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医学图像分割
论文阅读笔记(二)U-Net
U-Net:ConvolutionalNetworksforBiomedicalImageSegmentationU-Net:用于生物
医学图像分割
的卷积网络摘要要想成功地训练一个深度网络需要大量的数以千计的有标记的样本
ditangbi1614
·
2020-09-11 21:27
U-net介绍
U-net的产生极大的促进了
医学图像分割
的研究。
YOUNA12138
·
2020-09-11 21:44
Deep
Learning
基于模糊聚类的图像分割
这篇文章提出了一个新的模糊水平集算法去优化
医学图像分割
。可以直接演化根据空间模糊聚类的初始分割。水平集的控制参数也是来自于模糊聚类。而且模糊水平计算法被增强通过局部正则化的方程。
TiWalker
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2020-08-26 16:31
图像处理
Dice-loss
使用深度学习做
医学图像分割
时,经常会用dice系数作为损失函数。
xys430381_1
·
2020-08-26 16:58
机器学习
图像处理
深度学习
医学图像分割
模型的常用loss
1.交叉熵损失函数-crossentropy二分类交叉熵损失函数binary_crossentropy其中,N为像素点个数,为输入实例的真实类别,为预测输入实例属于类别1的概率.对所有样本的对数损失表示对每个样本的对数损失的平均值,对于完美的分类器,对数损失为0。多分类交叉熵损失函数categorical_crossentropy该损失函数分别检查每个像素,m为类别数(num_label),将类预
gefeng1209
·
2020-08-26 12:45
医学图像分割
Unet:实现多通道输入的
医学图像分割
前言:作为一个小白加入实验室后寒假需要自己动手搭建一个神经网络来完成脑部肿瘤的分割识别,网上几个阅读量比较大的博客都讲的比较详细,但是发现基本上都是灰度图输入,灰度图输出,而我的数据集为彩色图片要输出二值化(黑白)预测图片,而且很多的博客代码运行会有很多问题,通过学习了几个博主的博客和研究了几份代码之后完成自己的第一个完整图像分割编写,这边文章主要是针对彩图数据集输入,二分类,输出黑白图片来表示分
y.programming
·
2020-08-26 12:35
[CVPR 2019] Data augmentation using learned transformations for one-shot medical image segmentation
Dataaugmentationusinglearnedtransformationsforone-shotmedicalimagesegmentation使用学习变换进行一次性
医学图像分割
的数据增强这篇文章做了一件什么事情
yxhamburger
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2020-08-24 05:38
文献阅读
医学图像分割
之 Dice Loss
转载自:https://www.aiuai.cn/aifarm1159.html在很多关于
医学图像分割
的竞赛、论文和项目中,发现Dice系数(Dicecoefficient)损失函数出现的频率较多,自己也存在关于分割中
longma666666
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2020-08-22 17:11
ubuntu
蟒蛇
U-Net:用于生物
医学图像分割
的卷积网络
转自:http://baijiahao.baidu.com/s?id=1600400677130320639&wfr=spider&for=pc摘要众所周知,成功地训练一个深度网络需要大量的已标注数据集。本文提出了一种新的网络结构和训练方法,依靠数据增强将有效的标注数据更为有效地使用。该网络由收缩路径(contractingpath)和扩张路径(expandingpath)组成。其中,收缩路径用于
Alex-Zhou
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2020-08-22 11:53
文献阅读
[深度学习从入门到女装]H-DenseUNet: Hybrid Densely Connected UNet for Liver and Tumor Segmentation from CT Volu
论文地址:H-DenseUNet:HybridDenselyConnectedUNetforLiverandTumorSegmentationfromCTVolumes这是一篇使用Unet改进进行
医学图像分割
的论文对于传统的
炼丹师
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2020-08-21 01:00
深度学习
医学图割方法
随着医院图像的数量大量增加,用电脑进行图像的处理和分析成了一种必要,图像分割领域的方法也很多,各有优异,今天来说说
医学图像分割
常用的各种方法吧。
a-娇
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2020-08-20 08:54
图割
论文分享 Unsupervised Cross-Modality Domain Adaptation of ConvNets for Biomedical Image Segmentations wi
本文提出了一种用于跨模态生物
医学图像分割
的具有对抗性学习的无监督域自适应框架。具体来说,
Klay Ye
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2020-08-20 04:00
医疗图像分割
论文分享
U-net
医学图像分割
代码作者一数据集分割fromPILimportImageimportos#FortheDatasetregisterat:http://brainiac2.mit.edu/isbi_challenge/#Downloadthecorrespondingdatafiles#Only30imagesareavailablewithgroundtruth#6Imagesareusedforvalidat
yuyangyg
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2020-08-20 04:17
深度学习
使用注意力机制来做
医学图像分割
的解释和Pytorch实现
在这篇文章中,我们将集中讨论注意力是如何影响
医学图像分割
的最新架构的。为此,我们将描述最近两篇论文中介
ronghuaiyang
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2020-08-17 15:31
网络
python
计算机视觉
人工智能
深度学习
【
医学图像分割
网络】之ScSE U-Net网络PyTorch复现
【
医学图像分割
网络】之SCSEU-Net网络PyTorch复现1.内容U-Net网络算是
医学图像分割
领域的开山之作,我接触深度学习到现在大概将近大半年时间,看到了很多基于U-Net网络的变体,后续也会继续和大家一起分享学习
一只稚嫩的小金毛
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2020-08-16 07:59
医学影像
论文复现之医学图像应用:视网膜血管分割
中文翻译为:用于生物
医学图像分割
的U-Net卷积网络。1
guangcheng0312q
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2020-08-16 06:57
本周新出计算机视觉开源代码汇总(语义分割、目标检测、超分辨率、网络结构设计、训练策略等)
CV君汇总了过去一周计算机视觉领域新出的开源代码,涉及到图像增广、
医学图像分割
、图像恢复、目标检测、语义分割、超分辨率、显著目标检测、轻量级网络结构设计、网络规范化、标注工具等,其中有多篇来自CVPR2019
关注公号‘AI深度学习视线’
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2020-08-14 23:47
CNN
卷积神经网络
医学图像分割
——Unet
这是一个学习记录博~可能有错,欢迎讨论P.S.本文所用的unet源码来自Unet源码。目标实现胃部超声图像的病灶分割医学数据以及预处理简介医学图像的数据格式十分复杂,数据形式有什么CT图像,MRI图像(目前还没接触过~),超声图像等(详细信息可以参考:医学图像了解。),而数据格式上有诸如dicom(.dcm,.IMA,常用的python处理库有:SimpleITK,pydicom库),Nifit(
XX|XX
·
2020-08-14 19:38
python深度学习
python
人工智能
深度学习
unity 物体围绕自身中心旋转而非轴心
目前的情况是:需要对
医学图像分割
后进行三维重建,先直接由ground-truth作为测试。ground-truth为.nii文件,在matlab中转化为.obj文件后导入unity。
normol
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2020-08-14 03:36
unity
[论文解读]U-Net+与FCN的区别+医学表现+网络详解+创新
U-Net是一篇基本结构非常好的网络,由于网络结构像U型,所以叫Unet网络U-Net不止应用于图像分割(尤其是
医学图像分割
),也用于自然图像生成的任务,所以它几乎是骨干(backbone)网络的标配1.2FCN
玖零猴
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2020-08-11 19:29
#
医学影像分割
深度学习
#
论文翻译与解读
(分割网络评价指标)dice系数和IOU之间的区别和联系
传统的分割任务中,IOU是一个很重要的评价指标,而目前在三维
医学图像分割
领域,大部分的paper和项目都采用dice系数这个指标来评价模型优劣。那么二者有什么区别和联系呢?
敏儿enjoy
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2020-08-10 15:11
神经网络
医学图像处理最全综述
目录0、引言1、病变检测2、图像分割基于深度学习的
医学图像分割
与检测3、图像配准图像配准的定义4、图像融合5、预测与挑战6、结论参考文献0、引言医学图像处理的对象是各种不同成像机理的医学影像,临床广泛使用的医学成像种类主要有
无止境x
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2020-08-09 03:41
计算机视觉
计算机视觉
论文解读:医学影像中的注意力机制
138555896Multi-scaleself-guidedattentionformedicalimagesegmentation该论文的方法为2019年发布的在CHAOSMRIDataset上进行
医学图像分割
的最优方法
Charmve
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2020-08-07 11:13
深度学习
计算机视觉
人工智能
深度学习
机器学习
推荐系统
itk中的花式数据切割(一)
当遇到纷乱复杂的患者病例,
医学图像分割
这段爱情成了一个永远不可能完成的偶遇。
winston600
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2020-08-05 16:02
ITK医学图像处理
目录-
医学图像分割
与配准(ITK初步分册)
1欢迎1.1团体机构1.2如何学习1.3软件组织1.3.1获取软件1.4ITK下载1.4.1下载发行的版本1.4.2从CVS下载1.4.3加入MailingList1.4.4目录结构1.4.5文献1.4.6数据1.5ITK团体和服务1.6ITK的主要历史2安装2.1ITK设置2.1.1CMake准备2.1.2ITK设置2.2开始使用ITK3系统概述3.1系统组织3.2系统基本概念3.2.1范型编程
小登徒子
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2020-08-05 16:30
[论文阅读]Multi-scale guided attention for medical image segmentation
用于像素方式识别的学习到的特征表示的辨别力可能不足以用于一些具有挑战性的任务,例如
医学图像分割
。
gefeng1209
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2020-08-05 16:26
医学图像分割
基于FCN的
医学图像分割
(1)
上一篇文章还是基于CNN的人脸性别识别,但是这一篇直接啥都变了,这是为啥呢。。。因为我老板说了,学习CNN只是为了热身,真正想让学的是FCN,是的,也就是用来分割的FCN。好吧,我也只能听命。FCN的代码网上都有,我也是直接借鉴的,这里不多说,这篇文章主要记录一下我在调参路上的艰辛旅程。首先我先记录一下我所搜集的所有可能有助于对抗过拟合的方法(是的,因为我的数据集较小,只能从别的方面下手):1、参
xiaogao556
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2020-08-03 08:22
个人经验
U_Net(Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation)学习笔记
U_net卷积网络架构15年由http://lmb.informatik.uni-freiburg.de/该实验室提出的(作者不认识),主要是为了解决
医学图像分割
问题。
best-too
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2020-08-03 02:51
【图像分割应用】
医学图像分割
(一)——脑区域分割
从本周开始,新专栏《图像分割应用》就跟大家见面了。本专栏主要介绍图像分割在各个领域的应用、难点、技术要求等常见问题。本文是专栏《图像分割应用》的第1篇文章,首先来聊聊医学领域的图像分割之一:脑区域分割。作者|孙叔桥编辑|言有三1任务分析医学领域中,为了满足病情诊断、治疗方案制定等需求,常常需要对病人进行扫描,从而确定各内部器官的情况。深度学习方法出现以前,这个过程主要是由医生直接完成。尽管成熟医生
有三AI
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2020-07-30 22:02
【图像分割应用】
医学图像分割
(二)——心脏分割
本文我们就来看看
医学图像分割
之心脏分割。作者&编辑|孙叔桥1任务分析心脏是我们身体内的一个重要器官,拥有一个健康、稳定工作的心脏是我们探索、创造和感知世界的必要条件。然而,各种各样的
有三AI
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2020-07-30 22:50
【图像分割应用】
医学图像分割
(三)——肿瘤分割
这是专栏《图像分割应用》的第3篇文章,本专栏主要介绍图像分割在各个领域的应用、难点、技术要求等常见问题。肿瘤的分割是医学图像分析领域的一个重要内容,相比较前面提到过的脑区域分割和心脏分割,肿瘤分割任务由于个体间形状、纹理等差异大,从而实现更加困难。本文就来分析一下,肿瘤分割任务。作者&编辑|孙叔桥1任务分析在传统医学诊断中,专家的判断几乎是一个决定性的考量因素。即使在深度学习和人工智能快速发展的今
有三AI
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2020-07-30 20:46
nnU-Net: 基于U-Net
医学图像分割
技术的自适应框架
**nnU-Net:基于U-Net
医学图像分割
技术的自适应框架**https://arxiv.org/pdf/1809.10486.pdf作者:FabianIsensee提要U-Net于2015年推出。
QuantMess
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2020-07-30 04:33
AI
unet网络结构为什么适用于
医学图像分割
任务
一、医学图像的特点医学图像边界模糊、梯度复杂,需要较多的高分辨率信息人体内部结构相对固定,分割目标在人体图像中的分布很具有规律,语义简单明确,低分辨率的信息就可以简单定位二、unet网络结构适用的原因对于unet网络结构可以看这篇博文unet网络结构说明及keras实现详解这里需要说明一下,unet的下采样过程,是从高分辨率(浅层特征)到低分辨率(深层特征)的过程。unet的特点就是通过上采样过程
努力增重的贪吃熊
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2020-07-30 03:24
计算机视觉
U-Net图像语义分割实战:训练自己的数据集
U-Net是一种基于深度学习的图像语义分割方法,尤其在
医学图像分割
中表现优异。
bjcc81227
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2020-07-29 17:37
图像分割与三维重建
.
医学图像分割
:根据需要选择一定的特征量或指定特定的测量准则来检测图像中不同区域的一致性,根据检测出来的区域一致性将图像区别成不同区域,从而可以更加方便地进行进一步的分析和理解。.
丶沉默
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2020-07-28 15:37
图像分割与三维重建
U-Net 和 ResNet:长短跳跃连接的重要性(生物
医学图像分割
)
本文为AI研习社编译的技术博客,原标题:Review:U-Net+ResNet — TheImportanceofLong&ShortSkipConnections(BiomedicalImageSegmentation)作者|SHTsang翻译|斯蒂芬二狗子校对|酱番梨审核|约翰逊·李加薪整理|立鱼王原文链接:https://medium.com/datadriveninvestor/revie
AI研习社
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2020-07-28 08:22
[深度学习从入门到女装]Few-shot 3D Multi-modal Medical Image Segmentation using Generative Adversarial Learning
Few-shot3DMulti-modalMedicalImageSegmentationusingGenerativeAdversarialLearning这是一篇使用GANs进行semi-supervised3D多模态
医学图像分割
的论文对于
炼丹师
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2020-07-28 04:03
深度学习
CVPR 2020 论文大盘点-语义分割篇
图像分割应用广泛,在CVPR2020论文中所占比例很高,可说是一大热门,有110多篇相关论文,本文盘点CVPR2020所有语义分割(SemanticSegmentation)相关论文(不含实例分割、全景分割、
医学图像分割
我爱计算机视觉
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2020-07-28 04:57
U-net代码实现CPU版本——深度学习初学可在自己笔记本上尝试
U-net研一上课程比较多,这次寒假在家时间有点长,尝试复现一些代码,也为大家提供一些参考意义:利用少量数据集进行训练测试,为
医学图像分割
做出很大贡献代码地址:U-net-without-GPU代码源自这个博客
DJ_SIGS
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2020-07-27 16:55
V-Net、U-net、AttentionGatedVNet
论文贡献:第一,3D图像分割end2ent模型(基于3D卷积),用于MRI前列腺容积
医学图像分割
。第二,新的目标函数,基于Dicecoefficient。
JimmyChoo
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2020-07-13 23:51
深度学习
V-Net:
医学图像分割
V-Net:
医学图像分割
V-Net:
医学图像分割
引言网络结构训练参考V-Net:
医学图像分割
引言卷积网络在计算机视觉和医学图像分析领域有了很广泛的应用。
xholes
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2020-07-13 22:01
机器学习
[论文翻译]V-Net:Fully Convolutional Neural Networks for Volumetric Medical Image Segmentation
论文下载:地址V-Net:FullyConvolutionalNeuralNetworksforVolumetricMedicalImageSegmentationV-Net:用于三维
医学图像分割
的全卷积神经网络
玖零猴
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2020-07-13 19:46
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论文翻译与解读
#
医学影像分割
运用图像处理解决基于MRI的脑肿瘤图像分割问题
电子科技大学格拉斯哥学院2017级谭茗珊1.背景:
医学图像分割
技术的发展是一个从人工分割到半自动分割和自动分割的逐步发展过程。早期的图像分割完全是靠人工完成的。
333。0.0
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2020-07-13 11:29
电工小白
CVPR 2020 论文大盘点-医学影像处理识别篇
本文盘点相关论文,总计19篇,其中:
医学图像分割
6篇医学图像检测2篇医学图像配准2篇MRI重建2篇分类2篇细胞跟踪1篇医学影像插值1篇数据保护的模型训练1篇超分辨率1篇CT血管标记1篇其中,罗格斯大学等发表的
我爱计算机视觉
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2020-07-13 08:42
【图像分割应用】
医学图像分割
(二)——心脏分割
本文我们就来看看
医学图像分割
之心脏分割。作者&编辑|孙叔桥1任务分析心脏是我们身体内的一个重要器官,拥有一个健康、稳定工作的心脏是我们探索、创造和感知世界的必要条件。然而,各种各样的
言有三
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2020-07-13 05:00
医学图像分割
多目标分割(多分类)实践
文章目录1.数据集2.数据预处理3.代码部分3.1训练集和验证集划分3.2数据加载和处理3.3One-hot工具函数3.4网络模型3.5模型权重初始化3.6损失函数3.7模型评价指标3.8训练3.9模型验证3.10实验结果1.数据集来自ISICDM2019临床数据分析挑战赛的基于磁共振成像的膀胱内外壁分割与肿瘤检测数据集。(原始数据)(groundtruth)灰度值:灰色128为膀胱内外壁,白色2
LYNNzZ361
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2020-07-13 02:33
图像分割
医学图像分割
知识点总结
一、血管造影技术1.1、数字减影血管造影(DSA)相比于其他常规造影技术成像的图像,整体血管结构更加清晰、直观,背景噪声较少,对于一些精细血管都能较为准确的显示。特别适用于大血管的检查,对冠状动脉也是最好的成像方法之一。1.2、基于超声的经颅多普勒成像(TCD)能够测量相当重要的血液动力学信息。1.3、磁共振血管造影(MRA)图像清晰,血管的细微结构显示好、空间分辨率高,但是细小血管的灰度与周围脑
Ckname
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2020-07-13 00:17
【图像分割应用】
医学图像分割
小总结
本专栏的第一个板块
医学图像分割
中从具体应用出发,介绍了脑分割、心脏分割和肿瘤分割三个问题,本文就总结一下现阶段
医学图像分割
中该知道的内容。
言有三
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2020-07-12 22:16
【图像分割应用】
医学图像分割
(三)——肿瘤分割
这是专栏《图像分割应用》的第3篇文章,本专栏主要介绍图像分割在各个领域的应用、难点、技术要求等常见问题。肿瘤的分割是医学图像分析领域的一个重要内容,相比较前面提到过的脑区域分割和心脏分割,肿瘤分割任务由于个体间形状、纹理等差异大,从而实现更加困难。本文就来分析一下,肿瘤分割任务。作者&编辑|孙叔桥1任务分析在传统医学诊断中,专家的判断几乎是一个决定性的考量因素。即使在深度学习和人工智能快速发展的今
言有三
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2020-07-12 22:16
【
医学图像分割
】Semi-Supervised Brain Lesion Segmentation with an Adapted Mean Teacher Model
这是一篇2019IPMI使用半监督学习进行
医学图像分割
的文章,文章的主要思想就是使用MeanTeacherNetwork和Studentnetwork进行学习,然后提高性能,主要的贡献在于提出了一个一致性损失去利用未标记的数据
Glory_g
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2020-07-12 20:20
Paper_Reading
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