单细胞聚类第25页

单细胞多样本整合之harmony

GSE1175701.下载和读取数据rm(list=ls())library(stringr)library(Seurat)library(dplyr)f=dir("GSE117570_RAW/");f##[1]"GSM3304007_P1_Tumor_processed_data.txt.gz"##[2]"GSM3304011_P3_Tumor_processed_data.txt.gz"##[

小洁忘了怎么分身·2023-11-24 09:46

高中生物知识31个顺口溜+35个重要概念！速记，学霸必备

2.细胞的结构中有关细胞膜的记忆线叶双(线粒体、叶绿体有双层膜)无心糖(没有膜结构的是中心体和核糖体)3.原核生物、真核生物中易混的单细胞生物区分记忆a.原核生物：一(衣原体)支(支原体)细(细菌)蓝(

豪爵吸金ing·2023-11-24 09:06

[python] 使用scikit-learn工具计算文本TF-IDF值（转载学习）

在文本聚类、文本分类或者比较两个文档相似程度过程中，可能会涉及到TF-IDF值的计算。这里主要讲述基于Python的机器学习模块和开源工具：scikit-learn。

彩虹下的天桥·2023-11-24 06:29

NUAA模式识别实验报告

K-均值算法1.算法原理概念K-均值（K-Means）算法是典型的基于距离的聚类算法，采用距离作为相似性的评价指标，即认为两个对象的距离越近，其相似度就越大。

阿迪不想上班·2023-11-24 06:30

NUAA数据融合实验课报告

数据融合实验报告聚类算法-K-means1.算法原理概念K-均值（K-Means）算法是典型的基于距离的聚类算法，采用距离作为相似性的评价指标，即认为两个对象的距离越近，其相似度就越大。

阿迪不想上班·2023-11-24 06:30

基于Java的文本聚类技术及应用

文本聚类是一种将相似文本分组的技术，它在自然语言处理领域具有广泛的应用。在本文中，我们将介绍基于Java的文本聚类技术及其应用，并提供相应的代码示例。

ByteWhisper·2023-11-24 06:49

TensorFlow实战教程（三十五）-VS Code配置Python编程和Keras环境及手写数字识别（基础篇）

前一篇文章利用Keras构建无监督学习Autoencoder模型并实现聚类分析。

张志翔的博客·2023-11-24 04:34

聚类笔记/sklearn笔记：Affinity Propagation亲和力传播

1算法原理1.1基本思想将全部数据点都当作潜在的聚类中心(称之为exemplar)然后数据点两两之间连线构成一个网络(相似度矩阵)再通过网络中各条边的消息(responsibility和availability

UQI-LIUWJ·2023-11-24 02:08

机器学习/sklearn 笔记：K-means,kmeans++,MiniBatchKMeans

1K-means介绍1.0方法介绍KMeans算法通过尝试将样本分成n个方差相等的组来聚类，该算法要求指定群集的数量。它适用于大量样本，并已在许多不同领域的广泛应用领域中使用。

UQI-LIUWJ·2023-11-24 02:37

NBIS系列单细胞转录组数据分析实战（二）：数据降维可视化

第二节：数据降维可视化加载所需的R包和质控过滤后的数据首先，我们加载分析所需的R包和上一节中质控过滤后的数据集。#加载所需的R包suppressPackageStartupMessages({library(Seurat)library(cowplot)library(ggplot2)library(scran)})#加载质控过滤后的数据alldata<-readRDS("data/results

Davey1220·2023-11-24 01:30

天猫用户重复购买预测——数据探索

天猫用户重复购买预测——数据探索1.理论1.1缺失数据处理1.2不均衡样本1.2.1随机欠采样1.2.2随机过采样1.2.3基于聚类的过采样方法1.2.4SMOTE算法1.2.5基于数据清洗的SMOTE1.3

Rocket,Qian·2023-11-24 01:44

week15 Kmeans和MFC GDI入门

K-meansK-means算法是集简单和经典于一身的基于距离的聚类算法，采用距离作为相似性的评价指标，即认为两个对象的距离越近，其相似度就越大。该算

吃醋不吃辣的雷儿·2023-11-24 00:40

Sklearn实践——利用Scikit-learn进行机器学习模型构建和评估

它提供了丰富的工具和函数，用于各种机器学习任务，如分类、回归、聚类和模型评估等。本文将介绍Sklearn的基本用法和核心功能，通过实例演示如何使用Sklearn进行机器学习模型构建和评估。

非著名程序员阿强·2023-11-23 17:55

机器学习算法——聚类算法

目录1.概述2.K-MEANS算法2.1工作流程2.2代码实践1.概述聚类算法是一种无监督学习方法，用于将数据集中的对象分组或聚集成具有相似特征的集合，该集合被称为簇(cluster)。

哈密瓜Q·2023-11-23 16:52

Fuzzy c-means

Fuzzyc-means模糊C-均值聚类算法：是一种模糊聚类算法，是K均值算法聚类的推广形式，隶属度取值为[0,1]区间内的任意一个数，提出的基本依据是“类内加权误差平方和最小化”准则。

孤嶋·2023-11-23 16:46

论文阅读“Contrastive and attentive graph learning for multi-view clustering”

etal.Contrastiveandattentivegraphlearningformulti-viewclustering[J].InformationProcessing&Management,2022,59(4):102967.摘要导读基于图的多视图聚类旨在利用多视图图信息来提供聚类解决方案

掉了西红柿皮_Kee·2023-11-23 15:30

资源盘点：有用的社交网络分析、链接分析和可视化软件

WGH100817·2023-11-23 15:55

神奇的小球藻（功效篇）

来源：《绿藻食疗网》之前跟大家介绍了有“营养之王”和“排毒圣品”的单细胞植物—小球藻，或许有人会问小球藻真的有这么神奇吗？

jocelyn_wing·2023-11-23 14:57

胶质母细胞瘤免疫亚型分析+免疫组化发8+分SCI

本研究作者对单细胞转录组和bulk转录组数据集进行分析，鉴定到了一个新的GBM细胞亚型，随后构建的11-基因分类器有助于将GBM划分为对预后和抗PD-1治疗效果不同的亚组。

JUpter_·2023-11-23 13:59

分享-Spss下载含spss25.spss26.spss27等版本

统计分析：SPSS27支持多种统计方法，包括描述性统计、方差分析、回归分析、聚类分析、因子分析等。数据可视化：SPSS27可以生成多种图表，如条形图、饼图、散点图、箱线图等，

榕先生·2023-11-23 10:46

vmware两台服务器虚拟成一台,VMware使两台windows虚拟机能够互相ping通

K-means聚类算法聚类分析(英语:Clusteranalysis,亦称为群集分析)K-means也是聚类算法中最简单的一种了,但是里面包含的思想却是不一般.最早我使用并实现这个算法是在学习韩爷爷那本数据挖掘的书中

指尖流逝先森·2023-11-23 09:26

非因解读 | Multiplex immunofluorescnece-多重免疫荧光结合单细胞蛋白组技术探索肿瘤微环境

Multipleximmunofluorescence-多重免疫荧光结合单细胞蛋白组技术探索肿瘤微环境技术背景：解析组织原位蛋白表达谱信息，并在单细胞层面进行深入的全方位数据解读已经成为了肿瘤微环境研究的下一个热门领域

FynnBio·2023-11-23 09:22

为什么受伤的总是你？因为你“单蠢”了啊！

单，就是简单，就像单细胞动物，伤到头了抱头，伤到脚了抱脚，只有动物的本能反应。

何初见·2023-11-23 07:24

基于模型的聚类和R语言中的混合高斯模型

聚类是一种常用的数据分析方法，用于将相似的数据点归为一类。而混合高斯模型是一种常用的概率模型，用于对数据进行建模和聚类。在本文中，我们将介绍基于模型的聚类方法，并使用R语言中的混合高斯模型进行实现。

领域征途探险·2023-11-23 07:51

java电影推荐系统_基于Mahout的电影推荐系统

经典算法包括聚类、分类、协同过滤、进化编程等等，并且，在Mahout的最近版本中还加入了对ApacheHadoop的支持，使这些算法可以更高效的运行在云计算环境中。2.Taste简介T

语文乌托邦·2023-11-23 05:02

单细胞36计之18擒贼擒王---单细胞与空间转录组整合

与scRNA-seq参考整合为了促进Slide-seq数据集的细胞类型注释，我们利用了由Saunders*，Macosko*等人制作的现有小鼠单细胞RNA-seq海马数据集。2018。

Seurat_Satija·2023-11-23 05:41

【人工智能Ⅰ】8-回归 & 降维

【人工智能Ⅰ】8-回归&降维8-1模型评价指标分类任务准确率、精确率与召回率、F值、ROC-AUC、混淆矩阵、TPR与FPR回归任务MSE、MAE、RMSE无监督任务（聚类）兰德指数、互信息、轮廓系数回归任务的评价指标

MorleyOlsen·2023-11-23 04:46

基于情感分析+聚类分析+LDA主题分析对服装产品类的消费者评论分析

如果文章对你有帮助的话，欢迎评论点赞收藏加关注+目录1.项目背景2.数据集介绍3.技术工具4.实验过程4.1加载数据4.2数据预处理4.3数据可视化4.4情感分析4.5相关性分析4.6特征重要性分析4.7聚类分析

艾派森·2023-11-23 01:31

机器学习——周志华_笔记

机器学习——周志华_笔记机器学习——周志华_笔记机器学习——周志华_笔记神经网络介绍支持向量机SVM介绍贝叶斯分类器EM算法集成学习聚类降维与度量学习特征选择与稀疏学习计算学习理论半监督学习概率图模型强化学习神经网络介绍神经网络介绍

Pandy Bright·2023-11-23 00:44

聚类——基于机器学习_周志华

上篇主要介绍了一种机器学习的通用框架–集成学习方法，首先从准确性和差异性两个重要概念引出集成学习“好而不同”的四字真言，接着介绍了现阶段主流的三种集成学习方法：AdaBoost、Bagging及RandomForest，AdaBoost采用最小化指数损失函数迭代式更新样本分布权重和计算基学习器权重，Bagging通过自助采样引入样本扰动增加了基学习器之间的差异性，随机森林则进一步引入了属性扰动，最

Pandy Bright·2023-11-23 00:13

用Python进行无监督学习的几种最热门的聚类算法

本文介绍用Python进行无监督学习的几种聚类算法，包括K-Means聚类、分层聚类、t-SNE聚类、DBSCAN聚类等。无监督学习是机器学习技术中的一类，用于发现数据中的模式。

妄心xyx·2023-11-22 21:08

【PCL】PCL点云库介绍及VS环境配置

文章目录PCL介绍WindowsPCL环境配置UbuntuPCL环境配置PCL介绍PCL是跨平台点云处理库，用来点云可视化、分割、聚类等应用。

DevFrank·2023-11-22 19:28

跟着Cell学单细胞转录组分析(四):单细胞转录组测序UMAP降维聚类

KS科研分享与服务·2023-11-22 15:15

[Spark版本更新]--2.3.0发行说明（二）

3181]-使用Huber估计器添加鲁棒回归算法·[SPARK-4131]-支持“通过查询将数据写入文件系统”·[SPARK-12139]-Hive查询的REGEX列规范·[SPARK-14516]-聚类评估器

浅汐王·2023-11-22 13:54

SPSS快速聚类

目录1.快速聚类2.SPSS实现3.结果分析1.快速聚类快速聚类是一种针对大规模数据集的聚类方法，它能够快速地对数据进行划分和聚类。常见的快速聚类算法有K-Me

抱抱宝·2023-11-22 12:17

聚类系列(一)——什么是聚类？

Daisy_JuJuJu·2023-11-22 12:13

SPSS系统聚类

目录1.系统聚类2.SPSS实现3.结果分析1.系统聚类系统聚类是一种按照一定的顺序将数据点逐渐合并成聚类的方法。它不需要预先确定聚类的数目，而是通过构建聚类树

抱抱宝·2023-11-22 12:40

膜翅目—递弱代偿

膜翅目：蜂、蚂蚁（就差看电视了）粒子-原子-分子-大分子-亚细胞（单细胞）-多细胞-人类晚级生物存态弱演变量（道）-感知失真（假象）-伪在危在代偿位相分化藕合中级生物社会：亲缘社会（性）-体质残化社会（

上下_求索·2023-11-22 09:02

单细胞测序分析肺部分实性结节的细胞生态系统

2022年2月，北京大学人民医院王俊院士团队在ClinicalandTranslationalMedicine发表了题为“Single-cellRNAsequencingrevealsthemulti-cellularecosystemindifferentradiologicalcomponentsofpulmonarypart-solidnodules”的研究成果。通过比较肺腺癌早期患者部分实

晶典教你玩转科研·2023-11-22 08:15

密度散点图的绘制（画图基本知识）

今天我们的任务是实现下面这张图图片.png多样本整合分析降维聚类之后，每个样本分布的二维空间密度图，可以显示每个样本在空间上的分布差异，体现的是样本之间的差异。

单细胞空间交响乐·2023-11-22 08:39

Linux下安装Foldseek并从蛋白质的PDB结构中获取 3Di Token 和 3Di Embedding

的作者)开发的一款用于快速地从大型蛋白质结构数据库中检索相似结构蛋白质的工具，可以用于计算两个蛋白之间的结构相似性，可以用于蛋白质结构比对，也可以与MMseqs2和Linclust结合实现基于结构对蛋白质聚类

@ZyuanZhang·2023-11-22 07:15

LeGO-LOAM 复现（Ubuntu18.04、ROS Melodic、gtsam）

简单总结起来，LeGO-LOAM的主要特点有以下三点：（1）对地面做了分割，减少了特征搜索范围（2）提取特征之前做了聚类，提高了特征质量（

Demo_xxx·2023-11-22 04:11

论文阅读“ZINB-based Graph Embedding Autoencoder for Single-cell RNA-seq Interpretations”

LuY,WangY,etal.ZINB-basedGraphEmbeddingAutoencoderforSingle-cellRNA-seqInterpretations.AAAI2022.摘要导读单细胞

掉了西红柿皮_Kee·2023-11-22 03:22

【学习笔记】机器学习基础--逻辑回归

学习笔记】机器学习基础--线性回归_一无是处le的博客-CSDN博客【第一章代码解释】【线性回归】原生numpy实现波士顿房价预测_一无是处le的博客-CSDN博客【第三章】传统机器学习【先不写】【第四章】聚类算法

一无是处le·2023-11-22 01:23

聚类算法（knn流程，评估方法，特征选择、主成分分析）总结

聚类算法聚类算法分类：粗聚类、细聚类一种典型的无监督学习算法，主要用于将相似的样本自动归到一个类别中计算样本和样本之间的相似性，一般使用欧式距离sklearn.cluster.KMeans(n_clusters

jialun0116·2023-11-21 22:26

单细胞EB病毒基因检测技术助力鼻咽癌感染机制研究

鼻咽癌（Nasopharyngealcarcinoma,NPC）是一种发生于鼻咽黏膜柱状上皮的恶性肿瘤，绝大多数为鳞状细胞癌。常见临床症状为鼻塞、涕中带血、耳闷堵感、听力下降、复视及头痛等。全球80%鼻咽癌发生在中国，60%发生在南方特别是广东，故称作“中国癌“又叫“广东癌“。鼻咽解剖结构罹患鼻咽癌的名人罹患鼻咽癌的名人香港著名导演陈木胜，以执导警匪片著称，知名的作品包括《双雄》《新警察故

生物医学小站·2023-11-21 22:29

机器学习算法(SVM、决策树、k均值聚类等)

机器学习算法(SVM、决策树、k均值聚类等)1.SVM1.1线性支持向量机假设我们有两类数据，分别用圆形和方块表示。

溜溜真6·2023-11-21 21:45

单细胞测序+免疫，还可以这样做！

近些年，免疫治疗疗效的影响因素一直是研究热点，单细胞测序也是越来越受欢迎，这篇文章就很好的将二者进行了结合，从细胞-细胞互作的角度去分析肿瘤对抗PD-1治疗不同的应答机制。

概普生信·2023-11-21 21:50

深入浅出理解索引结构

微软的SQLSERVER提供了两种索引：聚集索引（clusteredindex，也称聚类索引、簇集索引）和非聚集索引（nonclusteredindex，也称非聚类索引、非簇集索引）。

新鲜鱼排·2023-11-21 19:50

空间组数据和单细胞数据的相关性分析（Seurat）2022-05-20

黄甫一·2023-11-21 19:47

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