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生物信息学
数据挖掘 and
生物信息学
之旅
目录前言:
生物信息学
历史
生物信息学
主要应用数据挖掘和
生物信息学
的关系前言:我的
生物信息学
之旅始于一位导师的指引。
heart_6662
·
2023-01-21 10:04
生物信息学
数据挖掘
人工智能
DNA和RNA修饰的鉴定和编辑技术前沿综述 (全文翻译版)
生物信息学
习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
·
2023-01-21 10:31
编程语言
人工智能
大数据
java
机器学习
积微论坛--用微生物组时序数据重现生物膜装配动态过程PPT对应的讲解和提问
生物信息学
习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
·
2023-01-21 10:31
大数据
机器学习
人工智能
数据分析
数据挖掘
如何自学
生物信息学
:从菜鸟到专家
一、
生物信息学
:源起人类基因组计划(HumanGenomeProject,HG
简佐义的博客
·
2023-01-20 13:49
编程语言
人工智能
大数据
java
微软
生物信息学
主要研究方向
生物信息学
主要研究方向
生物信息学
利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。目前的
生物信息学
基本上只是分子生物学与信息技术(尤其是因特网技术)的结合体。
weixin_30439031
·
2023-01-20 13:13
数据库
人工智能
生物信息学
简史
生物信息学
简史2018-08-15,7127words,26minread前几天看到Briefingsinbioinformatics发了一篇文章介绍
生物信息学
发展历史。
wangchuang2017
·
2023-01-20 13:13
其他
life science 研究领域之
生物信息学
lifescience研究领域之
生物信息学
不读名校吗2018-08-0217:35点击标题下「bangbangacademy」可快速关注No.1
生物信息学
什么是
生物信息学
生物信息学
(Bioinformatics
wangchuang2017
·
2023-01-20 13:43
其他
【
生物信息学
】现在及未来,学习规划及入门
1.关于
生物信息学
生物信息学
大家并不陌生,但自己好像从未思考其来源和本质,最近在读到有关书籍中有如下介绍:Bioinformaticsisaninterdisciplinaryfieldthatdevelopsmethodsandsoftwaretoolsforunderstandingbiologicaldata.Asaninterdisciplinaryfieldofscience
爱做饭的电饭煲
·
2023-01-20 13:11
科研高效工具-种草
学习
动态规划
算法
肿瘤(Oncology)
生物信息学
分析简介
肿瘤(Oncology)
生物信息学
分析简介肿瘤简介肿瘤是临床上患者死亡最常见的原因,是发生在机体某个系统多个器官、某个器官多个系统,或者这两种情况共同存在的一种复杂的疾病。肿瘤分为良性肿瘤和恶性肿瘤。
荞麦agan
·
2023-01-20 13:34
生物信息学
生物学
生物信息学
生物信息学
的发展与未来
1.发展历史今天我们大部分人认为,现代
生物信息学
是最近出现的,有利于下一代测序数据分析。然而,
生物信息学
的起源发生在50多年前,当时台式计算机仍然是一个假设,DNA还不能测序。
Bioinfor 生信云
·
2023-01-20 13:32
生物信息学
人工智能
大数据
科技
开源
健康医疗
【数学建模/数据分析论文写作】图表制作 | 数据可视化常用工具整理
致力于
生物信息学
/医学图像分析等领域,对计算机方向的特别友好~网址跳转:①http://sangerbox.com/Tool②http://vip.sangerbox.com/home.html派森诺基因云很多很多
RickieLim
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2023-01-18 00:23
Data
Visualization
1024程序员节
数据分析
数据挖掘
数据可视化
可视化
送书《R语言数据分析和可视化》 | 这个为生信学习和生信作图打造的开源R教程真香!!!...
生物信息学
习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
·
2023-01-17 09:41
编程语言
数据可视化
人工智能
数据分析
数据挖掘
Bioinformatics|MGPLI:探索蛋白质-配体相互作用预测的多粒度表示
Bioinformatics|MGPLI:探索蛋白质-配体相互作用预测的多粒度表示最近搞了个公众号《AIandBioinformatics》介绍应用于
生物信息学
的人工智能算法和研究进展,以及网络表示学习算法研究
Struggle~
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2023-01-16 09:38
生物网络文章
深度学习
人工智能
anaconda 删除环境_Anaconda:解决你装包的烦恼
生物信息学
的日常就是利用五花八门的工具和各种各样的数据打交道,很多时候需要在命令行安装软件或者包。
weixin_39960147
·
2023-01-14 14:11
anaconda
删除环境
anaconda删除环境
anaconda安装包
anaconda添加清华镜像
IB生物笔记:Structure and function of organelles
OptionalTopics包括∶神经与行为学,生物科技与
生物信息学
,生
IB_course
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2023-01-13 13:02
学习
MATLAB | 如何使用MATLAB绘制序列logo图
这次开发了一个
生物信息学
比较常用的序列logo图绘制MATLAB代码包,绘制效果如下:数据来自基迪奥生物项目编号为seqlogojrois9l2jit的示例数据。
slandarer
·
2023-01-11 19:37
#
MATLAB
科学绘图
matlab
开发语言
python
生物信息学
_序列比对(一)序列比对概述
比较是科学研究中最常见的研究方法之一,通过比较寻找研究对象可能具备的某些特征和特性。序列比较的理论基础是进化学说:如果两个序列之间具有足够高的相似性,那么两者可能是共同的进化祖先经过序列内残基的替换,残基或序列片段的缺失或插入以及序列重组等遗传变异过程分别演化而来。序列比较的目的主要有两点:根据相似性通过已知序列来预测未知序列的结构和功能推断序列之间的同源性,推测进化关系相似性同源性任意两条序列都
金石就好
·
2023-01-11 08:57
生物信息学
生物信息学
知识图谱-
生物信息学
-医学论文(BMC Bioinformatics-2022)-挖掘阿尔茨海默病相关KG来确定潜在的相关语义三元组用于药物再利用
论文标题:MiningOnAlzheimer’sDiseasesRelatedKnowledgeGraphtoIdentityPotentialAD-relatedSemanticTriplesforDrugRepurposing论文地址:https://arxiv.org/pdf/2202.08712论文期刊:BMCBioinformatics20229.(2022.2.17)BMCBioinf
Cheng_0829
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2023-01-10 09:01
知识图谱
知识图谱
人工智能
机器学习
自然语言处理
生物信息学
R 语言 4.2.2安装 WGCNA
文章目录1WGCNA库介绍2安装踩坑还得是官方文档这样安装我出现的问题参考AppendixA.安装RB.配置环境C.修改镜像1WGCNA库介绍WGCNA是用于加权相关网络分析的R包,相关网络越来越多地用于
生物信息学
应用加权基因共表达网络分析是一种系统生物学方法
LiQiang33
·
2023-01-09 19:31
编程环境配置
杂文
r语言
开发语言
【
生物信息学
】ATAC-seq流程及代码分析、复现文章
1:ATAC-seq的定义及用途whatisATAC-seq全称是AssayforTransposase-AccessibleChromatinsequencing即借助Tn5转座酶对开放染色质区域进行高通量测序主要原理:Tn5转座酶可以对染色质开放区域DNA切割并添加测序接头,然后进行高通量测序就取得了开放染色质区域的测序数据。与其他技术比较(DNase-Seq,FAIRE-Seq)ATAC-s
爱做饭的电饭煲
·
2023-01-09 17:16
中科大研究生考试
ATAC-seq
生物信息学ATAC
关联规则挖掘(Apriori算法和FP-Growth算法)
一、关联规则概述1.关联规则分析用于在一个数据集中找出各种数据项之间的关联关系,广泛用于购物篮数据、个性化推荐、预警、时尚穿搭、
生物信息学
、医疗诊断、网页挖掘和科学数据分析中2.关联规则分析又称购物篮分析
小盗啊1247949232@qq.com
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2023-01-08 14:33
Python
算法
大数据
机器学习
机器学习在生物信息(如DNA比对等方面)的研究现状是怎样的?
所以来知乎跪求学
生物信息学
的大佬们分享下当前的研究情况以及需要机器学习解决什么问题。答几个比较简单的应用,以我和朋友今年的毕业设计为例:Nanopore的三代测序题主都很熟悉,简单说就是
wangchuang2017
·
2023-01-07 17:40
其他
数据库
sql
生物信息学
中的机器学习:使用K-Means和PCA进行基因组序列分析 COVID-19接下来如何突变?
许多人没有想到,病毒就像地球上为生存而挣扎的其他生物一样,它们会进化或变异。只要看一看人类病毒来源的蝙蝠携带的病毒RNA序列片段即可。AAAATCAAAGCTTGTGTTGAAGAAGTTACAACAACTCTGGAAGAAACTAAGTT…以及人类COVID-19病毒的RNA序列的摘录…AAAATTAAGGCTTGCATTGATGAGGTTACCACAACACTGGAAGAAACTAAGTT…显
python机器学习建模
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2023-01-07 17:04
python生物信息学
机器学习
kmeans
人工智能
机器学习 及其在
生物信息学
的应用
由于我现在的方向是
生物信息学
,所以给大家推荐一本书,叫《
生物信息学
:机器学习方法》,网上提供下载,我就不放在附件中了。
0x0101
·
2023-01-07 17:34
bioinformatics
人工智能
php
数据库
变异记录文件格式 vcf
vcf文件做记录个体或群体突变的文件格式,在
生物信息学
应用中举足轻重。主流的生物信息分析软件,在处理变异信息时,也基本上需要考虑支持解析或输出vcf格式的文件。
新爷话数据
·
2023-01-07 16:33
生物信息学
生物信息学
|药物发现中的机器学习技术(1)
本篇推文引自:Advancedmachine-learningtechniquesindrugdiscovery1.摘要: 机器学习(ML)在药物发现中的持续增长,产生了令人印象深刻的结果。随着它们的使用增加,它们的局限性也变得越来越明显。这些局限性包括它们对大数据的需求、数据的稀缺性以及缺乏可解释性。也很明显的是,这些技术并不是真正自主的,即使在部署后也需要再训练。在这篇综述中,我们详细介
ShenggengLin
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2023-01-07 16:02
生物信息学
药物发现
机器学习
生物信息学
|药物发现中的机器学习技术(2)
本篇推文引自:Advancedmachine-learningtechniquesindrugdiscovery1.迁移学习 如果数据量比较少,那么有一些技术可以用来规避这个问题。迁移学习就是这样一种技术,它是将从解决一项任务中获得的知识转移到另一项相关任务的过程。迁移学习是一种越来越流行的ML框架,特别是在医学图像分类中,它包含了一系列技术。迁移学习是通过从已经学习的相关任务中转移知识来改
ShenggengLin
·
2023-01-07 16:02
机器学习
药物发现
当生物信息遇见机器学习
比如
生物信息学
里面的:回归分析、随机森林、支持向量机等算法,都是比较成熟的应用了。那今天本文,就给大家剖析一下当生物信息遇见机器学习,会有什么火花。
新爷话数据
·
2023-01-07 16:01
机器学习
论文解读《STALLION:一个基于堆叠的原核赖氨酸乙酰化位点预测的集成学习框架》
识别蛋白质赖氨酸乙酰化(Kace)位点是
生物信息学
中的一项具有挑战性的任务。到目前为止,几种基于机器学习的方法,在硅中识别Kace站点的方法已经被开发出来。其中,少数是原核生物物种
HXH@
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2023-01-06 16:28
集成学习
机器学习
人工智能
利用计算机辅助药物设计方法有何优点,计算机辅助药物设计的原理及应用
刘景陶+刘映雪摘要:计算机辅助药物设计(computeraideddrugdesignCADD)是以计算机的数值计算、逻辑判断、图形处理和数据库技术与功能为载体,运用化学和
生物信息学
提供的信息资源,直接模建或间接虚拟靶点图像
weixin_39630813
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2023-01-05 15:58
R语言机器学习mlr3:模型解释
获取更多R语言和生信知识,请欢迎关注公众号:医学和生信笔记医学和生信笔记公众号主要分享:1.医学小知识、肛肠科小知识;2.R语言和Python相关的数据分析、可视化、机器学习等;3.
生物信息学
学习资料和自己的学习笔记
医学和生信笔记
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2023-01-05 02:20
R语言机器学习
r语言
机器学习
数据挖掘
python
R语言机器学习mlr3:技术细节
获取更多R语言和生信知识,请欢迎关注公众号:医学和生信笔记医学和生信笔记公众号主要分享:1.医学小知识、肛肠科小知识;2.R语言和Python相关的数据分析、可视化、机器学习等;3.
生物信息学
学习资料和自己的学习笔记
医学和生信笔记
·
2023-01-05 02:49
R语言机器学习
r语言
机器学习
python
一起学习关于Biclustering的那点东西
双聚类算法之学习记录(1)前言双聚类简介背景与意义双聚类算法评估指标最后前言在读计算机专业硕士一枚,课题组方向为
生物信息学
,主要研究方向是双聚类算法。
普普通通的小C
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2023-01-05 00:30
聚类
算法
生物与编程的碰撞
之所以产生并开始学习编程一个大原因是因为21世纪毕竟是一个数据爆炸的时代,而如何处理数据,找到数据背后的规律也是生物专业所必需的技能,也因此催生了生物专业较为热门的小专业--
生物信息学
。
donerest
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2023-01-04 18:41
C/C++
c语言
学习
生物化学 单个基因
生物信息学
分析笔记
单个基因
生物信息学
分析01基因结构预测和功能注释选择基因文件及物种预测结果02蛋白结构域预测03同源基因分析04多序列比对05蛋白二级三级结构预测06蛋白特性分析07跨膜结构分析08信号肽分析09亚细胞定位预测
FakeOccupational
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2023-01-04 08:16
深度学习
人工智能
生存分析及生存曲线_2021-01-30
生存分析(英文:SurvivalAnalysis),是
生物信息学
分析中常用到的一种重要方法,主要分析场景如:不同组癌症病人在一种或者一种以上的变量作用下其生存概率随着记录时间发展而发生的变化或者走势。
知无牙
·
2022-12-31 08:23
R数据可视化
数据可视化
R
R数据分析
没有网也可以安装 Conda 环境
生物信息学
习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2022-12-30 09:47
java
linux
python
编程语言
大数据
lasso回归结果一行代码提取及美化
主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、
生物信息学
等。
医学和生信笔记
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2022-12-30 04:42
可视化
回归
r语言
python
2021年总结
今天整理了硕士期间学习分子生物学、
生物信息学
及基因敲除
Han_zh
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2022-12-29 21:29
送书 | 222Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA
生物信息学
习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述
生信宝典
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2022-12-29 15:55
大数据
python
人工智能
机器学习
编程语言
自学
生物信息学
(思维+超全常用网站)
如果你有以下情况,你可以做什么?一个基因或一种蛋白质1、在DNA水平上2、在转录层面3、在蛋白质水平上一组基因/蛋白质芯片高通量测序数一系列测序数据生物学问题一个基因或一种蛋白质1、在DNA水平上这个基因的基因组位置是什么?它是否有串联复制的副本?基因的外显子/内含子结构是什么?基因内是否有可转座子元素?表观遗传学条例?转录因子结合?geneXplainTRANSFAC功能数据库(转录因子、它们在
小飞棍来喽~
·
2022-12-29 03:34
数据库
常用
生物信息学
数据库简介
常用
生物信息学
数据库简介1、常用数据库NCBI(美国国家生物数据库)EnsemBI(欧洲生物数据库)Uniprot(蛋白质数据库)2、[在线工具galaxy](https://usegalaxy.org
小飞棍来喽~
·
2022-12-29 03:03
数据库
生物信息学
中用到的计算机知识,
生物信息学
期末复习知识点总结
生物信息学
:利用数学、物理、化学的理论、技术和方法,以计算机为工具,对生命现象加以研究,得到深层次的生物学知识。
量投科技-于少伟
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2022-12-28 20:45
生物信息学中用到的计算机知识
【2022年】中科大研究生-考试题、复习资料汇总(往年真题+复习资料)(持续更新中)
无论是学习问题,还是交流
生物信息学
、科研相关问题,很荣幸能与你共同学习!最后再次感
爱做饭的电饭煲
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2022-12-28 20:14
2022年中科大考试
中科大研究生
研究生复习资料
博士申请 | 香港城市大学王鲁生教授招收
生物信息学
方向全奖博士生
合适的工作难找?最新的招聘信息也不知道?AI求职为大家精选人工智能领域最新鲜的招聘信息,助你先人一步投递,快人一步入职!香港城市大学香港城市大学是一所坐落于香港九龙塘的公立研究型大学。2022年QS世界大学排名第53名,QS建校未满50年最佳大学第4名,ARUW工程/技术/计算机科学香港地区第1名,泰晤士全球最国际化大学第1名。校园地处九龙塘商业区,港铁九龙塘站,背靠狮子山,眺望九龙半岛和维多利亚
PaperWeekly
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2022-12-27 11:19
人工智能
生物信息学
|用于预测药物-药物相互作用事件的多模态深度学习框架
本篇推文引自:Amultimodaldeeplearningframeworkforpredictingdrug–druginteractionevents1.摘要 动机:药物-药物相互作用(DDIs)是药物研究的主要关注之一。很多基于机器学习的方法被提出用于DDI的预测,但大多数都是预测两种药物是否相互作用。研究发现DDIs可引起不同的后续事件,预测DDI相关事件更有助于探讨联合用药或不良
ShenggengLin
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2022-12-27 11:47
生物信息学
计算机辅助药物设计
药物相互作用
深度学习
生物信息学
机器学习
人工神经网络原理与实践,人工神经网络实战教程
至今已有数种深度学习框架,如深度神经网络、卷积神经网络和深度置信网络和递归神经网络已被应用在计算机视觉、语音识别、自然语言处理、音频识别与
生物信息学
等领域并获取了极好的效果。另
普通网友
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2022-12-27 06:28
深度学习
人工智能
BGI-College生信入门系列——2、什么是数据?
生物信息学
中的数据传统的生物学家可能会认为,
生物信息学
是一种将数据转换成结果的软件。实则不然,
生物信息学
只是将一种格式的数据,转
华大基因学院
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2022-12-25 23:04
生信入门
python
r语言
big
data
GEO芯片数据分析更新(补富集分析与WGCNA)
GEO数据挖掘,表达芯片分析举例:王同学近期拟通过
生物信息学
相关软件与数据库来探讨女性非抽烟者的非小细胞肺癌预后相关的显著性基因及潜在的治疗靶点,他在NCBI上查询到了1套芯片数据GSE19804。
Annaaphq
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2022-12-25 22:08
数据分析
数据挖掘
r语言
知识图谱-
生物信息学
-医学顶刊论文(Bioinformatics-2021)-KG4SL:用于人类癌症SL预测的知识GNN
5.(2021.7.12)Bioinformatics-KG4SL:用于人类癌症SL预测的知识GNN论文标题:KG4SL:knowledgegraphneuralnetworkforsyntheticlethalitypredictioninhumancancers论文地址:https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/Supplement_
Cheng_0829
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2022-12-25 03:46
知识图谱
知识图谱
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