mcmc

R语言MCMC:Metropolis-Hastings采样用于回归的贝叶斯估计|附代码数据

p=19664最近我们被客户要求撰写关于MCMC的研究报告，包括一些图形和统计输出。MCMC是从复杂概率模型中采样的通用技术。
·2023-08-15 20:06

Python贝叶斯推断Metropolis-Hastings（M-H）MCMC采样算法的实现

MCMC的目标是从某个概率分布中抽取样本，而不需要知道它在任何一点的确切概率。MCMC实现这一目标的方式是在该分布上"徘徊"，使在每个地点花费的时间与分布的概率成正比。
·2023-08-15 20:01

拓端tecdat|Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型

p=5263在本文中，我们将在贝叶斯框架中引入回归建模，并使用PyMC3MCMC库进行推理。我们将首先回顾经典或频率论的多重线性回归方法。然后我们将讨论贝叶斯如何考虑线性回归。
·2023-08-15 20:28

拓端tecdat|Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型

p=5263在本文中，我们将在贝叶斯框架中引入回归建模，并使用PyMC3MCMC库进行推理。我们将首先回顾经典频率论的多重线性回归方法。然后讨论贝叶斯如何考虑线性回归。
·2023-08-15 20:28

拓端数据(tecdat):R语言贝叶斯推断与MCMC：实现Metropolis-Hastings 采样算法示例

p=21545示例1：使用MCMC的指数分布采样任何MCMC方案的目标都是从“目标”分布产生样本。在这种情况下，我们将使用平均值为1的指数分布作为我们的目标分布。
·2023-08-15 20:27

拓端tecdat|R语言实现MCMC中的Metropolis–Hastings算法与吉布斯采样

原文链接：http://tecdat.cn/?p=3772创建测试数据第一步，我们创建一些测试数据，用来拟合我们的模型。我们假设预测变量和因变量之间存在线性关系，所以我们用线性模型并添加一些噪音。trueA 1表示跳跃当我们运行这个算法时，它访问的参数的分布会收敛到目标分布p。那么，让我们在R中得到：########Metropolis算法# ################ proposalfu
·2023-08-15 20:27

R语言实现MCMC中的Metropolis–Hastings算法与吉布斯采样|附代码数据

p=3772原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于MCMC的研究报告，包括一些图形和统计输出。创建测试数据第一步，我们创建一些测试数据，用来拟合我们的模型。
·2023-08-15 20:53

如何改造inferCNV的热图？

inferCNV/wiki/Installing-infercnv需要依赖jags程序mac安装：brewinstalljagswindows安装：https://sourceforge.net/projects/mcmc-j
Seurat_Satija·2023-08-15 07:14

MCMC（马尔可夫链）

1.马尔可夫链由状态空间和转移矩阵定义2.齐次马尔可夫链是指未来状态的条件概率分布仅依赖于现在状态，与过去无关3.如果马氏链的每个状态都会趋于一个稳定的数值，我们称过程收敛4.如果分布π(X)使得停留在某一状态的概率与从随机采样的前期状态转移到它的概率相同，该马氏链称为平稳分布5.平稳分布就是表示在某一个时刻后，分布不再改变6.细致平衡是平稳分布的充分不必要条件，它将平稳分布与转移矩阵联系在一起7
整得咔咔响·2023-08-10 19:51

【SWAT水文模型】SWAT-CUP安装及使用

该程序将GLUE、ParaSol、SUFI2和MCMC等程序与SWAT连接起来，可以执行SWAT模型的敏感性分析、校准、验证和不确定性分析。下面介绍一下SWATCUP的安装与使用。
WW、forever·2023-08-01 10:18

英飞凌 AURIX TC3XX 系列单片机的 CAN 外设介绍（一）

2、介绍2.1、MCMCAN框架图从下图可知，一个MCMC
大橙子疯·2023-07-25 07:50

纯生信分析工具 代谢建模的高效工具箱

尽管知名的建模工具箱COBRA功能强大，但它需要大量的计算时间来进行通量平衡分析，敲除分析和马尔科夫链蒙特卡罗(MCMC)采样，这对于大规模全基因组分析来说是一种局限性。
概普生信·2023-07-14 13:20

【随机过程】 17 -离散时间马氏链典型应用

离散时间马尔科夫链的典型应用文章目录离散时间马尔科夫链的典型应用0.概述1.PageRank1.1背景1.2模型建立1.3模型求解2.MCMC2.1概述2.2实现思路2.3具体实现2.3.1第一步：细致平衡
Ciaran-byte·2023-06-24 05:50

R语言BUGS/JAGS贝叶斯分析: 马尔科夫链蒙特卡洛方法（MCMC）采样|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=17884最近我们被客户要求撰写关于BUGS/JAGS贝叶斯分析的研究报告，包括一些图形和统计输出。在许多情况下，我们没有足够的计算能力评估空间中所有n维像素的后验概率。在这些情况下，我们倾向于利用称为Markov-ChainMonteCarlo算法的程序。此方法使用参数空间中的随机跳跃来（最终）确定后验分布相关视频：马尔可夫链原理可视化解释与R语
·2023-06-22 11:21

Python用MCMC马尔科夫链蒙特卡洛、拒绝抽样和Metropolis-Hastings采样算法

p=27267我们将研究两种对分布进行抽样的方法：拒绝抽样和使用MetropolisHastings算法的马尔可夫链蒙特卡洛方法(MCMC)。像往常一样，我将提供直观的解释、理论和一些带有代码的示例。
·2023-06-20 13:10

MCMC（蒙特卡洛采样）

1.MCMC是一种随机性近似推断方法，核心思想是求复杂概率分布下的期望值2.采样的样本应该趋于高概率区域以及样本之间相互独立3.如果p(z)分布简单，可以通过概率分布采样得到所需要的样本4.大多情况下，
整得咔咔响·2023-06-19 11:32

R语言MCMC:Metropolis-Hastings采样用于回归的贝叶斯估计|附代码数据

MCMC是从复杂概率模型中采样的通用技术。蒙特卡洛马尔可夫链Metropolis-Hastings算法问题如果需要计算有复杂后验pdfp（θ|y）的随机变量θ的函数f（θ）的平均值或期望值。
·2023-06-16 00:55

MATLAB随机波动率SV、GARCH用MCMC马尔可夫链蒙特卡罗方法分析汇率时间序列|附代码数据

全文下载链接：http://tecdat.cn/?p=27340最近我们被客户要求撰写关于汇率时间序列的研究报告，包括一些图形和统计输出。波动率是一个重要的概念，在金融和交易中有许多应用。它是期权定价的基础。波动率还可以让您确定资产配置并计算投资组合的风险价值(VaR)甚至波动率本身也是一种金融工具，例如CBOE的VIX波动率指数。然而，与证券价格或利率不同，波动性无法直接观察到。相反，它通常被衡
·2023-06-13 23:26

Matlab马尔可夫链蒙特卡罗法（MCMC）估计随机波动率（SV，Stochastic Volatility） 模型|附代码数据

全文下载链接：http://tecdat.cn/?p=16708最近我们被客户要求撰写关于随机波动率的研究报告，包括一些图形和统计输出。波动率是一个重要的概念，在金融和交易中有许多应用。它是期权定价的基础。波动率还可以让您确定资产配置并计算投资组合的风险价值(VaR)甚至波动率本身也是一种金融工具，例如CBOE的VIX波动率指数。然而，与证券价格或利率不同，波动性无法直接观察到。相反，它通常被衡量
·2023-06-13 23:54

MATLAB随机波动率SV、GARCH用MCMC马尔可夫链蒙特卡罗方法分析汇率时间序列|附代码数据

全文下载链接：http://tecdat.cn/?p=27340最近我们被客户要求撰写关于波动率的研究报告。波动率是一个重要的概念，在金融和交易中有许多应用。它是期权定价的基础。波动率还可以让您确定资产配置并计算投资组合的风险价值(VaR)。甚至波动率本身也是一种金融工具，例如CBOE的VIX波动率指数。然而，与证券价格或利率不同，波动性无法直接观察到。相反，它通常被衡量为证券或市场指数的收益率历
·2023-06-13 23:53

R语言中实现马尔可夫链蒙特卡罗MCMC模型

p=2687原文出处：拓端数据部落公众号什么是MCMC，什么时候使用它？MCMC只是一个从分布抽样的算法。这只是众多算法之一。
·2023-06-13 23:21

Matlab随机波动率SV、GARCH用MCMC马尔可夫链蒙特卡罗方法分析汇率时间序列

原文链接：http://tecdat.cn/?p=27340波动率是一个重要的概念，在金融和交易中有许多应用。它是期权定价的基础。波动率还可以让您确定资产配置并计算投资组合的风险价值(VaR)。甚至波动率本身也是一种金融工具，例如CBOE的VIX波动率指数。然而，与证券价格或利率不同，波动性无法直接观察到。相反，它通常被衡量为证券或市场指数的收益率历史的统计波动。这种类型的度量称为已实现波动率或历
·2023-06-13 23:20

Matlab马尔可夫链蒙特卡罗法（MCMC）估计随机波动率（SV，Stochastic Volatility） 模型|附代码数据

全文下载链接：http://tecdat.cn/?p=16708最近我们被客户要求撰写关于随机波动率的研究报告，包括一些图形和统计输出。波动率是一个重要的概念，在金融和交易中有许多应用。它是期权定价的基础。波动率还可以让您确定资产配置并计算投资组合的风险价值(VaR)甚至波动率本身也是一种金融工具，例如CBOE的VIX波动率指数。然而，与证券价格或利率不同，波动性无法直接观察到。相反，它通常被衡量
·2023-06-13 23:11

MCMC详解

MCMC(一)蒙特卡罗方法MCMC(二)马尔科夫链MCMC(三)MCMC采样和M-H采样MCMC(四)Gibbs采样
Z_onechorm·2023-06-13 10:15

MCMC简介

一、重温贝叶斯公式首先我们先复习一下贝叶斯公式：P(θ∣x)=P(x∣θ)P(θ)P(x)P(\theta|x)=\frac{P(x|\theta)P(\theta)}{P(x)}P(θ∣x)=P(x)P(x∣θ)P(θ)其中各项的说明如下：P(θ∣x)P(\theta|x)P(θ∣x)：后验概率，给定观测数据xxx后，我们模型的参数θ\thetaθ的概率，该项是我们最终想要获取的解；P(θ)P(
杨纳切克·2023-06-13 10:14

MCMC算法原理及其实例

一.概述通过概率统计模拟来进行数值计算的方法统称为蒙特卡罗(MonteCarlo)方法，而MCMC方法称为马尔科夫链蒙特卡洛(MarkovChainMonteCarlo)方法。
嗯哼嘿嘿嘿·2023-06-13 10:44

马尔可夫蒙特卡洛方法（MCMC）简单理解

本文没有理论推导证明，旨在用简单的例子理解MCMC方法。
lyyy98·2023-06-13 10:43

MCMC算法

一.MCMC算法定义MCMC是MarkovchainMonteCarlo的缩写，即马尔可夫链蒙特卡罗方法。MCMC是一组利用马尔可夫链从随机分布中取样的算法。生成的马氏链即是对于目标分布的近似估计。
S1406793·2023-06-13 10:13

MCMC基础简说

MCMC是一种随机采样方法，由两个MC组成，即蒙特卡罗方法（MonteCarloSimulation，简称MC）和马尔科夫链（MarkovChain，也简称MC）。
wazsd1·2023-06-13 10:41

马尔可夫链蒙特卡罗算法（MCMC方法）

MCMC方法是什么具体而言，假设我们要计算积分μ=∫Sh(θ)π(θ∣x)dθ\mu=\int_Sh(\theta)\pi(\theta|x)d\thetaμ=∫Sh(θ)π(θ∣x)dθ如果后验分布π
huhubbdd·2023-06-08 14:11

马尔科夫链与MCMC方法

马尔科夫链概述基本思想：过去所有的信息都已经被保存到了现在的状态，基于现在就可以预测未来。Example：假如每天的天气是一个状态的话，那今天是不是晴天只依赖于昨天的天气，而和前天的天气没有任何关系。当然这么说可能有些武断，但是这样做可以大大简化模型的复杂度。因此马尔科夫链在很多时间序列模型中得到广泛的应用，比如循环神经网络RNNRNNRNN，隐式马尔科夫模型HMMHMMHMM等，当然MCMCMC
huhubbdd·2023-06-08 14:32

Controlled MCMC

https://www.ci.i.u-tokyo.ac.jp/~hachisuka/amcmcppm.pdfhttp://crest.science/RePEc/wpstorage/2001-33.pdf
MADMAX97·2023-04-21 13:13

物种种群扩张检测——扩展的贝叶斯天际线图（EBSP）

采用分子钟或化石校正，借助BEAST系列软件，基于马尔科夫链的蒙特卡洛算法（MonteCarloMarkovchain，MCMC）求出有效种群大小随时间推移的变化。
凌恩生物·2023-04-18 18:51

Machine Learning-贝叶斯规则分类器(上)

贝叶斯规则分类器目录一、简介二、模型相关基础知识2.1关联分析2.2Beta分布和二项分布（共轭分布）2.3Dirichlet分布和多项式分布（共轭分布）2.4马尔科夫链蒙特卡洛方法(MCMC)三、贝叶斯规则分类器四
丁想·2023-04-07 23:27

从随机过程到马尔科夫蒙卡洛方法

转从随机过程到马尔科夫链蒙特卡洛方法1.Introduction第一次接触到MarkovChainMonteCarlo(MCMC)是在theano的deeplearningtutorial里面讲解到的RBM
RXiaoHong·2023-04-05 21:03

R语言贝叶斯MCMC：用rstan建立线性回归模型分析汽车数据和可视化诊断

最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯MCMC的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文将谈论Stan以及如何在R中使用rstan创建Stan模型。
拓端研究室·2023-03-31 14:49

MCMC-PurBayes

RelatedKnowledge异质性肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一，是指肿瘤在生长过程中，经过多次分裂增殖，其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变，从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。简单点说就是同一肿瘤中可以存在有很多不同的基因型或者亚型的细胞。因此同一种肿瘤在不同的个体身上可表现出不一样的治疗效果及预后，甚至同一个体身上的肿瘤细胞也存在不同的特性和差异。
脑阔不疼·2023-03-30 16:22

变分推断

变分推断（VariationalInference）一文读懂贝叶斯推理问题：MCMC方法和变分推断
crunch114·2023-03-27 01:56

MCMC的Metropolis-hastings 算法python实现

本文重点介绍贝叶斯推断中的MCMC方法，这是众多方法中的一个，具体的分类可以看图。基于估计的呢，是点估计，求出目标分布的极值。
王难难难·2023-01-31 07:01

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机器学习—MCMC蒙特卡洛方法MCMC平稳分布MCMC是一种随机的近似推断，其核心就是基于采样的随机近似方法蒙特卡洛方法。
DCGJ666·2023-01-29 08:56

Datawhale 2021.7集成学习 笔记

基于讲义和自己的笔记）机器学习数学基础基于python-B站视频高等数学和线性代数概率论和随机过程初步数理统计（极大似然估计）极大似然估计与贝叶斯估计随机过程基础与泊松分布马尔可夫过程、鞅过程与高斯过程拒绝采样和MCMC
今夜我说·2023-01-23 10:24

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因为RBN，学习了一会儿MCMC，理解不太深，但在接触BayesianGAN时碰到HMC又很晕，好在看了两篇博客，重新梳理了MCMC，对HMC有了点初步理解，整理如下。
tkyjqh·2023-01-18 00:52

个人笔记目录

目录生成模型笔记生成模型笔记（一）：概率基础知识生成模型笔记（二）：最大似然，贝叶斯和最大后验概率生成模型笔记（三）：近似推断生成模型笔记（四）：MCMC和GibbsSampling生成模型笔记（五）：
Artificial Idiots·2023-01-12 15:27

MATLAB随机波动率SV、GARCH用MCMC马尔可夫链蒙特卡罗方法分析汇率时间序列|附代码数据

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·2023-01-11 23:46

r语言插补法_R语言︱缺失值处理之多重插补

大致的步骤简介如下：缺失数据集——MCMC估计插补成几个数据集——每个数据集进行插补建模(glm、lm模型)——将这些模型整合到一起(pool)——评价插补模型优劣(模型系数的t统计量)——输出完整数据集
weixin_39901213·2023-01-11 16:28

R语言随机波动模型SV：马尔可夫蒙特卡罗法MCMC、正则化广义矩估计和准最大似然估计上证指数收益时间序列

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·2023-01-05 16:20

马尔可夫链蒙特卡洛采样(MCMC)

首先我们要明确的是马尔可夫链蒙特卡洛采样以下简称MCMC，它首先是个采样方法。
我会像蜗牛一样努力·2023-01-04 09:27

抽样（蒙特卡洛法）到底是在干啥？

目录一、简单抽样二、逆转换方法三、“接受-拒绝”抽样四、马尔科夫链蒙特卡洛法（MCMC）五、“接受-拒绝”抽样再认识1.接受-拒绝抽样法理论介绍2.算法3.接受-拒绝抽样法代码实现六、马尔科夫链蒙特卡洛法
陈嘟嘟cc·2023-01-04 09:54

Matlab马尔可夫链蒙特卡罗法（MCMC）估计随机波动率（SV，Stochastic Volatility） 模型|附代码数据

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·2023-01-04 00:26

【源码】MATLAB的BMS工具箱：贝叶斯模型平均（BMA）

BayesianModelAveragingforlinearmodelsunderZellner’sgprior.可选项包括：固定的（BRIC,UIP,…）和可调的g先验（经验贝叶斯，hyper-g）、5种先验模型、通过模型枚举或MCMC
梅花香——苦寒来·2023-01-02 18:20
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