基因

ExpHunterSuite

ExpHunterSuite是一种用于基因表达数据分析的生物信息学工具套件。它可以用于从高通量测序数据中提取差异表达基因，并对其进行注释和功能富集分析。
m1chiru·2024-01-03 23:09

samtools

旨在成为一种以下格式：足够灵活，可以存储各种比对程序生成的所有比对信息；足够简单，可以通过对齐程序轻松生成或从现有对齐格式转换；文件大小紧凑；允许对齐上的大部分操作在流上进行，而无需将整个对齐加载到内存中；允许按基因组位置对文件进行索引
m1chiru·2024-01-03 23:09

IF:14.957｜组装新策略完成犬蝠基因组精细图谱并揭示食果蝙蝠免疫基因演化新机制

蝙蝠已经演化出独特的免疫系统来应对病毒感染，能够无症状地携带多种哺乳动物烈性病毒，包括尼帕病毒、亨德拉病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒、MERS病毒、SARS病毒以及最近引起COVID-19的SARS-CoV-2病毒，是这些人畜共患病毒的天然宿主。狐蝠科蝙蝠（旧大陆果蝠）被认为是引起国际公共卫生组织关注的多次病毒大流行事件中高致病性病毒的天然宿主。因此，研究狐蝠科蝙蝠免疫系统演化遗传机制对人类制定病毒
ee00dc6faab7·2024-01-03 23:44

今日问题：为什么说我们每个人都是这个世界上独一无二的个体？

虽然是同胞兄妹，性格、爱好、面相、习惯、爱好等不尽相同，无论任何时候都有个体差异，就是遗传基因有共性和变色异性，如饿了吃饭，困了睡觉，冷了穿衣等又存在着共性。
姜惠春·2024-01-03 22:35

2022-07-12

Nature|CD8+T分化因子有望提升CAR-T治疗实体瘤效果原创图灵基因图灵基因2022-07-1217:16发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制CAR-T细胞疗法在治疗儿童和成人白血病和淋巴瘤方面取得了成功
图灵基因·2024-01-03 22:03

试析兰溪商埠与徽商的鱼水情缘 - 草稿

徽学前辈张海鹏说，中原文化和积淀是徽州文化的基因，加之当地固有文化因子的融入，遂形成徽州文化深厚的底蕴；徽州文化的发达，则源自徽商的酵母。
鲍运达·2024-01-03 22:01

『比较基因组学』TBtools 30秒解决基因组共线性。

直接给我惊呆了，从点开开始到出结果一共32秒ಥ_ಥ，想当年光blastp就得跑大半天，更不要说编译MCScanX，各种奇葩问题...先看下什么是共线性：Syntenic*=asetoflociintwodifferentspecieswhichislocatedonthesamechromosomeineach(notnecessarilyinthesameorder).Collinear=ase
ShawnMagic·2024-01-03 22:29

NCBI的primer picker设计qRT-PCR染色法引物

搜索基因的mRNA序列选择gene，搜索框中输入基因名称、human/其他物种，然后search注意选择人类的基因，点进去选择mRNA向下滑动到mRNAandprotein此处有NRxxxxx数字，为NCBI
盘山路·2024-01-03 22:34

洞级跨界丨万科X知乎，听说他们要一起搞事情

跨界似乎成为了当今品牌的必备技能，其中蕴含的脑洞和潮流属性，让“跨界”一词充满了时尚基因，更能吸引年轻新生代的眼球。但在房地产领域，却少见有创意的品牌跨界合作。
duici9·2024-01-03 22:11

R语言：一致性聚类 ConsensusClusterPlus

这类文章一般会对表达量或甲基化等数据进行聚类分析，选出最优聚类数；对聚出的类组进行差异化表达分析得到DEGs，差异表达基因做GO、pathway一系列分析，在分析一下与生存的关系、免疫细胞丰度的区别，等等
生信频道·2024-01-03 20:47

【单细胞测序】数据格式转换loomR

Linnarson实验室开发的基于hdf5的数据结构loom，可以方便地存储单细胞基因组数据集和元数据。
森尼啊·2024-01-03 20:18

分子生物学知识整理

表观遗传变异定义：是指碱基序列不变，通过DNA甲基化、组蛋白乙酰化、RNA编辑、基因沉默在、休眠转座子激活等方式影响了基因的活性，导致基因控制的性状发生改变，这种变化是可逆的，可能遗传。
雪切丝·2024-01-03 19:20

学党史 找初心

就是要从百年历程中传承红色基因，重温中国共产党为中国人民谋幸福、为中华民族谋复兴的不变初心。日前，习近平总书记出席党史学习教育动员大会并发表重要讲话，深
杨斌_a8e8·2024-01-03 19:09

《高效能人士的七个习惯》之第三章读后感

提出这个习惯前，作者先提出现在社会上被广泛用来解释人性的三种决定论：基因决定论，心理决定论和环境决定论。这三种决定论认为环境与条件对我们起着决定性的作用。但作
许诺无言·2024-01-03 18:29

颈椎病药物，目前市场规模已超过200亿美元

除了传统的药物治疗外，一些新型颈椎病药物，如生物制剂、基因治疗等，也逐渐进入临床应用阶段
QYR市场调研所·2024-01-03 18:00

你的格局，隐藏在你不经意间说出的话中

在某些研究上来说，基因决定了了人类几乎所有的表征，也就是我们几乎完全被基因操控着，并不能够活出一个真正的自己。但是虽然是这样，通过后天的刻
更好时代·2024-01-03 18:45

2022网购返利APP排行榜前十名 2022最新返利APP排行榜前十强

公司位于杭州阿里巴巴互联网村梦想小镇，有很强的互联网基因。技术实力雄厚：高省将平台技术研发作为立
高省_飞智666600·2024-01-03 17:21

蛋白质组学知识背景及分析流程

蛋白质组知识背景蛋白质组(proteome)：由一个细胞、一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质，是一个整体的概念。
Seurat_Satija·2024-01-03 16:56

[青春冒险] 少年来自黑水城（三）

7在远赴南方上了大学后，马达便继承了他父亲精于算计的好基因。入学伊始，他就在校门口卖锅碗瓢盆、棉衣被褥一类的东西，之后，慢慢升级为倒卖磁带、唱片、明星海报。
澈言·2024-01-03 16:14

易基因｜组学研究：人类胎儿发育过程的DNA羟甲基化(5hmC)和RNA m5C动态重编程

易基因｜组学研究：人类胎儿发育过程的DNA羟甲基化(5hmC)和RNAm5C动态重编程大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。
易基因科技·2024-01-03 15:32

对77,539个基因组进行的遗传关联分析揭示了罕见疾病的病因

原则上，RDB可以为基因型、变异、基因、参与者和统计结果的分析提
生信风暴·2024-01-03 15:01

维生素B5和琥珀酰辅酶A可以改善SF3B1基因突变引起无效造血过程

今天给同学们分享一篇实验文章“VitaminB5andsuccinyl-CoAimproveineffectiveerythropoiesisinSF3B1-mutatedmyelodysplasia”，这篇文章发表在SciTranslMed期刊上，影响因子为17.1。结果解读：SF3B1突变导致MDS-RS患者COASY异构体的错误剪接MDS造血细胞在骨髓和血液中的缺氧和正常氧环境下都会发展。为
生信风暴·2024-01-03 15:01

7+非肿瘤+WGCNA+机器学习+诊断模型，构思巧妙且操作简单

结果解读：DEGs和血小板相关基因的鉴定作者通过R的“GEOquery”和“limma”包，在数据预处理后获得了
生信风暴·2024-01-03 15:01

20-基于全基因组分析探索MAPK失调与免疫应答的关系

由于缺乏对免疫反应基因组特征的认知，这导致无法开发一种新的、有效的治疗乳腺癌的方式。
AAA肿瘤信息学王协·2024-01-03 15:28

如果能实现意识转移，那么我们真的可以永生不死吗？

但单纯的克隆只是基因的复制，也就是像同卵双胞胎。其中的核心技术应该是记忆与思维的扫描复制，这在近几年的电影和电视剧中也有涉及。比如《超能查派》和《碳变》都是通过数字化储存，并通
有爱科学·2024-01-03 15:37

勤能补拙

“相比于基因和人种，这些差异更可能来源于社会资源、环境和教育。”我们不得不承认人与人的差别，但真正的差别涉及的因素不仅仅是智力——没有准确衡量标准的东西。
井蛙看世界·2024-01-03 14:02

双荧光素酶报道系统详解

一、概述报告基因(reportergene):是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因，也就是说，是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。
上官万尘·2024-01-03 14:18

samtools index failed

近来在进行染色体级别基因组的分析。使用pindel软件对染色体的结构变异进行检测。
薄皮儿核桃·2024-01-03 12:50

“集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用”

种数据类型是远远不够的，随着高通量测序和多组学的快速发展，生物医学研究开始采取多组学技术结合的方法，传统的信息数据处理算法不能满足大数据的处理要求，机器学习作为从数据中进行学习的算法，可以对不同组学来源（如基因组学
20220705·2024-01-03 12:07

做到商学院——为什么成功路上没有你（十倍成长）

成功的专业人士拥有什么样的心智模式和成功的基因？自童年开始，每个人都有自己美好的梦想。随时光流逝，蓦然回首，有些人已经站在理想的彼岸，有些人却离当初的梦想越来越远。
zuodao·2024-01-03 11:41

2023-05-16 最近在读一些有深度的书

再比如一个有趣的理论，在生存的环境压力之下，进化论的理论，会让生物（这里主讲的是植物）进行变异，而且适应这个环境压力的物种，才会被保留下来，成为基因优势，遗传并且让物种生存下去！
百界无疆KOKO·2024-01-03 10:01

【读书笔记】《够笑一年的奇葩人体冷知识》

二、总结◆引言人类基因中天生存在两种渴望一个是下海一个是上天下海，是对生命源点的寻踪上天，则是对未来的渴求我们未被赋予翅膀和鳃于是，科学带我们翱翔天际，深潜海底◆第1章疯狂的进化：从猿人到智人，
松鼠啃书·2024-01-03 10:49

全球首家医疗健康人工智能区块链应用平台LPAI震撼启动！

近日，加拿大LP生命密码基因医学博士团队联合曾任职于BAT企业高级管理工程师和国际医疗健康行业企业组织，共同打造区块链医疗健康人工智能应用平台——LPAI。
招财猫区块链研究院·2024-01-03 10:28

贵州省文化旅游科技有限公司：5G赋能，打造智慧文旅数字再现精品工程

为赓续红色血脉，传承红色基因，贵州依托5G赋能，打造了全国首个以长征为主题的全域行浸式数字体验馆——“红飘带”。
shujuguan2023·2024-01-03 08:15

利他行为

9.12利他行为基因的改变会让自己的后代不断的改变，这是一种行为。还有利他行为理论也是一种传递的行为。而利他行为研究是只在血缘的范围内传播。更多的时候会思考利己的行为来维护自己的利益。
徐猛_Merlin·2024-01-03 07:01

2021-09-06

NatComm|高胆固醇使癌细胞产生铁死亡抵抗促进癌症发展与转移原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制长期高胆固醇水平与患乳腺癌的风险增加有关，并且与大多数癌症的预后较差有关，但这种联系尚未完全被了解
图灵基因·2024-01-03 07:20

基于美国应对网络生物安全风险的报告的思考

网络生物安全威胁因素1、合成生物学可及性的增强2、全球高生物安全等级设施的扩增3、生物目标的广泛性4、攻击途径的多样化5、自动化的快速发展三、美国网络生物安全的主要漏洞四、美国出现的典型安全漏洞1、恶意基因组工程
岛屿旅人·2024-01-03 06:50

《再读〈论语〉》

近千年代代相传的精神伦理观念的基因代码，与其懵懵懂懂不如清清晰晰。第二《论语》飞针走线，穿起了超大规模的中国社会。《论语》说了109次“仁”。仁的发端是血缘关系，是入孝出悌，也就是从一个人怎么对
月照爱琴海·2024-01-03 06:03

机器学习-生存分析：如何基于随机生存森林训练乳腺癌风险评估模型？

这些方法可以挖掘患者的临床、基因、影像等多种数据，预测患者的生存期、疾病进展和治疗效果，为临床决策提供
笑不语·2024-01-03 05:39

48个实用的生信在线工具

基因结构绘制1.Exon-IntronGraphicMaker工具链接：ttp://www.wormweb.org/exonintronimageRNA二级结构2.Mfold工具链接：http://unafold.rna.albany.edu
东风008·2024-01-03 05:49

为什么农村出来的孩子不容易成功

4，穷，父母基因一般，子女相貌身高智商也一般。5，穷，导致性格容易走极端，自卑等相伴而生。
080eb33733c8·2024-01-03 04:13

无题

作为九型人格中典型的享乐型，偏胖的家族基因，相对舒适低压的工作环境，天时地利人和使我瘦不下来。虽然现下流行逃离舒适区，挑战未知领域。但感觉当前减肥的动力和阻力完全不成正比。
流水平沙·2024-01-03 04:01

独立的女性，即使没有另一半也能活得精彩——读《人生由我》有感

梅耶马斯克出生在一个幸福、民主的家庭，她的家族基因是努力和冒险。在这样的家庭中成长，为她奠定了坚强的意志和努力的品格。然而，她的婚姻是不幸的，她嫁给了一位自私粗暴的男人。
如雨季节过来人·2024-01-03 02:53

《女王的棋局》-- 成长靠对手

女主遗传了数学博士妈妈的良好基因，但即使这样，从一个无名小卒到顶级国际象棋大师，都是需要不断复盘和提升的。每一次复盘，升级，换更厉害的对手
富多多Kelly·2024-01-03 02:44

每日一写（7）丨顶级杀手就应该养猫

狗这种动物比起大型猛兽来，确实算得上“灵活而危险”，但它一向以忠诚闻名，循规蹈矩的性格早已深入基因，比起杀手，它更适合做士兵。猫就不一样了。首先，它是狮虎
雨辰子读书写作·2024-01-03 01:17

长染色体bam索引创建及变异检测

在变异检测的所有阶段，都需要对文件进行索引，不管是输入的基因组文件，还是输出的比对结果和变异结果文件。不同的软件处理会生成不同的索引，供后续不同的软件使用，但不可避免的会出现特殊情况。
xiaoji_hb·2024-01-03 00:47

单细胞类型鉴定总结

细胞类型鉴定细胞类型鉴定分两种思路一种是基于Markergene，看某个亚群的差异基因（onetoothers）与数据库中哪种细胞类型的markergene比较一致，结合其表达量来鉴定细胞类型。
Seurat_Satija·2024-01-02 23:11

坚持敢于斗争、自我革命

党的十九届六中全会通过的《中共中央关于党的百年奋斗重大成就和历史经验的决议》，深刻把握党的事业发展和自身建设规律，将“坚持敢于斗争”“坚持自我革命”凝练为中国共产党百年奋斗的历史经验，揭示了百年大党风华正茂的基因密码
淡蓝蓝·2024-01-02 23:52

【SubPhaser-多倍体亚基因组分型流程解读】

写本篇文章，主要目的是从tmp文件和软件运行信息解读亚基因组分型分析。进入tmp文件夹之后，其实就可以看到对应的文件：如何查看什么步骤产生了怎么样的结果文件？
陈有朴·2024-01-02 22:28

命名实体识别综述

识别出实体的边界对于给定的某句话，识别出其中每个实体的start和end的位置，即分词2.给每个实体分类目前普遍分为7类：人名、地名、机构、时间、日期、货币、百分比，但在某些特殊的领域，类别是不一样的，比如生物医学领域，通常分为：基因
小小程序员一枚·2024-01-02 20:35
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