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宏基
ROS实践04 发布方实现Python
文章目录运行环境:思路:1.1Python代码实现1)工作空间创建和编译2)功能包创建和添加依赖3)新建.py文件4)修改CMakeList5)运行节点运行环境:ubuntu20.04noetic
宏基
暗影骑士笔记本思路
duduzai20192019
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2023-04-10 07:54
ROS机器人实践
python
开发语言
R语言分析微生物组数据代码示例大全
本文推荐的几款微生物组(扩增子、
宏基
因组)的数据分析示例网站(pipeline、workshop)进一步降低了该领域数据分析的门槛,把入场券的价格拉到了新的低度。
周运来就是我
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2023-04-10 05:28
usb_cam 相机ROS配置
运行电脑自带cam1.3修改launch文件1)不插入usb_cam编号查询2)插入usb_cam编号查询1.4运行usb_cam2.1Rviz显示运行环境:ubuntu20.04noeticusb_cam
宏基
暗影骑士笔记本
duduzai20192019
·
2023-04-09 20:12
相机-雷达联合标定
ubuntu
c++
usb_cam相机录制rosbag
1.1usb_cam连接:1.2usb-cam启动1.2查看相机话题名称2.1rosbag录制2.2播放rosbag运行环境:ubuntu20.04noetic杰瑞微通usb_cam(分辨率640x480)
宏基
暗影骑士笔记本
duduzai20192019
·
2023-04-09 20:12
相机-雷达联合标定
数码相机
代谢组学如何结合16S 测序与
宏基
因组测序
而
宏基
因组与代谢组学的关联主要是其代谢通路与基因功能和代谢产物的关联。]1.过
苏可_7fe6
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2023-04-09 12:52
Tablet PC
2000年微软比尔盖兹在comdex上提出了"tabletpc"的概念,富士通,惠普,联想和
宏基
相继推出了合作产品相比普通液晶显示屏,TabletPC液晶触摸显示屏的图像分辨率要高很多,至少为5倍。
杰_6343
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2023-04-07 20:11
肝癌代谢组学
宏基
因组测序的吞吐量和准确性的最新进展使得对与疾病相关的特定微生物群的积极研究成为可能。人类微生物群与各种疾病的发展密切相关。
Rhine3523
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2023-04-07 13:39
扩增子、
宏基
因组、宏转录组,三大法宝玩转肠道微生物
俗话说,“遇事不决,量子力学;机制难寻,肠道菌群”。和研究物理学微观粒子的量子力学一样,我们肚子里面肠道菌群也是一个神奇的微观世界,里面包含约100万亿个微生物,有人体细胞总数的10倍之多,影响着宿主的饮食、疾病、以及生长发育等。面对数目如此庞大的肠道微生物,要使用哪些技术去了解其物种的组成,发挥的功能,以及对宿主的影响呢?下边,我们就为大家献上研究肠道微生物的“三大法宝”。存在哪些微生物——扩增
诺禾致源
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2023-04-06 08:16
宏基
因组学研究—纵向微生物组数据分析
1.
宏基
因组纵向数据的意义1.1纵向数据提供了更多的信息纵向数据从根本上比单点(End-point)数据提供了更多的信息,因为时间系列有两个特殊特征:(a)时间对样本施加了固有的、不可逆的排序;(b)样本具有时间函数的统计相关性
JarySun
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2023-04-05 17:23
微生物生态学研究中的
宏基
因组工具
2021年2月,来自美国、荷兰、中国、挪威的多国研究团队在《CurrentOpinioninBiotechnology》发表综述,回顾了从
宏基
因组学的应用中收集到的关于微生物生命的新见解,以及促进探索复杂微生物群落多样性和功能的广泛分析工具
尐尐呅
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2023-04-05 11:08
宏病毒组学 | 病毒
宏基
因组相关基金资助项目研究分析
病毒
宏基
因组学(Meta-virome)是在
宏基
因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支,是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle
易基因科技
·
2023-04-05 06:50
TaxonKit: 小巧、高效、实用的NCBI分类学数据命令行工具集
TaxonKit:小巧、高效、实用的NCBI分类学数据命令行工具集
宏基
因组按:NCBI物种分类注释信息格式复杂,存在层级不整齐、缺失、名称变动等问题,在使用中存在一定困难。
斗战胜佛oh
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2023-04-04 02:25
NBT | 基于培养的1520人肠道细菌参考基因组
1,520referencegenomesfromcultivatedhumangutbacteriaenablefunctionalmicrobiomeanalyses中文:来自人肠道细菌的1520参考基因组促进功能
宏基
因组分析单位
小白菜学生信
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2023-04-04 00:27
2019-07-25
如何估计
宏基
因组样本中的物种组成及丰度?答:
宏基
因组中的物种分类,一般用OTU(operationaltaxonomicunit),即可操作物种单元,来表示。
YX_Andrew
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2023-04-03 21:46
Cell子刊:成年同卵双胞胎的病毒组多样性与肠道微生物组多样性相关
文章目录CHM:成年同卵双胞胎的病毒组多样性与肠道微生物组多样性相关热心肠日报研究总结研究背景研究结果选择微生物组一致或者不一致的同卵双胞胎类病毒颗粒(VLPs)的鸟枪法
宏基
因组测序识别推定的细菌污染功能组成支持病毒在类病毒颗粒纯化中的富集病毒组是个体独特的微生物组具有一致性的双胞胎共享病毒类型在肠道病毒组中噬菌体占优势病毒多样性与微生物多样性相关
斗战胜佛oh
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2023-04-02 13:43
Nature子刊|“二代+三代”
宏基
因组学揭示肠道微生物群的个性化结构变异
2022年,《Naturecommunications》期刊发表的“Short-andlong-readmetagenomicsexpandindividualizedstructuralvariationsingutmicrobiomes”研究论文中,通过建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装的新方法,表征了来自健康人类的数百个肠道微生物组中结构变异(SV)的精细遗传变异。研
凌恩生物
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2023-04-01 12:30
5G笔记| 概述:5G三大应用场景、5G关键技术概览
5G5G(5thGenerationMobileCommunicationSystem)指第五代移动通信系统5G的特性高速率低时延大连接/高网络容量:两个层面,无所不包和无所不在具体而言,4G的大功率
宏基
站虽然覆盖范围大
Insomnia_X
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2023-03-31 08:53
5G笔记
1024程序员节
linux,内核(kernel)对AD9371配置流程。
该元件系列提供FDD和TDD应用中的3G/4G微处理器和
宏基
站设备所需的高性能和低功耗的多功能组合。AD9371工作频率为300MHz至6GHz,涵盖大部分需执照和免执照蜂窝频带。
Luki401
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2023-03-31 06:27
ad9371
kernel
arm
NBT|人肠道菌培养组HBC
文章标题:Ahumangutbacterialgenomeandculturecollectionforimprovedmetagenomicanalyses译题:人肠道菌基因组和资源库改善
宏基
因组分析期刊
小白菜学生信
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2023-03-30 18:10
【5G通信网络架构与5G基站架构概述】
目录一、移动通信网络架构二、移动通信网络端到端的通信架构三、5G网络架构四、5G基站架构五、5GRAN架构六、5G
宏基
站/微小站一、移动通信网络架构首先,我们先来了解一下移动通信网络的基本架构,即无线网
jiujiujiukakakamiao
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2023-03-29 16:12
无线通信
5G
信息与通信
扩增子和
宏基
因组分析实用指南 | 微生物组研究
来自中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国科学院大学、中国中医科学院等多家科研机构组成的科研团队在《Protein&Cell》发表了微生物组数据扩增子和
宏基
因组分析的实用指南。
尐尐呅
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2023-03-26 13:38
【微生物系列专题】
宏基
因组分析流程及常见结果解读
【微生物系列专题】
宏基
因组分析流程及常见结果解读image.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage
李时刻
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2023-03-25 22:51
婚礼主持词-V3
非常欢迎各位来到江西萍乡
宏基
大酒店参加彭奕先生和赵晗碟女士的新婚典礼,我是本场婚礼的司仪,在仪式开始之前,请允许我代表两位新人及双方父母对各位的到来表示最诚挚的感谢(鞠躬)!
地沟油炸鸡
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2023-03-23 04:46
微生物组(16S rRNA)数据分析套件PMS尝鲜
前几日
宏基
因组公号上推送了《iMeta:青岛大学苏晓泉组开发跨平台可交互的微生物组分析套件PMS》一文,但软件中示例文件貌似是单端数据,于是想着拿手里一批已发表过的双端测序16S数据集尝试一番。
凯凯何_Boy
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2023-03-22 12:34
记录:差点因贪小便宜而上当受骗
今天从通山回武汉,在
宏基
车站右侧大东门公交站旁,有一个小摊,是一个骗子摊。
algernon_
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2023-03-21 17:45
R语言
宏基
因组学统计分析(第四章)笔记之ggplot2
4.3ggplot2简介4.3.1ggplot2和图形语法ggplot2可以用来创建优雅的图形,由于它的灵活,简洁和一致的接口,可以提供美丽、可直接用来发表的图形,吸引了许多用户,特别是科研领域的用户。ggplot2使用grid包来提供一系列的高水平的函数,并将其延伸为图形语法,即独立指定绘图组件,并将它们组合起来,以构建我们想要的任何图形显示。图形语法包含6个主要成分:data,transfor
zd200572
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2023-03-20 18:22
2019-07-16
冲动购物不可取笔者日前到朋友家串门,发现他家去年购买的那台
宏基
品牌电脑落满尘埃。据笔者所知,朋友当初购买时,他妻子竭力反对。
放纵四海1
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2023-03-17 16:13
宏病毒组学 | 病毒组组装软件如何选?
因此,对病毒
宏基
因组(virome)的研究在很大程度上依赖于短测序reads的从头组装来恢复组成和功能信息。
宏基
因组组装对于病毒组数据尤其具有挑战性,通常导致组装碎片化和病毒群落成员恢复不完全。今天我
易基因科技
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2023-03-17 04:20
基因组学系列专栏
:基因组学简介(IntroductiontoGenomics)测序技术(Sequencingtechniques)序列组装(GenomeAssembly)基因组注释(Genomeannotation)
宏基
因组学
宇宙独一无二的我
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2023-03-16 17:53
Empress可视化你的16S进化树
我们知道,
宏基
因组中krona图来展示某个样品的详细信息,最近有点好奇16S的进化树可视化问题,这不,在qiime2官方视频教程里发现了一个方法,很不错,分享下!
zd200572
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2023-03-15 21:54
三维基因组(Hi-C)的原理以及应用
Hi-C技术不仅可以研究染色体片段之间的相互作用,建立基因组折叠模型,还可以应用于基因组组装、单体型图谱构建、辅助
宏基
因组组装等,并可以与RNA-Seq、ChIP-S
生信编程日常
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2023-03-15 12:45
凌恩生物文献分享|颠覆性的
宏基
因组新思路,速来get!
非人灵长类动物(NHP)是人类的近亲,为宿主-微生物互作的研究提供了一个很好的例子。近年来研究主要集中在野生灵长类动物的肠道微生物群,这将有助于了解灵长类及其肠道微生物群的进化,但仍然缺乏关于野生种群肠道微生物群的基本信息。今日分享一篇发表在《ComputationalandStructuralBiotechnologyJournal》期刊上(IF=6.155)的论文,研究发现野生觅食和食物供应的
SHANGHAILINGEN
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2023-03-14 22:26
科技
其他
凌恩生物资讯|抗性
宏基
因组又一力作|抗性基因+可移动元件研究新成果!
凌恩生物合作客户:合肥工业大学崔康平老师团队利用凌恩生物
宏基
因组抗性基因研究解决方案,对污水处理厂活性污泥中的钆(Gd(III))和抗生素磺胺甲噁唑(SMX)的联合污染情况进行了调查,强调了Gd(III
SHANGHAILINGEN
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2023-03-14 22:55
PacBio
三代测序
16s基因全长测序
科技
其他
凌恩生物资讯|
宏基
因组到底要不要去宿主?
HighSensitivityofShotgunMetagenomicSequencinginColonTissueBiopsybyHostDNADepletion”,该研究提出的优化去除宿主DNA方法提高了鸟枪
宏基
因组测序在活检中细菌检测中的敏感性
SHANGHAILINGEN
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2023-03-14 22:55
16s基因全长测序
三代测序
PacBio
其他
科技
凌恩客户文献|
宏基
因组binning解析中国浓味白酒窖泥微生物群落MAGs和代谢潜力
通过
宏基
因组binning解析了中国
SHANGHAILINGEN
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2023-03-14 22:24
微生物
三代测序
PacBio
其他
科技
凌恩客户文章|《Microbiome》:
宏基
因组构建反刍动物全消化道超1万个MAGs新进展
凌恩生物客户最新合作文章“Anintegratedgenecatalogandover10,000metagenome-assembledgenomesfromthegastrointestinalmicrobiomeofruminant”(DOI:10.1186/s40168-021-01078-x)发表在微生物学权威1区期刊Microbiome(IF=14.650)。南京农业大学动物科技学院毛
SHANGHAILINGEN
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2023-03-14 22:24
三代测序
PacBio
16s基因全长测序
其他
科技
凌恩客户文章|
宏基
因组揭示大蒜素对抗生素抗性基因的影响
凌恩生物客户最新合作文章“Metagenomicapproachrevealsthefatesandmechanismsofantibioticresistancegenesexposedtoallicinsduringwasteactivatedsludgefermentation:Insightofthemicrobialcommunity,cellularstatusandgeneregul
SHANGHAILINGEN
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2023-03-14 22:54
三代测序
宏基因组学
微生物
科技
其他
二代测序数据质控 QC
相对于Sanger测序而言,二代测序可以提供中等的读长和适中的价格,适合denovo测序、转录组测序、
宏基
因组研究等。Solexa的测序原
点滴生信
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2023-03-12 06:09
3种思维方式,到底有何不同?
在商场有很多品牌,比如联想,戴尔,华硕,苹果,
宏基
,三星等等很多品牌。顾客呢对品牌也有一定程度的认知。今天过来
薛诚俊
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2023-03-10 23:46
利用
宏基
因组数据组装基因组-评估篇
前言:最近组装了一种病原体的基因组,基因组大小为610kb,结果发现在300,000-400,000之间发现很多的Gap区域,需要找一下原因。因为是用二代数据测的,我先推测的原因是基因组这个区域有可能GC含量比较高,那下载一下它的基因组,看一下,找到了bedtools工具,发现这个软件功能十分强大,bedtools总共有二三十个工具/命令来处理基因组数据。比如:根据bed中的位置信息提取目标基因及
吕强强学生信
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2023-03-10 05:25
R语言
宏基
因组学统计分析学习笔记
3.4微生物数据组成分析早在1897年,皮尔逊就警告说,在器官测量中使用两个绝对测量值的比值,可能会形成“伪相关”。自1920s以来,地质学的研究人员已经知道,使用标准的统计方法来分析成分数据可能会使结果无法解释。Aitchison认识到关于组成成分的每一个陈述都可以用成分的比率来表述,并开发出一套基本原理、各种方法、操作和工具来进行成分数据分析。其中,对数比变换方法被地质学、生态学等领域的统计学
斗战胜佛oh
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2023-03-09 23:30
Protein Cell:扩增子和
宏基
因组数据分析实用指南
扩增子和
宏基
因组数据分析实用指南ApracticalguidetoampliconandmetagenomicanalysisofmicrobiomedataProteinCell[IF:10.164]
生信宝典
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2023-02-20 07:21
数据库
大数据
编程语言
机器学习
人工智能
组装 → 分类注释→下游分析, 按步骤帮你整理
宏基
因组生信分析工具
土壤微生物组分析工具2020年1月出版的SpringerBriefsinEnvironmentalScience丛书(电子版)《UnravellingtheSoilMicrobiome》第六章针对土壤微生物的
宏基
因组生信分析工具进行了总结和说明
尐尐呅
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2023-02-18 11:44
【007不出局二班】2019年2月张鹏组总结
本组共8位战友007-74张鹏(组长)007-76刘应勤007-78倪祥奕007-79李斌007-87刘利民007-88郑
宏基
007-99甘露007-105罗峰本组3位战友已出局007-68张伟007-
007小王子
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2023-02-17 04:55
今天是浴佛节
在这轮回的世间总是会有很多烦恼很多忧伤,闻思修这么久偶尔还是会因习气急躁认真而结根,昨天因为一个租房又和一个老姐姐(曾经
宏基
的姐姐长我一圈,精明能干性子急个性超强)还
圆英ly
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2023-02-17 04:08
宏基
因组分析-基于binning
一、介绍
宏基
因组(Metagenome)指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。
微基生物
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2023-02-07 11:22
宏基因组
宏基因组测序
宏基因组检测
宏基因组分析
宏基因组二代测序
宏基
因组生信分析方法介绍
随着高通量技术的发展,
宏基
因组学(metagenomics)已经成为研究微生物群落物种及功能的前沿科学,在肠道微生物、环境微生物等研究领域具有广泛应用。
微基生物
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2023-02-07 11:21
宏基因组分析
生信分析
生信分析方法
宏基因组测序
宏基
因组分析-基于Reads比对
介绍
宏基
因组(Metagenome)指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。
微基生物
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2023-02-07 11:50
宏基因组检测
宏基因组分析
Reads比对
宏基因组
微生物检测
单细胞空间
宏基
因组揭秘微生物群对癌症空间和细胞异质性的作用2
Effectoftheintratumoralmicrobiotaonspatialandcellularheterogeneityincancer,2022年11月发表于nature,在文章单细胞空间
宏基
因组揭秘微生物群对癌症空间和细胞异质性的作用中已经进行了导读
Evil_Genius
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2023-02-06 20:08
键盘上的金鱼
说这条金鱼,它躺在了我刚买的
宏基
笔记本键盘上,正甩着尾巴猛敲键盘,发出“嚓嚓嚓”的声音,两边的鱼腮跟着尾巴的节奏规律地起起伏伏,嘴里吐着噗噜噗噜的小泡泡。若不是条鱼,还真像极了一只撒娇的宠物狗。
神澈律子
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2023-02-05 00:24
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