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qPCR
ggplot2绘图:
qPCR
数据箱式图叠加散点图1
小白新手,加速记忆,先整理个帖子正题:install.packages('gg.gap')library(ggplot2)#首次用需要先安装install.packages('ggplot2')#如果报错也可以用这种方式安装install.packages("ggplot2",repos="http://cran.r-project.org")library(RColorBrewer)#首次用需要
Sayond
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2022-12-26 17:59
r语言
gnu
开发语言
spss分析
qpcr
数据_SPSS统计分析案例:Kappa一致性系数
SPSS软件的交叉表分析功能,大家更喜欢输出的是卡方检验的结果。殊不知,还有另外一个应用较为广泛而且实用的统计量。它就是kappa系数。在问卷信度、测绘、医疗等行业领域使用的比较多,主要用于衡量同一对象两种评价的一致性,在问卷调查领域常用于重测信度的考察,在医疗行业主要用于不同医师/治疗方法/药物在治疗结果方面的一致性。来看一个医疗领域的案例:甲、乙两名医生对同一批64张肝癌可以患者的CT片采用盲
weixin_39602005
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2022-12-14 16:13
spss分析qpcr数据
MyBioSource 丨艾美捷COVID-19 PCR试剂盒
MyBioSource艾美捷冠状病毒快速RT-
qPCR
检测试剂盒用于使用逆转录定量聚合酶链反应(RT-
qPCR
)检测人鼻咽和口咽拭子样本中的SARS-CoV-2核酸。
Sylvia_sc
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2022-11-29 12:27
MyBioSource
2022-05-24如何设计
QPCR
引物
本教程是利用NCBI数据库进行设计。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/第一步:准备所要设计引物的基因序列第二步:打开blastn选项图片.png图片.png图片.png第三步:找到自己研究的物种,点击序列所属的accession图片.png第四步:点击‘pickprimer’图片.png第五步:选择参数1、选择产物的长度,一般都是70-150.2、选择引物跨越外显子图片.p
麦冬花儿
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2022-05-25 10:00
BioVendor 细胞/外泌体 miRNA 分离试剂盒
基于优化的试剂缓冲液和硅胶膜柱,CellmiRNAKit能够获得高质量和高纯度的miRNA,可广泛用于
qPCR
、Microarray和NGS等下游应用。
Sylvia_sc
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2022-04-26 09:59
BioVendor
Front Immunol 复现 | 1. GEO数据下载及sva批次校正(PCA可视化)
FII前几天有同学问了一篇文章里的一个方法的实现,看了一下这篇文章除了
qPCR
验证基本都是纯生信,今天就试着来复现一下。
木舟笔记
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2022-04-17 10:23
可视化
bug
数据可视化
webgl
sqlserver
一文看懂:ChIP实验和
qPCR
定量分析怎么做|易基因技术
本文对ChIP实验之前的准备、获得理想ChIP结果步骤、ChIP的
qPCR
定量分析和ChIP案例分析进行总结,希望帮助到
深圳市易基因科技
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2022-03-30 11:00
继续学习
qPCR
相关知识
在手机上学习的很多知识,主要还是集中在
qPCR
,比如RNA提取的新方法,
qPCR
结果分析,
qPCR
结果作图等等,我把学习到的东西给大家做个分享吧!
医博云天
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2022-02-08 23:42
qPCR
实验的Ct值的合理范围
qPCR
扩增过程中,扩增产物的荧光信号达到设定的荧光阈值时的所对应的扩增循环数(CycleThreshold)。C代
标准生信
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2021-07-09 14:32
StatQuest学习笔记02——样本量与重复
此时我们先对A进行采血,A的血样我们会检测3次,这3次就叫技术重复(technicalreplicates),因为我们是对同一个样品进行了测序,研究其基因表达谱,这其实类似于我们做RT-
qPCR
中的复孔
backup备份
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2021-06-22 11:30
荧光定量(
qPCR
)结果整理的辅助小工具
写在前面荧光定量(
qPCR
)早已是各个分子生物学实验室常用的简单的实验技术。十年的变化很大。
生信札记
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2021-06-12 02:57
molecular biology
分子生物学实验DNA/RNA提取
qPCR
(Real-timeQuantitativePCRDetectingSystem)即实时荧光定量核酸扩增检测系统,也叫实时定量基因扩增荧光检测系统)聚合酶链式反应简称
生信小菜鸟
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2021-04-21 06:20
spss分析
qpcr
数据_SPSS数据分析-描述性统计分析
在我们获得一些数据后,首先要做的就是对这些数据进行基本的统计分析,例如均值、中位数、方差等。SPSS中的基本统计分析主要包括频数分析、描述性统计分析、探索分析、列联表分析等。这节先来介绍前两种的SPSS操作过程。一、频数分析1、目的通过频数分析能够了解变量取值的状况,对把握数据的分布特征是很有帮助的。2、SPSS操作2.1操作步骤对某公司30名职工的血糖含量(mmol/L)进行频数分析。在SPSS
温顺而野性
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2021-01-01 21:53
spss分析qpcr数据
qPCR
数据处理
这次,我们来介绍一下
qPCR
的数据处理。
小折线
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2020-09-09 02:40
荞麦RNA提取
荞麦是一种含多酚量比较高的植物,一般的试剂盒很难得到较高质量的RNA,从而难以进行后期的
qPCR
实验。
lxmic
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2020-08-24 13:58
如何快速评估16S rRNA基因引物的覆盖率及特异性
背景无论是在进行细菌、古菌高通量测序前,还是细菌、古菌
qPCR
前,最纠结的问题永远是引物选择。评估引物效果最重要的两个指标是覆盖率(coverage)和特异性(specificity)。
刘永鑫Adam
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2020-08-08 01:46
淡水:21世纪的分子微生物生态学
文章目录淡水:21世纪的分子微生物生态学摘要原文信息1.研究背景2.微生物生态学简史3.实例探究3.1|
qPCR
-肯尼河流域的灾难性农药泄漏事故3.2|扩增子-厌氧氨氧化是淡水中重要的氮素流失途径3.3
刘永鑫Adam
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2020-07-30 05:46
宏基因组
NormqPCR笔记对应文献之一
title:NormqPCR笔记对应文献之一date:2019-10-0112:00:00type:"tags"tags:miRNAqPCR内参categories:生信工具前言最近在处理
qPCR
数据过程中
backup备份
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2020-07-29 10:51
NormqPCR包笔记
前言NormqPcR这个包用于对
qPCR
数据进行均一化(normalization,这里需要注意的是,这里的normalization只是使用内参来校正目标基因的表达的意思,与统计学中的归一化(Normalization
backup备份
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2020-07-28 12:53
PCR技术
基因表达:转录:DNA到RNA翻译:RNA到氨基酸、蛋白一般认为RNA,mRNA的量和最后的蛋白量一致「不考虑转录后调控」;当然目前绝大数研究基因表达的都是
qPCR
和WB一起来。
weixin_30892889
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2020-07-10 07:50
暑期社会实践第八天
下午,王旭之老师带领我们参观了实验室,了解了上机测序的相关内容,并详细讲解了
qPCR
技术。
好害羞哦
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2020-07-06 14:31
高效获取基因的代表性转录本
写在前面高通量测序已然成为
qPCR
一样普及到几乎每一个实验室。大量的物种被测序,对这些物种的序列信息进行分析,有助于我们更多地认识生物演化,预测更甚至了解基因的功能。
生信札记
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2020-06-24 14:57
科普一下
qPCR
一般情况下,我们做完RNA-Seq后最简单的验证就是做个
qPCR
对获得的差异基因进行验证。因此这是一条将生信分析文件提升到科学实验文章的捷径。
正踪大米饭儿
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2020-06-22 15:55
社会实践第八天
在实验室门口一切都穿戴好之后,我们来到了位于实验室里面的几件实验小隔间,王旭之老师耐心的给我们讲解了FA检测文库片段大小,
QPCR
检测文库浓度,文库Pooling,文库变性稀释及上机,其中质控环节是非常重要必不可少的
将暮未暮_5083
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2020-06-22 10:25
ToneScript cDNA 第一链合成试剂盒常见问题
ToneScriptcDNA第一链合成试剂盒是专门用于两步法RT-PCR的第一步,含有合成高质量第一链cDNA所需的所有成分,适用于后续的PCR、
qPCR
以及基因克隆。
toneker
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2020-03-25 05:40
使用法国Coriolis µ改善空气微生物颗粒收集:从花粉到病毒
利用这种技术,后续可对收集的样本使用不同的方法进行分析,如分子、
qPCR
、免疫分析、质谱分析等。安装在屋顶上,Coriolisµ能够收集人群吸入的具有代表性的空气样品。
伯齐科技
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2020-03-17 22:15
(文献翻译)一篇多芯片生信分析(meta)
方法:我们通过GeneExpressionOmnibus(GEO),相关文献,癌症基因组图谱(TCGA)和RT-
qPCR
收集的数据,研究了miR-144-3p表达与临床特征之间的相
柳叶刀与小鼠标
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2020-02-25 04:29
如何寻找并设计ChIP-
qPCR
引物
如何寻找并设计ChIP-
qPCR
引物引物设计的流程:用到的工具:NCBI,UCSC网站(直接百度就可以找到官网了)首先,确定目标区域的DNA(我是以做ChIP为例,寻找的是DNA引物模板)原理:IP拉下来的是
liu_ll
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2020-02-19 15:25
科研技术服务介绍
中科联盟平台在实验/技术服务上能够提供各种科研技术支持,包括有PCR/
QPCR
技术、超声成像技术、透射电镜技术、分子对接/QSAR技术、低分辨/高分辨质谱技术、肝微粒体代谢稳定测试、血浆蛋白结合率测试、
汐阳_f871
·
2020-02-17 01:33
WGCNA分析--提升转录组测序文章档次的利器
现在做转录组测序,看看差异基因,做做富集分析,再讨论下差异基因功能与自己研究性状或处理之间的关系,最后加简单的
qPCR
验证,这样的数据发SCI影响因子越来越低了。必须增加新的分析内容才能有所突破。
组学大讲堂
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2020-02-16 04:17
qPCR
到底有几种方法?
我叫骨头,是新来的NPC,最近要自己来设计
qPCR
引物了,听林师兄说得好简单的,就自己随便设计设计就行了。呃,可是我打开了AlleleID6.0之后,还是有点懵。
华联科生物
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2020-02-13 05:54
细胞常见问题分析
2019年1月29日,星期二,晴今天
qPCR
做了一个超完美的结果,还有一个乱七八糟的。(10ul的
qPCR
体系还得摸索。)本来下午准备做流式的,结果由于没有提前预约,还有一些鸡毛蒜皮的事,没能做成。
医博云天
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2020-02-05 18:32
同科生物与辰山植物园“约会”圆满结束
本次展会同科生物诚挚邀请了辰山植物园各课题组(包括:实验平台、实验室、组培室、人工气候室、资源圃、实验田和科研温室等)的老师和同学前来参观指导,展出了我司在行业内的拳头产品,如:PCR/
qPCR
/RT-PCR
toneker
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2020-01-07 09:14
Novel LncRNA的实时定量PCR引物设计教程
NovelLncRNA的选择novelLncRNA选择的原则:1.不能选与其他基因exon重叠的lncRNA,否则,RT-
qPCR
结果就混合了两个基因的表达量。
sryjm
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2020-01-02 23:00
qRT-PCR实验及数据分析
qRT-PCR实验原理RT-
qPCR
由普通PCR技术发展而来,它是在传统PCR反应体系中加入荧光化学物质(荧光染料或者荧光探针),根据各自不同的发光机制实时检测PCR退火、延伸过程中荧光信号变化来计算PCR
ShawnMagic
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2020-01-02 03:00
实时荧光定量 PCR
实时荧光定量PCR,简称RT-
QPCR
,属于Q-PCR的一种,目前该技术已得到广泛应用,如:扩增特异性分析、基因定量分析、基因分型、SNP分析等。
Zhigang_Han
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2019-12-31 13:53
申请基金必备,近几年火起来的circRNA干货送给你(下)
通过微阵列分析细胞系中circRNAs的表达谱,寻找一些显著表达的circRNAs,或通过高通量测序或芯片结合RT-
qPCR
验证筛选出感兴趣的circRNA,包含二代测序建库和RNA深度生物信息学分析。
华联科生物
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2019-12-28 09:25
同科生物技术服务|ELISA/细胞因子 array
同科生物为您提供分子克隆领域所需全线产品,包含基因重组/克隆、电泳检测、核酸提取/纯化、PCR/
qPCR
/RT-PCR以及细胞因子等系列产品,各类产品均得到客户高度认可,且反馈良好。
toneker
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2019-12-22 16:06
同科生物为您介绍
qPCR
常见问题及分析
通常来讲,real-timeqPCR的反应程序不需要像常规的PCR那样,要变性、退火、延伸3步。由于其产物长度在80~150bp之间,所以只需要变性和退火就可以了。SYBR@Green等染料法,最好在PCR扩增程序结束后,加一个溶解程序,来形成溶解曲线,判断PCR产物的特异性扩增。而溶解程序,仪器都有默认设置,或稍有不同,但都是一个在产物进行溶解时候,进行荧光信号的收集。同科生物今天给大家分享一下
toneker
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2019-12-21 00:56
同科生物感恩十年,分子生物试剂全线促销!
同科生物的成长离不开广大新老客户的相知相伴,同科生物十周年庆,感恩有您,现隆重推出分子生物试剂全线产品最低五折促销活动:分子生物试剂全线系列产品:基因重组/克隆电泳*MarkerPCR/
qPCR
/RT-PC
toneker
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2019-12-13 01:02
一文重复一篇四分SCI------基于TCGA和geo的circRNA研究(1)
方法:采用大数据挖掘、逆转录-定量聚合酶链反应(RT-
qPCR
)和计算生物学相结合的方法,对肝癌相关基因进行研究,探讨其可能的作用机制。采用CMap分析,探讨肝癌的潜在治疗
柳叶刀与小鼠标
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2019-12-12 19:49
RNA提取和逆转(Takara)和
qPCR
主要器材和试剂实验材料细胞样品冰冻或新鲜组织试剂、试剂盒TRIzol试剂氯仿异丙醇75%乙醇DEPCH2O仪器、耗材离心管离心机1总RNA提取样品处理:培养细胞:收获细胞1-5×10^7,移入1.5ml离心管中,加入1mlTrizol,混匀,室温静置5min。组织:取50-100mg组织(新鲜或-70℃及液氮中保存的组织均可)置1.5ml离心管中,加入1mlTrizol充分匀浆,室温静置5min。
Stone_Stan4d
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2019-12-12 11:45
实验复盘(三)提RNA降解还反转?
这一次的实验复盘,想好好总结一下最基本的分子实验操作------提取RNA反转成cDNA 应用:可以用于基因表达定量/非定量,比如说RT-PCR,RT-
qPCR
等等part1简单说一下我用到该实验技术的目的
liu_ll
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2019-12-06 07:57
同科生物上海中医药大学展会圆满结束
同科生物展出了PCR/
qPCR
/RT-PCR、电泳检测、核酸提取/纯化试剂盒、基因重组/克隆、蛋白检测以及感受态细胞等分子生物学产品,并推出了一系列优惠活动,引起了大家的广泛关注。
toneker
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2019-11-08 13:26
荧光定量 PCR 常见困难之引物探针篇
荧光实时定量PCR技术(real-timequantitativePCR,
qPCR
)几乎是现代分子生物学技术中最重要、应用最广泛的核酸定量检测技术。成功的定量PCR实验离不开精准的实验设计和操作流程。
weixinsuoxian
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2019-11-01 23:30
Beacon Designer:为所有主要
qPCR
测定设计具体且有效的寡糖
通过自动解释BLAST结果和避免模板结构,设计成功的SYBRGreen,TaqMan,HRMAPrimers,MethyLightTaqMan,LNAspikedTaqMan的分子信标、Scorpions和FRET测定。自动化实时PCR引物和探头设计BeaconDesigner自动化实时引物和探头的设计。它被全世界的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了失败实验的时间和金钱。Beaco
哲想软件
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2019-09-29 00:00
Clone Manager:RT-PCR/
qPCR
引物设计
NCBI下载所需基因的转录本序列(NM或NR开头)如GADPH基因,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000012.12?report=genbank&from=6534517&to=6538375,选择GenBank格式。点击CreateFile下载Fig1.PNG下载后拖入CloneManager打开,显示有GADPH基因这个转录本详细的外显子(中
佳名
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2019-07-10 10:50
从
qPCR
溶解曲线判断PCR产物的相对大小
在做
qPCR
的时候,40个循环之后,都会插入一步(6):绘制溶解曲线。
佳名
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2019-05-25 07:59
qPCR
的点滴增长
qPCR
真的很精深,感觉学了很久,还有好多不会的!之前不懂
qPCR
做浓度梯度,画标准曲线的目的,后来了解到这个可以帮助我们判断cDNA的稀释浓度和上样量。
医博云天
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2019-02-19 10:06
科研是要努力,但生活不要忘记!
按计划,今天重新做一次
qPCR
。我一到中心实验室之后就着手RT-PCR。把反应体系梳理一下之后就着手加样。中途PZP同学过来咨询病情,她这几天发热、咳嗽,很是担心自己得了重疾,于是就各种买
医博云天
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2019-01-18 22:02
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