宏基

如何计算宏基因组测序数据中来自于人基因组的污染？

KneadData是一款宏基因组测序数据质控的软件，其主要功能包括使用Trimmomatic对序列过滤和bowtie2比对至宿主基因组去除宿主序列。
斗战胜佛oh·2021-03-29 17:23

mac上安装taxa分析软件STAMP

STAMP是一款非常好用的宏基因组分析相关软件。最近想在mac上面安装，差点被搞疯了，还好最后解决了。
scdzzdw·2021-03-15 09:58

荆州之石首市乡镇办事处名字大串烧作者:(宫门桃李)李府钟

高筑宏基建庙宇，南边口岸诸阁亭。高坡陵岗修竹茂，大象无形满垸春。分久必合垸中水，一团和气山绕盈。天鹅洲头谁逐鹿，皇
府钟·2021-03-10 05:38

预印 | 猪肠道>25000 MAGs分析揭示了断奶后微生物组组成和代谢的变化

Post-weaningshiftsinmicrobiomecompositionandmetabolismrevealedbyover25,000piggutmetagenomeassembledgenomes标题：超25000猪肠道宏基因组组装基因组分析揭示了断奶后微生物组组成和代谢的变化杂志
小白菜学生信·2021-02-26 13:27

MPB：广东生态土壤所孙蔚旻组-DNA稳定同位素示踪与宏基因组单菌草图组装联用技术...

为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量，本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后，采用公众号推送方式分享全文，任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题，建议电脑端点击文末阅读原文下载PDF审稿。在线文档(https://kdocs.cn/l/cL8RRqHIL)大众评审页面登记姓名、单位和行号索引的修改建议。修改意见的征集截止时间为推文发布后的72小时，文章将会结合有建设性的修改意
刘永鑫Adam·2021-02-06 07:00

如何构建kraken2个性化数据库

kraken2就不介绍了，是一款挺好用的快速比对宏基因组软件。现在有了nt数据库下面animal的序列，那么如何构建kraken2的数据库呢？
谷流觞·2021-02-04 10:19

[4G&5G专题-27]：架构-UE终端的4G+5G双连接详解

多连接的聚合和分离点的分类1.3多连接好处1.4双连接的本质1.5多连接的控制面与数据面连接方法分类1.61C+2U模式下数据承载的三种方式1.7分清各种场景的基本思路1.8关于终端与基站之间的无线控制信道第2章4GLTE宏基站与小基站的双连接
文火冰糖的硅基工坊·2021-01-30 20:35

[4G&5G专题-23]：架构-5G无线接入内部网元架构与空口协议功能切分

目录1.5G无线接入网内部网元架构2.5G空口协议栈2.1主要的协议功能2.2协议功能之间的接口3.不同网元的协议栈功能切分3.1一体化经典4G小基站3.2一体化4G/5G经典宏基站3.3高层切分-分布式
文火冰糖的硅基工坊·2021-01-27 00:53

室内分布系统和基站

宏基站直白点，铁塔站，有塔杆，有的是角钢塔，有的是圆管塔比较大，一个站覆盖几十
冰湖雁·2021-01-26 11:27

建造者模式 + 构造方法的语义化实现

场景：假设宏基笔记本仅由CPU和内存组成，其中生产CPU和内存的工序可以独立出来交由各个OEM厂商制造。
k00baa·2021-01-19 00:59

病原微生物笔记-Taxonomy 分类流程解决⽅方案

Taxonomy分类流程解决⽅方案1.使⽤用Kraken2对其中的微⽣生物进⾏行行物种注释.Kraken2是⼀一个基于k-mer算法的⾼高精度宏基因组序列列分类软件，能够快速的将测序reads进⾏行行物种分类
XuningFan·2021-01-19 00:56

r语言rank降序_常见排序分析方法及R语言实现

它们对物种(或基因、功能)的分析具有重要作用，因而频频出现在16S测序及宏基因组测序中。以上分析本质上都属于排序分析(Ordinationanalysis)。
HRGO·2021-01-16 08:37

宏基因组公众号4年精华文章目录，收藏贴(2021.1更新)

宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强宏基因组学技术和成果交流传播，推动全球华人微生物组领域发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，联合海内外同行共同打造本领域纯干货技术及思想交流平台
刘永鑫Adam·2021-01-01 07:00

群落多样性之Alpha多样性（一）

宏基因组，是不是就是很“宏”的基因组？……答案很统一：必须是啊！这可以总结出一套理解生物学概念的方法，就是顾名思义。
布莱特杨·2020-12-28 16:33

boost asio 应用案例_libevent、libev、libuv、libhv、asio、poco、muduo

libevent、libev、libuv、libhv、boost.asio、poco、muduo七种echo-server实现对比libhv中的宏艺术C语言宏基础知识golangdefer宏实现javasynchronized
weixin_39952182·2020-12-25 15:52

微生物组数据学习笔记

Metagenome宏基因组：狭义仅指宏基因组测序分析基因组和功能基因，广义泛指研究微生物组的学科。
曲凉不见·2020-12-10 14:38

宏基因组 + 宏转录组分析工具：HUMAnN

导读HUMAnN（全称HMPUnifiedMetabolicAnalysisNetwork）最早由CurtisHuttenhower团队针对HMP项目开发的一款可对宏基因组/宏转录组测序数据进行物种分类分析和功能
胡童远·2020-11-07 15:21

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.11)

欢迎点击上方蓝色”宏基因组”关注我们！
刘永鑫Adam·2020-11-05 07:00

宏基因组数据分析：差异分析（LEfSe安装使用及LDA score计算）

文章目录导读原理LDAscore计算安装分析文件输入格式数据格式转换lefse分析绘制lefse结果图绘制特征条形图绘制系统发育树图参考资料导读LEfSe（LineardiscriminantanalysisEffectSize）通过将用于统计显着性的标准检验与编码生物一致性和效果相关性的检验相结合，确定最有可能解释类别之间差异的特征。LEfSe分析可以实现多个分组之间的比较，还进行分组比较的内部
__dys__·2020-10-14 20:48

Meta组装小课题2:GapCloser

宏基因组复杂样品基因组的组装（无参考基因组）什么是Gap以及它是怎样产生的Gap：序列中未确定的区域，通常用N或n表示。
周运来就是我·2020-10-09 23:37

MEGAN6安装及使用的问题

最近接手了一个宏基因组项目，做了一段时间，已构建群体的基因丰度集，其间遇到的种种问题暂且不表。本以为接着就可以进行结构和功能注释，忙活了半个月终于可以有可视化的结果了。
NICE_AGIS·2020-10-09 13:52

5G仅仅是网速快吗？或许答案并没有那么简单……

也许你已经对5G了解过很多：更宽的带宽、更快的速率、更密集的基站，还有诸如毫米波、宏基站、微基站、D2D等等……今天，小编跟你聊聊5G的另一面。相信在很多人眼中"5G=更快的网速"
架构师联盟盟主·2020-10-08 16:01

综述 | 临床微生物学实验室中的mNGS：走向成熟之路

来源：微生态译者：陈佩佩原文：https://mp.weixin.qq.com/s/lQni2FMTqK6faKb6auVmsw综述信息：综述框架：摘要：新一代宏基因组测序（mNGS）正在越来越多地应用于临床实验室进行无差别的微生物培养与独立诊断
胡童远·2020-10-06 17:53

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.10)

欢迎点击上方蓝色”宏基因组”关注我们！
刘永鑫Adam·2020-10-01 07:00

浅谈CPRI原理及测试解决方案（转）

分布式基站结构的核心概念就是把传统宏基站基带处理单元（BBU）和射频处理单元（RRU）分离，二者通过光纤相连。
xiao_Mrs_li·2020-09-17 05:59

A315-56 Compal LA-H801P LA-J801P宏基笔记本点位图

宏基AcerAspire3A315-56CompalLA-H801PLA-J801PFH5LIRev1.0笔记本点位图品牌宏基型号Aspire3A315-56主板版号CompalLA-H801PLA-J801PFH5LI
iduvip_com·2020-09-16 09:11

最后1天|宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam·2020-09-15 06:34

最后3天|宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam·2020-09-15 06:33

最后一周 | 微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam·2020-09-15 06:33

16S扩增子分析 | 05 Alpha和Beta多样性分析

利用宏基因组、16SrRNA测序等高通量测序技术分析微生物群体结构的时候，常见的有α和β多样性两个指标。Alpha多样性分析Alpha多样性主要反映样本内多样性。
小虎牙儿·2020-09-15 06:21

微生物组-宏基因组分析第8期 (报名直播课免费参加线下课2020.7，最后一周)

“福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
生信宝典·2020-09-15 05:30

写在博一下学期伊始

老板寒假给安排宏基因组组装的两个小工作还在初始阶段，但最近这十天也没闲着。这周一（2月13日）上午，老板叫过去聊师兄的课题，顺带问了一嘴组装的事情。
lmenjoy·2020-09-15 01:43

Microbiome：微生物组研究中优化方法和规避误区

本网对Markdown排版支持差，请跳转至“宏基因组”公众号阅读；微生物组研究中优化方法和规避误区2017年五月发表在Microbiome上的综述，对于老司机会有很多共鸣，对于新人更要必读，少走弯路。
刘永鑫Adam·2020-09-14 16:16

宏基因组合种树第285期，胡杨专车

宏基因组蚂蚁森林公益合种团队。现诚招队友，带你3000~5000g能量种10~20万能量大树，每天浇水一千，每种树循环种。
刘永鑫Adam·2020-09-14 16:16

drep：微生物基因组快速去冗余-文章解读+帮助文档+实战

在微生物分离培养、分箱中获得的大量的基因组、宏基因组拼接的基因组(MAG)，如何确定到底有多少种非冗余的细菌基因组呢?
刘永鑫Adam·2020-09-14 16:15

宏基因组云讲堂第2期由刘永鑫主持，特邀王金锋副研分享“Gut：用时序微生物组数据重现生物膜装配的动态过程”9月16日晚8点开讲！...

为促进我国宏基因组研究领域的学术交流和技术分享，推动微生物组领域的发展，“宏基因组”公众号联合国内外优秀人才组织“易生信-宏基因组积微学术论坛”，与同行在线交流文章经验、分享研究思路、共享实验和分析技术
刘永鑫Adam·2020-09-14 16:43

台湾媒体：李焜耀“挥泪斩马谡”实有因可循

在明基去年正式收购西门子手机部门之际，不少投资机构并不看好合并前景，甚至泛宏基系“教父”施振荣也认为明基多头出击，难以全面顾及。
cncy94258·2020-09-14 13:24

Java性能调优实战(二) | 如何制定性能调优策略

2.宏基准性能测试宏基准性能测试是一个综合测试，需要考虑到测试环境、测试场景和测试目标。首先看测试环境，我们需要模拟线上的真
自由的♂·2020-09-13 20:33

opensuse在宏基笔记本无法调节屏幕亮度---解决方案

问题描述：安装好Opensuse后，发现无法调节屏幕亮度，快捷键调整时倒是会出现亮度条，亮度占比数值也会变化，但是屏幕亮度不变，坑了个爹啊～解决方案：google后，得知：将/etc/default/grub中的“GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT=......”替换为GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="resume=/dev/disk/by-id/ata-S
带你环游world·2020-09-13 16:12

Visual Studio 2013崩溃问题解决

问题解决本人电脑类型：宏基v5-573
ruirui610·2020-09-13 12:08

英汉《营销学》常用词汇-1

absorptionofcosts成本分配accesibility可进入性accessoryequipmentmarkets附属设备市场accountmanagementpolicies客户管理策略Acer宏基
weixin_30664051·2020-09-13 06:33

Marketing Word

absorptionofcosts成本分配accesibility可进入性accessoryequipmentmarkets附属设备市场accountmanagementpolicies客户管理策略Acer宏基
HoldingSky·2020-09-13 04:37

微软MR头盔设置及手柄配对

我也第一时间用手头的联想版本的MR头盔试玩了TheLabVR以及公司自己的产品，手柄定位上几乎做到了和HTCvive无差别的精准度，再考虑到联想、惠普、戴尔、宏基等硬件厂商的大力宣传，以及三千人名币左右
张广木·2020-09-13 03:21

看了林志颖的个人履历 我第一次被他震住了

15岁------尚未出道的林志颖因完美的外形和健康阳光的气质被广告商拉去拍了三个大广告——白兰洗面乳、宏基电脑、金车麦根沙士。
swordzjj·2020-09-13 02:10

林志颖的个人履历，佩服的五体投地!

15岁------尚未出道的林志颖因完美的外形和健康阳光的气质被广告商拉去拍了三个大广告——白兰洗面乳、宏基电脑、金车麦根沙士。
phphot·2020-09-13 00:26

权威公布：彻底搞清楚哪些笔记本和台式机主板能够支持42mm SATA M.2 NGFF(2242)接口的固态硬盘！！！...

已知使用42mmSATAM.2NGFF(2242)规格的设备：宏基Chromebook:C720,
weixin_33971205·2020-09-12 07:41

权威发布：彻底搞清楚哪些笔记本和台式机主板可以支持42mm SATA M.2 NGFF(2242)接口的固态硬盘！！！

已知使用42mmSATAM.2NGFF(2242)规格的设备：宏基Chromebook:C720,C720Corei3(C
jaminwm·2020-09-12 04:34

[性能优化]-02制定调优策略

2、宏基准性能测试，综合测试，考虑：测试环境、场景、目标环境，模拟真实线上环境场景，排除干扰因素，包含：其他服务、第三方接口目标，逐渐增加并发数，测试TPS（最大的每秒事务请求数），并观察：吞吐量、响应时间
chestnut_lan·2020-09-11 01:35

宏基因组公众号2017年发展简史和十大热文盘点

回顾2017年，是宏基因组公众号从无到有的一年。从一人独行，到多人分享，更是我个人成长最大的一年，也同样是很多朋友事业再上新台阶的一年。
刘永鑫Adam·2020-09-10 21:47

宏基因组物种分类、组装、分箱方法

导读BriefingsinBioinformatics2017年的一篇文章罗列了宏基因组物种分类、组装、分箱绝大多数方法，值得参考。
胡童远·2020-09-03 15:33
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