r语言随机森林第59页

TCGA数据下载推荐：R语言easyTCGA包

#使用easyTCGA获取数据#清空rm(list=ls())gc()#安装bioconductor上面的R包options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")if(!require("BiocManager"))install.packages("BiocManager")if(!require("TC

weixin_49320263·2023-08-15 08:10

R语言生存分析（机器学习）（1）——GBM（梯度提升机）

GBM是一种集成学习算法，它结合了多个弱学习器（通常是决策树）来构建一个强大的预测模型。GBM使用“Boosting”的技术来训练弱学习器，这种技术是一个迭代的过程，每一轮都会关注之前轮次中预测效果较差的样本，以便更专注地对它们进行建模。这有助于逐步减少整体预测误差。#1清空rm(list=ls())gc()#2导入包library("survival")library("gbm")help(pa

weixin_49320263·2023-08-15 08:40

TED英语演讲 | Joshua Foer：每个人都能掌握的记忆技巧附视频&演讲稿

介Featsofmemoryanyonecando演讲者：JoshuaFoer语言：英语简介：2012|有人能在很短时间内背下上千个数字，或是记下一叠或更多牌的顺序。

TED博物馆·2023-08-15 07:33

【Sklearn】基于随机森林算法的数据分类预测（Excel可直接替换数据）

【Sklearn】基于随机森林算法的数据分类预测（Excel可直接替换数据）1.模型原理1.1模型原理1.2数学模型2.模型参数3.文件结构4.Excel数据5.下载地址6.完整代码7.运行结果1.模型原理随机森林

敲代码两年半的练习生·2023-08-15 05:01

2022-07-31

从一开始的R语言实战，到Linux基础，再到实战下载的fastq数据一路以来就是不断地犯错+debug+Google那么RNA-Seq的学习告一段落，马上开始GEO数据库挖掘的学习，因为我发现有关ID转化

佳奥·2023-08-14 18:49

机器学习面试005—决策树

1.请问（决策树、随机森林，Boosting、Adaboot）GBDT和XGBoost的区别是什么？

Silence_Dong·2023-08-14 17:18

大数据分析案例-基于KMeans和DBSCAN算法对汽车行业客户进行聚类分群

如果文章对你有帮助的话，欢迎评论点赞收藏加关注+喜欢大数据分析项目的小伙伴，希望可以多多支持该系列的其他文章大数据分析案例合集大数据分析案例-基于随机森林算法预测人类预期寿命大数据分析案例-基于随机森林算法的商品评价情感分析大数据分析案例

艾派森·2023-08-14 16:42

生信星球学习小组第29期第六天

swirl包——R语言入门绝佳指引在写这个之前，我想安利一波swirl包。在这个信息爆炸的时代，我们要做的不是收集资料，而是做选择。如果要用一个包来入门R，我会毫不犹豫的推荐swirl包。

科研狗Poppy·2023-08-14 11:08

【量化课程】08_1.机器学习量化策略基础实战

1.1回归模型1.2分类模型1.2.1SVC介绍1.2.2SVC在量化策略中的应用2.机器学习量化策略实现的基本步骤3.策略实现1.常用机器学习模型1.1回归模型线性回归多层感知器回归自适应提升树回归随机森林回归

Taylor_29511·2023-08-14 11:08

随机森林（Random Forest）

随机森林（RandomForest）bagging+决策树=随机森林随机森林是一种重要的基于Bagging的集成学习方法，用来做分类，回归等问题。

HU_LSS·2023-08-14 06:45

生物信息学：bedGraph文件、Bed文件转、BAM文件转化

目录引言bam文件bed文件bedGraph文件R语言和linux实现从bedgraph到bam的转化从bedgraph到bedgenome.size.txtbed转bam引言BamBedbedGraph

茅逗逗·2023-08-14 06:32

(function (classes, fdef, mtable):unable to find an inherited method for function ‘X’ for signature

R语言报错报错原文问题描述举例说明解决方案报错原文Errorin(function(classes,fdef,mtable):unabletofindaninheritedmethodforfunction

茅逗逗·2023-08-14 06:32

R语言列表中嵌套列名一致的多个数据框如何整合为一个数据框

在批量建模后容易得到list，list中的每个元素都是单个的tibble或者dataframe，如何将这些数据整合为一张表呢？载入R包library(broom)library(tidyverse)模拟数据models%group_by(city)%>%do(mod=lm(log2(sales)~factor(month),data=.,na.action=na.exclude))modelsmo

茅逗逗·2023-08-14 06:30

跟着Nature Biotechnology学作图:R语言pca分析并使用ggplot2可视化结果

论文Removingunwantedvariationfromlarge-scaleRNAsequencingdatawithPRPShttps://www.nature.com/articles/s41587-022-01440-w#data-availability数据链接https://zenodo.org/record/6459560#.Y2D2NHZBzidhttps://zenodo.

小明的数据分析笔记本·2023-08-14 05:05

【SCI复现】绘制CNV棒棒糖图

前面给大家简单介绍了如何从TCGA数据库下载CNV（拷贝数变异数据），以及如何使用R语言来合并CNV数据。今天我们来基于合并之后的CNV矩阵来重现一篇SCI文章中的棒棒糖图。

生信交流平台·2023-08-13 22:20

数据分析 | 为什么Bagging算法的效果优于单个评估器

1.回归问题如何降低方差以随机森林为例，假设随机森林中含有n个弱评估器，由于子样本集的相似性以及使用的是同种模型，因此各模型有近似相等的方差和偏差，因此假设任意弱评估器上输出结果为,方差均为，则随机森林的输出结果为

梨子串桃子_·2023-08-13 21:34

数据分析 | 随机森林如何确定参数空间的搜索范围

1.随机森林超参数极其重要的三个超参数是必须要调整的，一般再加上两到三个其他超参数进行优化即可。

梨子串桃子_·2023-08-13 21:32

学cpp看的那点书

C++C++Primer语言基础学习C++TemplatesTheCompleteGuide(2ndEdition)学习模板，更好的阅读STL源码，毕竟C++标准库大部分是模板。

502203305·2023-08-13 18:22

正则表达式（stringr包）

前言R语言的stringr包是由大名鼎鼎的HadleyWickham开发，是对于stringi的进一步封装。

范垂钦_92be·2023-08-13 12:54

R语言泊松(Poisson)分布

Poisson分布，是一种统计与概率学里常见到的离散概率分布，由法国数学家西莫恩·德尼·泊松（Siméon-DenisPoisson）在1838年时发表。泊松分布的参数λ是单位时间(或单位面积)内随机事件的平均发生次数。泊松分布适合于描述单位时间内随机事件发生的次数。当二项分布的n很大而p很小时，泊松分布可作为二项分布的近似，其中λ为np。通常当n≧20,p≦0.05时，就可以用泊松公式近似得计算

qq_27390023·2023-08-13 11:13

R语言均值，标准差等

max()#最大值min()#最小值mean()#均值median()#中位数var()#方差sd()#标准差sum()#总和range()#max和minwhich.max()#最大值下标（返回位置）which.min()#最小值下标sort()#排序

装在瓶子里的阳光_2a70·2023-08-13 10:13

时序预测 | Matlab实现基于RF随机森林的电力负荷预测模型

文章目录效果一览基本介绍模型描述源码设计学习小结参考资料效果一览基本介绍时序预测|Matlab实现基于RF随机森林的电力负荷预测模型电力负荷预测是指通过对历史电力负荷数据分析，来预测未来某个时间段内的电力负荷需求

机器学习之心·2023-08-13 10:00

三种聚类方法：层次、K均值、密度

一、层次聚类1）距离和相似系数r语言中使用dist(x,method="euclidean",diag=FALSE,upper=FALSE,p=2)来计算距离。其中x是样本矩阵或者数据框。

姚的日志·2023-08-13 09:39

常用的模型集成方法介绍：bagging、boosting 、stacking

本文将讨论一些众所周知的概念，如自助法、自助聚合（bagging）、随机森林、提升法（boosting）、堆叠法（stacking）以及许多其它的基础集成学习模型。

婉妃·2023-08-13 06:14

学习R语言之ShinyApp（1）

学习R语言之ShinyApp（1）顾YY2018年8月1日不知怎么的开始接触R语言了，大概是因为公司中有人在使用R语言进行一些分析。最先知道R是因为python。

returngu·2023-08-13 05:54

机器学习参数调优

手动调参分析影响模型的参数，设计步长进行交叉验证我们以随机森林为例：本文将使用sklearn自带的乳腺癌数据集，建立随机森林，并基于泛化误差（GenelizationError）与模型复杂度的关系来对模型进行调参

人工智·2023-08-12 17:03

R语言基础--向量

R-基础-向量运行代码快捷键：ctrl+entertab补全控制台清屏：ctrl+l赋值（globaloptions=>appearance=>zoom=>150%符号皆为英文符号？函数名，查看帮助文档设置工作目录setwd('E:\bioinfo_study\one')#设置工作目录Error:'\o'isanunrecognizedescapeincharacterstringstarting

山竹山竹px·2023-08-12 14:29

机器学习实战3-随机森林算法

文章目录集成算法概述sklearn中的集成算法模块RandomForestClassifier重要参数&&随机森林的分类器控制基评估器的参数n_estimatorssklearn建模流程复习交叉验证我们进行

wa的一声哭了·2023-08-12 11:37

2022-02-02 R语言-一行拆分成多行

将一个单元格中的多个元素拆分成多行，如图。一行拆分成多行#示例代码df%as_tibble()%>%separate_rows(transcript_ID,sep=",")

NAome·2023-08-12 07:48

饮食有度的元气少女·2023-08-12 07:40

R语言的物种气候生态位动态量化与分布特征模拟实践技术

利用R语言进行物种气候生态位动态量化与分布特征模拟，不仅可以量化描述物种对环境的需求和适应性，预测物种的潜在生态位和分布，还可以模拟物种分布的动态变化，捕捉生物种群生态位的时空异质性。

Mr.靳靳477302280·2023-08-12 07:09

【R语言进阶】不同数值大小的比较

逻辑数值比较ComparisonoflogicalsTRUE==FALSE比较数字-6*14!=17-101比较英文字符串ComparisonofcharacterstringsJIAXUE_JIYIN==BEST_JINYIN_COMPANY将逻辑数值与数字进行比较ComparealogicalwithanumericTRUE==1TRUE==0TRUE==3直接比较中文字符佳学基因佳学基因佳学

genedecoders·2023-08-12 06:24

机器学习与深度学习目录

机器学习：线性回归逻辑回归决策树贝叶斯分类随机森林集成算法支持向量机kmeans聚类k近邻算法深度学习感知器自编码器受限玻尔兹曼机卷积神经网络循环神经网络生成对抗网络深度强化学习深度学习项目实战YOLOSSDMTCNNFasterRCNN

计算机视觉__掉队选手·2023-08-12 03:14

好书有售｜奥加提：一场讲座｜A Lecture by Valerio Olgiati

瓦勒里欧·奥加提：一场讲座Olgiati：ALecturebyValerioOlgiati出版：Birkhauser语言：英语页数：108尺寸：15.24x14.73cm格劳宾登(graubünden)

大鱼建筑·2023-08-11 23:17

孤立随机森林（Isolation Forest）（Python实现）

目录1简介2孤立随机森林算法2.1算法概述2.2原理介绍2.3算法步骤3参数讲解4Python代码实现5结果1简介孤立森林（isolationForest）是一种高效的异常检测算法，它和随机森林类似，但每次选择划分属性和划分点

然哥依旧·2023-08-11 23:19

R语言ggplot2 | R语言绘制物种组成面积图（三）

文章目录面积图简介准备数据集加载数据集数据处理数据可视化利用R语言绘制物种组成图。本文以堆叠面积图的方式与大家分享。面积图简介面积图又叫区域图。

酷在前行·2023-08-11 22:26

GEO芯片数据下载和探针ID转换（保姆级教程）

保姆级教程）一、问题描述探针ID转换数据是否预处理过二、Rstudio的安装（建议阅读，避免后续转换时出错）安装包的下载安装步骤三、（正文）芯片数据下载和ID转换相关设置和包的加载数据下载本文章主要参考了：①R语言的安装

新客草草·2023-08-11 21:56

机器学习可解释性【随机森林规则提取】

本文主要讲：模型可解释性方案有哪些随机森林规则提取的方法有哪些随机森林规则提取，如何实现相关工作模型可解释性方案可分为：事前可解释性建模：有些模型自带可解释性，如：朴素贝叶斯、线性回归、决策树、

细卷子·2023-08-11 17:26

Coding and Paper Letter（八十七）

文章目录1Coding:2Paper：1Coding:1.针对R语言新手的shiny培训教程。shinybeginners2.R语言包tinter，用于获取颜色的色调和阴影。

胖胖雕·2023-08-11 14:31

Buzz语音转文字安装使用(含Whisper模型下载)

可以简单理解为QT的前端界面，python语言构建服务端，使用Whisper语言模型进行计算语音转文字的软件。痛点在于离线，缺点也很明显，模型较大，高质量

JerryLXu·2023-08-11 13:01

R语言，leafletCN包，read.geoShape函数，json地图读取为sp对象

O(∩_∩)O哈哈哈~#ThuOct2216:13:242020-#字符编码：UTF-8#R版本：Rx644.0.3forwindow10#[email protected]#个人笔记不负责任#——拎了个梨.rs.restartR()require(leafletCN)#read.geoShape函数，json地图读取为sp对象rm(list=ls());gc()#用于将geojson形状文件

youmigo·2023-08-11 12:05

复现Cell图表：pyscenic分析之转录因子二项值热图

第一是热图是二项值热图，只有0，1两个值，我们知道，在R语言版本的SCENIC分析中，最后可以得到二项值热图，那么pyscenic的分析结果中也是可以进行二项值分析并做热图的。

TS的美梦·2023-08-11 11:40

pyscenic分析：视频教程

我们也说过，我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了，因为它比较耗费计算资源和时间，所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pyscenic的分析进行的。

TS的美梦·2023-08-11 11:09

R语言之探索性数据分析1

首先得把dplyr和ggplot2知识综合起来如果没有安装tidyverse这个包的话，会出现错误提示library(tidyverse)Errorinlibrary(tidyverse):不存在叫‘tidyverse’这个名字的程辑包那需要执行下面的代码，下载包，并且加载这个包install.packages("tidyverse")library(tidyverse)那钻石的列子来做可视化分析

分享之家·2023-08-11 03:46

R语言中的函数24：Combinat：combn(), permn()

介绍combinat中的combn()和permn()函数可以得到所有的排列组合的情况combn()函数combn(x,m,fun=NULL,simplify=TRUE,…)x–组合的向量源m–要取的元素的数量fun–应用于每个组合的函数(可能为空)simplify–逻辑的，如果是FALSE，返回一个列表，否则返回向量或数组实例permn()permn(x,fun=NULL,…)x–组合的向量源f

zoujiahui_2018·2023-08-11 02:37

R语言中的函数25：paste,paste0

文章目录介绍paste0()实例paste()实例介绍paste0()和paste()函数都可以实现对字符串的连接，paste0是paste的简化版。paste0()paste(...,sep="",collapse=NULL,recycle0=FALSE)…oneormoreRobjects,tobeconvertedtocharactervectors.sepacharacterstringt

zoujiahui_2018·2023-08-11 02:07

感谢一页书_fe0f

非常感谢一页书_fe0f订阅我的挤进R语言，一直以来挤进R语言是我的一个想法。虽然一直学习着，会一些基本操作。但是由于各种原因总是草草了事，对于写的热情也降低了。

TYBNII·2023-08-11 00:29

R语言实现线性回归

R语言是一种流行的统计和数据分析语言，你可以使用它来编写复杂的程序。

LiuTselin·2023-08-10 20:29

机器学习(十八)：Bagging和随机森林

本文目标：理解什么是集成学习，明确Bagging算法的过程，熟悉随机森林算法的原理及其在Sklearn中的各参数定义和使用方法代码及数据集下载点这里一、引言在机器学习的众多算法中，随机森林无疑是其中最受欢迎和最经常被应用的方法之一

算法小陈·2023-08-10 12:39

R语言APSIM模型高级应用及批量模拟

随着数字农业和智慧农业的发展，基于过程的农业生产系统模型在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农田固碳和温室气体排放等领域扮演着越来越重要的作用。APSIM(AgriculturalProductionSystemssIMulator)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。APSIM模型有Classic和NextGeneration两个系列模型，能模拟几十种农作物、牧

Mr.靳靳477302280·2023-08-10 11:40

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