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Linux
RawData
扩增子质控流程多,专属名词来揭晓
在高通量测序王国中,Rawreads(或
rawdata
)已不陌生,但在扩增子测序的质控数据中还有Rawtags、Cleantags、Effectivetags等一串的专属名词,这些名词代表什么,分析要关注哪些数据
ee00dc6faab7
·
2024-02-26 16:53
【R语言】批量读取某路径下文件内容
1.把所有数据读入在一个文件夹中dir.create("data_in_one")#创建目标文件夹,也可右键创建dir("
rawdata
/")#查看原
巩翔宇Ibrahimovic
·
2024-02-20 12:39
ggplot2批量生成图片并组合图片
这是某次血常规的数据(经过了修改),将数据整理成下面这种形式:分组情况如下:library(rio)library(ggplot2)library(patchwork)
rawdata
0.05",size
钿璎纍纍佩珊珊
·
2024-02-19 22:42
linux实用命令及注意(持续更新)
dd将原始数据(
rawdata
)按照数据源的格式原封不动的拷贝到目的地;
Self-Discipline
·
2024-02-13 08:55
Linux
linux
GDSC数据库使用(分析基因表达量与药物敏感性影响)
数据下载:不要下载
rawdata
细胞系注释文件:Cell-line-annotation药物注释文件:Compounds-annotationimg药物IC50以及AUC文件:GDSC1-datasetimgANOVA
期待未来
·
2024-02-09 11:02
使用C++11 简单测试接口性能矩阵
在性能方面,除了简单的获取返回的gunzip后的解压数据大小外,还获取了unzip之前的
rawdata
大小。使用的
FredricZhu
·
2024-02-08 08:05
C# 滤波算法
/// ///移动平均,曲线平滑 /// ///原曲线数组 ///步长 /// publicdouble[]Smoothing(double[]
rawData
,intstep
遇见不烦
·
2024-02-06 22:18
C#
算法
c#
Gps 整体框架文字版
,GpsLocationProvider用于抽象GNSS提供的服务,NetworkProvider用于抽象网络定位服务,Libgps用于对接Android接口,解析NMEA,Gpsengine通过计算
rawdata
奶一口仙气
·
2024-02-06 06:12
Gps
android
比对软件索引构建与效率比较
最近接触下组学的
rawdata
分析,慢慢学咯~下载参考基因组【直播】我的基因组(五):测试数据及参考基因组的准备比对原创10000+生信教程大神给你的RNA实战视频演练比对效率5款流行比对工具大比拼
王诗翔
·
2024-02-05 08:18
SD和SE的区别
标准差(SD)强调
rawdata
的Variation,而标准误(SE)强调平均数的可信程度。例如在毒理学实验中,可能少数个体出现不良反应也很重要,需要给予关注,因此这时SD比SE更重要。
西贝_贾
·
2024-01-28 14:15
node: 批量读、改、写一个文件夹下的所有文件
本文以json类型的数据为例://1.引入fs模块constfs=require('fs');//使用require方法加载fs核心模块letrawDataDir='d:\\a-pro\\data\\
rawData
欧石楠
·
2024-01-27 00:40
Oncoscan CNV 芯片处理流程
杀杀最近在学习处理Oncoscan的CNV芯片
rawdata
流程,在这里记录一下。
不会生信哟
·
2024-01-13 00:31
二代测序基础知识
数据格式高通量测序(如IlluminaHiSeqTM/MiseqTM)得到的原始图像数据文件经CASAVA碱基识别(BaseCalling)分析转化为原始测序序列(SequencedReads),我们称之为
RawData
点滴生信
·
2024-01-10 05:57
智能手环数据研究1——系统响应时延简易评估
目前已有的部分内容为设备系统响应延迟研究设备数据准确性研究设备传感器研究需要取得智能手环的原始数据(
rawdata
)。需要考察数据的
黑阿贝
·
2024-01-02 17:03
Wearable
系统延迟评估
智能手环
数据分析
转录组分析实战第一节:
Rawdata
的质量控制与清理
在转录组数据拿到后,公司一般会给我们一个
Rawdata
和Cleandata如果喜欢折腾的可以直接拿着
Rawdata
进行一下数据清理后再进行后期的数据分析我们今天就对我们之前获得的一个
Rawdata
进行分析和质量控制为后期做数据分析做准备需要安装的软件是
Yeyuntian
·
2024-01-02 02:41
kitti数据集 Raw Data与00-10 Ground Truth的对应关系
一直困惑KITTI数据集
RawData
没有对应的groundtruth,今天终于找到其与数据集序列00-10的groundtruth的对应关系:
稻壳特筑
·
2023-12-22 09:16
SLAM
computer
vision
GWAS走起~(2 fastqc、fastp)
Stepfour:对从公司送回来的原始数据
rawdata
预处理,至于问什么要进行这一步,通俗点讲就像是炒菜,直接从地里拔出来的青菜是不能直接用的,而正规的程序,至少要洗洗切切;而洗菜得用盆,切菜得用刀,
roguish读书人
·
2023-12-21 16:23
linux/ubuntu 批量解压脚本,解压kiiti-raw data
目的:我下载完kitti-
rawdata
后,发现全是zip的压缩包,一个个unzip解压有点太emm,写了个下面的.sh脚本#!
C++有手就行
·
2023-12-21 07:49
linux
ubuntu
运维
sklearn随机森林 测试 路面点云分类
region1读取数据dir='D:\\py\\RandomForest\\'filename1='trainRS'filename2='.csv'path=dir+filename1+filename2
rawdata
累了就要打游戏
·
2023-12-17 07:02
点云
ML
sklearn
随机森林
点云
分类
一个转录组上游分析流程 | Hisat2-Stringtie
fq.gzforiinSRR6929571SRR6929572SRR6929573SRR6929574SRR6929577SRR6929578;dopfastq-dump--split-files--threads20--gzip-s00_
RawData
小杜的生信筆記
·
2023-12-05 21:44
R语言精美图形绘制教程
学习
数据库
网络图
转录组
转录组学
分析流程
一个完整的转录组分析流程
fq.gzforiinSRR6929571SRR6929572SRR6929573SRR6929574SRR6929577SRR6929578;dopfastq-dump--split-files--threads20--gzip-s00_
RawData
小杜的生信筆記
·
2023-12-05 21:09
R语言精美图形绘制教程
conda
转录组分析
生物信息学
组学
分析流程
react 踩坑记录
“key”prop原因:数据中缺少key字段,或者表格忘记加rowKey=“唯一标识,譬如id,name之类的字段名”也就是凡是有遍历循环的玩意,都记得加key2、.list错误原因:空间名未匹配3、
rawData
.same
欧阳筱苒
·
2023-12-03 12:21
react
GPS 定位信息分析:航向角分析及经纬度坐标转局部XY坐标
GPS定位信息分析(1)从下面的数据可知,
rawdata
的提取和经纬度的计算应该是没问题的在相同的经纬度下,x和y还会发生变化,显然是不正确的
rawdata
:3150.9333112411717.594670805.3latitude
Prejudices
·
2023-12-02 14:10
传感器
机器人
echarts地图上绘制堆叠柱状图并切换地市
1、echarts地图上绘制堆叠柱状图1、jsimportechartsfrom'echarts'functioninitMap(myChart,region,geoCoordMap,
rawData
){
揣手手了
·
2023-12-01 18:05
地图
echarts
echarts
javascript
ecmascript
RNA-Seq raw2fpkm pipeline (snakemake)
前几天,帮师妹分析转录组数据,由于她只需要FPKM,并且我刚好在学snakemake,就试着用snakemake写了一个简单的从
rawdata
到FPKM的流程。
李诚0921
·
2023-11-27 23:29
python的格式化输出
%r用来做debug比较好,因为它会显示变量的原始数据(
rawdata
),而其它的符号则是用来向用户显示输出的。
多啦A梦的时光机_648d
·
2023-11-21 09:21
微信|支付宝小程序登录
一、微信小程序1、初始化进入登录页初始化获取用户信息
rawData
,openId和session_key,后续登录接口需要使用(1)uni.getProvider获取服务供应商服务类型传授权登录oauth
老马甲
·
2023-11-20 18:00
小程序
微信
小程序
camera硬件知识-1
Camera的30根Pin脚可大致分为以下几类:1、电源部分:a)VCAMD就是DVDD数字供电,主要给ISP供电,由于
RAWDATA
格式的sensor其ISP是在BB端,所以将其引脚将其NC。
yaogangganggang
·
2023-11-10 03:17
camera
splunk 的dashboard 制作过程
1下载数据到本地,type:raw-data格式:比较一下下载格式:
Rawdata
:{"sensugo_data":{"namespace":"dcg75","entity_name":"j303avfb.dcxx.pkx.abc.com.cn
shenghuiping2001
·
2023-11-04 18:31
splunk
dashboard
小程序支付流程详解
一、小程序需要是企业级开发,并且将开发者加入开发者白名单二、支付实现1、获取用户信息获取授权`handleGetUserInfo(e){//1获取用户信息const{encryptedData,
rawData
安安DE爸爸
·
2023-10-20 09:02
javascript
获取ios应用的相关配置信息
mobileProvisionPath=[[NSBundlemainBundle]pathForResource:@"embedded"ofType:@"mobileprovision"];NSData*
rawData
杨闯
·
2023-10-14 15:08
如何在
Rawdata
的fq.gz中找到一条read序列
事情是这样的:在IGV中查看我的bam文件时,找到了一对有趣的reads:E00582:592:HHF5YCCX2:3:2101:5863:59604这个bam文件用的是clean的reads,但我想看看
Rawdata
笺牒九州的怪咖
·
2023-10-07 03:28
linux pcm和alsa 区别,linux alsa pcm(此pcm非硬件pcm接口)
I2S:數字音頻接口,用於CPU和Codec之間的數字音頻流
rawdata
的傳輸。每當有playback或record操作時,snd_soc_dai_ops.prepar
朱子宁
·
2023-10-05 18:03
linux
pcm和alsa
区别
Vofa+使用笔记(1):用Vofa+通过串口连接显示波形
1.介绍Vofa+有三种协议设置
rawdata
:你发什么就显示什么,跟普通的串口助手一样firewater:最简单在VOFA+里绘制波形的协议,建议仅在通道数量不多、发送频率不高的时候使用。
Su^!-苏释州
·
2023-10-03 11:10
开发工具
单片机
上位机
波形显示
PHP后台实现微信小程序登录
2).调用wx.getUserInfo获取签名所需的
rawData
,signatrue,encryptData。3).发起请求将获取的数据发送的后台。
荒~
·
2023-09-27 20:15
PHP
#
小程序
#
API
微信小程序
php
如何向Sequence Read Archive (SRA) 提交未组装的高通量测序reads?
基本简介原始数据(
Rawdata
)指测序下机后未经处理的全部原始数据文件,SRA是NCBI中收录原始数据的主要数据库,有454,Illumina,SOLiD,IonTorrent,Helicos和CompleteGenomics
唯问生物
·
2023-09-26 22:41
滴水逆向作业——PE03_stage1
includeWORDNumberOfSections=0;DWORDSizeOfHeaders=0;DWORDSizeOfImage=0;DWORDSectionAlignment=0;intinfo_Address[10];intinfo_
RawData
刘大聪聪聪聪
·
2023-09-22 05:44
逆向
利用qiime2分析微生物组16S rRNA数据小结
混合双端、V3-V4区域测序,00.
RawData
已经进行了样本拆分、barcode去除和引物切除。
竹舞清风_忆
·
2023-09-20 08:27
生信
linux
qiime2
mpvue解决无法使用getUserInfo问题
1.解决mpvue无法使用getUserInfo问题发布methods:{bindGetUserInfo:(e)=>{console.log(e.mp.detail.
rawData
)}},2.关于
while1love
·
2023-09-19 07:43
转录组测序数据分析
rawdata
下载
柴本
·
2023-09-08 20:26
前端常用获取后端请求方法(request·axios)
data:{//参数
rawData
:
rawData
,code:loginRes.code},header:{'custom-header':'hello'//自定义请求头信息},method:'POST
淡忘_cx
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2023-09-06 10:23
前端
vue方法
vue
ajax
(IOS)取图片某一点的颜色
if(point.x=width||point.y>=height)returnnil;unsignedchar*
rawData
=malloc(height*width*4);if(!
rightmost
·
2023-09-02 19:43
技术干货|如何使用 DolphinDB 解决数据精度问题
1DECIMAL的计算特性1.1DECIMAL的计算方式DECIMAL的存储分为两部分,即存储整型数据的
rawdata
和存储小数位数的scale。
DolphinDB智臾科技
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2023-08-31 01:18
数据库
DECIMAL
DolphinDB
数据分析
数据精度
时序数据库
使用Echarts后台传来的值是base64编码时前端解码
constrawData=window.atob(item.data.obj.Wave);//首先把后台传来的数据使用window.atob()方法解码constoutputArray=newArrayBuffer(
rawData
.length
hanhan丶
·
2023-08-30 17:49
转录组全记录:从
rawdata
到DEG功能富集
1.
rawdata
1.1QCfastqc-oout_pathfilenamemultiqc./1.2数据量统计调用工具:iTools使用:iToolsFqtoolsstat-InFq-InFq-OutStat2
NICE_AGIS
·
2023-08-24 20:39
xamarin uwp数字证书公钥私钥
4///证书字节数组5///keyStore密码6///证书密码7///证书类型8///true表示导入成功false表示导入失败9publicboolImportCertificate(byte[]
rawData
weixin_30737363
·
2023-08-14 12:47
Seurat包合并多个单细胞样本
1、
rawdata
改名、分组创建Seurat对象,每个样本都需要barcodes.tsv.gz、features.tsv.gz、matrix.mtx.gz三个
小贝学生信
·
2023-08-12 17:02
生信学习笔记:fastp质控处理生成的report结果解读
文章目录前言
rawdata
和fastq文件readsQ20和Q30N值AdaptersDuplicationInsertfastpreportsummaryAdapterInsertsizeestimationBeforefiltering
twocanis
·
2023-08-12 15:36
生物信息
生物信息学
SDWebImage缓存图片的机制(转)
而NSURLCache每次都要把缓存的
rawdata
再转化为UIImage,就带来了数据处理和内存方面的更多操作。具体
HELLO_Cand
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2023-08-09 00:42
ShareSDK 国外平台登陆返回参数
第三方登陆平台/返回参数用户信息user.
rawData
授权信息[user.credentialrawData]Facebookemailaccess_tokenfirst_namedata_access_expiration_timeidexpires_ininstalledgranted_scopeslast_name-public_profilename-emailpayment_price
MobTech袤博科技
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2023-08-05 05:46
开发者
前端
uni-app
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