富集

单细胞测序数据的差异表达分析方法总结-single cell differential expression

是比较两组不同样本基因表达异同的基本方法，可获得一组样本相对于另一组样本表达显著上调（up-regulated）和下调的基因（down-regulated），从而可进一步研究这些差异表达基因的功能，包括富集的通路
AIPuFu·2020-06-20 21:45

高通量测序数据分析：RNA-seq

SRAToolkit）测序数据质控与过滤（fastp）2.序列比对（SAMtools、HISAT2）3.序列组装（StringTie、TACO）4.表达定量和差异表达分析（Salmon、DESeq2）5.GO和KEGG富集分析
精分大神·2020-06-20 15:56

关于功能富集分析的基础知识

富集分析基因富集分析（genesetenrichmentanalysis）是在一组基因或蛋白中找到一类过表达的基因或蛋白。
果蝇饲养员的生信笔记·2020-06-20 00:40

脱靶检测技术助力Cas9研究

该项研究目前主要有3个方向：首先，是CRISPRScreen文库脱靶检测1.应用目的:CRISPRScreen检测是基于用文库及选择机制后的细胞系进行二代测序，分析统计每一种sgRNAreads富集数，
一抹_暖光·2020-06-13 00:20

clusterProfiler基因功能富集分析 +气泡图

1.非模式生物非模式生物需要提前从AnnotationHub抓取目标物种的OrgDb数据库，这个库里包括Uniport，ENSEMBL，ENTREZID，REFSEQ，GO...。拥有它，你就可以实现GENENAME，ENSEMBL，ENTREZID等多种格式的自由转换。不过这个功能一些在线网站也能做到，如果只有少量数据转换，DAVID/gProfiler还是挺香的。下面以油菜(Brassica_
APExBIO·2020-06-08 11:54

clusterProfiler基因功能富集分析 +气泡图

1.非模式生物非模式生物需要提前从AnnotationHub抓取目标物种的OrgDb数据库，这个库里包括Uniport，ENSEMBL，ENTREZID，REFSEQ，GO...。拥有它，你就可以实现GENENAME，ENSEMBL，ENTREZID等多种格式的自由转换。不过这个功能一些在线网站也能做到，如果只有少量数据转换，DAVID/gProfiler还是挺香的。下面以油菜(Brassica_
西山egg·2020-06-08 11:21

对眼睛最好的3种食物，你一定得知道！比猪肝还补眼睛

不过，按照富集原理
健康生活百科·2020-06-08 00:00

在我开始摆摊之前，我的老板抢先做起了吃播

虾头里的虾黄，其实就是小龙虾的消化腺，而水体中存在的重金属等污染物又很容易在这里富集。喜欢吃虾黄的你，一定要看看这个视频再下嘴啊～上面
果壳网·2020-06-05 00:00

2020-05-31 学习maftools : 可视化分析SNV（二）

续昨天的学习，不过是重启了一下，临床富集分析又可以做了，但是Signature分析这一步开始出现了新的错误，后面解决。不知道为什么GitHub都打不开连接了，好多资料都找不到。
程凉皮儿·2020-06-02 08:39

什么瑞典丸子，中国的1万种丸子，不香吗？

一颗丸子里，富集了华夏烹饪技艺的精华——华北酥脆的干炸丸子，江南醇香的蟹粉狮子头，湖南咸浓的猪血丸子，福建弹嫩的花枝丸，潮汕手打的牛肉丸……蒸、煮、煎、炸无所不能，鲁、淮、湘、粤无所不包。
果壳网·2020-05-30 00:00

不到一年，这家券商又换帅！80后接任总经理一职，这家互联网券商有何新招式？

记者此前了解到，事实上，东方财富集团一直有意培养郑立坤，84年生人的他，是东财系的核心人物之一。再换总经理天眼查数据显示，东方财富证券5月21日出现两项变更：负责
券商中国·2020-05-26 00:00

碘与甲状腺的那些纠葛，专业营养师帮你捋一捋

生物从大自然获得碘，可富集而高于自然界的碘浓度，海洋生物＞陆地生物，陆地的动物＞植物。人作为生物链最顶端，所需碘主要来源于动植物（80%-90%），少部分来源于空气和水（10
健康报·2020-05-15 00:00

【转载整合】RNAseq data的network analysis的不同做法，原理和方案

网络：其实就是“图”，由点（node）和边（edge）组成一般来讲，探索基因表达数据的标准流程是这样：差异表达分析:研究转录水平不同处理的差别的原因基因富集分析(GO/KEGG)。
Geekero·2020-05-06 09:24

TCGA_09

GEO0.背景火山图就是ggplot2点图KEGG富集分析BgRatio（background）：该通路总基因/收录KEGG的总基因GeneRatio：输入的差异基因数中属于该通路的/输入的所有差异基因人与动物
沈住氣·2020-04-18 10:47

刘小泽学习GSEA

2020.1.22-23自从上次写过豆豆在UM的第一天就开始了适应过程，到现在也适应差不多了，一切步入正轨，赶在过年之前发一波我们经常听说：GeneSetEnrichmentAnalysis、GSEA、基因集富集分析
刘小泽·2020-04-14 13:16

【好白相】夏日来临，这些避暑景点你不容错过！

桂花岛上佳境胜景众多，猴子跳水、蟠龙台、通天石门、玉兔蟾宫、岩桂问猴、鞋帽台、问字石等等，可谓蔚为大观，不愧是规模大、品位高、景观富集的经典湖岛旅游景区呢！桂花岛上的鞋帽台岩溶如屏，间有透光圆窦
康达国旅x好白相·2020-04-14 07:33

在线绘制桑基图

http://112.125.26.206:3001/alluvial-diagram/现在许多文章都利用桑基图来展示ceRNA网络、功能富集等图，也有很多R包专门可以用来画桑基图，不过小编在这里发现ggplot2
呆呆聊生信·2020-04-13 21:59

今天是10月17日，是国际消除贫困日

是联合国组织在1992年12月22日会议上通过47/196决议，由1993年起把每年10月17日定为国际灭贫日，用以唤起世界各国对因制裁、各种歧视与财富集中化引致的全球贫富悬殊族群、国家与社会阶层的注意
天云祥·2020-04-12 09:53

鼓捣币：比特币今日冲高未果，主流币多数下跌

Beincrypto文章称，似乎LTC和USDT的财富集中度相比其他
碍人峰·2020-04-11 23:55

探访2017香港首届“文化+金融”论坛

论坛由世界华人宗亲研究会总会、世界投融資論壇(北美)、亚太中心企业联会总会、香港一带一路国际联合总会、中国红富财富集团有限公司、中财信达(北京)投资管理有限公司、北京惠民富民基金管理有限公司、中視
养生经济·2020-04-11 09:48

碧玉为什么有黑点？对价值影响有多大？

可是，当这些离子富集的时分反而会构成黑点。由于铬离子在地壳中
珠宝大课堂·2020-04-11 03:31

央视新闻：时汇创富骗取投资者的资金，揭露亏损内幕？

时汇创富集团网址域名成立时间为2017年8月9日，时间很新。
Eternity_9387·2020-04-10 19:35

规模大带来的好处

其次，规模大微生物环境才能营造得更好，有利于微生物的富集
党群薛慧·2020-04-10 04:30

（转帖）-GO enrichment (Easier)

这一次配置文件分为两个txt文档，分别存有上调和下调基因的GO富集结果，数据格式如下图所示：左边是上调基因GO富集的结果，右边是下调基因GO富集的结果，每边1-4列分别是GOterms,Genenumber
苏慕晨枫·2020-04-10 00:31

第8篇：用网页版工具做功能分析和motif分析

除此之外，下游分析通常还包括鉴定我们感兴趣的蛋白质结合的motif；鉴定这些结合区域的基因以及这些基因的富集通路或网络。
六六_ryx·2020-04-09 23:07

Metascape

之前本来准备使用DAVID软件进行基因富集分析的，后来听说DAVID更新比较慢，最近一次更新是2016年，上一次的更新则是2012年，还是在被Nature点名批评之后进行的更新。
Stone_Stan4d·2020-04-08 13:27

折腾了许久才复现出的WGCNA图-GSE106292你值得拥有

表格如何读入R里面，做出作者文章中那样的图，但是分组很复杂，需要去文章中找细节内容，老大jimmy还写了篇推文：没有生物学背景的数据分析很危险，反反复复重做了好几次，终于做出和文章中的WGCNA的图和富集分析的结果非常接近的答案
小梦游仙境·2020-04-08 06:30

创新，与人和团队的智慧并无必然关联！

自由活泼、洋溢着咖啡文化的创业氛围，宽容失败的创新发展文化，丰富集聚的智力资源，能够充分激励人们创新激情的奖励制度，等等外部条件，一度成为倡导、鼓励创新地
老卢庸观·2020-04-08 05:11

云享富集团董事长何演婷2018新年贺词

我是何演婷，云享富集团董事长。狗年到来，携集团所有员工祝云享富所有会员新春大吉，合家安康，旺丁旺财，小孩子聪明伶俐，老人家福寿康宁，投身工作的青年步步高升。商城2.0版本在新春到来之前已经升级完毕！
冷月清泉·2020-04-08 03:39

真核生物mRNA测序

一、真核生物mRNA的结构：image.png二、建库方式：真核生物mRNA含有poly-A尾，因此最常用的富集真核生物mRNA的方法就是采用附着poly-Toligo的磁珠从totalRNA中抓取mRNA
HOLLYxiao·2020-04-07 22:57

2019-12-30触摸一体机的特点

明联电子技术研发与生产教育一体化机以其精华（黑板互动和视听富集），消除浮渣（黑板单调性和视听单极性）为基础，从根本上解决了过去的问题和教育形式的不足；真正完成“互动式”教学，完成高质量、高能力的教育形式
东安盛·2020-04-06 04:39

文献：Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expressi...

我们提供了一种方法，叫做基因集富集分析（GSEA），用来实现这个目标。它具有相似功能的基因作为一个基因集，作为操作的单位。我们通过一些癌症数据来演示其如何进行。
康君爱上了蕊酱·2020-04-05 21:36

《地下与天空》目录

全球核心能源城市月原群岛因地震意外发生大规模核爆炸，大量放射性物质泄露入海，连锁反应导致人类几乎灭绝，各地幸存者躲入地下建立了新的王国，因地表辐射严重，变异丛生，各国均大力发展无人机技术，用无人机打击异种，收集其大脑富集的放射元素
千光一·2020-04-05 21:19

3月贵州，你都去了吗？

旅游资源贵州旅游资源富集，分布广、类型多、品位高、保护好，是名符其实的自然风光“大公园”和民族文化“大观园”。
小铃子_2015·2020-04-05 04:12

杭州、上海 5 月场 | R 语言与表达数据挖掘培训班开始招生

然而还是会遇到问题：临床医生科研本就薄弱，做实验攒数据劳心劳力；梦想升主治医师，评职称拿基金全要拼SCI文章；好不容易得到测序数据，聚类分析、富集分析还是不会做；想用R语言分析基因芯片，但是不知道如何入手
丁香园·2020-04-05 00:00

合并案和倒闭潮背后，O2O创业者怎么了？

劲霸·创富汇以“闻道、授业、解惑、维新”为宗旨，致力于汇聚有着共同价值观和责任感的创富者，构建一个充满正能量，充满梦想，极具感召力的创富集体。
Alter聊IT·2020-04-03 17:03

KEGG是什么：快速了解KEGG

我们有时候很关心基因所在的pathway、上下调控以及一堆基因富集到的pathway，再或者同源基因等信息，KEGG数据库也算是目前（注释）常用的明星数据库KEGG：京都基因和基因组百科全书：KEGG项目于
Amy_Cui·2020-04-02 22:30

基因集富集分析

基因集富集分析(GeneSetEnrichmentAnalysis,GSEA)的基本思想是使用预定义的基因集，通常来自功能注释或先前实验的结果，将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序，然后检验预先设定的基因集合是否在这个排序表的顶端或者底端富集
王诗翔·2020-04-01 23:08

20171127 - 主要矛盾

有谁知，这股指创富的过程，就是互联网行业强者越强，大者越大，财富集中，创业公司压力巨大的体现。另一方面，眼疾手快的转发和支持北京外来人口整顿搬迁的新闻和评论，表达自己对所谓低端人群的同情。
Will·2020-04-01 23:31

村小校长的良方

学校越办越洋，规模越来越大，它们以优越的区域优势、丰富的生源优势，还有政策的“特别关注”优势，占尽了天时地利人和，在人、财、物富集的环境，领跑在教育发展的前沿。但是，
935ff7f93a4b·2020-03-30 17:37

二八法则你学会了没有？

1897年，意大利经济学家帕列托在对19世纪英国社会各阶层的财富和收益统计分析时发现：80%的社会财富集中在20%的人手里，而80%的人只拥有社会财富的20%，这就是“二八法则”。
马克图布了·2020-03-30 09:33

推出科技业务板块，玖富集团布局未来十年

诸如刚刚完成6500万美元D轮融资的玖富集团，就马不停蹄的开始了集团业务板块的战略升级。6月25日，玖富集团在京举行了主题为“科技赋能玖富先行”的玖富
邻章·2020-03-29 17:36

如何成为说服大师01

后来杜老师研究的结果呢发现了一个秘密这个世界上95%的财富集中在5%的人的口袋里这个世界上有钱人多还是少？少嘛95%的人的钱财富其实加起来可能还不如5%的少数人所拥有的财富有没有可能？
山涧清溪·2020-03-29 15:18

GSEA分析结果详细解读

在解读传统的富集分析结果时，经常会有这样的疑问，一个富集到的通路下，既有上调差异基因，也有下调差异基因，那么这条通路总体的表现形式究竟是怎样呢，是被抑制还是激活？
生信修炼手册·2020-03-29 09:31

GO富集分析&pathway分析

目的：通过GO富集分析，可以将差异表的的基因按照其功能进行归类，达到对基因进行注释和分类的目的。
风中的鱼儿·2020-03-29 08:29

穿越槟榔谷 寻天使之城

这是一片张家界地貌和喀斯特地貌富集区，森林草地覆盖率超过80%。其间，刀劈斧削的石柱刺
流浪三毛_b76f·2020-03-28 13:15

一文掌握GO和pathway分析

非原创参考资料：一文掌握GO和pathway分析-生物信息学讨论版-丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124一.GO富集GO是Geneontology
wangprince2017·2020-03-28 10:39

中原大讲堂｜王玉：从梅溪沙看公益性地名文化讲座举行

地名文化灿若星河，独特富集。南阳益博社会工作服务中心致力于南阳地名文化的保护、传承和弘扬，实施的南阳地名文化大宣讲大宣讲项目得到国务院地名普查办和民
益博社会工作·2020-03-28 01:58

玖富12年合作40多家银行总行共建科技赋能生态链

6月25日，玖富集团在北京昆泰酒店，举行了主题为“科技赋能，玖富先行”的科技战略升级发布会，宣布正式启用“玖富科技”品牌，旗下AI及区块链公司成立。
互联网新观察·2020-03-27 20:40

biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置

但是关于本体论和富集分析，大家还是有点小困难。当然我自己交东西也慢了很多，因为时间也总是不太够，完全靠周末挤出来。
徐洲更hoptop·2020-03-27 18:47
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