sra数据下载第5页

2021-09-13

二、数据下载1.准备工作工作目录管理##示例如下：tree-L1├──biosoft#软件安装目录├──database#数据库存放目录，包括参考基因组，注释文件，公共数据库等├──pipline#流程搭建目录

R小王子·2023-12-14 17:24

如何下载全国道路（路网）数据？

通过以下方法可以将全国道路（路网）数据下载到本机。

GIS数据转换器·2023-12-06 14:28

中文手写数字数据识别

实验环境python=3.7torch==1.13.1+cu117torchaudio==0.13.1+cu117torchvision==0.14.1数据下载地址：Mnist中文手写数字数据集Python

!chen·2023-12-06 10:12

一个转录组上游分析流程 | Hisat2-Stringtie

/bin/bash##使用fastq-dump解压sra数据#本数据集为双端数据#解压格式为fq.gzforiinSRR6929571SRR6929572SRR6929573SRR6929574SRR6929577SRR6929578

小杜的生信筆記·2023-12-05 21:44

一个完整的转录组分析流程

/bin/bash##使用fastq-dump解压sra数据#本数据集为双端数据#解压格式为fq.gzforiinSRR6929571SRR6929572SRR6929573SRR6929574SRR6929577SRR6929578

小杜的生信筆記·2023-12-05 21:09

省事地获取已公开测序数据的下载链接（.sra|.fastq.gz）

写在前面课题需要，前述，在TBtools中开放了一个SraExperimentXML2InfoTable的功能。在这个功能的辅助下，我们较快的完成了阶段任务。筛选数据完成了，但是下载数据却出现了问题。主要遇到的问题是NCBI的数据，似乎有时候能下载到，有时候却下载不到。或许网速是一个原因，但我更多地开始认为或许NCBI并没有存储所有的短读段测序数据。DDBJ也是一样。相反ENA似乎存储全面，只是传

生信石头·2023-12-05 02:00

开发者利器：免费好用的api接口

全国招投标查询：查询招标保标信息，涵盖招标信息查询、中标信息查询、VIP项目、拟在建项目、业主委托项目、PPP项目、项目来源、历史招标库、政府采集信息、招标定制、订阅推送、订阅导出、数据下载等数十个招投标领域

海碗吃饭·2023-12-04 19:22

生信软件9 - 多公共数据库数据下载软件Kingfisher

简介kingfisher是一款专门用于高通量测序数据下载的工具。支持从公共数据库（ENA、NCBI、SRA、AmazonAWS和GoogleCloud）获取序列文件及其元数据注释。

生信与遗传解读·2023-12-04 06:18

vb.net 循环读取多个textbox_for 循环太 Low？是你没用对

，但是本文中将重点介绍她，并跟大家分享我工作常用的几段代码示例(如果你想实操，文末有数据下载链接)。for循环示意图可以有部分朋友还不太清楚for循环的工作机制，这里

weixin_39774905·2023-12-03 06:28

Tools:aspera上传数据到SRA数据库

1.先注册NCBI账户,然后访问https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/，创建新的提交image.png按照步骤，一步步填写内容，第5和6步骤比较费时间，需要下载模板

wo_monic·2023-11-30 22:17

【现学现卖】宏基因组数据与深度学习

现在测序技术发展快速，序列数据越来越多，NCBI中SequenceReadArchive(SRA)数据库中的reads成倍地增长。

乔伊nikkie·2023-11-30 13:34

Superset禁用数据下载功能（1）-图表及仪表板Download功能删除

项目场景：Superset使用过程中存在数据可下载功能，有些公司为数据安全需要禁用数据下载功能，下面从几个不同角度解决此问题。

正在进阶的数据分析师·2023-11-30 00:26

No.1 在文本文件中提取关键的信息

示例数据下载地址：https://gitee.com/shiying0618/study_shell/raw/master/demofiles/demo_calc_20201120.log示例文件来自服务器真实的一段程序日志

eXtreme_4a1a·2023-11-29 22:46

转录组学习第三弹-下载SRR数据并转成fastq

下载数据前面已经安装好了需要的软件，那么我们现在需要下载我们练习需要用到的sra数据。从SRA数据库下载数据有多种方法。

长腿猴子请来的救兵·2023-11-29 18:50

echarts-map的使用

echarts-map的使用地图的下载：方式一：在安装echarts依赖时，已经将数据下载到项目中了。你想要的省级Js、Json文件，node_modules文件下全都有。

songsong9181·2023-11-28 16:00

【ArcGIS教程】专题图制作-人口密度分布图——人口密度分析

示例数据下载链接：数据下载链接第一步准备数据如下为湖北省各级别行政区划与居民点数据第二步符号化显示将湖北的市级行政区划矢量数据进行简

遥感云·2023-11-28 09:47

基因组组装练习

上GenomeAnnouncements网站（https://mra.asm.org/）找一篇细菌基因组文章；找到文章记载的SRA号；QQ图片20211108211549.pngimage.png从SRA

月时有青天·2023-11-28 05:54

ArcGIS土地利用制图流程（附练习数据）

（文末有练习数据下载）01数据布局在更改布局中根据自己研究区的形状进行调整，原则上布满整个图框中即可数据范围大于自己的研究区范围有2种方法解决按研究区边界进行裁剪（ArcGIS自带工具栅格及矢量裁剪）数据框按研究区范围裁剪

GIS前沿·2023-11-28 01:05

GEO通用

数据下载：可以通过GEOquery这个R包进行下载，或者直接在网页上下载---下载的内容包括：==表达矩阵==和==注释文件==rm(list=ls())#一键清空环境中的对象options(stringsAsFactors

pedagogoose·2023-11-27 16:48

单细胞表达矩阵文件转换

先附上学习连接https://mp.weixin.qq.com/s/NaZ5kz3ew2O01cFEnK8sXg这个问题之前也遇到过，在此搬个小板凳来学习学习数据下载由于工作站暂时连接不上，所以打算利用

小潤澤·2023-11-27 08:07

rmd学习及gdc- client数据下载R.tacg-1

rmd插入代码块ctrl+alt+I级别标题：＃.pngTCGA癌症类型.png1.数据下载gdc-client官方下载工具UCSCXena浏览器分类打包，直接下载gdcRNAtools基于gdc-client

小胡同学_d5e1·2023-11-27 04:42

aglient芯片原始数据处理

1.下载和读取数据1.1获取临床信息数据从前，提到GEO数据下载，我们只有GEOquery，神功盖世，但是死于网速。后来就有了中

小洁忘了怎么分身·2023-11-26 20:37

ultralytics yolov8 实例分割训练自有数据集

参考：https://docs.ultralytics.com/datasets/segment/coco/http://www.bryh.cn/a/613333.html1、数据下载与转换yolo格式

loong_XL·2023-11-26 12:29

ubuntu 使用快照启动polygon主网

polygon2.1heimdall安装2.1.1heimdall编译2.1.2初始化heimdall2.1.3修改配置文件2.2bor安装2.2.1bor编译2.2.2创建bor数据目录2.2.3修改配置文件三、快照数据下载

杰哥的技术杂货铺·2023-11-26 10:03

【2023年APMCM亚太杯C题】完整数据与解题思路

2023年亚太杯C题数据下载与搜集重点数据其余数据第一问第二问第三问第四问第五问第六问数据与思路获取数据下载与搜集该题并没有提供数据集，对所需数据进行收集整理是对题目进行求解的基础。

Better Rose·2023-11-25 20:51

RAM模型从数据准备到pretrain、finetune与推理全过程详细说明

提示：RAM++模型：环境安装、数据准备与说明、模型推理、模型finetune、模型pretrain等文章目录前言一、环境安装二、数据准备与解读1.数据下载2.数据标签内容解读3.标签map内容解读三、

tangjunjun-owen·2023-11-25 20:03

JavaScript如何实现base64（图片，pdf等格式）数据下载？

JavaScript如何实现base64数据下载？

元晖·2023-11-25 16:58

如何下载全国建筑轮廓(基底)数据？

通过以下方法可以将全国建筑轮廓(基底)数据下载到本机。

GIS数据转换器·2023-11-24 15:10

53.《Bioinformatics Data Skills》之实战：统计落在外显子区域dbSNP数目

本节数据下载数据准备首先，导入小鼠1

DataScience·2023-11-24 08:34

python爬虫必备-urllib库详解

urllib库详解python比较基础的应用之一就是写爬虫了，写爬虫抓取数据无外乎就几个步骤，先把html等数据下载下来，再从下载得到的数据之中的利用各种字符串解析的方法提取解析我们所需要的的数据，当然也包括数据清洗

卷儿哥·2023-11-24 03:42

TCGA数据分析系列（一：数据下载清洗）

二、数据下载（网页下载/R语言下载）墙裂建议R语言下载，一键download和清洗，非常方便。1、网页下载然后进入GDC数据库网站。按照以下步骤，依次选择reposito

基因组学研究生·2023-11-24 02:50

点三种Excel转SHP文件的方法（附练习数据下载）

概述数据的获取渠道是多种多样的，获取的数据格式也是多种多样，作为一名GISer，需要熟练掌握各种格式的数据之间的转换，例如本文要介绍的Excel格式的数据，经常会遇到，如果需要转换为SHP格式应该怎么做，这里给大家盘点了三种转换方式，希望能够对大家有所帮助。数据来源本教程所使用的数据是从水经微图中下载的POI数据，除了POI数据，常见的GIS数据都可以从水经微图中下载水经微图（关注微信公众号“水经

水经注GIS·2023-11-22 17:24

【python笔记】客户运营 - cohort分析

一、数据本文涉及数据下载链接。

htuhxf·2023-11-22 13:51

GEO数据挖掘-数据下载

断断续续学习生物信息也有一段时间了，因为做实验的缘故没办法系统学习，只能看大家的帖子一点点补充。俗话说的好，好记性不如烂笔头，为方便记忆，我就将每天用到的生信知识记录下来，加油！GEO（GeneExpressionOmnibusDatabase),是由NCBI开发和维护的一个公共数据库。储存有基因芯片数据，新一代测序数据以及其他形式的高通量功能基因组数据。详细参考菜鸟青盐：https://www.

活捉一只Sophie·2023-11-22 03:49

[转]全球地理遥感GIS数据免费下载

来源：http://hi.baidu.com/kuanjin8309/blog/item/a575ac5085677e8a8d54302b.html全球各国shape数据下载，包括矢量要素、dem数据、

sixiangzhanshi·2023-11-21 18:05

【收藏】夜光遥感数据下载网址及方式

夜光数据在经济发展、城市扩张、火源监测以及船舶灯光监测等多方面广泛使用。而目前的能够获取到的夜光数据主要可以算是3类：DMSP（美国）、SNPP（美国）、珞伽一号（中国）。卫星DMSP/OLSNPP/VIIRS珞伽一号国家美国美国中国数据获取时段1992-2012,2013年后数据不公开2011年12月-至今2018年6月至今空间分辨率2.7km742m130m时间分辨率12h12h15d像素饱和

生态与遥感应用·2023-11-21 18:58

SpringBoot异步请求时获取ServletRequestAttributes为空，request空指针问题

异步之前开启子线程共享设置值：ServletRequestAttributessra=(ServletRequestAttributes)RequestContextHolder.getRequestAttributes();sra.setAttribu

Cy@Liang·2023-11-21 12:38

Chipseq单端测序数据分析

工作目录mkdir-p~/maos/chipseqcd~/maos/chipseqmkdir{sra,fastq,fastqc,trim,bam,bw,bed,peak,pic}downloadfastqfile

bred·2023-11-21 09:50

asp.net校园二手交易网站VS开发sqlserver数据库web结构c#编程计算机网页项目

视频演示：asp.net校园二手交易网站VS开发sqlserver数据下载地址：asp.net校园二手交易网站VS开发sqlserverc#编程计算机网页项目-电子商务文档类资源-CSD

qq_251836457·2023-11-20 13:14

楼块获取+楼块切片3dtiles+IIS服务器发布+cesium加载楼块

数据下载使用工具QGIS对楼块进行获取下载，生成.shp文件备用工具下载地址：https://www.qgis.org/en/site/forusers/download.html下载安装完毕，设置中文新建链接获取楼块保存

LBY_XK·2023-11-20 06:05

个人贷款违约预测模型

案例背景案例来源《python数据科学：技术详解与商业实践》数据下载地址该案例使用一套来自某银行真实数据集构建贷款违约预测模型本案例遵循数据挖掘项目通用流程CRISP-DM进行建模,流程如下:项目理解数据理解数据准备模型构建与评价模型监控

熊定坤·2023-11-20 03:54

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1984-2019年全球水资源分类数据数据简介数据下载参考数据简介JRCYearlyWaterClassificationHistory,v1.4是一个对全球水资源进行分类的数据集，覆盖了1984年至2019

WW、forever·2023-11-20 02:58

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目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于支持向量机SVM的时间序列数据训练测试和预测未来数据（代码完整，数据齐全）

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-11-20 02:18

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常用数据检索与R语言自动化下载及可视化方法常用数据下载网站（包括：气候、土壤、水文等,GBIF）数据获取方法手动下载R语言命令行自动下载与可视化方法R语言数据清洗与特征变量筛选R、Rstudio安装软件常用功能讲解数据清洗的原理与实操练习

xiao5kou4chang6kai4·2023-11-19 12:06

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生信小窝·2023-11-19 12:03

第八章用matplotlib、seaborn、pyecharts绘制散点图

本文可以学习到以下内容：matplotlib中文乱码解决办法seaborn中文乱码解决办法seaborn库csv数据下载地址用matplotlib、seaborn、pyecharts绘制散点图数据及源码地址

帅帅的Python·2023-11-19 04:09

数据集记录

1、结肠癌CT数据数据下载链接：https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CT+COLONOGRAPHY#dc149b9170f54aa29e88f1119e25ba3e

萤石ym·2023-11-17 03:20

GEE开发之Worldpop人口数据分析

GEE开发之Worldpop人口数据分析1基础知识2获取某地区的人口遥感影像3获取某地区每年人口的数据4TIF数据下载前言：如何利用GEE平拍获取Worldpop人口数据。

等待着冬天的风·2023-11-17 01:43

图神经网络（2020智源大会）Topic推荐-AMiner

系统2006年上线，吸引了全球220个国家/地区1000多万独立IP访问，数据下载量230万次，年度访问量超过1100万，成为学术搜索和社会网络挖掘研究的重要数

AMiner学术搜索和科技情报挖掘·2023-11-16 17:26

音画同步策略

、特定场景：点播自身视频的特点：交叉存储异常的情况，也就是视频自身封装异常或者流异常这两种特殊情况；只有视频流或者音频流；同步策略：视频帧快播/慢播；丢帧处理；3、解决方案：现有的播放流程描述：A网络数据下载

starmier·2023-11-15 16:13

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