基因组信息学

国自然热点|超级增强子“super”在哪？cell重磅发现：新型DNA调控元件——促进子

1981年，增强子首次被描述为猿猴病毒40（SV40）基因组中一个72bp的重复序列，可以使报告基因的异位表达增加约200倍。1983年，在哺乳动物的小鼠免疫球蛋白重链基因中发现了增强子。
爱基百客·2024-01-16 12:42

The Plant Journal | DAP-seq助力揭示乌龙茶树杂种优势形成的分子机制

期刊：ThePlantJournal影响因子：7.1发表日期：2022年10月11日单位：中国农业科学院深圳农业基因组研究所2022年10月11日中国农业科学院深圳农业基因组研究所合成生物学研究中心张兴坦研究员课题组在
爱基百客·2024-01-16 12:11

会议 | 宏基因组和生物信息学进行病原检测的进展和未来

文献信息文章：Currentprogressandfutureopportunitiesinapplicationsofbioinformaticsforbiodefenseandpathogendetection:reportfromtheWinterMid-AtlanticMicrobiomeMeet-up,CollegePark,MD,January10,2018杂志：Microbiome时
胡童远·2024-01-16 07:41

高性能计算环境大规模DNA测序数据集柱状工具HipMer的介绍，安装和使用方法

HipMer介绍HipMer是一个基因组组装软件，它特别为高性能计算环境设计，旨在处理大规模的DNA测序数据集。
小果运维·2024-01-16 06:54

生物信息学之同源性、相似性、一致性和直旁系同源

作为生物信息学中序列分析方面的核心概念，话不多说直接上核心内容：同源性：具有共同进化祖先的两条序列称为同源序列。同源性没有程度之分，要么是同源，要么非同源，高度同源这种说法是错误的。
AIzealot无·2024-01-16 02:33

生物信息学及其研究方向与应用

生物信息学是生物er在AI以及cs时代的出路，所以AI以及生信一定是生物er的出路，21世纪的生物只有和最具生产力的行业结合，才能爆发出生命力，哦不，拿到高薪。
AIzealot无·2024-01-16 02:32

生物信息学之序列比对

从事生物信息学方面的研究利用了有生产力的CS方面的技术来研究生物领域的内容。当研究基因和蛋白质时，常常涉及到专有名词——序列比对。何为序列比对呢？
AIzealot无·2024-01-16 02:02

使用Diamond比对NR数据库获取物种注释

之前用Kraken2注释宏基因组的contig，发现只有30%左右可以被Kraken2注释Kraken2+Bracken：宏基因组物种注释-CSDN博客不信邪，再用NR库试试参考：将NR数据库diamond
CAAS_IFR_zp·2024-01-15 22:56

FastANI：安装与使用

zipunzipfastANI-linux64-v1.34.zip（完整路径）/FastANI/fastANI-h#{ref_assembly_txt}和{quary_assembly_txt}是包含基因组路径的文件
CAAS_IFR_zp·2024-01-15 22:25

生信步骤|kmc+genomescope进行基因组调查

在组装未知基因组时，往往需要利用重测序数据提前进行基因组调查，以获取其基因组规模，杂合率，重复序列比例，GC含量等信息。从而更好地拟定后继测序策略。基因组调查可以采用kmers方法。
学术程稻属·2024-01-15 20:04

生信步骤|原核生物基因组注释--Prokka

全基因组注释是鉴定生物基因组特征的过程。Prokka是一个适用于原核生物基因组注释工具，可以注释细菌，古菌和病毒基因组。
学术程稻属·2024-01-15 20:04

生信步骤|转录组测序上游分析：hisat2+samtools+stringtie

转录组分析在当下研究功能基因组领域十分常用。相关软件组合种类也十分丰富，本文采用了hisat2+samtools+stringtie策略从转录组数据中挖掘差异表达基因。
学术程稻属·2024-01-15 20:34

科研绘图（四）火山图

火山图是生物信息学中常用的一种图表，用来显示基因表达数据的变化。
BZD数模社·2024-01-15 20:55

基础分子结构(1): exon, intron, CDS, ORF, 3',5'-UTR

分子生物学的基础知识对正确运用生物信息学工具有着举足轻重的作用。因此我想对其中重要的概念进行学习。
逐鸿·2024-01-15 17:57

MTHFR突变相关的症状和饮食指南-非正式

我们每个人都有相同的基因组，不过每个人都会因基因组微小的变化而表现出差异，不仅会影响到外表或行为，还会影响到身体对外部因素的反应方式，特别是在食物和生活方式方面。
万健康品·2024-01-15 06:00

深度学习与药物发现在健康衰老中的应用

深度学习可以通过分析大量的基因组、表型和临床数据，揭示这些因素之间的相互作用关系，从而为抗衰老研究提供新的视角。其次，深度学习可以帮助科学家们更好地理解和预测疾病的进展和风险。通
道亦无名·2024-01-15 05:04

2022-09-28

癌症基础和转化研究中的大数据，影响诊断和治疗决策原创榴莲不酥图灵基因2022-09-2810:09发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：榴莲不酥IF=69.800推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：大数据分析、生物信息学和人工智能的结合使人们对癌症生物学的基本理解和转化取得了显著进展
图灵基因·2024-01-15 04:20

这篇12分只有2张图的文章思路值得借鉴

作者对致命性前列腺癌的未治疗初级样本以及去势抵抗后的样本进行了基因组测序，分析了前列腺癌原发肿瘤活检中的基因改变，评估相同
科研菌·2024-01-15 00:02

计算叶绿体基因组LSC/IR/SSC的GC含量

https://www.bilibili.com/video/BV1sA411x7xmhttps://www.bilibili.com/video/BV1GV411Y7ihimage.png输入文件就是叶绿体基因组的
小明的数据分析笔记本·2024-01-14 23:48

1077：统计满足条件的4位数 ------ 信息学奥赛高级题库

【题目描述】给定若干个四位数，求出其中满足以下条件的数的个数：个位数上的数字减去千位数上的数字，再减去百位数上的数字，再减去十位数上的数字的结果大于零。【输入】输入为两行，第一行为四位数的个数n，第二行为n个的四位数。(nusingnamespacestd;intmain(){intn,s=0;charm[4];cin>>n;for(inti=0;i>m;intg,q,b,p;g=m[3]-48;
小小鲁创客·2024-01-14 23:29

1071：菲波那契数 ------ 信息学奥赛高级题库

【题目描述】菲波那契数列是指这样的数列:数列的第一个和第二个数都为1，接下来每个数都等于前面2个数之和。给出一个正整数k，要求菲波那契数列中第k个数是多少。【输入】输入一行，包含一个正整数k。（1≤k≤46）【输出】输出一行，包含一个正整数，表示菲波那契数列中第k个数的大小。【输入样例】19【输出样例】4181【知识点】神奇的斐波那契数列故事得从西元1202年说起，话说有一位意大利青年，名叫斐波那
小小鲁创客·2024-01-14 23:58

1075：药房管理 ------ 信息学奥赛高级题库

【题目描述】随着信息技术的蓬勃发展，医疗信息化已经成为医院建设中必不可少的一部分。计算机可以很好地辅助医院管理医生信息、病人信息、药品信息等海量数据，使工作人员能够从这些机械的工作中解放出来，将更多精力投入真正的医疗过程中，从而极大地提高了医院整体的工作效率。对药品的管理是其中的一项重要内容。现在药房的管理员希望使用计算机来帮助他管理。假设对于任意一种药品，每天开始工作时的库存总量已知，并且一天之
小小鲁创客·2024-01-14 23:58

1076：正常血压 ------ 信息学奥赛高级题库

【题目描述】监护室每小时测量一次病人的血压，若收缩压在90-140之间并且舒张压在60-90之间(包含端点值)则称之为正常，现给出某病人若干次测量的血压值，计算病人保持正常血压的最长小时数。【输入】第一行为一个正整数n(nusingnamespacestd;intmain(){intn,a1,a2,s=0,maxa=1e-12;cin>>n;for(inti=0;i>a1>>a2;if(a1>=9
小小鲁创客·2024-01-14 23:58

1051：分段函数 ------ 信息学奥赛高级题库

【题目描述】编写程序，计算下列分段函数y=f(x)的值。结果保留到小数点后三位。y=−x+2.5;0≤x<5y=2−1.5(x−3)(x−3);5≤x<10y=x/2−1.5;10≤x<20【输入】一个浮点数N(0≤N<20))。【输出】输出N对应的分段函数值：f(N)。结果保留到小数点后三位。【输入样例】1.0【输出样例】1.500【知识点】编程中的函数：函数是一个可以反复执行的程序段，在一个程
小小鲁创客·2024-01-14 23:28

1042：奇偶ASCII值判断------信息学奥赛高级题库

【题目描述】任意输入一个字符，判断其ASCII是否是奇数，若是，输出YES，否则，输出NO。例如，字符A的ASCII值是65，则输出YES，若输入字符B(ASCII值是66)，则输出NO。【输入】输入一个字符。【输出】如果其ASCII值为奇数，则输出YES，否则，输出NO。【输入样例】A【输出样例】YES【知识点】十进制代码十六进制代码MCS字符或缩写DEC多国字符名ASCII控制字符00NUL空
小小鲁创客·2024-01-14 23:27

1050：骑车与走路 ------ 信息学奥赛高级题库

【题目描述】在清华校园里，没有自行车，上课办事会很不方便。但实际上。并非去办任何事情都是骑车快,因为骑车总要找车、开锁、停车、锁车等,这要耽误一些时间。假设找到自行车，开锁并骑上自行车的时间为27秒；停车锁车的时间为23秒；步行每秒行走1.2米，骑车每秒行走3.0米。请判断走不同的距离去办事,是骑车快还是走路快。如果骑车快，输出一行"Bike"；如果走路快，输出一行"Walk"；如果一样快，输出一
小小鲁创客·2024-01-14 23:27

信息学奥赛 基础算法 第4次课 课堂练习与课后作业

1、NOIP2015复赛普及组第1题金币OpenJudge-45:金币2、1242：网线主管信息学奥赛一本通（C++版）在线评测系统3、P2440木材加工木材加工-洛谷4、1.2编程基础之变量定义、赋值及转换
dllglvzhenfeng·2024-01-14 23:25

1058：求一元二次方程 ------ 信息学奥赛高级题库

【题目描述】利用公式x1=(-b+√(b²-4ac))/2a，x2=(-b-√(b²-4ac))/2a，求一元二次方程ax²+bx+c=0的根，其中a不等于0。结果要求精确到小数点后5位。【输入】输入一行，包含三个浮点数a,b,c（它们之间以一个空格分开），分别表示方程ax²+bx+c=0的系数。【输出】输出一行，表示方程的解。若两个实根相等，则输出形式为：“x1=x2=”；若两个实根不等，在满足
小小鲁创客·2024-01-14 23:23

2016《Cell Research》全基因组重测序研究狗的驯化起源

然而，我们依然可以从它们的基因组DNA中找到其驯化迁徙的痕迹，探究物种群体的命运和奋斗历程。在生物体的世代交替过程中，基因组DNA一代一代地传递下来，它保存了调控生物体生长发育的几乎所有信息。
iBioinformatics·2024-01-14 21:26

组装细菌基因组

1.首先上GenomeAnnouncements网站找一篇细菌基因组文章，找到文章记载的SRA号，这里随便找一篇，找到的SRA号为SRR9678926；2.用prefetch下载该文件；prefetchSRR9678926
Orphans_2333·2024-01-14 19:19

同性恋基因已被找到，同性恋者不会再被误解了

英国《每日电讯报》报道，研究人员观察了1000多名同性恋男子的完整基因组，发现同性恋和异性恋男子在SLITRK5和SLITRK6两种基因上存在差异，而SLITRK6是一种促进大脑发育的重要基因，在包括下丘脑的大脑区域尤为活跃
茧破·2024-01-14 10:58

信息学竞赛中的数学 习题集 481-490（10题）

3289：练47.1交作业信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统/*第77课交作业啦（递归算法）利用递归算法，试编一程序，算一算我收到多少本作业。
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:16

信息学竞赛中的数学 习题集 491-500（10题）

3294：【例49.1】回文平方数信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统3295：【例50.1】陶陶摘苹果信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统/*电子协会C语言2级2、陶陶摘苹果陶陶家的院子里有一棵苹果树
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:16

学习信奥（CSP-J CSP-S NOIP等），以赛带练 有哪些比赛可以参加

有哪些信息学奥赛相关的比赛和考试有哪些信息学奥赛相关的比赛和考试-CSDN博客信息学竞赛有什么好的比赛网站？信息学竞赛有什么好的比赛网站？
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:45

GOC信息学竞赛真题讲解(15集）

第1集https://www.douyin.com/video/7275679835882556732第2集|GOC题目——勾股定理https://www.douyin.com/video/7303052080216919334第3集|GOC题目——同心圆2（146）https://www.douyin.com/video/7303047003259309322第4集|GOC题目——多层梯形(58
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:44

《信息学奥赛一本通 编程启蒙C++版》第1课 -- 第86课

第一章顺序结构《信息学奥赛一本通编程启蒙C++版》第1课--第3课第一章顺序结构《信息学奥赛一本通编程启蒙C++版》第1课--第3课-CSDN博客第一章顺序结构《信息学奥赛一本通编程启蒙C++版》第4课
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:14

C++入门课（1-61）《信息学奥赛一本通 编程启蒙 C++版》

C++入门课（1-61）《信息学奥赛一本通·编程启蒙C++版》27.1_哔哩哔哩_bilibiliQWERTY学堂的个人空间-QWERTY学堂个人主页-哔哩哔哩视频第1节第1节_哔哩哔哩_bilibili
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:13

C++版-----信息学奥赛一本通-----编程启蒙（1-19）

C++版-----信息学奥赛一本通-----编程启蒙【例2.2】你好世界C++版-----信息学奥赛一本通-----编程启蒙【例2.2】你好世界-CSDN博客C++版-----信息学奥赛一本通-----
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:13

信息学奥赛一本通-编程启蒙 第1-17集

第1集|1-1-编程语言&软件安装https://www.douyin.com/video/7278256137546386747第2集|1-2-第一个C++程序https://www.douyin.com/video/7278257165146574135第3集|1-3-输出类--couthttps://www.douyin.com/video/7278257476791831867第4集|1-
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:12

【信息学奥赛一本通-编程启蒙】部分视频集（2023.10.12）

信息学奥赛一本通启蒙版3028与圆有关的计算信息学奥赛一本通启蒙版3028与圆有关的计算_哔哩哔哩_bilibili信息学奥赛一本通启蒙版3046加四密码信息学奥赛一本通启蒙版3046加四密码_哔哩哔哩
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:11

C++信息学轻松入门系列（1-81集）

第1集|C++信奥第001课：自己的第一行C++代码https://www.douyin.com/video/7121480117666270478第2集|C++信奥第002课：输出与换行https://www.douyin.com/video/7121866664811040036第3集|C++信奥第003课：使用cout按格式输出https://www.douyin.com/video/712
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:11

GoC编程工具、GoC软件、GoC编程PPT

GoC是C语言的扩展，是专门针对小学和初中学生开发的趣味编程入门语言).rarhttps://download.csdn.net/download/weixin_51188609/206440740、信息学奥赛
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:08

信息学奥赛训练体系（2023.02.21）

信息学奥赛寒假、暑假、国庆十一假期如何进行集训信息学奥赛寒假、暑假、国庆十一假期如何进行集训_dllglvzhenfeng的博客-CSDN博客信息学奥赛CSP-J2CSP-S2第2轮复赛如何取得好成绩信息学奥赛
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:37

信息学奥赛学习规划 国内顶尖信息学奥赛名校训练模式 信奥中的数学

从搜狗CEO王小川（信息学金牌），看这二十几年中国奥赛金牌的去向从搜狗CEO王小川（信息学金牌），看这二十几年中国奥赛金牌的去向国内顶尖信息学奥赛名校训练模式有感国内顶尖信息学奥赛名校训练模式有感信息学奥赛夺金六要素
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:37

小学二三年级入门信奥赛，如何从Scratch进入C++的学习

小学生几年级适宜开始学习C++，这是讨论的比较热烈，也是比较热门的话题小学生适宜几年级开始学C++小学生适宜几年级开始学C++-CSDN博客simplehappiness:【信息学规划】北京二年级学生图形化过二级想往信奥靠拢如何准备
dllglvzhenfeng·2024-01-14 07:04

.【机器学习】隐马尔可夫模型（Hidden Markov Model，HMM）

概率图模型可以用于机器学习，人工智能，自然语言处理，计算机视觉，生物信息学等领域。一、马尔科夫模型随机过程马尔科夫过程马尔科夫链状态转移矩阵通过训练样本学习得到，采
十年一梦实验室·2024-01-14 06:52

胶质瘤文献1：脑干胶质瘤的整合基因组和表观基因组图谱

本文作者对一大组脑干胶质瘤（包括弥漫性固有脑桥胶质瘤）进行了综合研究，包括表观遗传学和基因组分
努力爱学习的JUN·2024-01-14 04:02

【博士每天一篇论文-算法】Optimal modularity and memory capacity of neural reservoirs

阅读时间：2023-11-151介绍年份：2019作者：NathanielRodriguez印第安纳大学信息学、计算和工程学院，美国印第安纳州布卢明顿期刊：NetworkNeuroscience引用量：
Better Bench·2024-01-13 23:48

TCGA数据库与数据下载

RNAseq，miRNAseq，DNA甲基化，CNV，SNP等信息，是目前为止可以获得的公开数据库里面数据相对全面的一个，33种癌症类型，在各个领域得到了广泛的应用，为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据
吴小玥·2024-01-13 10:00

2022-03-07

NatComm|胃癌4种分子亚型32基因特征的开发和验证原创图灵基因图灵基因收录于话题#前沿分子生物学机制佛罗里达州梅奥诊所癌症中心的科学家们表示，最近的一项研究正在验证使用基因组测序来预测胃癌患者从化疗或免疫治疗中获益的可能性
图灵基因·2024-01-13 07:16
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