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oracle 查看 sql 执行效率

wenku.baidu.com/view/eaed94c2d5bbfd0a79567329.html==============================SQL效率检查sql：SELECTEXECUTIONS,DISK_READS

ralflee·2020-07-28 10:56

Oracle创建视图view错误ORA-01031: 权限不足

createorreplaceviewREPORT_CONFIGQUERY_367ASSELECT*FROM(selectPARSING_USER_ID,EXECUTIONS,SORTS,COMMAND_TYPE,DISK_READS

awen7916·2020-07-27 19:46

Mysql查询数据IO次数如何计算

当索引是InnoDB时，参数列表:Innodb_data_reads数据读请求量数量，包含dic，data，undoInnodb_data_writes数据写请求量数量，包含dic，data，undoInnodb_dblwr_writes

Cris_February·2020-07-16 05:28

Physical Reads（物理读）和Logical Reads（逻辑读）(转)

现在没得时间去总结，记录一下别人写的有关文章了这个是关于oracle里的物理读和逻辑读比较清楚的文章physicalreads>"physicalreadsdirect+physicalreadscache"Totalnumberofdatablocksreadfromdisk.Thisvaluecanbegreaterthanthevalueof"physicalreadsdirect"plus

iteye_18365·2020-07-16 00:09

物理读和内存读较高SQL

SELECTt.HASH_VALUE,t.EXECUTIONS,t.DISK_READS,round(t.DISK_READS/t.EXECUTIONS)ASperDiskReads,t.BUFFER_GETS

congnen9588·2020-07-15 21:46

团队管理经典书籍推荐：《团队管理必读12篇》

我对这个问题的答案是：《团队管理必读12篇》（特别说明：该书仅能从12Reads官网获得）。为什么是《团队管理必读12篇》而非其他？你或许也和笔者一样，读过很多管理书籍及所谓的“团队管理经典书籍”。

code-is-poetry·2020-07-15 18:50

R语言-使用ggplot2绘制测序深度图

本文展示如何使用ggplot2包绘制测序reads深度分布图，即用条形图来展示每个位点的测序深度，以及用饼图来展示检出病原的分布。

husy_·2020-07-15 10:16

skewer过滤软件的安装及使用

skewer是一个能快速且准确地处理NGS双端reads的接头去除软件。

husy_·2020-07-15 10:02

StrToInt / IntToStr Asm For Delphi

edxasmpushebxpushesipushedimovedi,edxxorecx,ecxmovebx,10xoredx,edxcmpeax,0//checkfornegativesetldlmovesi,edxjnl@readsnegeax@reads

weixin_34249367·2020-07-15 05:30

SQL SERVER 语句优化

SQLServer启动以来累计使用CPU资源最多的语句SELECTc.last_execution_time,--最后一次执行时间c.execution_count,--执行次数c.total_logical_reads

IngGoer·2020-07-15 02:03

RNA-seq，生信技能树

sra文件地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/下载测序数据#循环下载sra文件1，for((i=677;i1ls*

bettermaan·2020-07-15 00:59

Innodb Read IO 相关参数源代码解析

在阅读之前一直有个疑问，showglobalstatus中有两个指标innodb_data_reads和innodb_data_read。两个计数器仅差一个字母，他们之间的含义到底有何差别呢？

orion61·2020-07-14 16:44

SQL SERVER 语句耗用查看

SELECTTOP10SS.plan_handle,SS.SUM_EXECUTION_COUNT,SS.SUM_TOTAL_ELAPSED_TIME,SS.SUM_TOTAL_WORKER_TIME,SS.SUM_TOTAL_LOGICAL_READS

leejin_521·2020-07-14 13:54

生物信息学练习题-赞哥

1）请统计本次测序的PEreads数是多少对reads？理论上能否使基因组99%以上的区域达到至少40X覆盖？请简要写出推理和计算的过程与结果，

ANNOROAD·2020-07-14 03:35

RNA-seq数据分析

话休絮烦主要流程：将reads比对到基因组上；将比对好的reads进行拼装；量化基因的表达水平；计算在不同条件下的差异表达分析image原始数据：ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/RNAseq_protocol

Luster_Li·2020-07-13 19:36

mysql readlock

这里是官方介绍文档http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/innodb-locking-reads.html需求在一个事务中进行insert或者update操作时，

actlea·2020-07-13 19:20

FastQC处理二代测序原始数据的质量结果解读

当二代测序的原始数据拿到手之后，第一步要做的就是看一看原始reads的质量。

BeautifulSoulpy·2020-07-13 16:25

reads在染色体上分布作图（转载）

以1000kb为窗口bedtoolsmakewindows-bhg19.txt-w1000>hg19.window.bedawk'{print$1"\t"$2"\t"$3"\t0\t0\t+\n"$1"\t"$2"\t"$3"\t0\t0\t-"}'hg19.window.bed>hg19.window.bed.region###需要修改！bam转换成bed再进行下一步###bedtoolscov

njmujjc·2020-07-13 10:42

linux-blk.h

*NOTEthatwritesmayuseonlythelow2/3ofthese:reads*takeprecedence.**32seemstobeareasonablenumber

yangsc1984·2020-07-12 17:03

python实现根据序列ID从提取fasta文件序列

提取将近100万条reads耗时也就需要10s左右#!/usr/bin/python#-*-coding:utf-8-*-#Usage:pythons

little^raccoon·2020-07-12 11:35

生信软件 | bowtie2（测序序列与参考序列比对）

文章目录一、介绍二、安装1.Conda安装2.传统安装三、使用1.示例必需参数可选参数（常用）2构建索引官方索引自建索引3.例子小鼠：*M.musculus*,UCSCmm10一、介绍Bowtie2是将测序reads

白墨石·2020-07-12 02:15

RPM(CPM)/RPKM/FPKM/TPM

RPM/CPMRPM/CPM:Reads/CountsofexonmodelpermillionmappedreadsCalculateFormula:RPM=Totalexonreads/Mappedreads

jlyq617·2020-07-11 21:06

python实现fastq文件GC含量的计算

含量的计算fastq格式是生物信息分析中最常见的格式之一通常我们可以将测序的数据分为双端测序和单端测序双端测序的数据含有两个fastq格式的文件，单端测序的数据只有一个fastq格式的文件第一行是用来区分不同reads

狗蛋儿张·2020-07-11 15:14

MongoDB中的锁

一、单个MongoDB实例1、MongoDB使用的是多读单写锁（reads-writelock），读锁可以共享，写锁只能有一个写操作，并且写锁的优先级高于读锁。

两只手刷牙·2020-07-11 09:45

Prometheus Node_exporter 之 Disk Datail /proc/diskstats

Oops/sec(iops)Label:IOread(-)/write(+){{device}}-Readscompleted:每个磁盘分区每秒读完成次数metrics:irate(node_disk_reads_completed_total

dixu7849·2020-07-11 05:08

sam文件格式简介

简介文件后缀名:.sambwa、Bowtie2是现下最流行的短序列比对软件，SAM(SequenceAlignment/Map)格式是一种通用的比对格式，用来存储reads到参考序列的比对信息。

zhu_si_tao·2020-07-10 14:09

基因组组装工具之 SOAPdenovo 使用方法

SOAPdenovo是一个新颖的适用于组装短reads的方法，能组装出类似人类基因组大小的denovo草图。

weixin_34221775·2020-07-10 08:09

biostar handbook|如何模拟测序结果

weixin_34138521·2020-07-10 08:07

BWA-MEM算法记录

2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>>BWA-MEM算法整体流程如下：1读入bwt、options、reads；2利用mem_chain生成chain；3利用mem_chain_flt过滤掉部分

weixin_34075551·2020-07-10 08:25

illumina测序原理

Illumina测序时，测序反应发生的位置，1个flowcell含有8条lanelane通道每一个flowcell上都有8条泳道，用于测序反应，可以添加试剂，洗脱等等tile每一次测序荧光扫描的最小单位reads

weixin_30251587·2020-07-10 06:58

[samtools]mpileup命令简介

在pileup格式中(没有-u或者-g参数)，每一行代表基因组的位置，由染色体名、1个碱基坐标、参考碱基、reads覆盖该位点的数量、reads的

BlueWing2000·2020-07-10 05:51

SQLServer查看正在执行的SQL语句的方法

SELECTTOP50(total_logical_reads+total_logical_writes)AStotal_logical_io,(total_logical_reads/execution_count

乘舟御风·2020-07-10 03:48

【一起学生信】 bwa -M 参数解读

-M参数用来处理同一个reads比对到参考基因组上不同位置的情况。

探索者v·2020-07-10 03:05

Duplicate与PCR扩增偏向性

接下来有一些解决方法，但是“但是”也会很多，接受现实吧~~~首先Duplicate出现的类型有两种，一种是由于PCR扩增的原因导致的完全一样的reads，另一种是比对到基因组上同一位置不同的reads，

浮生终有醒·2020-07-10 02:17

BWA-MEM算法结构分析

一、BWA-MEM函数框架软件位置：https://sourceforge.net/projects/bio-bwa/1读入bwt、options、reads；2利用mem_chain生成chain；3

小c轩令·2020-07-09 23:35

BWA用法笔记

其中提供了三种算法：算法应用场景BWA-backtrackillumina测序结果（reads长度不超过100bp）BWA-SW支持序列长度70bp-1Mbp，同时支持剪接性比对(splital

寂桐·2020-07-09 21:25

bam/sam 数据格式的介绍（一）

1.bam文件读取samtoolsviewxxx.bamsamtoolsviewxxx.bam|less2.bam和sam的区别与一致sam是带有比对信息的序列文件（即告诉你这个reads在染色体上的位置等

niuhuihui_fei·2020-07-09 20:45

java poi 处理excel数据（不连续）

resources/register.xlsx",2,7,1,4);introws[]={1,2,3,4,5,6,7};intcells[]={1,2,3,4};Objectdatas[][]=ExcelUtil.reads

lyl00ling·2020-07-09 20:03

全基因组重测序

SBC将不同梯度插入片段（Insert-Size）的测序文库结合短序列（Short-Reads）、双末端（Paired-End）进行测序，帮助客户在全基因组水平上扫描并检测与重要性状相关的基因序列差异和结构变异

casularm·2020-07-09 14:27

基因数据处理106之bwa-mem运行paird-end（1千万条100bp的reads g38L100c10000000Nhs20Paired12）

脚本：hadoop@Master:~/xubo/project/alignment/sparkBWA$catg38L100c10000000Nhs20Paired12Bwamem.shecho"start"startTime4=`date+"%s.%N"`time4=`date+"%Y%m%d%H%M%S"`#spark-submit--classorg.apache.spark.examples

KeepLearningBigData·2020-07-09 13:49

基因数据处理102之SparkBWA本地运行100万条paired-reads实例

脚本：spark-submit--classSparkBWA\--masterlocal\--archivesbwa.zip\SparkBWA.jar\-algorithmmem-readspaired\-index/home/hadoop/xubo/ref/GRCH38L1Index/GRCH38chr1L3556522.fasta\-partitions3\/xubo/alignment/sp

KeepLearningBigData·2020-07-09 13:48

基因数据处理100之bwamem算法处理100万条paired-reads数据GRCH38chr1L3556522N1000000L100paired12

运行记录：hadoop@Master:~/xubo/ref/GRCH38L1Index/pe$bwamem../GRCH38chr1L3556522.fastaGRCH38chr1L3556522N1000000L100paired1.fastqGRCH38chr1L3556522N1000000L100paired2.fastq>GRCH38chr1L3556522N1000000L100pai

KeepLearningBigData·2020-07-09 13:48

基因数据处理59之snap运行single-end（1千万条100bp的reads）

记录：hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$snap-alignersinglesnap/snapindexg38L100c10000000Nhs20.fq-osnap/g38L100c10000000Nhs20.snap.samWelcometoSNAPversion1.0beta.23.Loadingindexfrom

KeepLearningBigData·2020-07-09 13:17

基因数据处理56之bwa运行paird-end（1千万条100bp的reads）.md

（1）pair1.fq》saibwaalnGRCH38BWAindex/GRCH38chr1L3556522.fastag38L100c10000000Nhs20Paired1.fq>g38L100c10000000Nhs20Paired1.saipair1记录：hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$bwaalnGRCH3

KeepLearningBigData·2020-07-09 13:16

基因数据处理8之BWA_MEM小数据集处理（成功）

基因数据处理8之BWA_MEM小数据集处理环境：ubuntu14.046G内存参考基因：GRCH38来源请参考【1】1.fastq数据：SRR003161.fastq的头20行，即5条reads操作记录