宏基

微生物组-扩增子16S分析和可视化(2023.2)

课程改为长直播模式，报名后就可以学习，时间更充裕，练习更充分具体见：易生信培训改为长周期模式福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、转录组的线上
生信宝典·2023-08-13 05:47

这个Nature推荐的代码海洋竟然有文章作者上传的所有可重现性脚本，涉及单细胞、微生物组、转录组分析、机器学习等相关

计算分析类型的研究，是能够比较容易实现可重复性的-只要分享代码和数据就可以（当然配置运行环境也需要一定的功底），如使用Rmarkdown或Bookdown或者Jupyternotebook等，像宏基因组主编刘永鑫老师的植物根系菌群分析的
生信宝典·2023-08-12 23:49

基于R做宏基因组结果的PCoA分析

写在前面因为公司给的PCA结果效果不佳，决定从中重新挑选部分样本进行再分析步骤表格结果预处理在属水平genus参考原本结果已有的PCA图，尽可能挑选距离较远且聚团的样本选取不同样本属水平的丰度数据，整理成逗号分隔的csv文件代码演示library(vegan)#计算bray距离library(ggplot2)library(tidyverse)library(ape)#pcoa分析##如果没装先i
twocanis·2023-08-12 15:06

基于R做宏基因组的进化树ClusterTree分析

写在前面同上一篇的PCoA分析，这个也是基于公司结果基础上的再次分析，重新挑选样本，在公司结果提供的csv结果表上进行删减，本地重新分析作图步骤表格预处理在公司给的ClusterTree的原始表格数据里选取要保留的样本，同样保存为逗号分隔的csv文件代码演示无色版install.packages('vegan')install.packages('dendextend')install.packa
twocanis·2023-08-12 15:34

宏基因组分析笔记之binning

一、宏基因组简介：reads→（根据overlap组装）→contig重叠群→（构建454paired-end库或illuminameta-paired库，组装）→scaffold→（binning）→
小王的学习杂记·2023-08-07 06:21

亚马逊云科技HPC解决方案，帮助浙江大学实现成本和科研任务的双丰收

AmazonWebServicesCloudCreditsforResearch）的多次支持下，运用亚马逊云科技的高性能计算和专属行业解决方案，浙江大学土壤学科研团队整体在2个月内，成功完成了土壤微生物宏基因组数据自动化处理
Discovering_·2023-08-04 12:44

宏基因组学是什么？16S 测序和宏基因组测序分析有哪些？

宏基因组学宏基因组学（Metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学。
Seurat_Satija·2023-07-28 05:05

详解C语言assert宏

1.assert宏基本介绍原型：作用：简单来说，就是如果espression的值为0，或false（比如指针为NULL）时，就会调用abort函数来终止程序的运行，并告诉你具体的错误信息，比如如果判
Mylvzi·2023-07-26 21:54

02 - 如何制定性能调优策略？

1.2、宏基准性能测试宏基准性能测试是一个综合测试，需要考虑到测试环
Q.E.D.·2023-07-26 11:01

宏转录组方法_Cell：基因表达的改变和群落的更替塑造了全球海洋宏转录组

在此研究中，作者呈现了来自全球126个采样站的187个宏转录组和370个宏基因组的综合数据集，并构建了一个包含4700万个基因的参考基因集，来研究全球海洋不同深度层的微生物群落的转录组。作者研究了
weixin_39917811·2023-07-22 12:01

宏基因组分析步骤Linux,为什么宏基因组数据分析比较难？

生物数据分析包括很多种类，比如人基因组，植物，动物，微生物，还有RNA，单细胞RNA等等，其中宏基因组数据分析是比较难的部分，为什么呢？这里总结了以下10点原因。
南哥塔罗占卜师·2023-07-22 12:30

Acer宏基笔记本电脑,宏碁暗影骑士擎AN515-58原装出厂恢复原厂预装Windows11/Win10镜像oem专用系统

Acer宏基笔记本电脑,宏碁暗影骑士擎AN515-58原装出厂系统恢复重装，原厂预装Windows10/WIN11镜像oem系统安装其他相关型号：AN515-43、AN515-44、AN515-45、AN515
17855069·2023-07-20 17:43

NCBI|宏基因组原始数据上传

小编最近学习了关于NCBI数据上传的操作，今天给大家演示宏基因组原始数据上传NCBI的操作，宏基因组原始数据上传NCBI共分为三步，下面小编就为大家一一讲解吧！
维凡生物·2023-07-20 09:50

Acer宏碁掠夺者Predator战斧300 PH315-53原厂Windows10系统工厂模式,恢复安装原装OEM预装系统

Acer宏基笔记本电脑，Acer宏碁Predator掠夺者战斧300PH315-53原装出厂Windows10系统系统自带所有驱动、Office办公软件、出厂主题壁纸LOGO、AcerCareCenter
VXQ17855069·2023-07-15 19:35

一文读懂基因富集分析：从小白到SCI

对于小编来讲，刚入手生信时接触最多的就是差异分析，基因组可以算突变率、转录组可以算基因表达水平、表观组可以观察甲基化水平、蛋白质组/代谢组可以看蛋白/代谢物丰度，甚至是宏基因组也可以比较菌群的丰度。
概普生信·2023-07-13 17:15

多快好省！硫元素循环分析内容又升级啦！

凌恩生物强势推出基于宏基因组的硫循环研究方案，构建了完整的硫循环循环模式图，对宏基因组数据进行深入挖掘，各部分结果图可直接用于文章发表，充分满足您对元素循环的各类个性化分析要求！
SHANGHAILINGEN·2023-06-21 23:35

宏基因组分箱软件metaWRAP报错记录与解决方法

最近学习微生物宏基因组分箱（binning），按官方文档安装metaWRAP，踩了一堆坑，记录一下报错及解决方法：1.metaWRAP安装安装教程及下载地址：GitHub-bxlab/metaWRAP:
ygyxl·2023-06-21 04:21

普氏分析在生信中的应用

在宏基因组测
jl老弟·2023-06-16 18:54

VirSorter2识别病毒序列

从宏基因/转录组数据中识别病毒信号缺少1.广谱基因marker2.数据库代表3.有效工具。但VirSorter2很OK。
小白菜学生信·2023-06-16 17:51

CheckV评估病毒序列

中文：checkv评估meta组装病毒基因组的完整性杂志：NatureBiotechnology时间：2020CheckV通过将序列与完整病毒基因组的大型数据库进行比较来估计完整性，其中包括从公开可用的宏基因组
小白菜学生信·2023-06-16 17:18

宏病毒组研究大放异彩！| 凌恩生物1-5月高分宏病毒组文章大盘点！

病毒宏基因组学能够检测病毒群落的DNA或RNA序列，了解病毒种类
SHANGHAILINGEN·2023-06-15 13:23

GUT|IF30+的联合分析文章：宏基因加代谢组

●代谢组学是基于LC-MS/MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物进行定性和相对定量分析；●宏基因组-代谢组的联合分析可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性；●从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系
SHANGHAILINGEN·2023-06-15 13:52

感恩食堂饭菜

下了一夜雨，一地樱花粉红了整个雨季今日放假，躺在宽敞的套房，温暖的中央空调，打开阳台门可听屋外的细雨，楼外的树高到我二楼阳台的位置，触目可及宝贝在家上语文课我很开心昨天给自己买了潮宏基彩金耳钉和戒指，好漂亮好幸福
悠悠妈妈儿童原创故事·2023-06-13 22:25

MPAndroidchartChart

1、MPAndroidChart的使用技巧2、MPAndroidChart介绍3、MPAndroidChart教程：坐标轴，X轴，Y轴，Labels（三）4、庄宏基（mpandroidchart最全介绍
天高任鹰飞·2023-06-11 00:44

0. 5G关键技术

5G的关键技术一、密集组网（UDN）超密集网络需要由大量的小基站构成，小基站是低功率的无线接入点，工作在授权的步谱，覆盖范围一般为10m~200m，相比之下，宏基站的覆盖范围可达数千米。
weixin_46465571·2023-06-08 23:44

金宏基教你如何提高宝宝免疫力，这三个阶段最重要

宝宝出生后，生病时是最让妈妈抓狂的。眼看着宝宝受罪，妈妈却无法代替。宝宝的免疫力，是随着宝宝的长大逐渐增加的，直至十几岁时才接近成人免疫力。在这之前要经历这三个阶段：016个月时的宝宝有个神奇的现象，不知您发现没有？6个月前的小宝宝虽然看着较弱，但很少生病，反而到了6个月以后，感冒发烧什么的，才源源不断地来了。这是为啥呢？原因在这里：宝宝在妈妈肚子里时，妈妈就已经将自己的抗体通过胎盘传输给了宝宝，
金宏基生物·2023-06-08 16:10

杨慎《临江仙·滚滚长江东逝水》曹全碑作品

滚滚长江东逝水，随着一句雄浑、宽厚、低沉、饱满而富于磁性的男低音的演唱，电视剧《三国演义》拉开帷幕，这是《三国演义》的开篇词，也是电视剧《三国演义》的主题曲，是由杨宏基老师演唱的。
碧彧·2023-06-07 10:17

科普：四大学术出版社

这篇文章年代稍微有点久了，一些实际内容也有些不一样了，但这不妨碍粗浅的了解一下：国际学术期刊的四大巨头(360doc.com)(67条消息)iMeta|宏基因组&生物信息期刊-创刊背景和简介_刘永鑫Adam
BI_wan·2023-05-19 14:31

shot-gun宏基因组：KneadData质控，Kraken2Bracken物种分类，HUMAnN3功能注释

导读第一次做宏基因组还是在2018年，现在2021很多软件数据库大更新，这里搭建目前比较受认可的流程，即用Kneaddata（trimmomaticbowtie2）kraken2humann3进行宏基因组数据基础分析
胡童远·2023-05-09 22:04

双系统安装Windows&linux

文章目录1.1联想小新windows10重装1.2宏基暗影骑士windows10重装2.1ubuntu18.04重装1）清理空间并制作U盘启动2）ubuntu分区3.1ros安装4.1deb包安装5.1
圆嘟嘟2019·2023-04-21 15:40

DNA甲基化组+转录组+宏基因组+16S研究思路

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。本期我们以一篇多组学研究揭示DNA甲基化在植物促生菌-植物-微生物互作关系中作用的文献案例来讲解多组学研究如何做，并对多组学研究分析方法和组学分子实验验证思路进行总结，一起来看看吧。2022年02月24日，南京农业大学沈振国和蒋建东教授团队合作在期刊《Microbiome》（IF:14.65/1区）发表了题为“Long-termeffe
易基因科技·2023-04-18 07:16

Femto基站及其射频方案

+45dBm：能够覆盖室外大约5km的宏基站+30dBm：能够覆盖大约0.5km的微蜂窝基站+1
aibotest·2023-04-17 18:52

吃撑了

今天晚上，我在我表哥家玩完回家后，妈妈和爸爸带我去必胜客吃，位置在宏基大厦，专门吃披萨的。他们门店的那个logo是一个红色的帽子，我们刚一进门，虽然人不怎么多，但是我感觉好热啊！
禧子·2023-04-16 21:21

第4天 我的笔记本不行了

之后，经同事介绍，在某一个商场买了一台宏基电脑。手里有一台笔记本之后，心里是特别开心的，这种开心，不仅仅是因为自己有了人生中的第一台笔记本，更是因为自己在某一方面又能够实现自主的开心。
奔跑的大海·2023-04-16 03:52

凌恩生物美文分享|基于宏基因组的氮循环分析内容重磅升级！

凌恩生物强势推出基于宏基因组的氮循环研究方案，构建了完整的氮循环循环模式图，对宏基因组数据进行深入挖掘，各部分结果图可直接用于文章发表，充分满足您对元素循环的各类个性化分析要求！
SHANGHAILINGEN·2023-04-14 14:14

小宝宝便秘 新手爸妈这样做

【金宏基生物小儿居家按摩推拿锦囊】解决婴儿便秘妙招宝爸宝妈学起来_腾讯视频腹部按摩第一步足屈伸法即伸一下屈一下，共10次；然后做单腿屈伸10次。第二步顺时针转圈轻揉在按摩时，要在温暖舒服的地
金宏基生物·2023-04-14 08:53

宏基因组如何在动植物研究中一展神通

宏基因组测序技术可以挖掘99%不可培养的微生物，可用于解析环境微生物的群落结构、物种组成、系统进化、基因功能和代谢网络等。
贝瑞科服·2023-04-11 23:32

宏基因组之物种注释（基于nr库）

昨天下午捣鼓了一下宏基因组物种注释过程(基于nr库)，现在将整个流程记录一下。
凯凯何_Boy·2023-04-11 21:02

宏基笔记本怎么进入BIOS界面

方法一1.开机不断按F12方法二1.插入U盘启动盘，开机时不停按F2进bios，按→方向键移动到Boot，选择SecureBoot回车，改成Disabled；2.在Main下，将F12BootMenu设置成Enabled，最后按F10回车保存重启；
So Youth·2023-04-11 16:00

宏基因组学研究—宏基因组数据的假设检验

1.宏基因组数据假设检验介绍1.1假设检验在科研中的应用假设检验随着人类微生物研究从技术发展和基础科学发现向转化医学和环境研究的转变，统计假设检验的应用将变得越来越重要。
JarySun·2023-04-11 13:32

相机雷达时间同步（基于ROS）

2.3编写可执行文件2.4配置文件3.1编译运行4.1录制时间同步后的rosbag4.2rviz可视化rosbag运行环境：ubuntu20.04noeticusb_cam速腾Robosense16线宏基暗影骑士笔记本思路
duduzai20192019·2023-04-11 06:04

ROS实践14 分布式通信

文章目录运行环境：思路：1.1设置固定IP2.1修改hosts文件3.1检查是否成功通信4.1修改bashrc5.1演示运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路：主机启动roscore
duduzai20192019·2023-04-11 06:04

ROS实践05 订阅方实现Python

文章目录运行环境：思路：1.1Python代码实现1）工作空间创建和编译2）功能包创建和添加依赖3）新建.py文件4）修改CMakeList5）运行节点运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路
duduzai20192019·2023-04-11 06:00

ROS实践12 自定义源文件并调用

文章目录运行环境：思路：原理：1.1头文件编写1.2编写源文件1.3编写可执行文件1.4配置文件1.5编译运行运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路：上一期：类和函数：头文件声明可执行文件定义本期
duduzai20192019·2023-04-10 07:01

ROS实践13 python模块导入

文章目录运行环境：思路：1.1新建.py1.2demo02_pub.py调用tool.py附：动态获取工作空间地址运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路：将不同的.py文件关联起来
duduzai20192019·2023-04-10 07:01

ROS实践11 自定义头文件并调用

文章目录运行环境：思路：1.1编写头文件1.2includepath添加头文件路径1.3编写可执行文件1.4配置文件1.5编译运行运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路：类和函数
duduzai20192019·2023-04-10 07:31

Robosense激光雷达录制rosbag

rslidar_packets话题1.5录制rslidar_points话题1.6Rviz可视化rslidar_points.bag运行环境：ubuntu20.04noetic速腾Robosense16线宏基暗影骑士笔记本
duduzai20192019·2023-04-10 07:30

ROS实践02 发布方实现C++

shift+B配置中更换为以下代码1.2C++代码实现1）工作空间创建和编译2）功能包创建和添加依赖3）新建.cpp文件4）修改CMakeList5）运行节点运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路
duduzai20192019·2023-04-10 07:30

ROS实践07 自定义消息调用python

CMakeLists.txt3)运行节点2.1订阅方实现1)在功能包scripts中新建person_sub.py文件2)修改CMakeLists.txt3)运行节点运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路
duduzai20192019·2023-04-10 07:30

ROS实践04 发布方实现Python

文章目录运行环境：思路：1.1Python代码实现1）工作空间创建和编译2）功能包创建和添加依赖3）新建.py文件4）修改CMakeList5）运行节点运行环境：ubuntu20.04noetic宏基暗影骑士笔记本思路
duduzai20192019·2023-04-10 07:54
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