基因组信息学

信息学奥赛一本通1957：【12NOIP普及组】质因数分解

1957：【12NOIP普及组】质因数分解时间限制:1000ms内存限制:131072KB提交数:13525通过数:7646【题目描述】已知正整数n是两个不同的质数的乘积，试求出较大的那个质数。【输入】输入只有一行，包含一个正整数n。【输出】输出只有一行，包含一个正整数p，即较大的那个质数。【输入样例】21【输出样例】7【提示】【数据范围】对于60%的数据，6≤n≤1000。对于100%的数据，6
ptyz306·2024-01-13 07:36

bismark 识别甲基化位点-比对篇

bismark软件根据序列的比对情况就可以识别甲基化位点，首先需要对基因组建立索引，建好索引之后，就可以开始比对了。
生信修炼手册·2024-01-13 04:11

基因组编码区的注释

一、注释策略进行注释的三种策略：从头注释(denovoprediction)：通过已有的概率模型来预测基因结构，在预测剪切位点和UTR区准确性较低同源预测(homology-basedprediction)：有一些基因蛋白在相近物种间的保守型搞，所以可以使用已有的高质量近缘物种注释信息通过序列联配的方式确定外显子边界和剪切位点基于转录组预测(transcriptome-basedpredictio
loooop·2024-01-13 03:18

【EI会议征稿】第十届机电一体化与工业信息学国际学术研讨会（ISMII 2024）

第十届机电一体化与工业信息学国际学术研讨会（ISMII2024）202410thInternationalSymposiumonMechatronicsandIndustrialInformatics随着往年九届的成功举办
搞科研的小刘选手·2024-01-12 23:52

用R语言随便编一个模拟fasta序列

在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式），是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。
小贝学生信·2024-01-12 22:31

USACO备考冲刺必刷题 | P5834 MooBuzz

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考学习过程中的题目，记录每一个瞬间。
热爱编程的通信人·2024-01-12 18:38

USACO备考冲刺必刷题 | P2958 Papaya Jungle

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考学习过程中的题目，记录每一个瞬间。
热爱编程的通信人·2024-01-12 18:37

USACO备考冲刺必刷题 | P3405 Cities and States

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考学习过程中的题目，记录每一个瞬间。附上汇总贴：USACO备考冲刺必刷题|汇总-CSDN博客【题目描述】FarmerJohn有若干头奶牛。
热爱编程的通信人·2024-01-12 18:37

USACO备考冲刺必刷题 | P5541 Sleepy Cow Herding

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考学习过程中的题目，记录每一个瞬间。
热爱编程的通信人·2024-01-12 18:34

基因组与群体进化，解析物种进化历程-02

有性繁殖的物种在驯化过程中经历了数百至数千代的同源重组选择，并在基因组中留下了明显的特征。
百迈客生物·2024-01-12 17:58

全基因组关联分析(GWAS)protocol

全基因组关联分析（Genome-wideassociationstudy，GWAS）是应用基因组中数以百万级别的单核苷酸多样性（SingleNucleotidePloymorphism，SNP）作为分子遗传标记
只看不写_nathan·2024-01-12 17:06

创业与人体-06 用表观遗传学重新认识进化

1.表观遗传学在2000年的时候六国的科学家合作完成了人类基因组测序，在这之后科学家们逐渐发现原来的基因遗传理论并不能很好人类遗传中出现的种种现象，于是沃丁顿的获得性遗传
零翼彼方·2024-01-12 16:15

合成生物学之逆天改命：合成基因组

如果基因组代表了你的所有遗传信息，那么一旦你的基因组发生改变，你的命运，甚至你的整个人都会发生彻底改变。逆天改命，听起来像某些周易大师做的事情。不过，我今天说得是，如何科学的逆天改命。
83844babf581·2024-01-12 12:52

分子结构的子结构查询：SMARTS语言

在化学信息学中，有时候我们要确定化学分子是否包含特定的模式（结子构）之前我们已经提及，fingerprint的SMILES字符串经常用来表示分子。
wufeil·2024-01-12 04:56

“编”织未来，“程”就梦想---为什么要走信息学之路

“计算机普及要从娃娃抓起”，这是1984年2月，邓小平在上海视察中国福利会儿童计算机活动中心时说过的一句话。这一句话改变了许多人的一生，揭开了中国近三十年来计算机产业发展的新征程。二十一世纪是信息化时代，信息技术在这个时代飞速发展，编程和人工智能教育已经逐步落地，编程也否需要从娃娃抓起？让我们看看IT界的顶级精英们是从什么时候开始学习编程的？乔布斯（苹果公司联合创办人）11岁开始编程，成了一代传奇
书一·2024-01-12 04:53

重复一篇文献的GWAS（二）：用GEMMA跑GWAS

软件使用参考：使用GEMMA进行复杂性状全基因组关联分析(GWAS)https://www.jianshu.com/p/d31404620c9bgithubhttps://github.com/genetics-statistics
TOP生物信息·2024-01-12 01:41

噬菌体

噬菌体的宿主预测：利用细菌的spacers和自己宏基因组测序得到的序列，细菌的spacers建立blast索引，然后使用blastn参数：blastn-short-e1e-5进行比对。
宏病毒组·2024-01-11 18:00

信息学奥赛一本通1013：温度表达转化

1013：温度表达转化时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:147346通过数:89341【题目描述】利用公式C=5×(F−32)÷9C=5×(F−32)÷9(其中CC表示摄氏温度，FF表示华氏温度)进行计算转化,输入华氏温度FF，输出摄氏温度CC，要求精确到小数点后55位。【输入】输入一行，包含一个实数FF，表示华氏温度。（F≥−459.67）（F≥−459.67）【输出】输出一
ptyz306·2024-01-11 17:15

信息学奥赛一本通1015：计算并联电阻的阻值

1015：计算并联电阻的阻值时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:96169通过数:78596【题目描述】对于阻值为r1r1和r2r2的电阻，其并联电阻阻值公式计算如下：R=11r1+1r2R=11r1+1r2。输入两个电阻阻抗大小，浮点型。输出并联之后的阻抗大小，结果保留小数点后22位。【输入】两个电阻阻抗大小，浮点型，以一个空格分开。【输出】并联之后的阻抗大小，结果保留小数点后
ptyz306·2024-01-11 17:15

信息学奥赛一本通1012：计算多项式的值

1012：计算多项式的值时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:133664通过数:86904【题目描述】对于多项式f(x)=ax3+bx2+cx+d和给定的a,b,c,d,x，计算f(x)的值，保留到小数点后7位。【输入】输入仅一行，包含5个实数，分别是x，及参数a、b、c、d的值，每个数都是绝对值不超过100的双精度浮点数。数与数之间以一个空格分开。【输出】输出一个实数，即f(x
ptyz306·2024-01-11 17:45

信息学奥赛一本通1014：与圆相关的计算

1014：与圆相关的计算时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:167892通过数:85008【题目描述】给出圆的半径，求圆的直径、周长和面积。输入圆的半径实数r，输出圆的直径、周长、面积，每个数保留小数点后44位。圆周率取值为3.141593.14159。【输入】输入包含一个实数r（0usingnamespacestd;intmain(){std::ios::sync_with_s
ptyz306·2024-01-11 17:41

狄利克雷卷积及常见函数与莫比乌斯反演

QwQ文章目前没有题目，只有理论知识狄利克雷卷积狄利克雷卷积（DirichletConvolution）在解析数论中是一个非常重要的工具.使用狄利克雷卷积可以很方便地推出一些重要函数和公式，它在信息学竞赛和解析数论中至关重要
溶解不讲嘿·2024-01-11 15:43

基因组变异文件VCF格式详解

这期介绍一下基因组变异结果常见的文件格式VCF。
90066456ace6·2024-01-11 14:43

遗传算法总结（迭代版本2：附带MATLAB例题代码）

它是由一系列基因组成的，每个基因对应着解决方案的一个组成部分。基因（Gene）：基因是染色体中的一个元素，它对应着解决方案的一个特定部分。基因可以是二进制、整数或实数等不同的
CTGU-Yoghurt·2024-01-11 12:31

《未来简史》

如果能在两年前就接触到分子生物学并由此领悟到生命的算法，我一定会选择考生物信息学（青岛大学生物信息学要我我没去）。就像图二《人人都是产品经理》暗示从化学转行到生物医药的我再转行到生物信息学一样。
1379号监听者·2024-01-11 07:16

非负矩阵分解(NMF)的几个相关运用

>非负矩阵分解NMF介绍<本文列出了几项在生物信息学和神经影像学领域中应用NMF分析的研究。应该是最早将NMF运用到微阵列(Microarray)数据上的文章。
懒麻蛇·2024-01-11 02:04

【现代遗传学原理-基因和基因组学】

一、基本概念基因组学：研究基因组结构、功能及表达产物的学科，包括测序、基因组作图、基因组分析。蛋白质组学：研究各种基因组在细胞中全部蛋白质的组成、结构、功能及表达模式的学科。
HuangXinyue1017·2024-01-11 01:46

【MOOC-生物信息学-序列比较】

一、认识序列FASTA格式第一行：“＞”+名称或其他注释第二行及以后：字符串表示序列二、序列的相似性1.序列相似的重要性相似的序列往往起源于同一个共同的祖先序列，它们很可能有相似的空间结构和生物学功能，即相似的序列->相似的结构->相似的功能可用序列相似、结构功能已知的蛋白质推测当前仅知道序列的蛋白质2.一致度与相似度一致度（identity）：如果两个序列（蛋白质或核酸）长度相同，那么它们的一致
HuangXinyue1017·2024-01-11 01:16

CSP-J1世上最全知识点

信息学及计算机史：图灵奖和冯·诺依曼奖是计算机界的顶级奖项，分别由ACM和IEEE设立。图灵和冯·诺依曼都是在信息科学领域做出突出贡献的大神。
学习智者·2024-01-10 23:15

如何从干血斑中提取高质量的基因组DNA？

操作步骤1.请自行准备：无水乙醇、1.5ml离心管。2.取出洗涤液A和洗涤液B，按以下操作：a)洗涤液A：7mL加入3mL无水乙醇；14mL加入6mL无水乙醇，混匀。b)洗涤液B：3mL加入7mL无水乙醇；6mL加入14mL无水乙醇，混匀。3.取1.5ml灭菌离心管1支，加入200μL裂解液和20μL消化液，振荡混匀，再加入3-6片直径6mm干血斑，300rpm振荡8-12分钟，至干血斑滤纸片变白
清风拂面vv·2024-01-10 22:26

2022西湖论剑·安全托管运营服务论坛成功举行

浙江省工商业联合会党组成员、副主席、副会长林建良，浙江省卫生信息学会会长刘小舟，中国信息安全测评中心资深审核专家杨婧婧，浙江大学信息中心主任陈文智，数世咨询创始人兼总经理李少鹏，浙二医院信息中心主任许杰
IT科技那点事儿·2024-01-10 22:48

从单细胞数据分析的最佳实践看R与Python两个阵营的博弈

R与Python，在生物信息学领域的博弈异常激烈。许多生信分析，两个阵营都发展出了自己的方法，比如单细胞数据分析，R有Seurat，Python就有Scanpy。
简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-10 16:22

生物信息学软件：两种风格

生物信息学目前有两种极为不同的手段：一种是基于网络的工具，另一种是基于命令行的工具。基于网络的工具有时也被称为“点击工具”，使用这些工具并不需要具备编程知识，可以直接上手使用。
简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-10 16:52

生物信息学中的可重复性研究

在生物信息学领域，这意味着如下内容。工作流应该有据可查。这可能包括在电脑中保留文本文档以便复制和粘贴复杂命令、网址或其他形式的数据。
简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-10 16:50

【信息学奥赛一本通】（c++版）2053：【例3.3】三个数

大家好！今天小编就带大家一起学习：2053：【例3.3】三个数题目描述：【题目描述】输入三个整数，按从大到小的顺序输出。【输入】输入三个整数。【输出】按从大到小的顺序输出。【输入样例】321【输出样例】321使用的软件：Devc++5.11解题思路：1.输入3个数2.排序3.输出目录：1.思维导图2.运用到的头文件3.运用到的知识4.代码1.思维导图2.运用到的头文件：#include//基本的当
键盘总是被暴击的程序猿·2024-01-10 16:07

HEK-293细胞培养特性及注意事项

早期报道中指出该细胞基因组中含有腺病毒5（Ad5）基因组的左侧端和右侧端的DNA，但是现在明确了只存在其左侧端的DNA。经过
cas9x细胞基因敲除·2024-01-10 10:25

Treehouse-一个10000+肿瘤sample的数据库

难道还是image.pngTreehouse儿童肿瘤研究是UCSC基因组学研究所的研究机构的一个研究目标，希望通过这些大规模的数据集来确定哪些药物可以更
医科研·2024-01-10 07:02

重测序获取基因编辑植物T-DNA插入位点

早在本科学习比较基因组学期间就有意做一些知识分享，毕竟目前学得的七成生信知识是源自最早做知识分享的前辈们。计划一直夭折，一方面是自觉实力有限，怕误人子弟，一方面是有点空闲时间就想偷个懒。
CallumZhao·2024-01-10 05:50

基因组数据拼接软件：shovill简单的使用方法

shovill--R11_pair.fq.gz--R22_pair.fq.gz--outdirmydir--minlen200shovill：这是你要运行的软件。–R11_pair.fq.gz：指定包含第一对端读取的输入文件，格式为压缩的FASTQ文件（1_pair.fq.gz）。–R22_pair.fq.gz：指定包含第二对端读取的输入文件，格式为压缩的FASTQ文件（2_pair.fq.gz）
橄榄熊·2024-01-10 03:39

过去半年信竞基础学习总结

当Richard同学从去年7月份，开始从YY班学习C++和信息学竞赛时，他对C++还一无所知，但对计算机和编程的兴趣让他一直都乐在其中。
东升Forest·2024-01-10 00:24

如何快速查找物种间对应的同源基因

1.基于NCBIHomoloGene数据库查找物种间对应的同源基因NCBIHomoloGene数据库收集了部分已经完成基因组测序物种的同源基因数据。数据库现包含21个物种，共44233组同源基
JeremyL·2024-01-09 19:29

如何删除有90%以上一致性的序列

写在前面的话：本人是一枚生物学的学生，由于对生物信息学特别感兴趣，于是想自学生物信息学（新手莫怪）。了解到生物信息学要有编程基础，尤其是要会一门编程语言，例如：R语言、Python、P
天明豆豆·2024-01-09 18:40

基因家族分析（5）：基因家族基因结构可视化

需要的原始文件是基因组注释gff3文件，我们想要的信息只有SBT家族基因长度，基因id，exon的长度，在基因上的起始和终止
逐鸿·2024-01-09 15:59

读《教学勇气》04

我说的自身认同是一种发展的联系，在这种联系中，自我生命中所有力量汇聚，这样形成神秘的自我：我的基因组成，赋予我生命的父母的性格，我成长的文化环境，支持过我的人，伤害过我的人；我对别人和对我自己做过的有益的或无益的事情
生活_遇见美好·2024-01-09 13:06

【泛基因组】进展学习（1）

随着越来越多的植物基因组的组装，人们发现一个单一的参考组装并不能反映一个物种的基因多样性，这导致了泛基因组概念的产生。
jjjscuedu·2024-01-09 10:50

2022-04-16

Science|完整人类基因组中的片段重复及其变异原创风不止步图灵基因2022-04-1610:15收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：风不止步IF=47.728推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：文章比较了人类（
图灵基因·2024-01-09 09:19

基于Spring Boot+Vue的迎新管理系统

角色分为三个：超级管理员：全部信息教师：分管所属的学生信息查看学生信息财务缴费信息到站信息学生：学生报到流程安全教育信息采集到站登记财务缴费报告单打印项目功能用户管理：用户是
小熊学Java·2024-01-09 08:02

2022-12-06

重测序SNP分析------二代测序数据检测；SNPcalling；SNP过滤；遗传多样性分析；PCA分析；群体遗传结构分析；系统进化分析；QTL连锁不平衡分析；GWAS全基因组关联分析（关键基因挖掘）
王钦_ce33·2024-01-08 16:01

circRNA测序及机制全面讨论

纪伟讲测序，每周一讲，讨论组学，包括基因组，转录组，蛋白组，代谢组等相关实验数据分析及分子机制挖掘思路。
纪伟讲测序·2024-01-08 16:46

RNA_seq:将修剪后的序列比对到参考基因组

比对参考基因组的2种软件：hisat2、subjunchisat2软件1、构建索引：官网下载：https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/manual.shtmlhisat2
javen_spring·2024-01-08 15:16
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