多倍体和高杂合度物种基因组挂载开发。如果是复杂基因组，肯定是首选。对于简单基因组，我跑了下，结果不佳。

生物信息与育种·2023-12-29 08:42

HI-C 数据分析pipeline（三：AB compartment 区室计算）

使用HicPro处理fastqdata，并进行了数据格式转换以后，就可以进行一些常规的HiC下游计算了，最常规的包括ABcompartment，TAD相关计算，loop相关计算。

基因组学研究生·2023-12-27 05:44

ImportError: cannot import name 'DtypeArg' from 'pandas._typing

是HiC-Pro在运行ice_norm步骤时报的错查询到是pandas==1.3.1中的一个bug✅解决方案：pipinstallpandas==1.3.0参考文章：http://www.zhishibo.com

橙子_orange·2023-12-27 00:21

最详细的HiC-Pro使用记录及结果解读

HiC-Pro是2015年发表的一款处理Hi-C数据用来辅助组装基因组的

吕强强学生信·2023-12-26 08:16

hicPro+EndHiC(二)染色体挂载

EndHic想比较HiC-Pro，EndHic的安装就简单很多，就是下载即可用EndHiC的安装[email protected]:fanagislab/EndHiC.git要用到的脚本都在文件夹下

GenomeStudy·2023-12-16 10:16

人机交互HIC基础（上课笔记）

一、HIC目标使得用户在完成任务时，能够达到–安全性(Safely)–有效性(effectively)–高效率(Efficiently)–愉悦感(Enjoyably)更学术点‐可用性(Usability

LIGFN·2023-12-04 10:57

【嵌入式学习-STM32F103-TIM-输入捕获】

输出捕获目录回顾输出比较输入捕获理论输入捕获和输出比较的区别频率测量相关知识输入捕获的各部分电路==输入捕获基本结构==注意事项==PWMI基本结构==输入捕获模式测频率硬件接线图输入捕获的编程步骤主要函数程序现象代码main.cPWM.cPWM.hIC.cIC.hPWM

旅行的橘子汽水·2023-11-18 18:49

进博会再现上亿大单 EZZ携手HIC海橙嗨选签署2024年度合作备忘录

11月6日，在澳大利亚新南威尔士州政府代表的见证下，澳交所基因组龙头上市公司EZZ生命科学和中国跨境社交电商龙头HIC海橙嗨选签署2024合作备忘录，在未来的一年，EZZ与HIC将达成近亿人民币的合作意向

唐天下文化·2023-11-15 22:50

YOLOv8-seg改进：复现HIC-YOLOv5，HIC-YOLOv8-seg助力小目标分割

本文改进：HIC-YOLOv8-seg：1)添加一个针对小物体的额外预测头，以提供更高分辨率的特征图2）在backbone和neck之间采用involutionblock来增加特征图的通道信息；3）在主干网末端加入

会AI的学姐·2023-11-11 19:37

基于YOLOv8的交通摄像头下车辆检测算法（七）：HIC-YOLOv8复现HIC-YOLOv5，助力小目标检测，涨点明显

本文改进：HIC-YOLOv8，1)添加一个针对小物体的额外预测头，以提供更高分辨率的特征图2）在backbone和neck之间采用involutionblock来增加特征图的通道信息；3）在主干网末端加入

会AI的学姐·2023-11-05 08:28

生信 | 三维基因组技术（三）：Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用

写在前面以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen）暑期生信培训班上记录的课堂笔记1.Hi-C原理简介1.1Hi-C技术高通量染色体构象捕获技术(High-throughputchromosomeconformationcapture)研究全基因组三维构象及分析染色质片段相互作用的实验技术1.2Hi-C目的了解核内染色质的三维构象、获得细胞核内空间位置非常接近或存在相互作用的染色质测序片段更好

生信卷王·2023-11-02 20:06

YoloV7改进策略：复现HIC-YOLOv5，打造HIC-YOLOv7，用于小物体检测

文章目录摘要论文《HIC-YOLOv5：改进的YOLOv5，用于小物体检测》1、简介2、相关工作3、方法4、实验结果5、结论YoloV7官方代码测试结果CBAM注意力机制Involution内卷安装mmcv

静静AI学堂·2023-10-31 08:35

uniapp视频播放器

微信小程序使用hic-video-playerapp(android和ios)使用好用视频播放器注：用的是旧版本的这个组件目前只有app中支持竖屏横批选集android视频全屏是通过beforeDestroy

奥吼吼~~·2023-10-25 07:58

产后越来越胖是什么原因？产后咋样减肥最快才能挽回身材呢？

虽说产后难瘦的很多，但是瘦的快的人也不在少数，其实那些产后瘦身的妈妈都是通过【Hic

_eveR_6315·2023-10-21 15:59

YoloV5改进策略：复现HIC-YOLOv5，用于小物体检测

文章目录摘要论文《HIC-YOLOv5：改进的YOLOv5，用于小物体检测》1、简介2、相关工作3、方法4、实验结果5、结论CBAM注意力机制Involution内卷安装mmcv库官方代码测试结果改进一

静静AI学堂·2023-10-08 22:09

HIC测序数据生信分析——第三节，HIC数据挂载

HIC测序数据生信分析——第三节，HIC数据挂载将预处理后的HIC数据挂载到人工染色体上方法一：ALLHiC软件——接前面《HIC测序数据生信分析——第二节，预处理HIC数据》这一篇里面的方法一：Hicup

彼岸花128·2023-10-08 08:00

HIC测序数据生信分析——第四节，软件Juicerbox中进行手工修正，再使用3D-DNA软件拿到最终结果

HIC测序数据生信分析——第四节，软件Juicerbox中进行手工修正，再使用3D-DNA软件拿到最终结果这一篇文章，仅针对使用3D-DNA挂载HIC的结果分析安装juicebox再次使用3D-DNA这一篇文章

彼岸花128·2023-10-08 08:00

YoloV8改进策略：复现HIC-YOLOv5，打造HIC-YOLOv8，用于小物体检测

文章目录摘要论文《HIC-YOLOv5：改进的YOLOv5，用于小物体检测》1、简介2、相关工作3、方法4、实验结果5、结论Yolov8官方结果CBAM注意力机制Involution内卷安装mmcv库摘要

静静AI学堂·2023-10-04 10:07

HIC-YOLOv5：改进的YOLOv5，用于小物体检测

静静AI学堂·2023-10-04 07:59

月子里胖了能减下来吗，坐月子如何减肥最有效？第一步你就漏了

通过【HIC

王子瘦啊8082·2023-10-02 02:15

说说产后如何快速减肥，揭秘产后快速减肥方法

个月内，母体的荷尔蒙会迅速恢复原有的状态，同时新陈代谢的速率也会因此恢复正常，甚至加快，但院方称，一旦妊娠，孕妈妈就开始分泌孕激素，孕激素分泌一直持续到喂奶结束后的两个月，所以造成难以减下去的肥胖，配合hic

秀一个·2023-10-01 07:11

第18讲C和h合作(c的第四讲)

hic嗝。hiccup嗝，暂时性小问题。hickey唇印，器械。cohere黏合，联合，结合。hock抵押，肘关节。hockey冰球，曲棍球。hooch非

石三英语·2023-09-29 11:25

菜鸟自学04：运行HiC-Pro软件的tips

Hic-Pro的安装折腾了一段时间，终于把hicpro软件安装好了，走了弯路，回过头才发现别人的教程已经写的非常正确且清晰了…说说hic-pro,hic-pro的作用是把测序文件输出为标准互作图谱。

guguaihezi·2023-09-28 01:27

数据分析实战 | Hi-C数据格式转化

Rawcontactto.hic→juicer_tools软件地址：https://github.com/aidenlab/juicer/wiki/Download使用说明：https://github.com

阿狸的窝·2023-09-27 06:14

《驯龙高手》观后感

其实hic

Fox_Ultimate·2023-09-23 21:34

基于参考基因组的基因组组装和注释

独立组装中的contigs或scaffolds一般用遗传图谱、BioNano光学图谱或HiC技术进行染色体水平的挂，现在比较常用是HiC技术。

Boer223·2023-09-18 11:50

SA516Gr70(R-HIC)-美标-抗硫化氢腐蚀钢板-产地舞钢

一、SA516Gr70(R-HIC)简介:SA516Gr70(R-HIC)是一种抗硫化氢腐蚀钢板，目前已累计向国内外供应抗硫化氢腐蚀钢板近5万吨，广泛应用于国内石化制造行业舞钢2006年研发生产(舞钢为四川普光天然气田开发生产的

舞钢马云峰·2023-09-13 00:34

关于HIC、MCM、SIP封装与SOC的区别及工艺分析

摘要：本文分别从芯片设计技术和芯片封装技术的维度，针对解决电子产品对芯片小型化、性能优、功能强的要求，对SOC片上系统及HIC、MCM、SIP封装技术的特点进行分析，并给出其相互关系，最终提出SOC片上系统芯片设计和

hhjc·2023-09-03 22:56

6个月的孕妇如何减肥，每天吃多少长胎不长肉？这件就够了

孕期首先就是要通过控制孕激素分泌，孕期因为宝宝发育，胎盘激素升高，孕妈妈体重增速加快，体内的新陈代谢被打乱，通过借助HIC

璐璐_6de0·2023-08-21 23:00

2021-05-11 Hic-Pro下游分析

相信大家再用了Hic-Pro对Hic和Hi-Chip的数据进行分析以后，肯定会有一些疑问，这样的interaction结果虽然我们知道了两个坐标之间存在交互，但是如何可视化？

坚持天天吃早餐·2023-08-09 22:27

动画响应卡

html代码:LeafsLoremipsum,dolorsitametconsecteturadipisicingelit.Architecto,hic?

破裤兜·2023-08-03 12:22

【豆科基因组】绿豆Mungbean, Vigna radiata苏绿基因组预印

Vignaradiata)genome.November2020.DOI:10.22541/au.160587196.63922177/v1单位：江苏农科院主要结果：通过Nanopore+Illumina+HiC

米源MY·2023-04-20 09:52

conda安装Hic-Pro

关于在服务器集群上，非root用户如何使用conda安装Hic-Pro.首先，要先安装有合适的安装包，去到https://github.com/nservant/HiC-Pro右侧https://github.com

薄皮儿核桃·2023-04-17 11:05

perl 一行命令 2021-09-02

one-liner’–byCJchenconvert-delay10-resample10%ls|perl-lane'/CJ\d{4}\d{4}(\d{2})(\d{2})/;printif$1>8and$1/’Hic_genetic.fastaperlone-liner

yangkfor·2023-04-13 03:12

【三维基因组】Hi-C call loops？-choose juicer ! 之 step4

image.png我们知道.hic文件是高度压缩的二进制文件，便于存储和分析。那么如果我们想要从.hic提取某一区域的交互信息的话，该如何操作呢？这就涉及到了juicerdump。

XuningFan·2023-04-10 04:07

HiC 数据堆积热图工具--coolpup.py

最近看到的一个新的绘制HiC数据热图的工具，记录一下.安装1.1创建新环境condacreate-ncoolpuppypython=3.9-y1.2pip安装pipinstallcythonpipinstallcoolpuppy

寒山梦绮·2023-04-08 03:44

HiC矩阵可视化之-HiCPlotter

格式的==============NXN的对称矩阵格式如果没有header：设置-fh=0，因为默认为1，会跳过第一个行-ff：是跳过最后几行的======sparseformat===========（HiC-Pro

jjjscuedu·2023-04-01 03:12

各种HIC处理数据之间的相互转化

各种HIC处理数据之间的相互转化目前HI-C数据研究比较火爆，出现了各种各样的工具来分析HI-C。这些工具各有优缺点，而且对应的有不同的下游处理工具。但这些工具的结果数据格式大相径庭。

哈哈哈_很高兴·2023-03-23 21:06

使用SLURM运行Hic-Pro

由于最近工作失误，错误运行了两次Hic-Pro，由于其中Bowtie2的运行相当耗时，耽误了大量的时间，于是决定安装一个SLURM集群系统，并行运行Hic-Pro，来减少工作时间。

抠脚_b41d·2023-03-20 04:13

Hic-pro的结果文件转化为.hic文件，在juicebox中实现可视化

hic数据经过Hic-pro处理后，会生成allvalidpairs文件，这是所有有效配对的文件。一般想要可视化的话，比较复杂。

哈哈哈_很高兴·2023-03-18 20:31

dump—HiTC