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病理WSI配准库valis教程

病理WSI配准库valis教程项目地址环境配置（linux）（1）JDK配置（2）Maven配置（3）Openslide配置（4）libvips配置（5）conda虚拟环境配置使用案例官方文档项目地址https
Toby不写代码·2024-02-14 08:01

Openslide安装

文章目录安装open-slidepython下载openslide二进制文件解压到Anaconda的library目录下配置环境变量在py文件中添加以下语句即可官网链接安装open-slidepython
怎么全是重名·2023-12-29 15:03

ubuntu安装openslide教程

libglibsudoaptinstalllibgtk2.0-devlibglib2.0-devsudoapt-getinstalllibsqlite3-dev然后，官网下载相关安装包https://openslide.org
向天再借五百亿·2023-11-01 03:58

安装openslide和clam的小记录

刚开始也是像ubuntu18安装python接口的openslide过程和错误整理一样，报了很多错误，之后重新装了一遍成功了。
coding小趴菜·2023-11-01 03:58

在Ubuntu18.04上安装Openslide和ASAP

在Ubuntu18.04上安装Openslide和ASAP目录在Ubuntu18.04上安装Openslide和ASAP前言一、Openslide和ASAP是什么？
Furyboyyy·2023-11-01 03:27

openslide matlab,ubuntu安装openslide-matlab

跑全扫描图像需要用到openslide这个包，底层是用C语言写的，这里是openslide-python的安装以及详解：首先下载openslide-matlab的包，github上有https://github.com
二号猎人·2023-11-01 03:26

openslide matlab,LINUX教程：Ubuntu下安装openslide-matlab

《LINUX教程：Ubuntu下安装openslide-matlab》要点：本文介绍了LINUX教程：Ubuntu下安装openslide-matlab，希望对您有用。如果有疑问，可以联系我们。
颜卿Lydia·2023-11-01 03:26

openslide matlab,Ubuntu下安装openslide-matlab

跑全扫描图像需要用到openslide这个包，底层是用C语言写的，这里是openslide-python的安装以及详解点击打开链接解压用matlab运行openslide_load_library.m这个文件
我非杨过·2023-11-01 03:55

Ubuntu服务器上安装openslide

Ubuntu服务器上安装openslide-pythonUbuntu上安装openslide-python首先直接在服务器主界面上安装openslide的一些依赖包sudoapt-getinstallopenslide-toolssudoapt-getinstallpython-openslide
QQQuan浩·2023-11-01 03:53

Ubuntu下安装openslide

Ubuntu下安装openslide在执行这个链接中的代码时，注意在安装openslide-python前执行这两句代码。链接:link.
非要充钱吗_真香·2023-11-01 03:53

【openslide-python安装】Linux、Windows安装openslide-python

Linux安装openslide-python1.Linux环境安装openslide-pythonLinux提示Unabletolocatepackage该如何处理？
qq_40678911·2023-11-01 03:23

Ubuntu 18.04 安装 OpenSlide-Python

ref:https://linuxize.com/post/how-to-install-pip-on-ubuntu-18.04/https://openslide.org/download/全程上楼梯
fengkewei·2023-11-01 03:51

Ubuntu 安装 openslide-python 步骤及报错处理

OSError:libopenslide.so.0:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfileordirectory通过pip安装后，在python导入openslide
祁彧w·2023-11-01 03:21

Ubuntu python 安装 openslide

apt-getinstallopenslide-toolsapt-getinstallpython3-openslidepipinstallopenslide_python
RessCris·2023-11-01 03:51

pip install openslide-python失败

无论是anaconda，还是pycharm还是cmd使用pip命令都安装不上openslide-python依赖包。
longerking·2023-10-01 23:16

关于金字塔格式转tiff并且openslide能获取到缩略图等标签信息

我们都知道openslide通过openslide_get_associated_image_names获取相关的图像名称，比如"thumbnail",“label”,“macro"等。
6057·2023-04-18 04:22

（病理图像读写）病理图像（whole slide images，WSI）的读写（.svs, .tiff）,使用openslide,和pyvips以及matlab

先说结论，如果不需要读很小倍率的图像，pyvips比openslide快很多，写SVS的话用matlab。病理图像的存储有很多种格式，可以看如下图：常见的是.svs,.tif，.mrxs。
qq_782808845·2023-01-05 21:10

java.awt.image.DataBufferInt cannot be cast to java.awt.image.DataBufferByte

解决方案（实测有效）更改BufferedImage类型BufferedImagebi1=openSlide.createThumbnailImage(700);BufferedImagebi2=newBufferedImage
Simple.3·2022-12-16 21:50

查看本地WSI图像

为了观察WSI图像的整体情况，最直接的方法就是将其打开查看，但是由于WSI的分辨率较大，通常无法直接打开查看，针对于该问题，可以直接使用openslide缩略图查看，也可通过借助Flask和openslide
breezehasai·2022-12-03 10:31

openslide

因为WSI的分辨率比较大，常规处理方法通常无法完成对其进行处理，所以需要借助openslide库进行处理。
breezehasai·2022-12-03 10:01

Pytorch CPU/GPU版本切换

GPU版本condainstallpytorch==1.7.1torchvision==0.8.2torchaudio==0.7.2cudatoolkit=10.1-cpytorch跑代码的时候发现缺少了openslide
李三年·2022-11-29 11:24

Win11安装OpenSlide（Python + MATLAB R2022a）

Miniconda3+Python3.9①在官网下载OpenSlide的Windows二进制包；②解压下载的压缩包，将其中的bin文件夹、lib文件夹放入环境变量Path里；③执行以下命令安装，在base
SongGu1996·2022-11-19 00:58

Win10安装openslide-python接口处理医学SYS格式文件

文章目录下载配置与安装SVS转PNG支持下载首先进入官网下载Win10平台的Binaries文件，需要根据自己的系统下载32位或64位Binaries文件配置与安装然后解压，放置在你想要放置的目录，添加bin以及lib环境变量然后输入pipinstallopenslide-python安装完成后就可以使用了SVS转PNG我们以文件夹第一张图为例，由于这里我们的SVS存储的格式为RGBA四个通道，所
DeepHao·2020-12-30 01:13

利用openslide 、open CV 全扫描图片处理笔记（一）

下载请搜索官网或百度自行下载简单的使用这个是openslide的一些基本的函数。
像风一样Pro·2020-09-13 03:20

ubuntu windows 分别安装openslide

为了读图，分别在ubuntu和windows下安装openslide。
@younger·2020-09-12 23:48

ERROR: Command errored out with exit status 1

在安装openslide的时候出现：ERROR:Commanderroredoutwithexitstatus1:command:'d:\anaconda\python.exe'-u-c'importsys
junjian Li·2020-09-12 21:17

ubuntu18安装python接口的openslide过程和错误整理

目录配置安装过程pip直接安装安装openslide依赖：换源继续安装openslide-tools安装python-openslide添加适用于ubuntu版本的PPA安装python-openslidepython
甘栗稣·2020-08-23 21:36

import openslide时报 WinErr127的解决过程

原本在python上用openslide是很顺畅的，刚顺利跑完一个导入openslide的程序，然后帮同事看一个nii文件显示的问题，于是在自己的电脑上查找nii显示的方法。
老笨妞·2020-08-17 13:02

C#使用NetVips实现大批量图片的拼接输出

它支持各种图像格式，包括JPEG，TIFF，OME-TIFF，PNG，WebP，FITS，Matlab，OpenEXR，PDF，SVG，HDR，PPM，CSV，GIF，Analyze，DeepZoom和OpenSlide
llllinlink·2020-08-13 15:28

利用openslide-python处理病理

参考：博客总结https://www.jianshu.com/p/bd5b572b5269官方文档：https://openslide.org/api/python/#module-openslide获取元信息
math_computer·2020-07-28 03:53

openslide初印象———— 常用函数介绍

python中常用来处理.svs文件的一个包是openslide。对于openslide中常用到的一些函数方法，许多博主都给出了简单的例子，下面是一些我认为还不错的文章链接，以供参考：https:
Ruky_Z·2020-07-07 00:03

openslide安装（windows10）

烦工欲善其事必先利其器，这里先分享干货，一个是ASAP-1.9-win64.exe这个软件，一个是openslide-win64-20171122.zip安装包。我估计你应该知道这两个软件是干啥的吧。
hello689·2020-06-23 21:22

win10 pip install openslide-python后，虽然import不报错，但是程序运行时，报错

症状pipinstallopenslide-python后，虽然在pycharm里importopenslide不报错，但是程序运行时，报错:找不到指定模块解决方案添加以下步骤：下载并解压二进制文件到downloadopenslide下载二进制文件并解压配置环境变量解压后，把对应的bin和lib添加到环境变量即可，我的是：
鱼超好吃的·2019-06-27 14:42

java操作openslide

前言：最近在跟着老师做一个项目，对一个大型的医学影像图片进行处理（30M–4G），一般的图像预览器是不能直接打开的，老师推荐一个库opensloide（基于C语言的大型医学影像图片的处理库）。我随后找到一款软件ASAP，可以直接打开这类图片（这款软件是我在找相关的程序时候在github中中找到的，但是具体链接忘了）。老师给我推荐这个库的时候是完全不会使用，只能是问度娘，但是百度的都是基于pytho
yz5759·2019-01-04 20:53

使用openslide-python对whole slide image（WSI）进行读取、显示和金字塔构建、生成tiles

utf-8importopenslideimportmatplotlib.pyplotasplt#imagefileimg_path='path/to/img/1.tif'#method1slide1=openslide.OpenSlide
MerryYoung·2018-11-14 17:33

安装openslide，使用pip install openslide失败

提示错误：python@ubuntu:~$pipinstallopenslideCollectingopenslideCouldnotfindaversionthatsatisfiestherequirementopenslide(fromversions:)Nomatchingdistributionfoundforopenslide解决方法：进入官网按照需求使用相应的命令https://ope
CaoMei_HuaCha·2018-08-28 10:34

openslide-python 安装

1.下载OpenSlideWindowsdevelopmentbuild安装下载地址：https://buildbot.openslide.org/snapshots/windows/下载openslide-winbuild
DeepHacking·2018-07-19 02:34

python，Openslide自动切.SVS格式(WSI)病理图像

开源的openslide库提供清洁便利的读取方法。
super_lsl·2018-06-13 16:16

python中plt.imshow（img）显示不了图片

70215103[python]viewplaincopyimportopenslideimportnumpyimportpylabimportmatplotlib.pyplotaspltslide=openslide.OpenSlide
chencaw·2017-11-08 20:45

openslide处理大图

openslide官网http://openslide.org/api/python/可以下载使用，并安装安装方法：sudoapt-getinstallopenslide-toolssudoapt-getinstallpython-openslide
caicai2526·2017-07-18 19:47

python中plt.imshow（img）显示不了图片

importopenslideimportnumpyimportpylabimportmatplotlib.pyplotaspltslide=openslide.OpenSlide('/media/xhj
hjxu2016·2017-04-17 19:49

openslide-python使用心得（一）

全扫描（wholeslideimage）图像非常的大，处理起来比较麻烦，openslide提供了一个很好的接口，具体参考openslide官网http://openslide.org/api/python
hjxu2016·2017-04-17 17:53

openslide api函数概要

openslide格式封装：typedefstruct_openslideopenslide_t;struct_openslide{ conststruct_openslide_ops*ops; struct_openslide_level
u014568921·2015-03-21 14:00
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