转录

本周最新文献速递20220313

Predictionofhistonepost-translationalmodificationpatternsbasedonnascenttranscriptiondata不想看英文题目：基于新生转录数据的组蛋白翻译后修饰模式预测杂志和影响因子
橙子牛奶糖·2023-10-31 18:02

Abbkine GAPDH小鼠单克隆抗体解决方案

除了这一早已确立的代谢功能外，GAPDH最近还参与了一些非代谢过程，包括转录激活、细胞凋亡的启动、内质网到高尔基体小泡的穿梭以及快速轴突或轴浆运输。
Sylvia_sc·2023-10-31 14:15

IF: 4+ 通过共表达网络鉴定急性心肌梗死患者血小板转录组关键基因模块和通路

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你81篇原创内容-->公众号这期分享一篇贼简单的4+文章，2021年4月发表在AmJTranslRes.通过共表达网络（WGCNA）分别鉴定了ST段抬高型心肌梗死（STEMI）和非ST段抬高型心肌梗死（NSTEMI）中血小板相关的中枢基因。摘要急性心
90066456ace6·2023-10-31 09:55

cDNA_Cupcake处理Iso-Seq

该工具用于处理三代转录组（CCS）结果具体请关注：https://github.com/Magdoll/cDNA_Cupcake/wikihttps://github.com/Magdoll/cDNA_Cupcake
斩毛毛·2023-10-31 01:42

10X单细胞空间联合分析之cell2location的详细梳理

这里演示了如何使用cell2location模型将单个细胞参考细胞类型映射到空间转录组数据集。
单细胞空间交响乐·2023-10-30 23:09

Plant Cell | DAP-seq和ATAC-seq助力构建玉米胚乳发育调控网络

三个关键转录因子，即NAKEDENDOSPERM1(NKD1)、NKD2和OPAQUE2(O2)，在玉米
爱基百客·2023-10-30 11:22

10X空间转录组 & 10X单核转录组联合分析解析肥厚性心肌病的调控机制

hello，大家好，又到了周五了，一周的收官之战，今天分享的内容有点多，涉及到很多单细胞和空间的分析方法，我们要精读并且进行深入的解析，我认为方法都很经典，而且运用的也比较好，我们慢慢逐一解析，文章在Lineage-specificregulatorychangesinthepathologicalcardiacremodelingofhypertrophycardiomyopathyunrave
单细胞空间交响乐·2023-10-30 05:48

免疫学—树突细胞_Immunity

2020年1-3月供推荐56篇单细胞领域高分文章（2020年一季度·单细胞文献速递56篇）序号：2020-122编者按：IRF8决定了树突细胞的发育命运差异性IRF8转录因子需求定义了人类树突状细胞发育的两种路径
安哥生个信·2023-10-29 23:55

转录组从下机数据到GO、kegg、GSEA

具体软件参数，见转录组全新学习之总篇clusterProfiler小试牛刀#!/bin/bash#复制下机数据到新的文件夹data,尽量避免操作原始文件~/disk/lyb/find.
wo_monic·2023-10-29 13:55

单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正

本文是参考学习单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正的学习笔记。可能根据学习情况有所改动。前言实际的科研项目中不可能只有一个样本，多样本的单细胞数据如何合并在一起，是否需要校正批次效应呢？
Seurat_·2023-10-29 02:39

常见慢性病形成原因及调养 • 高血压

只好直接转录文字过来。希望这里的分享能在日常慢性病调养和健康风险监测时帮到大家。中医治疗重点在于调整身体阴阳的平衡，一向防大于治，是从根本上解除高血压病发生和发展原因。高血
瑟诺玉·2023-10-28 23:43

ChIP实验简介

ChIP实验简介一、ChIP实验的作用染色质免疫沉淀(ChIP)是研究体内蛋白质-DNA相互作用的一种有价值的方法，鉴定各种DNA相互作用蛋白(如转录因子和调节因子、修饰组蛋白和表观遗传修饰因子)的结合位点和模式是必不可少的
卡梅德生物·2023-10-28 16:15

221002李克富 | 心理咨询的任务

起床就看到了一个大约30秒的短视频，题目叫“心理治疗的任务是什么”，转录成文字如下：我经常说，心理治疗的任务，不是让来访者变得更好，说不定会让他们的症状加重，因为他们可能会感受到人性的黑暗，看到世事险恶和亲密关系中的无奈
千千若水·2023-10-28 12:17

2022-04-09

-04-0910:49收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=54.908推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、作者介绍了EasyFuse，一种机器学习计算工具，用于检测从人类癌症样本中获得的转录组数据中的癌症特异性基因融合
图灵基因·2023-10-28 12:39

RNA-seq 详细教程：分析准备（3）

学习目标了解RNA-seq和差异表达基因的分析流程了解如何设计实验了解如何使用R语言进行数据分析1.简介在过去的十年中，RNA-seq已成为转录组差异表达基因和mRNA可变剪切分析不可或缺的技术。
冷冻工厂·2023-10-28 11:56

2018-04-13

上了一下ff14，打开了转录因子的文献也没干什么。躺床上把排
十元希·2023-10-27 23:30

单细胞scRNA-seq学习笔记6-单细胞批次效应

课程学习生信技能树单细胞转录组（基础）现在福利来了，单细胞课程免费开放了：#完整版视频上线！全！面！免！费！
天涯清水·2023-10-27 04:18

单细胞转录组基础分析七：差异基因富集分析

本文是参考学习单细胞转录组基础分析七：差异基因富集分析的学习笔记。可能根据学习情况有所改动。
Seurat_Satija·2023-10-26 16:07

【文献解读】cell-发育中的人类心脏的时空、器官范围的基因表达和细胞图谱

在这里，我们提出了一种分子方法，揭示了胚胎心脏在三个发育阶段的细胞类型的全面转录景观，并将细胞类型特异性基因表达映射到特定的解剖结构域。空间转录组学鉴定了在每个发育阶段对应不同解剖区域的独特基因图谱。
六博说·2023-10-26 13:45

【单细胞转录组】KEGG通路反推基因列表

#寻找通路和基因的关系library(clusterProfiler)mmu_kegg<-clusterProfiler::download_KEGG("mmu")names(mmu_kegg)head(mmu_kegg$KEGGPATHID2NAME)head(mmu_kegg$KEGGPATHID2EXTID)PATH2ID<-mmu_kegg$KEGGPATHID2EXTIDPATH2NAM
Geekero·2023-10-26 06:04

10X单细胞（10X空间转录组）之单细胞精度分析细胞通讯

开工了，到了我们上班的时间了，刚开始，我们来分享一些新出现的方法，看看方法上有哪些更新，我们虽然做不了潮流的引领者，但是要跟随潮流，保证自己不被时代抛弃，今天分享的文献在Comparativeanalysisofcell-cellcommunicationatsingle-cellresolution,里面对当前细胞通讯的方法做了一定的总结，我们借鉴一下，并看看作者的方法有哪些可取之处。目前的单细
单细胞空间交响乐·2023-10-26 03:34

2022-05-15

NatBiothech|通过空间转录组学与细胞类型对应关系原创存在一棵树图灵基因2022-05-1519:19收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：存在一棵树IF=54.902推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：开发了一种基于条件自回归的反卷积的方法
图灵基因·2023-10-25 20:29

转录组学习之转录本组装与定量（stringtie）[学习笔记通俗易懂版]

转录组学习之转录本组装与定量（stringtie）[学习笔记通俗易懂版]date:2023.07.25recorder:CYH-BI特别注意：本文为我自己学习的学习记录，没有任何权威，只能仅供初学者提供思路与参考
CYH-BI·2023-10-25 12:37

转录组之质量控制（FastQC）[学习笔记通俗易懂版]

转录组之质量控制（FastQC）本文简介：这篇文章是经过了自己学习实践出来的，参考了很多资料，如若有大佬能指出错误，我将感激不敬，有错误，请在评论区留言，谢谢。
CYH-BI·2023-10-25 12:07

转录组之序列剪切（Trimmomatic）[学习笔记通俗易懂版]

转录组之序列剪切（Trimmomatic）本文简介：这篇文章是经过了自己学习实践出来的，参考了很多资料，如若有大佬能指出错误，我将感激不敬，有错误，请在评论区留言，谢谢。
CYH-BI·2023-10-25 12:07

转录组学习之samtools软件[学习笔记通俗易懂版]

转录组学习之samtools软件[学习笔记通俗易懂版]date:2023.07.25recorder:CYH-BI特别注意（声明）：本文为我自己学习的学习记录，没有任何权威，只能仅供初学者提供思路与参考
CYH-BI·2023-10-25 12:07

2021-09-30-day6-重点是

主要参考百迈客医学公众号的文章“SRA数据下载的几种常见方法”和生信星球公众号的文章“生信小白第19天--转录组实战(一)”。
重点是·2023-10-25 11:44

2021-08-05 Omics Playground在线转录组和蛋白质组数据分析工具

网站链接OmicsPlayground是一个免费的生信分析平台，可以用于组学数据的可视化、分析和挖掘。适用于没有任何计算基础的生物小白，界面友好、图形可视化，没有任何编程经验的人都能用。参考文献：MurodzhonAkhmedov,AxelMartinelli,RogerGeiger,IvoKwee.OmicsPlayground:acomprehensiveself-serviceplatfor
iColors·2023-10-25 11:00

上海见 | 易基因科技与您相约2023年中国微生物学会学术年会

图片来源：中国微生物学会公众号易基因科技受邀参加会议，将携原核三代甲基化、原核转录组、宏病毒组、细菌ChIP-s
易基因科技·2023-10-25 10:03

易基因：WGBS等揭示植物基因体动态DNA甲基化与基因表达可塑性相关｜Genome Biol

尽管DNA甲基化在转座子和重复DNA沉默中的作用已得到很好的表征，但基因体甲基化与转录抑制无关，其生物学重要性尚不清楚。
易基因科技·2023-10-25 10:33

电泳迁移率变动（EMSA）实验原理

基于DNA-蛋白质或RNA-蛋白质复合体在聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）中有不同迁移率的原理，当转录因子与特异的DNA或RNA结合后，其在PAGE中的迁移率将小于未结合核蛋白转录因子的DNA
今日之森·2023-10-25 05:19

跟着NatureMetabolism学作图：R语言ggplot2转录组差异表达火山图

论文Independentphenotypicplasticityaxesdefinedistinctobesitysub-typeshttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00629-2#Sec15s42255-022-00629-2.pdf论文中没有公开代码，但是所有作图数据都公开了，我们可以试着用论文中提供的数据模仿论文中的图今天的推文重复一下论
凉亭下·2023-10-24 06:42

云原生架构及演进

本文是由AIOps社区举办的《云原生架构演进》meetup转录而来，嘉宾张晋涛，ApacheAPISIXPMCKubernetesingress-nginxreviewer，containerd/Docker
云智慧AIOps社区·2023-10-24 06:42

景联文科技：针对敏感数据的安全转录服务，护航信息安全

针对数据的安全转录服务，主要是为了确保数据在转录过程中的安全性和隐私保护。这些服务通常会采用一系列严格的安全措施，如数据加密、访问控制、数据脱敏等，以确保敏感数据不会被泄露或滥用。
景联文科技·2023-10-24 06:10

RT-PCR，QRT-PCR，real-timePCR之间的区别

RT-PCR：反转录baiPCR(reversetranscription-PCR)，是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。
斗战胜佛oh·2023-10-24 05:04

pyscenic的结果不可重复

一、pyscenic的结果不可重复最近在运行pyscenic的结果的时候发现了两次相同参数相同数据的结果存在不一致，回溯发现scenic的第一步GRN的结果已经出现了差异，转录因子和目标基因之间的importance
纷纷不可诉·2023-10-23 15:50

无央，原来是古汉语！

下面转录几处古文中的出处：《吕氏春秋·知化》:“今释越而伐齐，譬之犹惧虎而刺猏，虽胜之，其后患无央。”汉霍去病《琴歌》:“国家安寧，乐无央兮。”
魚十三·2023-10-23 14:23

发文很难吗？你只需要一个逆向思维：肿瘤TF预后

今天小编给大家带来不一样的TF肿瘤预后分析，文章发表于今年2月份FrontiersinOncology（IF：4.1）杂志，这是一篇干湿结合的关于胃癌转录因子调控影响预后的文章，实验做法简单明了，感兴趣的小伙伴可以扫码哦
概普生信·2023-10-23 10:17

使用rna-seq定量软件salmon运行index步骤遇到的一个问题（计算集群slurm）

building.html#installationgithub主页https://github.com/COMBINE-lab/salmon我最开始是直接使用conda安装的v1.4首先第一步是对参考转录组进行索引
凉亭下·2023-10-23 08:34

时间序列的单细胞转录组数据分析

——恩格斯单细胞转录组数据分析在阐述多细胞生物发育与疾病进程方面已经开发了多种新的方法，如比较有名的轨迹推断(TI，trajectoryinference)。
周运来就是我·2023-10-23 08:12

单细胞36计之31---RPKM、FPKM、TPM

简写RPKM:ReadsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedreads(每千个碱基的转录每百万映射读取的reads)FPKM:FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMi
Seurat_Satija·2023-10-23 07:33

「文献06」植入前胚胎的染色质可及性和转录组图谱

日期：2019年2月9日——2019-Week6分类：「思路,方法」题目：Anintegratedchromatinaccessibilityandtranscriptomelandscapeofhumanpre-implantationembryosDOI:https://www.nature.com/articles/s41467-018-08244-0.pdf杂志：NatureCommuni
六六_ryx·2023-10-23 05:28

学习小组Day7——林瑶

一代测序（Sanger测序）：利用双脱氧核苷酸ddNTP去摸索DNA分子二代测序构建DNA文库上样桥式PCR测序名词结构化基因组学（核酸序列分析）转录组学（基因表达分析）蛋白质组学代谢组学Day7.png
瑶_4ff9·2023-10-23 05:18

文献翻译--转录因子对可变剪接调控网络的多层控制

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276517300370摘要：协调的可变剪接事件网络在发育和疾病中起着至关重要的作用。然而，对调节这些网络的因素缺乏全面的了解。我们描述了一个高通量系统，用于系统地将反式作用因子与内源性RNA调节事件联系起来。利用这个系统，我们确定了数百个与不同调控层相关的因子，这些调控层积极或消极地控制
ECHO1216·2023-10-22 22:37

MIT 生物信息课程

DeepLearningforRegulatoryGenomics(Lecture08):在了解了基因调控的基本概念之后，这门课程进一步介绍了如何使用深度学习来预测和理解调控器结合和转录因子的绑定。
丸丸丸子w·2023-10-22 19:02

临床咨询心理学家（三）

记录信息：以书面、电子形式输入、转录、记录、存储或维护信息。向他人解释信息含义：翻译或解释信息的含义，以及该如何使用它们。详细工作活动通过观察、访谈或调查，从人们那里收
大智的自我养成手册·2023-10-22 07:34

GFAP---Gene family模块

区别点在于，该模块所针对是非转录因子且在植物中较为常见的基因家族，比如LRR,ABC家族等，至于我为什么知道这些家族是常见的，我估计应该不会告诉你我是翻阅了近500篇家族分析文章总结来的吧~秀一下界面吧稍微补充一个功能
许东·2023-10-22 05:17

本周最新文献速递20210516

20210516一文献题目：Landscapeofallele-specifictranscriptionfactorbindinginthehumangenome不想看英文题目：人类基因组中等位基因特异性转录因子结合图谱杂志和影响因子
橙子牛奶糖·2023-10-22 04:20

【RNA structures】RNA转录的重构和前沿测序技术

文章目录RNA转录重建1先简单介绍一下测序相关技术2MaptoGenomeMethods2.1Step1Mappingreadstothegenome2.2Step2Dealwithsplicedreads2.3Step3Resolveindividualtranscriptsandtheirexpressionlevels3Align-de-novoapproaches3.1Step1
丸丸丸子w·2023-10-21 22:02

RNA_seq生物分析学习--RNA-seq介绍

目录第一课课程介绍第二课RNAseq技术第三课RNAseq发展历史第四课关于基因的概念第一课课程介绍RNAseq捕获了细胞某一状态下所有的转录信息DNA是静态信息、RNA是动态信息，是某一时刻DNA表达谱的快照课程大纲
Drone_xjw·2023-10-21 20:42
上一页 7 8 9 10 11 12 13 14 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他