基因组信息学

信息学奥赛一本通2067：【例2.5】圆

2067：【例2.5】圆时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:98781通过数:53827【题目描述】输入半径r，输出圆的直径、周长、面积，数与数之间以一个空格分开，每个数保留小数点后4位。【输入】输入半径。【输出】如题述。数与数之间以一个空格分开。【输入样例】1.0【输出样例】2.00006.28323.1416思路：思路很简单啊直径（d）=2r周长=πd面积=π*r^2直接计算
ptyz306·2024-01-08 06:05

信息学奥赛一本通2068：【例2.6】鸡兔同笼

2068：【例2.6】鸡兔同笼时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:98496通过数:52425【题目描述】数学中经典的“鸡兔同笼”问题，已知头共x个，脚共y只，问笼中的鸡和兔各有多少只?【输入】头和脚的数量。【输出】鸡和兔各自数量。一个空格隔开。【输入样例】3090【输出样例】1515思路：小学的鸡兔同笼会算吧？假设全是鸡，就会有2x个脚（x只鸡）但事实上，现实有y只脚，2x里y
ptyz306·2024-01-08 06:05

信息学奥赛一本通1037：计算2的幂

1037：计算2的幂时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:112037通过数:63499【题目描述】给定非负整数nn，求2n2n的值，即22的nn次方。【输入】一个整数nn。0≤nusingnamespacestd;intmain(){longlongn,a;cin>>n;a=pow(2,n);cout<<a;return0;}
ptyz306·2024-01-08 06:35

信息学奥赛一本通1011：甲流疫情死亡率

1011：甲流疫情死亡率时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:154294通过数:96248【题目描述】甲流并不可怕，在中国，它的死亡率并不是很高。请根据截止2009年12月22日各省报告的甲流确诊数和死亡数，计算甲流在各省的死亡率。【输入】输入仅一行，有两个整数，第一个为确诊数，第二个为死亡数。【输出】输出仅一行，甲流死亡率，以百分数形式输出，精确到小数点后3位。【输入样例】10
ptyz306·2024-01-08 06:01

【文献分享】第一个水稻稻瘟病基因图谱绘制

写在前面这是第一篇系统讲述稻瘟病的文献，包括它的基因组、生活史、侵染变化以及对应植物的防卫反应，引用量高达到1030次，基本上发表和稻瘟病相关的文章都会引用这篇文献，就像做植物免疫的都会引用zig-zagmodel
巩翔宇Ibrahimovic·2024-01-08 06:44

SCI 文章中基因组的突变信号（maftools）

并做了相关的定义：细胞在成长过程中，基因组不断受到内源性和外源性DNA损伤的威胁，正是由于这些威胁，使得细胞基因组不断发生变化，并最终发生一些突变的积累。
90066456ace6·2024-01-08 03:38

爱的两面

学校组织信息学奥赛，班级负责统计名单。头一天往群里发了信息，应者了了。第二天把名单正式发到群里的时候，一位家长让我给孩子报上名。同学是女孩，成绩很好，班级中的很多事情都能主动参与。
龙之崛起·2024-01-08 01:19

全基因组CNV分析3. 深入CNVkit分析管道

值得一提的是CNVkit设计的出发点是可以针对hybridization原理的NGS数据进行分析，把on-target和off-target区域分开来考虑。但是我们的目标是WGS数据，不存在什么off-target，所以分析主线就是一条直线(无视左上角的Targetregions和Anti-targetregions)。就和前文快速上手所介绍的流程一样，bam-cnn(Bincoverages)-
Jason数据分析生信教室·2024-01-07 23:31

跟着Briefings in Bioinformatics学数据分析：植物线粒体基因组组装流程GSAT初步尝试

论文Mastergraph:anessentialintegratedassemblymodelfortheplantmitogenomebasedonagraph-basedframeworkhttps://academic.oup.com/bib/article-abstract/24/1/bbac522/6854450?redirectedFrom=fulltext&login=falseb
小明的数据分析笔记本·2024-01-07 22:52

2024年天津理工大学中环信息学院专升本专业考试准考证及考前提醒

2024年天津理工大学中环信息学院高职升本科专业课考试考前提醒考试时间考试时间为2024年1月8日上午9:00-11:00，9:00开考后禁止进入考场参加考试，建议考生提前30分钟到达考点。
天津专升本·2024-01-07 21:04

C语言高精度算法（已更新加，减，乘，阶乘）

ps：本文知识来源于b站麦克老师讲算法、信息学万老师等，每个会尽量附上例子o(╥﹏╥)o。目前只写了加法减法乘法，后面等我几天哈哈哈o(╥﹏╥)o高精度加法原理简单来说就是将
爱写代码的小鱼·2024-01-07 21:54

利用基因组信息改善牲畜 -综述（2019）

这边综述从家畜物种（即牛、绵羊、山羊、猪、家禽和鲑鱼）的可用基因组资源的状况，以及如何使用这些资源来加速缺陷致病基因的发现和管理，以提高准确性并扩展GS的范围，确定基因组编辑策略的方向，并开发利用日益广泛可用的基因组信息的新应用
Hello育种·2024-01-07 20:56

【动植物研究动态】20220918文献解读

s/5NPyf7CQvvu0tRmjxye5LwInternationalJournalofMolecularSciences（IF=6.208）|中科院植物研究所孙小芹：“常香粳1813“染色体水平基因组揭示香粳和非香粳稻间的基因组变异
iBioinformatics·2024-01-07 19:25

微生物基因组产品常见问题解答

“…………今天我们就大家提出的微生物基因组问题做十问十答，解决你的燃眉之急。Q1：GC-depth图是怎么做出来的？有什么意义？
ee00dc6faab7·2024-01-07 14:41

信息学奥赛一本通：2020：【例4.5】第几项

题目描述】对于正整数n,m，求s=1+2+3……+n，当加到第几项时，s的值会超过m？【输入】输入m。【输出】输出n。【输入样例】1000【输出样例】45【提示】【数据范围】对于全部数据：1≤m≤40000。#includeusingnamespacestd;intmain(){intm,sum=0,n=0;cin>>m;while(sum
芷水无棱·2024-01-07 13:13

信息学奥赛一本通：2021：【例4.6】最大公约数

【题目描述】求两个正整数m，n的最大公约数。【输入】输入m，n。【输出】m，n的最大公约数。【输入样例】46【输出样例】2【提示】【数据范围】对于全部数据：m,n<4000000。
芷水无棱·2024-01-07 13:13

信息学奥赛一本通：1083：计算星期几

【题目描述】假设今天是星期日，那么过天之后是星期几？【输入】两个正整数a，b，中间用单个空格隔开。0usingnamespacestd;intmain(){inta,b,day=1;cin>>a>>b;for(inti=0;i
芷水无棱·2024-01-07 13:43

信息学奥赛一本通：1084：幂的末尾

【题目描述】幂的末33位数是多少？【输入】两个正整数a，b。1≤a≤100，1≤b≤10000。【输出】从高位到低位输出幂的末三位数字，中间无分隔符。若幂本身不足三位，在前面补零。【输入样例】72011【输出样例】743#includeusingnamespacestd;intmain(){inta,b,fx=1;cin>>a>>b;for(inti=0;i=100){cout=10){cout<
芷水无棱·2024-01-07 13:42

真核微生物基因组质量评估工具EukCC的安装和详细使用方法

介绍：GitHub-EBI-Metagenomics/EukCC:Tooltoestimategenomequalityofmicrobialeukaryotes安装：docker：dockerpullmicrobiomeinformatics/eukcc推荐conda环境：condainstall-cconda-forge-cbioconda"eukcc>=2"#mamba更快mambainst
小果运维·2024-01-07 12:18

Megahit, metaSPAdes, metabat2, GTDB-tk, checkM

参考https://zhuanlan.zhihu.com/p/470457258、德布鲁因图和OLC组装基因组-简书(jianshu.com)、[算法学习1]基因组组装算法DeBruijnGraph-知乎
苦中作乐613·2024-01-07 12:48

一文详解宏基因组组装工具Megahit安装及应用

要点Megahit简介Megahit的基本组装原理Megahit的安装和使用Megahit实战hello，大家好，今天为大家带来关于宏基因组组装工具Megahit的超详细安装及应用教程。
JaneMarple️·2024-01-07 12:47

linux+基因组字符替换,IDBA-UD组装基因组简单用法

之前组装基因组一直用另外一个软件：SPAdes，组装效果还不错，但是IDBA的大名早就听说过，所以趁着这次刚那个两个菌的数据，分别用这两个软件组装一下，对比一下效果，在SPAdes的网站上面看到过几个组装软件的对比图
changlei chen·2024-01-07 12:17

宏基因组组装神器-MEGAHIT使用及常见问题

文章目录简介安装和使用常见报错和解决方法输出结果对内存需求样本实际组装时间参考简介宏基因组测序获得海量短片段测序数据，这些数据混合着环境中各种各样的微生物基因组序列，如何恢复出这些微生物基因组序列，基因组组装成为至关重要的一步
Neptuneyut·2024-01-07 12:15

纯二代测序从头组装基因组(基础版）

基因组组装基因组组装一般分为三个层次，contig,scaffold和chromosomes.contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。
wangchuang2017·2024-01-07 12:15

宏基因组：MEGAHIT组装拼接及quast评估

Megahit组装软件很多下面介绍三款组装软件：MEGAHIT下载地址https://github.com/voutcn/megahitgitclonehttps://github.com/voutcn/megahit.gitcdmegahitmake其他两款组装软件下载地址SOAPdenovo下载地址http://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/file
狗蛋儿张·2024-01-07 12:15

iMeta | 青岛华大范广益组基于共标签测序数据的高质量宏基因组组装工具MetaTrass...

点击蓝字关注我们MetaTrass：基于共标签测序数据的人类肠道微生物高质量宏基因组组装工具https://doi.org/10.1002/imt2.46RESEARCHARTICLE●2022年8月15
生信宝典·2024-01-07 12:45

Vamb宏基因组分箱：安装与使用

mkdir~/Software/VambcdVambgitclonehttps://github.com/RasmussenLab/vamb-bmastercdvambpipinstall-e.vamb-hGitHub-RasmussenLab/vamb:Variationalautoencoderformetagenomicbinning使用参考上述官方文档
CAAS_IFR_zp·2024-01-07 12:15

链读测序技术在宏基因组组装研究中的应用

链读测序（Linked-readsequencing）通过将相同的barcode与长DNA片段(10-100kb)的序列连接在一起，能够消除其中的一些错读，从而改进宏基因组组装。
谷禾牛博·2024-01-07 12:44

原创||宏基因组干货分享专题———组装

拿到宏基因组序列之后，首先要进行质控分析，这步的主要目的是去掉接头和低质量序列。质控结束之后，拿到了干净的数据。就要对基因序列进行组装，组装是一个繁琐且耗时久的一个过程。
bioDeep·2024-01-07 12:44

宏基因组序列无参考基因组装工具idba-ud的介绍及详细使用方法

介绍idba-ud工具是一种用于组装无参考基因组的工具，它可以将高通量测序数据转化为基因组序列。它是idba工具的升级版本，专门用于组装多样性的无参考基因组。
小果运维·2024-01-07 12:14

metaSPAdes,megahit,IDBA-UB:宏基因组装软件安装与使用

metaSPAdes,megahit,IDBA-UB是目前比较主流的宏基因组组装软件metaSPAdes安装GitHub-ablab/spades:SPAdesGenomeAssembler#3.15.5
CAAS_IFR_zp·2024-01-07 12:43

Guideseq分析流程

Guideseq是一种检测体内基因编辑脱靶的测序方法，基本原理是CRISPR系统剪切基因组后，在进行基因组修复时可能会将一段设计好的双链DNA，即tag，插入到基因组中，通过tag设计引物可将基因组断裂位点两侧的序列扩增出来建库
WuYankang·2024-01-07 10:44

【保研记录】2023年（24届）SE上岸经历

先开个坑，慢慢填~个人信息学校：某双非专业：软件工程第四轮学科评估：无（对就是没有等级）排名：1/400+竞赛/荣誉：国奖x2，省三好，大英国二，大数省三，蓝桥杯省三等等（水赛一堆，英语的占了一半）科研
李加号pluuuus·2024-01-07 10:59

利用aTRAM定向组装目标序列

在系统发育中，我们往往只需要目标基因来进行系统发育重建，一些数据量大的基因组组装起来非常耗时耗资源，可以使用定向组装的方法来组装我们需要基因。
惊鸿影·2024-01-07 07:19

2022-07-17

发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=68.164推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、作者开发了VASA-seq程序，这是一种能够对单细胞的全长转录组进行测序的新技术，其在可扩展性、敏感性、基因组覆盖率检测方面具有明显的优势
图灵基因·2024-01-07 07:25

2022-05-18

CanDisc|基于复发性癌基因共变异的精准联合疗法图灵基因图灵基因2022-05-1813:24收录于合集#前沿分子生物学技术德克萨斯大学MD安德森癌症中心的科学家报告了一种新型生物信息学平台的开发，
图灵基因·2024-01-07 05:56

TBtools | 全基因组 - 基因密度统计，充实你的图片

摘要两张图总结本文，以方便大家确定是否还有看下去的兴趣写在前面Emmm...今天开放一个旧功能，全基因组基因密度统计。虽然是早前就写好的，但我一直没开放，主要是考虑到这个功能感兴趣或者用得上的人不多。
生信石头·2024-01-07 04:40

信息学奥赛一本通——2065：【例2.2】整数的和

2065：【例2.2】整数的和时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:34527通过数:29553【题目描述】求3个整数的和。输入a、b、c这3个整数，求它们的和。【输入】3个整数。【输出】三个数的和。【输入样例】123【输出样例】6本题无难度直接上代码：#includeusingnamespacestd;intmain(){inta,b,c;cin>>a>>b>>c;coutusi
Minecraft__Him·2024-01-07 01:00

【信息学奥赛】2065：【例2.2】整数的和（C++）

今天来让我们来继续分析信息学奥赛一本通的第十二道题道题，也就是按照题目的要求交换两个数的值。（并且，看了我的文章的人只有少数人点了赞，如果你觉得我写的好，或对你有帮助的话，请点赞！！！并收藏。谢谢！）
信息开发者·2024-01-07 01:00

信息学奥赛一本通1009：带余除法

1009：带余除法时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:177195通过数:122241【题目描述】给定被除数和除数，求整数商及余数。此题中请使用默认的整除和取余运算，无需对结果进行任何特殊处理。【输入】一行，包含两个整数，依次为被除数和除数（除数非零），中间用一个空格隔开。【输出】一行，包含两个整数，依次为整数商和余数，中间用一个空格隔开。【输入样例】103【输出样例】31思路：
ptyz306·2024-01-07 01:58

信息学奥赛一本通1010：计算分数的浮点数值

1010：计算分数的浮点数值时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:175138通过数:108062【题目描述】两个整数aa和bb分别作为分子和分母，既分数abab，求它的浮点数值(双精度浮点数，保留小数点后99位)。【输入】输入仅一行，包括两个整数aa和bb。【输出】输出也仅一行，分数abab的浮点数值（双精度浮点数，保留小数点后99位）。【输入样例】57【输出样例】0.71428
ptyz306·2024-01-07 01:58

信息学奥赛一本通2063：【例1.4】牛吃牧草

2063：【例1.4】牛吃牧草时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:97997通过数:60658【题目描述】有一个牧场，牧场上的牧草每天都在匀速生长，这片牧场可供15头牛吃20天，或可供20头牛吃10天，那么，这片牧场每天新生的草量可供几头牛吃1天？【输入】（无）【输出】如题述，牛的数量。【输入样例】（无）【输出样例】（无）思路：最后算出来是10，输出就好了别问我怎么算的，我也不会
ptyz306·2024-01-07 01:58

信息学奥赛一本通题库2065 【例2.2】整数的和

【题目描述】求3个整数的和。输入a、b、c这3个整数，求它们的和。【输入】3个整数。【输出】三个数的和。【输入样例】123【输出样例】6【题目思路】输入三个整数，求和即可【参考代码】#includeusingnamespacestd;inta,b,c;intmain(){cin>>a>>b>>c;cout<<a+b+c<<endl;return0;}
黑胡发·2024-01-07 01:57

信息学奥赛一本通 1200：分解因数 | OpenJudge NOI 2.2 1751:分解因数

【题目链接】ybt1200：分解因数OpenJudgeNOI2.21751:分解因数【题目考点】1.递归2.深搜【解题思路】解法1：递归由于要求得到的因数分解序列必须是升序的，那么每次分解出的因数必须大于等于上次分解出的因数。递归问题：对整数k进行因数分解，分解出的因数大于等于st的方案数递归关系：对k的每个大于st的因数i，将k分解为：k=i∗(k/i)k=i*(k/i)k=i∗(k/i)的形式
君义_noip·2024-01-07 01:57

信息学奥赛一本通（2065：【例2.2】整数的和）

2065：【例2.2】整数的和时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:194通过数:180【题目描述】求3个整数的和。输入a、b、c这3个整数，求它们的和。【输入】3个整数。【输出】三个数的和。【输入样例】123【输出样例】6【参考代码】#includeintmain(){inta,b,c;scanf("%d%d%d",&a,&b,&c);printf("%d\n",a+b+c);r
橙子教师·2024-01-07 01:57

【信息学奥赛一本通】2065：【例2.2】整数的和

2065：【例2.2】整数的和时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:3075通过数:2645【题目描述】求3个整数的和。输入a、b、c这3个整数，求它们的和。【输入】3个整数。【输出】三个数的和。【输入样例】123【输出样例】6#includeusingnamespacestd;intmain(){inta,b,c;cin>>a>>b>>c;cout<
bfckcqs·2024-01-07 01:26

信息学奥赛一本通 2065：【例2.2】整数的和

【题目描述】求3个整数的和。输入a、b、c这3个整数，求它们的和。【输入】3个整数。【输出】三个数的和。【输入样例】123【输出样例】6#includeusingnamespacestd;intmain(){inta,b,c,s;cin>>a>>b>>c;//输入给定3个整数的值s=a+b+c;//求3个整数的和cout<<s<<endl;return0;}
cataplay·2024-01-07 01:56

信息学奥赛一本通：2065：【例2.2】整数的和

【题目描述】求3个整数的和。输入a、b、c这3个整数，求它们的和。【输入】3个整数。【输出】三个数的和。【输入样例】123【输出样例】6定义三个变量，依次相加。#include#include#includeusingnamespacestd;intmain(){inta,b,m;scanf("%d%d%d",&a,&b,&m);printf("%d",a+b+m);return0;}
阿耨多羅·2024-01-07 01:56

信息学奥赛一本通：1179：奖学金

【题目描述】某小学最近得到了一笔赞助，打算拿出其中一部分为学习成绩优秀的前5名学生发奖学金。期末，每个学生都有3门课的成绩:语文、数学、英语。先按总分从高到低排序，如果两个同学总分相同，再按语文成绩从高到低排序，如果两个同学总分和语文成绩都相同，那么规定学号小的同学排在前面，这样，每个学生的排序是唯一确定的。任务：先根据输入的3门课的成绩计算总分，然后按上述规则排序，最后按排名顺序输出前五名学生的
阿耨多羅·2024-01-07 01:56

信息学奥赛一本通 2065 【例2.2】整数的和

【题目描述】求3个整数的和。输入a、b、c这3个整数，求它们的和。【输入】3个整数。【输出】三个数的和。【输入样例】123【输出样例】6#include#includeusingnamespacestd;intmain(){inta,b,c;cin>>a>>b>>c;cout<<a+b+c<<endl;return0;}
骑兔看夕阳·2024-01-07 01:25
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