基因组信息学第6页

基因组联合代谢组与转录组锁定关键通路--01

基因组结合转录组及代谢组，将系统的锁定关键通路中的基因和代谢物。技术路线适用范围案例一研究背景榕树是热带和亚热带植物，他们的气生根沿着寄主树木的树干

百迈客生物·2024-01-30 13:58

人类基因组计划发现的8大真相

人类基因组计划是科学史上重要的里程碑事情。该计划的成功，不仅开启了人类了解自身的旅程，而且成为了国际科技合作的典范。对于人类基因组，发现了以下8个事实。1.人类基因组约有20300个蛋白质编码基因。

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-30 10:46

ChatGPT如何为初学者进入生物信息学领域赋能？

也引发了人们对它们在促进编程重数据分析方面的潜在用途的巨大兴趣，如生物信息学。凭借其卓越的会话和编程能力（例如rtour.ai网站），ChatGPT有望帮助学生克服编程障碍。

qq_37303241·2024-01-30 10:44

使用 ChatGPT 为生物信息学初学者赋能

论文：EmpoweringBeginnersinBioinformaticswithChatGPT.2023对于生信初学者而言，最大的困难是身边没有经验丰富的人给予指导。而ChatGTP的出现可能改变这一现状，学生可以自己作为导师，指导ChatGPT完成数据分析工作。众所周知，与ChatGPT互动，给予的指令越精确，那么它给出的答案越精准。这篇论文提出一个与ChatGPT互动的模型：OPTICAL

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-30 10:13

2018.8.9

玉米粥土豆春卷大绿砖曲折的生物学学长结果是生物信息学纠结来纠结去很辣的辣子鸡美美的午觉破釜沉舟的决心吧桃子核桃打打气刚刚好的生活刚刚到的快递港澳通行证签证凉面烤奶微生物打卡保持明天开始独立实验了不需要人陪

珍惜眼前始为真·2024-01-30 09:14

生物信息学编程零基础学习 Python

我本科是农学，研究生专业是生物学，方向是植物基因组。编程方面真是零基础，仅仅在大一接触C语言。整个课题组基本都是用Python作为主要的编程语言。目前是研一下学期，我也想总结一下编程的学习之路。

球果假水晶蓝·2024-01-30 09:14

信息学竞赛中的数学习题集911-920（10题）

第2集|C++小学组20203模拟测评题——2、积善成德https://www.douyin.com/video/7305241928356859173登录#includeusingnamespacestd;intmain(){intn,k,ans=0;cin>>n;for(inti=1;i>k;if(k0){coutusingnamespacestd;boolcmp(inta,intb){ret

dllglvzhenfeng·2024-01-30 08:17

信息学竞赛中的数学习题集1011-1020（10题）

167.(201706比赛)第4题：跑道（runway）登录intmain(){pen.hide();pen.c(6);pen.rt(90);for(inti=1;i>n;p.rt(30);for(inti=1;i>n;a=50;for(inti=1;i<=n;i++){a=a%200;if(i%3==1)p.c(1).fd(a).oo(10,1);if(i%3==2)p.c(2).fd(a).o

dllglvzhenfeng·2024-01-30 08:17

信息学竞赛中的数学习题集891-900（10题）

642.海滩登录643.蜈蚣登录2533.期末考试第3套-选择题5登录2534.期末考试第3套-判断题1登录2535.期末考试第3套-判断题2登录P2421[NOI2002]荒岛野人[NOI2002]荒岛野人-洛谷P2613【模板】有理数取余【模板】有理数取余-洛谷Bash'sBigDayBash'sBigDay-洛谷SherlockandhisgirlfriendSherlockandhisgi

dllglvzhenfeng·2024-01-30 08:16

USACO黄金级 USACO白金级

USACO信息学奥赛例题和算法金牌部分动态规划DP3（CSES1637RemovingDigitsUSACO信息学奥赛例题和算法金牌部分动态规划DP3（CSES1637RemovingDigits一维最小值递推

dllglvzhenfeng·2024-01-30 08:45

盘点结构变异在医学研究中的应用

据统计，每个人类基因组大约有20,000个结构变异（Structuralvariations，SVs），跨越1,000万个碱基对，是受SNVs影响

生信师姐·2024-01-30 05:35

随笔-近30天来的助教生活

实话说，我不想把竞赛写到自己的文字里，但无奈的是，信息学奥赛的学习是我高中阶段的重头戏，有一段时间几乎成了我生活的全部。上月八号起担任学校信息竞赛的助教

芒风_12mango·2024-01-30 05:30

Redis面试题36

药物研发和治疗方案优化：人工智能可以帮助加速药物研发过程，通过分析大量的医学文献和基因组数据，找到潜在的药物靶点和治疗方法。此外，人工智能还可以

CrazyMax_zh·2024-01-30 01:08

干货分享| 多组学助力中国科学家发表多篇CNS

多组学联合研究从多分子层次出发，通过整合生物系统中基因组、转录组、蛋白质组、

ee00dc6faab7·2024-01-30 00:10

基因组文章 | 南美白对虾《Nature communications》2019

今天跟大家分享一下最近刊登在NatureCommunications的南美白对虾基因组文章，信息如下（https://doi.org/10.1038/s41467-018-08197-4）：从基因水平揭示南美白对虾与视觉和运动有关的基因的扩展可能是其底栖生物适应的核心

生信师姐·2024-01-29 16:11

[基因组学]使用GAMP根据已知CDS序列来进行未知基因组序列的功能注释

GMAP最早用于讲EST/cDNA序列比对到参考基因组上，可以用于基因组结构注释。后来高通量测序时代，又开发了GSNAP支持高通量数据比对。软件安装我采用的是利用源代码且在无root权限下进行安装。

巩翔宇Ibrahimovic·2024-01-29 14:11

Stage 2 计算机基础: 人工智能神经阅读理解

来来来让我们一起围观一下最近人工智能领域的一颗新星:陈丹琦DanqiChenBefore:在毕业于斯坦福大学之前,陈丹琦2012年毕业于清华学堂计算机科学实验班（姚班).值得一提的是,她在高中（长沙市雅礼中学）参加信息学国家队集训期间提出了

AdelaZhou·2024-01-29 12:09

信息学奥赛一本通1414：【17NOIP普及组】成绩

1414：【17NOIP普及组】成绩时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:59077通过数:44121【题目描述】牛牛最近学习了C++入门课程，这门课程的总成绩计算方法是：总成绩=作业成绩×20%+小测成绩×30%+期末考试成绩×50%牛牛想知道，这门课程自己最终能得到多少分。【输入】只有1行，包含三个非负整数A、B、C，分别表示牛牛的作业成绩、小测成绩和期末考试成绩。相邻两个数之

ptyz306·2024-01-29 10:16

信息学奥赛一本通1914：【01NOIP普及组】数的计数

1914：【01NOIP普及组】数的计数时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:8148通过数:4213【题目描述】我们要求找出具有下列性质数的个数(包含输入的自然数nn):先输入一个自然数n(n≤1000)n(n≤1000),然后对此自然数按照如下方法进行处理:1.不作任何处理;2.在它的左边加上一个自然数,但该自然数不能超过原数的一半;3.加上数后,继续按此规则进行处理,直到不能

ptyz306·2024-01-29 09:12

Genome-wide association studies in R

全基因组关联（GWA）研究扫描整个物种基因组，寻找多达数百万个SNPs与特定感兴趣特征之间的关联。

m1chiru·2024-01-29 09:21

GWAS——Genome-Wide Association Study

全基因组关联研究（Genome-WideAssociationStudy，GWAS）是一种广泛用于寻找复杂遗传疾病关联基因的重要手段。

m1chiru·2024-01-29 09:51

“亲子小记录”之，傲娇小孩考了个零光蛋

信息学也是在他的理科学习路上的一个兴趣爱好。到现在为止，他学习信息学大概也有接近两年的时间。岑乖第一次的考试是不尽人意的，但是他毕竟也没学多少知识，我们就权当练习了。

烟火琳达·2024-01-29 01:51

基因组-生物分类

（1）现代的分类系统通常包括七个主要级别：界、门、纲、目、科、属、种。（2）种是基本单元，近缘的种归合为属，近缘的属归合为科，科隶于目，目隶于纲，纲隶于门，门隶于界。（3）当前最流行的分类是一种五界系统，分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。五界系统反映了生物进化的三个阶段和多细胞阶段的三个分支，是有纵有横的分类。（4）五界系统没有包括非细胞形态的病毒在内，也许是因为病毒系统地位

Zhigang_Han·2024-01-28 18:14

洛谷P1657 选书

#先看题目题目描述学校放寒假时，信息学奥赛辅导老师有1,2,3,⋯,x本书，要分给参加培训的x个人，每人只能选一本书，但是每人有两本喜欢的书。老师事先让每个人将自己喜欢的书填写在一张表上。

CZSJason·2024-01-28 17:42

QTL定位：MapQTL6

通过QTL分析，可以检测基因组上负责所研究数量性状表型变异的区域，估计相关的基因型效应，并以表格和(可调的)图表的形式呈现分析结果。

Wei_Sun·2024-01-28 17:11

讲解：JavaDNAProgramming AssignmentJava

分配涉及处理来自基因组文件的数据。你的程序应该与两个给定的输入文件一起工作。如果你很好奇（这不是必需的），国家生物技术信息中心出版了许多其他细菌基因组文件。最后一页告诉你如何使用你的程序来处理其他

rbqdgy0·2024-01-28 13:26

【R画图学习11.1】圈图学习1---circlize

圈图非常适合表示复杂信息，我们在展示基因组项目中最常用，我自己主要是用的Circos。

jjjscuedu·2024-01-28 00:02

NGS 数据mapping 算法简介

简介取得测序序列信息后，在有参考基因的情况下我们通过Mapping到参考基因组进行后续分析；没有则重头拼接序列。一般而言，基因组的组装将比readalignment消耗更多的计算资源。

茄子_0937·2024-01-27 20:06

院长说 | 人大金仓携手高校自主培养核心人才

“迎来春天”产业发展人才先行回顾人大金仓人才自主培养之路与众多高校携手深化校企合作创新人才培养模式自主培养了一批批卓越人才为区域发展产业升级数字中国建设作出了重要贡献快来听听院长们怎么说吧中国人民大学信息学院院长文继荣工程博士联合培养目前国家大力支持校企合作下的工程博士培养

金仓数据库·2024-01-27 13:23

1.19信息学，信息熵（wordle)

所谓均方误差实际上就是方差分析：对单词进行编码后，采用聚类方法，可以将单词难度分为三类或者更多，如困难、一般、简单。然后对每一类的单词可视化分析，并描述数据得出结论。聚类算法较多，在论文中可以使用改进的聚类算法就是说，情况越少，在总的所有可能情况里出现的概率也就越少，出现的话，那么也就越能确定如果所蕴含的信息越多，那么就是经过的判断也就越多，即经过所谓判断（是或不是）也就越多，也就是说，就是用所蕴

CQU_JIAKE·2024-01-27 10:10

新书速览|小学生C++创意编程（视频教学版）

本书内容C++是信息学奥赛指定的编程语言。本书以通俗易懂的方式深入浅出地介绍了C++编程语言，适合作为小学生学习的教材类读物。

全栈开发圈·2024-01-27 09:47

基因家族分析（保姆级教程二------鉴定）

太久没有更新了，最近忙着组装好几个基因组，后面我也会吧基因组组装的一些东西分享出来哦~那就步入正题吧，我们在前面准备好了数据之后，就可以开始鉴定所需要的基因家族成员了，这样才能开始后续的分析先从，最最最最基础的

GenomeStudy·2024-01-27 08:22

信息学奥赛一本通pdf_信息学奥赛冠军的竞赛“秘籍”

家长关注的国际中学生奥林匹克竞赛，包含数学、物理、化学、生物、信息学(计算机)五大学科。

weixin_39857513·2024-01-27 08:50

信息学竞赛中的数学习题集971-980（10题）

2055.恒温杯垫(2019DL)登录intmain(){inta;cin>>a;if(a>55)p.rr(120,100,1).text("55°C");elseif(a>d>>D;d/=2;D/=2;r=d+D;p.oo(r,3);p.up();p.fd(r).bk(d).oo(d,15);p.bk(d+D).oo(D,15);return0;}2058.旋转的弹珠(2019DL)登录intm

dllglvzhenfeng·2024-01-27 08:11

信息学竞赛中的数学习题集851-860（10题）

P1069[NOIP2009普及组]细胞分裂[NOIP2009普及组]细胞分裂-洛谷P1572计算分数计算分数-洛谷P4057[Code+#1]晨跑[Code+#1]晨跑-洛谷P1414又是毕业季II又是毕业季II-洛谷P2651添加括号III添加括号III-洛谷634.分数减法登录#includeusingnamespacestd;intgcd(inta,intb){if(a%b==0){ret

dllglvzhenfeng·2024-01-27 08:10

信息学竞赛中的数学习题集841-850（10题）

P2926[USACO08DEC]PattingHeadsS拍头[USACO08DEC]PattingHeadsS-洛谷P3383【模板】线性筛素数【模板】线性筛素数-洛谷P1835素数密度素数密度-洛谷P1029[NOIP2001普及组]最大公约数和最小公倍数问题[NOIP2001普及组]最大公约数和最小公倍数问题-洛谷P1072[NOIP2009提高组]Hankson的趣味题[NOIP2009

dllglvzhenfeng·2024-01-27 08:10

信息学奥赛书籍提高篇 --- 2022.01.30

1、信息学奥赛一本通提高篇2、算法训练营：海量图解+竞赛刷题（进阶篇）-2021.043、算法竞赛进阶指南（第六版）4、《算法竞赛入门经典(第2版)》（推荐指数：5颗星）---2014-065、算法竞赛入门经典

dllglvzhenfeng·2024-01-27 08:40

课课通、一本通、提高篇、算法竞赛进阶指南测试数据

信息学奥赛一本通题目数据https://download.csdn.net/download/esjiang/13090176信息学奥赛一本通(提高篇)测试数据.rarhttps://download.csdn.net

dllglvzhenfeng·2024-01-27 08:34

10-【BPGA】的安装和使用

安装时间：2021.2.171.简介BPGA是一款快速的泛基因组分析软件。似乎好像在windows上安装较为方便。在Linux下没有conda安装版本，只能手动进行安装。

lkj666·2024-01-27 05:07

文献分享-循环血浆 DNA 的全基因组拷贝数改变筛选：检测早期肿瘤的潜力

图片.png今天分享的是19年GenomewidecopynumberalterationscreeningofcirculatingplasmaDNA:potentialforthedetectionofincipienttumors发表杂志：annalsofoncology2021年影响因子：32.976中科院分区：1区数据通过老年协会（76%的参与者）或鲁汶大学医院（内科或麻醉科，24%的参

lqbzc·2024-01-27 03:11

全基因组关联分析GWAS专题2——连锁不平衡

连锁不平衡（linkagedisequilibrium,LD）分析是群体遗传学研究中常见的分析内容，也是关联分析的基础，在很多的GWAS文章中都会出现LD衰减图及单倍型block图，接下来一起连锁不平衡（linkagedisequilibrium,LD）初探。图1水稻自然群体连锁不平衡衰减与桃果糖含量位点相关单倍型区块1、LD的概念当位于某一座位的特定等位基因与另一座位的某一等位基因同时出现的概率

felix108·2024-01-26 15:14

安装WGCNA的各种方法

JeremyL·2024-01-26 11:16

LTR组装指数（LAI）评估基因组

基因组组装完成后，可通过查看contig的N50或者BUSCO，以及LAI评估组装质量。本文就LAI方法做一简单介绍。

斩毛毛·2024-01-26 11:06

抗性基因数据库(1)

抗性基因数据库（1）宏基因组：检测细菌、病毒等序列耐药基因：检测检出非人序列中的已知耐药基因，找到对应耐药基因的抗生素耐药/抗性基因数据库ARDB（AntibioticResistanceGenesDatabase

Zoeyer·2024-01-26 10:44

Scratch图形化编程：开启青少年逻辑思维与信息学奥赛之旅

在当今的信息化时代，编程教育已经逐步深入到基础教育阶段，其中图形化编程作为一种直观、易上手的教学工具，正逐渐成为培养青少年逻辑思维能力和参与信息学奥赛的重要途径。

@小码农·2024-01-26 07:36

2023-07-11 crossMap不同版本基因组位点坐标转换

CrossMapinstallationpip3installCrossMapdownloadchainfilesAchainfiledescribesapairwisealignmentbetweentworeferenceassemblies.UCSCandEnsemblchainfilesareavailable:UCSCchainfilesChainfilesfromhs1(T2T-CHM

xiaoguolaile·2024-01-26 02:05

Y叔谈clusterProfiler 4.0 前沿应用

image.png分析方法ORA，FCS进行打分（GSEA，通路上下调），PT（拓扑结构，不普遍）image.pngORA将所有能测到的基因（或全基因组）作为背景，超几何分布GSEA不筛选差异基因，去查看通路的基因方向

Hello育种·2024-01-25 23:43

WGVD：小麦基因组变异与选择信号数据库 | CNGBdb收录数据库推荐

随着完整的小麦参考基因组的发布以及下一代测序技术的发展，来自面包小麦及其祖先的大量基因组数据已经产生，并为小麦遗传学研究提供了基因组资源。

尐尐呅·2024-01-25 21:50

【Single Cell Genomics】Part1 单细胞基因组学

文章目录1SingleCellGenomics1.1Whysinglecells1.2传统singlecell分析1.3scRNA-seq2ScalingupscRNA-seqtechnology2.1分析单细胞技术进化2.2basicpipeline3BeyondRNA:scATAC-seq,Multi-Omics4Dealingwithnoiseanddoubletsinsingle-cell

丸丸丸子w·2024-01-25 20:24

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