linux+基因组字符替换

prokka-原核及病毒基因组高效便捷注释

文章目录简介安装使用下游分析提取16S序列物种注释统计5S/16S/23S/tRNA数量统计基因的数量、位置等信息注意参考简介Prokka:rapidprokaryoticgenomeannotation全基因组注释是在一组基因组
Neptuneyut·2023-11-10 03:48

A Survey on Neural Network Interpretability

此外，可解释性是深度网络成为其他研究领域强大工具的理想属性，例如，药物发现和基因组学。在本次调查中，我们对神经网络可解释性研究进行了全面回顾。
今我来思雨霏霏_JYF·2023-11-10 01:45

SQL注入进阶

SQL注入进阶文章目录SQL注入进阶OOB注入OOB简介关键点原理延时注入WAF绕过字符替换SQLMAP定制字符替换集合tamper脚本编写字符替换tamper脚本WAF绕过脚本OOB注入OOB简介out-of-band
抠脚大汉在网络·2023-11-09 23:41

基因预测软件prodigal的使用

Prodigal是一款常用的基因预测软件，可以用于预测原核生物基因组中的开放阅读框（ORF），并根据不同的编码调用方式（如起始密码子和终止密码子）对其进行注释。
小果运维·2023-11-09 23:04

转座子注释

转座子-知乎名词讲解：转座子（TE）、LTR、假基因-简书转座子（TE,散在重复）特征及其对基因组影响-简书(jianshu.com)名词讲解：转座子（TE）、LTR、假基因-简书如何进行基因组注释_genscan
zq_Shen·2023-11-09 11:34

植物突变体库（一）

背景1分子生物学的迅速发展，基因组学研究也随之进入后基因组时代。功能基因组学是在研究生物有机体内各种基因功能的基础上，进一步解析所有基因协调发挥作用的机制。
赛思基因科技·2023-11-09 11:32

玉米转座子插入型突变体”五折优惠

联系方式：中国农业科学院作物科学研究所孙老师18645149460突变体介绍突变体是植物功能基因组学研究的基础材料，转座子作为一类可移动的D
生信宝典·2023-11-09 10:24

基因组WGD的鉴定与分化时间

1.WGD简介全基因组复制(Wholegenomeduplications,WGD)是生物进化的重要因素之一（导致基因组扩增的因素包括全基因组复制和转座子TEs）,所以WGD分析也是基因组分析经常用到的一种分析方法
生信学习小达人·2023-11-09 10:22

转座子的简介

1.转座子的概述芭芭拉·麦克林托克（BarbaraMcClintock，1902年6月16日－1992年9月2日），美国著名女性细胞遗传学家，她首次发现并重点研究了玉米转座子一个转座子由基因组的一个位置移动到另一个位置的过程称为转座
生信学习小达人·2023-11-09 10:22

转座子的鉴定

其中，从头算法又包括基于基因组序列比对的方法、K—mer方法和基于结构特征的方法；基于同源性的方法包括基于同源序列比对的方法和基于隐马尔柯夫模型(HMM)的方法。
生信学习小达人·2023-11-09 10:44

Python之字符串、正则表达式练习

目录1、输出随机字符串2、货币的转换（字符串crr107）3、凯撒加密（book实验19）4、字符替换5、检测字母或数字6、纠正字母7、输出英文中所有长度为3个字母的单词1、输出随机字符串编写程序，输出由英文字母大小写或数字组成的长度为
微笑伴你而行·2023-11-08 23:17

LightDB23.4 GBK和UTF8转码失败的字符替换成空格

背景介绍用户使用迁移工具从Oracle数据库迁移数据到LightDB的过程中发现，某些GBK编码转成UTF8编码后，在插入到LightDB中会报错。以GBK编码AAA1为例，LightDB的GBK和UTF8映射表中不支持AAA1这个GBK编码的转换。不支持的GBK编码都是处于GBK编码的自定义区间。在上图中，UTF8编码EE8080对应于GBK编码AAA1，插入到LightDB时报错。所以，在Li
yunmu666·2023-11-08 13:11

STM32MP157开发板Linux+Qt项目实战：音乐播放器

stm32mp157开发板FS-MP1A是华清远见自主研发的一款高品质、高性价比的Linux+单片机二合一的嵌入式教学级开发板。
华清远见IT开放实验室·2023-11-08 09:28

sed续与awk(粗糙版)

s:sedd替换功能，改s:替换字符串格式是：sed-n's/需要替换的原内容/替换后的内容/(ps：数字是替换每行中的第几个，g代表是全内容替换)p'替换的文件地址例如：c:整行替换y:字符替换，替换前后的字符串长度必须相同的
陆墨宁·2023-11-08 08:29

【Node.js算法题】数组去重、数组删除元素、数组排序、字符串排序、字符串反向、字符串改大写 、数组改大写、字符替换

文章目录前言数组去重数组删除元素数组排序字符串排序字符串反向字符串改大写数组改大写字符替换字符替换总结前言本期文章是js的一些算法题，包括数组去重、数组删除元素、数组排序、字符串排序、字符串反向、字符串改大写
颜颜yan_·2023-11-08 07:43

操作符、sed和awk

操作符：d删除ssed的替换功能，&s:替换字符串c：整行替换y：字符替换，替换前后的长度必须相同。
Kido.S·2023-11-06 11:17

【动植物研究动态】20220605文献解读

克隆调控大豆籽粒大小和品质的重要基因NaturalallelicvariationofGmST05controllingseedsizeandqualityinsoybean该研究通过对1800多份大豆种质资源籽粒厚度性状的全基因组关联分析
生物信息与育种·2023-11-06 10:05

11.1总结

11.1总结文章目录11.1总结A.集合题目大意考场思路B.差后队列题目大意考场思路正解C.蛋糕题目大意考场思路正解D.字符替换题目大意考场思路正解总结A.集合题目大意给定一个长度为nnn的整数序列aaa
2020fengziyang·2023-11-06 04:43

10x scaffolding系列3：使用tigmint纠错并进行基因组scaffolding

背景介绍这篇应该是10xgenomics数据辅助基因组组装的最后一篇，tigmint也是这些软件之中效果最好的一个，属于压箱底的好工具。
卖萌哥·2023-11-05 20:56

NATURE COMMUNICATIONS|肿瘤PARP和PD-1联合抑制

上的一篇文章ImmunogenomicprofilingdeterminesresponsestocombinedPARPandPD-1inhibitioninovarianCancer，文章主要讲的是从免疫基因组的角度对使用
概普生信·2023-11-05 11:14

2022-12-22

NatMacInt|深度学习表观遗传预测评价体系原创图灵基因图灵基因2022-12-2209:10发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析人类基因组由30亿个密码字母组成，每个人都有数百万种变异。
图灵基因·2023-11-05 11:21

人类基因组拷贝数变异图谱

摘要对个体间基因组变异的一个主要贡献来自于缺失和复制——统称为拷贝数变异（CNV）——它们改变了DNA的二倍体状态。这些改变可能没有表型效应，可以解释
亦是旅人呐·2023-11-05 10:31

ccRCC独特的基因组特征和免疫微环境特征对治疗反应和预后具有复杂的意义（IF8+）

IntegrativeAnalysisoftheGenomicandImmuneMicroenvironmentCharacteristicsAssociatedWithClearCellRenalCellCarcinomaProgression:ImplicationsforPrognosisandImmunotherapy与透明细胞肾细胞癌进展相关的基因组和免疫微环境特征的综合分析
生信学霸·2023-11-05 07:47

转录组笔记（5）序列比对

HISAT2：比对到基因组TopHat首次被发表已经是7年前，STAR的比对速度是TopHat的50倍，HISAT更是STAR的1.2倍。
韦巍_e3f3·2023-11-05 01:56

基因组组装数据分析专题

得到一个物种的参考基因组是开展后续结构和功能基因挖掘的前提，通过高通量测序可以快速的拼接得到基因组，本文整理了基因组组装相关的数据分析资料。
生信修炼手册·2023-11-04 13:27

kalign:适用于基因组规模的多序列比对工具

之前提到的clustalo,muscle,mafft适用于几千到几万条序列的多序列比对，在比较基因组学的分析中，需要对不同基因组的序列进行多序列比对。
生信修炼手册·2023-11-04 12:57

二代测序之SNV基础知识笔记总结

基础知识笔记总结SNV基础知识SNVsMutationvs.Variant[变异和突变]不同层次的突变DNA：1.编码DNA（codingDNA）c.2.非编码DNA（non-codingDNA）n.3.基因组
唯有学习才能拯救世人·2023-11-04 09:06

第三代测序技术在微生物研究中的应用

第三代测序技术是一种集高通量、快速度、长读长及低成本等多种优点于一身的新型测序技术，它的出现为基因组学、转录组学及DNA甲基化等研究
wangchuang2017·2023-11-04 09:02

7种测序平台

1.illumina测序化学原理2.HiSeq测序仪工作原理3.PacBio单分子超长测序4.IonTorrent测序5.X10人全基因组测序6.illumina公司的NanoWell测序技术7.第一代
acoikw2620·2023-11-04 09:55

基于Edman降解的蛋白质测序法的用途详解

随着全基因组测序的发展，我们离获知所有基因（也可以说是所有蛋白质）序列的不远了。然而，就目前我们对基因序列的了解，并不
Li_yuntalkBio·2023-11-04 09:53

Nature Reviews Genetics| 在基因组学中应用机器学习的常见陷阱

PITFALLS.jpgNatureReviewsGenetics|在基因组学中应用机器学习的常见陷阱Whalen,S.,Schreiber,J.,Noble,W.S.etal.Navigatingthepitfallsofapplyingmachinelearningingenomics.NatRevGenet
木舟笔记·2023-11-04 06:28

BWA和Bowtie的安装使用及区别

本学期在学习谈老师讲的基因组重测序数据比对和变异检测软件这一章时，我们了解到了短序列比对软件主要有以下几种：主要短序列比对软件其中，BWA和Bowtie的使用较为普遍，接下来对这两个软件的安装使用进行介绍
可堪醉卧_b370·2023-11-04 05:24

欧洲科学家在实验室重组出新冠病毒

生物学论文预发布平台BioRxiv1月21日发表一篇名为RapidreconstructionofSARS-CoV-2usingasyntheticgenomicsplatform（利用合成基因组学平台快速重建新冠病毒
一一休·2023-11-04 03:30

精选| 2020年7月R新包推荐(第44期）

此次整理了七个类别，分别为计算方法、数据、基因组学、机器学习、科学、统计学、效率工具。以下是本期（总第44期
黄小伟Yeah·2023-11-04 00:58

宏基因组知识点

为了克服传统纯培养技术的不足，研究者们发展了宏基因组学的研究方法，为研究和开发新的微生物活性物质提供有力支持。
斗战胜佛oh·2023-11-03 21:32

病毒载体的基本元件

第一代载体所携带的转基因的两侧是2个完整的LTR,由增强子(U3)、R区（即转录起始区，在病毒颗粒中的载体基因组两端均存在）及U5区构成。
实验小助手·2023-11-03 15:25

【动植物研究动态】20220320文献解读

NatureGenetics|抗条锈病小麦品种Kariega基因组组装与抗病基因Yr27挖掘Long-readgenomesequencingofbreadwheatfacilitatesdiseaseresistancegenecloning
生物信息与育种·2023-11-03 13:01

生物信息学与功能基因组学（1）

随着基因组学、蛋白质组学、微生物组学等各组学的发展，生物信息数据呈指数级增长；对这些数据的存储、处理、分析变得越来越重要。
顺昕如意·2023-11-03 06:22

生信必会格式：GFF和GTF的简介和转换

制表符分隔（tab-delimited）的文本文件，一般存储基因组注释信息。自1997年以来，这些格式有了
万木春❀·2023-11-03 04:54

生物信息数据格式：bed格式

文章目录BEDformat（基因组的注释文件）基本列附加列示例[Bedtools简介](https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/index.html)下载安装演示版的
sunchengquan·2023-11-03 04:18

转录组分析（五）--王通老师讲解

重中之重来了）A为对照组，B为处理组，A和B都采用illumina测序，reads读长分别为70bp，插入片段大小为200bp，reads之间的距离为200-70-70=60bp，将这个两个样品分别与人全基因组参考序列进行比对
不如好好学生信吧·2023-11-02 20:40

生信 | 三维基因组技术（三）：Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用

Frasergen）暑期生信培训班上记录的课堂笔记1.Hi-C原理简介1.1Hi-C技术高通量染色体构象捕获技术(High-throughputchromosomeconformationcapture)研究全基因组三维构象及分析染色质片段相互作用的实验技术
生信卷王·2023-11-02 20:06

生信 | 基因组组装实战（五）：三代数据纠错gcpp、racon

写在前面以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen）暑期生信培训班上记录的课堂笔记1.三代数据纠错：gcpp，封装到了pb-assembly中，使用conda安装condainstall-cbiocondapb-assembly-y使用方法，一轮纠错就差不多了pbmm2indexcontig.fastaref.mmipbmm2alignref.mmi*subreadset.xmlcontigs
生信卷王·2023-11-02 19:53

胆汁酸-肠道菌群在肠道炎症和肿瘤生成中的互作

宿主的基因组和微生物的基因组共同产生各种各样的代谢物，可以作为重要的信号分子和能量物质。
Deepgener·2023-11-02 16:37

Java实现数据脱敏的方法

字符串截取字符串截取是一种简单的数据脱敏方法，它将敏感数据的一部分字符替换成“”号或其他字符。
期待奔跑·2023-11-02 11:50

【中科院】分子生物学-朱玉贤第四版-笔记-第10讲 分子生物学操作技术

7.1.3聚合酶链式反应(PCR)技术7.1.4实时定量PCR(realtimequantitativePCR，Q-PCR)7.1.5重亚硫酸盐测序技术(BisulfiteSequencing)7.1.6基因组
taotaotao7777777·2023-11-01 21:05

医学分子生物学试题答案

基因组（gencme）：细胞或生物中，一套完整单倍体遗传物质的总和（包括一种生物所需的全套基因及间隔序列）称为基因组。基因组的功能是贮存和表达遗传信息。
答案资料·2023-11-01 21:02

Java 中 replace()方法

1.定义replace()方法通过用newChar字符替换字符串中出现的所有searchChar字符，并返回替换后的新字符串。
菜鸟教程*…*·2023-11-01 20:11

西南大学优势学科再有新进展：构建家蚕全基因组编辑筛

5月19日，国际知名的《基因组研究》杂志在线发表了西南大学前沿交叉研究所生物研究中心夏庆友教授团队的最新研究成果。
厉景轩小谭·2023-11-01 08:41

【动植物研究动态】20220918文献解读

InternationalJournalofMolecularSciences（IF=6.208）|中科院植物研究所孙小芹：“常香粳1813“染色体水平基因组揭示香粳和非香粳稻间的基因组变异Chromosome-LevelGenomeAssemblyofaFragrantJaponicaRiceCultivar
生物信息与育种·2023-11-01 05:39
上一页 12 13 14 15 16 17 18 19 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他