Peaks

matlab设置图像窗口大小,matlab 图形窗口大小的设置

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%常用选项和小技巧%%%%%%画等值线[cchh]=contour(peaks(30),'LINESPEC','b-')

weixin_39534002·2024-09-15 20:05

matlab绘制contourf 和 pcolor 卫星数据图caxis并设置colorbar范围

1800,1320);y=reshape(data1(:,2),1800,1320);z=reshape(h,1800,1320);[C,H]=contourf(x,y,z,100);%contourf(peaks

拾穗哥·2024-02-19 16:35

bedtools intersect用法 (intersectBed)

比如求两个peaks的交集，或者看很多位点信息在没在peaks或其他区域中，用这个工具非常方便快捷。

生信编程日常·2024-01-19 17:20

Matlab GUI设计基础范例（可以一步一步跟着做）

我们要做一个GUI界面，可以选择peaks、membrane和sinc三种三维图数据，选择画出surf、mesh和contour三种图像。

不吃鱼的羊·2024-01-17 20:33

signal.find_peaks寻峰原理

signal.find_peaks寻峰原理scipy.signal.find_peaks是SciPy库中用于寻找信号峰值的函数。

故障诊断与python学习·2024-01-16 15:26

Open3D 截取感兴趣的点云部分

importtimeimportopen3daso3d;importnumpyasnp;importmatplotlib.pyplotaspltfromscipy.signalimportfind_peaks

easyboot·2024-01-14 15:42

Rose软件寻找超级增强子

（1）这个前提是已经用Macs2寻找到了peaks,很多人可能不明白一些人写的怎么将bed文件转化为.gff文件，其实根本不用，我们直接将Name_peaks.narrowPeak改一个名字，改成Name_peaks.narrowPeak.bed

坚持天天吃早餐·2024-01-01 12:05

CHIP-Seq数据分析流程

过滤低质量reads，去接头比对下载小鼠参考基因组的索引和注释文件比对sam文件转bam为bam文件建立索引载入IGV查看用MACScallpeak安装MACS结果注释与可视化使用deeptools进行可视化peaks

美丽的lemon·2023-12-29 19:41

MIT-BIH-AF 数据集开发库

signal_time_sample寻找R_R峰信号以及其位置----find_R_R_peak寻找nR峰信号以及位置----find_nR_peak找到指定范围内的所有nR峰----find_nR_peaks

六和七·2023-12-21 21:38

Matlab更改Figure图窗的背景色|底色|网格色|黑色白色蓝色红色任意RGB色|重置颜色

附全部测试代码：1.正常画图clc;clear;closeall%画图I=peaks(50);figure(1);surf(I);colorbar;colormap(jet);2.更改Figure窗口的背景色

光学码农·2023-12-15 14:21

MATLAB - 绘制立体图（平面+水深）

目录代码结果代码%在X-Y平面上绘图%正常绘制平面图[X,Y,Z]=peaks;contour(X,Y,Z,20);holdon%****重点******************************

陈yanyu·2023-12-14 23:55

macs2的输出文件解读

macs2的输出文件解读NAME_peaks.xls包含peak信息的tab分割的文件，前几行会显示callpeak时的命令。

awk_bioinfo·2023-11-03 04:16

python计算二维数组的峰值

importnumpyasnpfromscipy.ndimage.filtersimportmaximum_filterfromscipy.ndimage.morphologyimportgenerate_binary_structure,binary_erosionimportmatplotlib.pyplotasppdefdetect_peaks

星光技术人·2023-10-28 03:28

python 查找波峰和波谷

importnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltfromscipy.signalimportfind_peaks#生成示例信号x=np.array([1,3,7,1,2,6,0,4,3,2,5,1

Python图像识别·2023-10-28 03:56

MATLAB数据曲线拟合

在这里，我们将使用MATLAB自带的peaks函数生成一组随机数据点：[x,y

CodeWG·2023-10-25 04:35

tar: Exiting with failure status due to previous errors

/GSE42881GSM1052708_mouse_e11.5_forebrain_p300.peaks.txt.gzGSM1052708_mouse_e11.5_forebrain_p300.wig.gztar

今天也是个妖精头子呀·2023-10-21 18:14

BZOJ 3551 ONTAK2010 Peaks加强版 Kruskal重构树+可持久化线段树

题目大意：同3545强制在线3545题解传送门：http://blog.csdn.net/popoqqq/article/details/40660953强制在线没法排序启发式合并也就用不了了Kruskal重构树是个挺好玩的东西可以拿来处理一些最小生成树的边权最值问题这里我们Kruskal连边时并不直接连边而是新建一个节点ext将两个点所在子树都连到ext的儿子上比如说样例的树就建成了这样图中红色

PoPoQQQ·2023-10-11 21:40

MATLAB中findpeaks函数用法

目录语法说明示例在MATLAB中，findpeaks函数用于查找信号中的峰值（peaks）。

jk_101·2023-09-15 12:05

【Qt-17】Qt调用matlab生成的dll库

matlab生成dll库1、matlab示例代码functionuntitled4(x)z=peaks(x);figuresurf(z)end2、matlab环境配置首先检查自己的mcc编译器是否可用，

WXG1011·2023-09-15 00:16

【C#-1】C#调用matlab生成的dll库

matlab打包dll1、matlab示例程序：functionuntitled4(x)z=peaks(x);figuresurf(z)end2、输入deploytool打包matlab程序，具体如下：

WXG1011·2023-09-15 00:15

GenomicRanges 根据重合比例合并基因区间数据

最近在做ATAC-Seq分析，得到实验组和对照组peaksets（本文称为peaks1和peaks2）后想合并得到consensuspeaksets.用bedtoolsintersect做可以设置重合比例参数

BeeBee生信·2023-09-13 02:43

Matlab更改配色

map=[000.3000.4000.5000.6000.8001.0];surf(peaks)colo

今天你比昨天博学了吗·2023-07-28 04:05

Matlab 给plot线添加透明属性

z=peaks(30);z(:,31)=nan;colors=jet(30);forki=1:30hp(ki)=patch(1:31,z(ki,:),colors(ki,:),...'

东躲西藏的西城·2023-07-14 08:06

[R][DiffBind]用Diffbind做RNA-seq差异分析问题记录（持续更新）

官方sample1.Loadingsamplesheet...BT4741BT474ERResistantFull-Media1bedErrorinif(file.info(peaks)$size>0)

Scabbards_·2023-06-16 07:28

m6A上游 | 5 MACS2 peak calling

第3篇：用MACS2软件callpeaks-云+社区-腾讯云(tencent.com)MACS2软件callm6A甲基化peaks-(jianshu.com)macs2-(jianshu.com)https

一只小脑斧·2023-06-13 10:34

如何使用matlab制作2D彩色数据图

使用函数有pcolorcontourf%pcolor生成伪彩图[X,Y,C]=peaks(60);%生成随机x,y,zfigure;%产生图案pcolor(X,Y,C)%创建彩图colormap(jet

由行·2023-06-11 11:30

hist seg, find peaks, pava单调拟合，isotonic-regression，REGULARIZED DISCRETE OPTIMAL TRANSPORT

tony365·2023-04-17 21:25

hist seg, find_peaks

importcv2importnumpyasnpfromPILimportImagefrommatplotlibimportpyplotaspltfromscipyimportsignalif__name__=="__main__":file=r'D:\code_color\hist_seg\2007-TIP-HistogramSegmentation-master\images\lena.png

tony365·2023-04-17 21:25

2022-09-13 calling peaks问题

1.利用macs2callpeak进行callingpeaks，其中有个参数--keep-dup，这是如果输入为过滤掉重复reads的bam文件，这--keep-dupall。如果为未过滤重复reads的bam文件，--keep-dup1。此参数是指定输入爸妈文件中重复reads有无的。macs2callpeak的基本命令-tIP.bam-cinput.bam-ggenome.size-B输出bg

AsuraPrince·2023-04-15 16:49

MACS2软件call m6A甲基化peaks

前面给大家介绍了☛m6A甲基化数据分析流程，提到过两个peakcalling的软件Peakcalling用R包exomePeakcallpeak用MACS2callpeak其实目前可用的peakcalling工具很多，如下表所示更多信息也可以参考http://wodaklab.org/nextgen/data/peakfinders.htmlMACS2这个软件是目前用的比较多，也是大家比较认可的一

生信交流平台·2023-04-12 07:24

如何根据染色体坐标批量提取对应的DNA序列（bedtools）

方法如下：Step1你需要先拿到差异peaks从ATAC-seq数据中分析得到的差异p

生信start_site·2023-04-05 10:17

【ATAC-Seq 实战】三、比对与Peaks Calling

这里是佳奥！我们继续clean数据的比对。1使用bowtie2进行比对用bowtie2进行比对和统计比对率,需要提前下载参考基因组然后使用命令构建索引，或者直接就下载索引文件：下载小鼠参考基因组的索引和注释文件,这里用常用的mm10#索引大小为3.2GB，不建议自己下载基因组构建，可以直接下载索引文件，代码如下：mkdirreferece&&cdreferencewget-4-qftp://ftp

佳奥·2023-03-18 09:57

中国新疆12大高峰犹如12根擎天玉柱（12 peaks in Xinjiang, China)

汇贤书院|摘录新疆十二大绝美高峰，保证99%的人没见过！乔戈里峰很多人没听过这些高峰的名字，这可是矗立在中国新疆境内自己的山峰.我赶紧给大家普及一下:乔戈里峰（海拔8611米）布洛阿特峰（海拔8051米）加舒尔布鲁木山（海拔8080米）加舒尔布鲁木II峰，皇冠峰（海拔7295米），公格尔山九别峰（海拔7649米），慕士塔格山（海拔7564米），托木尔峰（海拔7435米），汗腾格里峰（海拔6995米

汇贤书院·2023-03-16 11:07

龙卷风富集热图

只需要bw文件和bed文件即可参考https://github.com/teunbrand/tornadoplot/blob/master/data-raw/octsox_peaks.R#Libraries

pudding815·2023-03-15 16:18

Clustering by fast search and find of density peaks论文密度峰值聚类算法学习与Python代码实现

Clusteringbyfastsearchandfindofdensitypeaks密度峰值聚类学习与其Python代码实现（马房山实验报告大学数据挖掘大作业）不想看我瞎扯可以直接跳到这算法分析代码说明Clusteringbyfastsearchandfindofdensitypeaks（通过快速搜索和密度峰值来聚类）一文介绍了一种新的无监督聚类算法。不想看我瞎扯可以直接跳到这算法分析参考：ht

WMIII·2023-01-05 02:35

极值理论在时序数据异常检测中的应用

一般来说，极值理论可分为两部分：一部分是BlockMaximaMethod，服从广义极值分布、另一部分是Peaks-over-threshold方法，简称POT，服从广义帕累托分布。

NOtargetSaltyfish·2023-01-03 11:15

【机器学习】3：Density Peaks聚类算法实现（局部密度聚类算法）

前言：密度峰聚类算法和DBSCAN聚类算法有相似的地方，两者都是基于密度的聚类方式。自己是在学习无监督学习过程中，无意间见到介绍这种聚类算法的文章，感觉密度峰聚类算法方法很新奇，操作也很简答，于是自己也动手写一下了。–-----------------------------------------------------------------------------—-------------

zzZ_CMing·2022-12-27 21:48

使用Python完成基本指标的计算

均方根误差，寻找到峰值及其x坐标值(274条消息)Python编程：方差、标准差、均方差、均方根值、均方误差、均方根误差_星月夜语的博客-CSDN博客_均方根误差代码(274条消息)python：find_peaks

思考实践·2022-12-20 10:31

【MATLAB100个实用小技巧】——图形应用(21-32)

文章目录前言系列文章21.PEAKS函数曲线22.片状图23.视角的调整24.向量场的绘制25.灯光定位26.柱状图27.设置照明方式28.羽状图29.立体透视（1）30.立体透视（2）31.表面图形32

yuan〇·2022-12-18 07:52

pantompkins matlab,Matlab对Python的findpeaks算法

/functions/detect_peaks.py"""Detectpeaksindatabasedontheiramplitudeandotherfeatures."""

weixin_39779530·2022-12-14 15:13

阅读桑迪潘·戴伊的《Python图像处理实战》笔记八

使用hough_line()或hough_line_peaks()函数和hough_circle()或hough_circle_pesks()函数分别检测带有直线和圆输入图像中的线和圆。

苏哩·2022-11-19 07:21

2021-05-23 ChIP-seq数据从头到尾比对及分析汇总（个人分析记录贴）

chip-seq数据分析大体流程，引自微信公众号《生信技能树》0_2用到的软件或脚本测序数据质控：fastp；测序数据比对：bowtie2；比对数据排序等：samtools;callPeaks:MACS3;差异peaks

xiaoguolaile·2022-10-24 10:57

matlab 学习笔记

matlab学习笔记作者：w104814画图部分参考资料：何正风Matlab在数学方面的应用北京清华大学出版社2012clear;clc%在绘制的等高线上绘制向量图n=-2.0:.2:2.0;[X,Y,Z]=peaks

lvming-elena·2022-07-26 09:38

Matlab来绘制三维曲面图、等高线图等

文章目录前言一、Matlab插值1.Meshgrid函数2.Griddata函数二、绘制1.使用函数（1）linspace函数（2）peaks函数（3）polt3函数（4）mesh函数（5）surf函数

摸鱼也很累·2022-06-07 21:34

使用ChIPseeker对找到的peaks文件进行注释

fromJimmy读入peakspeak3')",ylab="ReadCountFrequency")image.pngpeaks的注释peakAnno<-annotatePeak(peak,tssRegion=c(-3000,3000),TxDb=txdb,annoDb="org.Mm.eg.db")peakAnno_df<-as.data.frame(peakAnno)sampleName=s

超级无敌大蜗牛·2022-02-17 16:08

colormap

surf(peaks)colormapwinter2、colormap(target,map)为target指定的图窗、坐标区或图形设置颜色图，而不是为当前图窗设置颜色图

庵下桃花仙·2021-06-25 14:48

codewars（python）练习笔记二十二：Pick peaks(求峰值)

python）练习笔记二十二：Pickpeaks(求峰值)题目Inthiskata,youwillwriteafunctionthatreturnsthepositionsandthevaluesofthe"peaks

曹波波·2021-06-23 10:36

matlab学习—matlab画热力图、瀑布图以及findpeaks介绍

s_tid=gn_loc_drop2、waterfallfigure[X,Y,Z]=peaks(30);waterfall(X,Y,Z)（画波形瀑布图的时候，X-频谱x坐标，Y-系列时间，Z-频谱的y坐标

龙鹰图腾223·2021-06-23 08:22

bedtools intersect简单介绍

以下使用bedtools官方提供的例子进行展示一比一一般情况，使用bedtoolsintersect寻找两个peaks文件的交集

尘世中一个迷途小书僮·2021-04-29 20:56

MACS2 进行peak calling

MACS2是一款常用的peakcalling软件，可以鉴定ChIP-seq/Cut&Tag数据的peaks，本文简单介绍MACS2的安装及peakcalling的用法。

尘世中一个迷途小书僮·2021-04-29 10:13

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