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基因组信息学
【c++项目】
信息学
奥赛数据生成器
#includeusingnamespacestd;#defineDEV_RND((int)rand()*RAND_MAX+rand())#defineRND(L,R)(DEV_RND%((R)-(L)+1)+(L))intt,a,b,c,n;intmain(){cout>t;if(t==114514){cout>n;intar[n+1],q[n+1];cout>ar[i];srand(time(
NightStriker
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2024-02-11 09:06
c++
开发语言
2021-10-01
NatGen|从未吸烟者肺癌的
基因组
学和进化分类(二)原创楠烟不可言图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制撰文:楠烟不可言IF=38.33推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:本文对232份从不吸烟者的肺癌(LCINS
图灵基因
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2024-02-11 07:28
金域医学:医检行业顶级学术委员会成立,钟南山院士任主席
国内第三方医学检验行业的开拓者和引领者广州金域医学检验集团在广州国际生物岛总部,召开金域医学学术委员会成立大会暨金域学术汇报会由呼吸系统疾病专家、中国工程院院士钟南山出任委员会主席,医学遗传学家、中国工程院院士曾溢滔,生物
信息学
家
里昂杰森
·
2024-02-11 02:57
注释手工校正工具Apollo-数据导入篇
Apollo界面介绍Apollo的界面(下图)分为两个部分,分别是
基因组
编辑工作区(GenomicEditingWorkspace)和信息和管理面板(InformationandAdministrationPanel
xuzhougeng
·
2024-02-11 00:22
温故知新之CRISPR/Cas9原理
sgRNA与Cas9蛋白结合靶向到
基因组
特定位点,Cas9切割产生双链断裂(doublestrandbreaks,DSB),经过细胞自主性的非同源末端连接(non-homologousendjoining
Seurat_
·
2024-02-10 22:19
基因组
组装----SOAPdenovo2
1.
基因组
组装的流程
基因组
组装的大概流程如下:(1)测序得到rawreads序列。(2)Reads质量评估。(3)原始reads质控。(4)选择合适的参数进行组装。
bcl_hx
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2024-02-10 22:11
用k-mer分析进行
基因组
调查:(四)用GenomeScope评估
基因组
特征+用Smudgeplot估计倍性
(全文约3500字)【推荐】用Smudgeplot评估物种倍性后,用组合jellyfish+GenomeScope1.0做二倍体物种的
基因组
调查,用组合KMC+GenomeScope2.0做多倍体物种的
基因组
调查
生信技工
·
2024-02-10 22:02
猫主子每天都要睡十几个小时,你知道原因吗?
1、本能每种动物都有自己的作息规律,这来自身体构造、
基因组
成决定,例如牛、马之类的睡眠时间大约3小时;狼13小时;狮子就10~15小时,而猫咪就更长了,在
萌老大是也
·
2024-02-10 12:45
机器学习系列——(十九)层次聚类
层次聚类(HierarchicalClustering)是聚类算法中的一种,以其独特的层次分解方式,在各种应用场景中得到广泛应用,如生物
信息学
、图像分析、社交网络分析等。
飞影铠甲
·
2024-02-10 07:47
机器学习
机器学习
聚类
人工智能
#每天一本书# 快节奏,慢生活
今日共读:《快节奏,慢生活》图片发自App【关于作者】戴维·M·利维:华盛顿大学
信息学
院教授,就信息化发展这一问题进行教学和研究,同时致力于寻求更慢、更平静、更能让人沉下心来思考的生活模式。
五感自律研习社
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2024-02-10 04:08
东南大学-生物
信息学
http://www.lmbe.seu.edu.cn/chenyuan/xsun/bioinfomatics/Web/Index.html目录image第1章生物
信息学
引论第2章生物
信息学
的生物学基础第
wangchuang2017
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2024-02-10 01:12
TCGA新版数据库表达矩阵提取
主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物
信息学
等。
医学和生信笔记
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2024-02-10 00:22
三代转录组系列:使用Cogent重建
基因组
编码区
尽管目前已测序的物种已经很多了,但是对于一些动辄几个G的复杂
基因组
,还没有某个课题组有那么大的经费去测序,所以仍旧缺少高质量的完整
基因组
,那么这个时候一个高质量的转录组还是能够凑合用的。
xuzhougeng
·
2024-02-09 23:06
R语言可视化学习笔记之ggridges包
作者:严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物
信息学
方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源。严涛老师的绘图教程还有:gganimate|诺奖文章里面的动图布局教程来了!!
生信宝典
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2024-02-09 21:25
R
生物信息
生物信息
可视化
microRNA数据库与预测、功能分析软件大全
在microRNA的研究中,生物
信息学
发挥越来越重要的作用,以下是microRNA相关的数据库与预测、功能分析软件,绝对值得收藏。
Seurat_Satija
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2024-02-09 20:51
ggtreeExtra的开发及其在宏
基因组
上的应用
开发ggtreeExtra的初衷因为我之前工作的时候主要是做微生物组学数据的分析工作,工作中往往需要对这些数据进行可视化以方便数据展示与解析,简单的可视化还好,有ggplot2就行了。然而,微生物组学数据分析中往往需要将相关的外部数据信息与进化树或者是物种层级树联系起来才能更好展示并解析相关结果,而对于这样的操作来说,目前的很多工具基本都难以使用,除了ggtree。因为该软件包继承了ggplot2
斗战胜佛oh
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2024-02-09 12:52
信息学
奥赛一本通1317:【例5.2】组合的输出
1317:【例5.2】组合的输出时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:50986通过数:25592【题目描述】排列与组合是常用的数学方法,其中组合就是从n个元素中抽出r个元素(不分顺序且r≤n),我们可以简单地将n个元素理解为自然数1,2,…,n,从中任取r个数。现要求你用递归的方法输出所有组合。例如n=5,r=3,所有组合为:123124125134135145234235245
Jsjjsnmsk
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2024-02-09 11:18
算法
数据结构
信息学
奥赛一本通1330:【例8.3】最少步数
1330:【例8.3】最少步数时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:22556通过数:12591【题目描述】在各种棋中,棋子的走法总是一定的,如中国象棋中马走“日”。有一位小学生就想如果马能有两种走法将增加其趣味性,因此,他规定马既能按“日”走,也能如象一样走“田”字。他的同桌平时喜欢下围棋,知道这件事后觉得很有趣,就想试一试,在一个(100×100)的围棋盘上任选两点A、B,A点
Jsjjsnmsk
·
2024-02-09 11:48
算法
c++
开发语言
信息学
奥赛一本通1181:整数奇偶排序
1181:整数奇偶排序时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:36021通过数:23362【题目描述】给定10个整数的序列,要求对其重新排序。排序要求:1.奇数在前,偶数在后;2.奇数按从大到小排序;3.偶数按从小到大排序。【输入】输入一行,包含10个整数,彼此以一个空格分开,每个整数的范围是大于等于0,小于等于30000。【输出】
Jsjjsnmsk
·
2024-02-09 11:48
算法
数据结构
三维
基因组
|分子生物学简介 (1)
本系列将更新三维
基因组
相关内容,欢迎关注!分子生物学涉及生命从组成到活动的所有分子基础,包括DNA、RNA、蛋白质之间的相互作用、它们的生物合成以及这些相互作用的调节。
冷冻工厂
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2024-02-09 09:10
程序人生
生物——文献笔记
海洋动物群体遗传学的研究进展1.影响群体基因频率的因素2.根据自然群体的繁殖体系,海洋动物群体遗传类型可分为以下几类3.海洋动物群体遗传研究中常用的遗传标记4.研究展望重要经济海藻坛紫菜遗传多样性分布格局与环境适应性研究藻类
基因组
研究进展
星石传说
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2024-02-09 07:26
生物技术笔记
笔记
动物育种中的递归模型(Recursive models):解释、限制和扩展
如最近的文章:使用贝叶斯学习和
基因组
结构方程模型推断家禽肠道微生物群多样性和饲料效率特征的因果结构,结构方程模型可解开微生物群与复杂性状之间的生物学关系:以奶牛的甲烷生产为例本研究基于其最近的综述来进行讲解
Hello育种
·
2024-02-09 01:46
从列表中删除元素|自学生信Python(第十六天)
写在前面的话:本人是一枚生物学的学生,由于对生物
信息学
特别感兴趣,于是想自学生物
信息学
(新手莫怪)。
天明豆豆
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2024-02-08 22:40
「转录组」从环境配置之conda
【生物
信息学
频道bioconda】Anaconda是一个开源的Python发行版本,包含了conda、python等180多个科学包及其依赖项。因为包含了大量
旮旯蜗牛_c299
·
2024-02-08 21:35
2022-10-25
SciAdv|全
基因组
CRISPR筛查发现小细胞肺癌新靶点图灵基因2022-10-2516:04发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制肺癌是全世界癌症死亡的主要原因之一。
图灵基因
·
2024-02-08 19:43
中小学
信息学
奥赛CSP-J认证 CCF非专业级别软件能力认证-入门组初赛模拟题一解析(选择题)
CSP-J入门组初赛模拟题一(选择题)1、以下与电子邮件无关的网络协议是A、SMTPB、POP3C、MIMED、FTP答案:D考点分析:主要考查小朋友们网络相关知识的储备,FTP是文件传输协议和电子邮件无关,所以答案D2、二进制数11110110和00001111进行逻辑异或运算的结果是A、11111001B、00000110C、11111111D、00001001答案:A考点分析:主要考查小朋友
小兔子编程
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2024-02-08 17:52
NOI
CSP-J信息学奥赛
CSP-J模拟题
CSP入门组模拟题
CSP初级组模拟题
CSP初级组模拟测试题
CCF认证CSP初级组模拟题
csp-j预测模拟题
csp小兔子编程
【动植物研究动态】20220529文献解读
李家洋受邀发表作物驯化育种的遗传学研究综述Theintegratedgenomicsofcropdomesticationandbreeding该论文系统梳理了近十年作物遗传学领域的重要研究进展,包括对作物遗传信息的读取(作物参考
基因组
和群体
基因组
的构建
生物信息与育种
·
2024-02-08 16:31
2018-04-18宏
基因组
实战qiime2-201802(四)用dada2 过滤 和建树
因为我是双端数据,所以这一步我主要是参考了这个实战:https://docs.qiime2.org/2018.2/tutorials/atacama-soils/我前一步已经拿到了我切过引物的数据,要先看一下这个质量分布切之后这里我先上代码qiimedada2denoise-paired\--p-n-threads0\--i-demultiplexed-seqstrimmed-seqs.qza\-
小郑的学习笔记
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2024-02-08 15:10
看了老大比较
基因组
学视频后扩展的小内容
老大视频比较
基因组
在IGV看了http://www.bio-info-trainee.com/2218.htmlwes:探针捕获rna-seq:不会出现外显子两边下降chip-seq:不会出现整齐,得到的文件是
小梦游仙境
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2024-02-08 12:56
信息学
竞赛中的数学知识 --- 容斥原理
C++基础数论—————容斥原理C++基础数论—————容斥原理_C2020lax的博客-CSDN博客_容斥原理c++C++数论容斥原理————无关的元素C++数论容斥原理————无关的元素-算法网容斥原理-ZenyZ-博客园容斥原理_runaround的博客-CSDN博客随笔分类-[C++]数论-容斥原理[C++]数论-容斥原理-随笔分类-water_mi-博客园C++容斥原理—————表达式计
dllglvzhenfeng
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2024-02-08 09:27
程序猿的数学
计算机考研机试
算法
信奥
C+=
NOIP
CSP-J
PSMC软件分析群体历史有效群体大小步骤
现在出现了更好的算法,能用多个样本估计一个群体的历史群体大小:MSMC详情可见此链接@PSMC软件分析群体历史有效群体大小流程首先是软件下载,需要用到PSMC和samtoolPSMC下载地址1、文件转换
基因组
文件格式为
iBioinformatics
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2024-02-08 07:38
生信绘图:在线绘制 序列 Logo 图
它是由生物
信息学
领域中的生物学家TomSchneider和R.MichaelStephens在1990年首次引入的。序列Logo通过显示序列中每个位置上不同碱
Ningbo_JiaYT
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2024-02-08 07:09
统计绘图
生物信息学
R
学习方法
Nextstrain的安装教程
Nextstrain是一款利用病原体
基因组
数据,分析其分子进化和传播路线的平台,由TrevorBedford教授的团队研发;它基于Python、Java和Shell等多种语言编写,可以在macOS、Windows
Ningbo_JiaYT
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2024-02-08 07:08
python
学习方法
Gut Microbes+ Microbiome | 揭示太空环境对微生物的影响
借助16S扩增子、宏
基因组
、转录组等生物学技术,我们一起来探究在太空环境下,微生物所发生的变化。航天飞行期间,小鼠肠道微生物和宿主代谢的变化[1]肠道微生物通
ee00dc6faab7
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2024-02-08 05:16
【动植物研究动态】20220508文献解读
PlantCom|浙大张国平&湖南农大吴德志:解析盐生植物海大麦
基因组
及其耐盐机制Thegenomeandgeneeditingsystemofseabarleygrassprovideanovelplatformforcerealdomesticationandstresstolerancestudies
生物信息与育种
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2024-02-07 20:36
P1047 [NOIP2005 普及组] 校门外的树
题目来源[NOIP2005普及组]校门外的树-洛谷
信息学
奥赛一本通(C++版)在线评测系统题目考点模拟题目描述某校大门外长度为ll的马路上有一排树,每两棵相邻的树之间的间隔都是11米。
Shadow_of_the_moon
·
2024-02-07 19:43
c++
DNA replication stress --DNA 复制压力
DNA复制压力是指某些细胞的DNA在复制过程中,他们的
基因组
受到各种压力,导致复制叉停滞的现象。
寒山梦绮
·
2024-02-07 18:58
《万物简史》书评
基因和
基因组
让我们相似又独特。我们的基因存在于细胞核内部的46条染色
iOSDevLog
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2024-02-07 13:11
用k-mer分析进行
基因组
调查(genome survey):(三)用KMC进行k-mer频数统计
(全文约1100字)【推荐】用Smudgeplot评估物种倍性后,用组合jellyfish+GenomeScope1.0做二倍体物种的
基因组
调查,用组合KMC+GenomeScope2.0做多倍体物种的
基因组
调查
生信技工
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2024-02-07 13:33
表观遗传研究常用数据库
基本数据库1.UCSC数据库网站:http://genome.ucsc.edu/index.html简介:UCSC数据库给浏览
基因组
数据提供了可靠和迅速的方式;支持数据库检索和序列相似性搜索。
笺牒九州的怪咖
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2024-02-07 11:40
学习:StatQuest-RNA-seq技术重复
概念首先我们先辨析一下生物学重复和技术重复,我们的RNA-seq的data产生差异是正常的,关于差异来自于几个方面:生物学多样性,个体间差异,即便是同一物种(
基因组
相同),其转录本也未必都相同image.png
小潤澤
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2024-02-07 09:11
理解生物
信息学
FASTA格式
在生物
信息学
中,FASTA格式是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示,且允许在序列前添加序列名及注释。
陈佶1
·
2024-02-07 09:36
2021-12-10
尽管这些差异部分归因于核
基因组
的遗传和表观遗传修饰,但
图灵基因
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2024-02-07 08:30
少儿编程教育新趋势:
信息学
奥赛与Scratch等级考试融合实践
近年来,
信息学
奥林匹克竞赛(简称
信息学
奥赛)以其独特的魅力吸引了大量热爱编程的青少年参与。这项赛事不仅考察参赛者的编程技能,更注重逻辑思维能力、问题解决能力和创新能力的培养。
@小码农
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2024-02-06 23:47
python
科技
开发语言
人工智能
机器人
子宫肌瘤研究的新方向!meta分析揭示平滑肌瘤发展的两种遗传途径!
研究人员对来自冰岛或英国Biobank的16595例医院平滑肌瘤病例和523330例未受影响的对照基因分型阵列数据进行分析,追踪到21个与子宫肌瘤相关的变异体,这些变异位于
基因组
中的16个位点,当他们进一步挖掘这些位点
南博屹生物医学
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2024-02-06 20:08
Cytoscape软件下载、安装、插件学习[基础教程]
关于Cytoscape,对于做组学或生物
信息学
的同学基本是陌生的,可能有的同学用这个软件作图是非常溜的,做出来的网络图也是十分的好看,“可玩性”很高,就像前面分享的aPEAR包一样aPEAR包绘制功能富集网络图
小杜的生信筆記
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2024-02-06 18:28
R语言精美图形绘制教程
数据分析
Cytoscape
网络图
富集分析
信息可视化
生物信息学
r语言
体重管理,2个重要检测、4个基本指标需要get!
2、肠道菌群基因检测肠道菌群作为人体的“第二
基因组
”,其失调会影响营养的吸收和代谢,并引发持续性的慢性炎症,与肥胖的发生密切相关。通
程陌and颜易
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2024-02-06 15:48
捏脸时代
1990年,国际人类
基因组
计划启动。2000年,人类
基因组
工作草图公布。2018年,人体基因改造技术临床实验隐秘开展。2026年,荷兰率先通过决议使人体基因改造技术合法化。
傅立叶柏拉图
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2024-02-06 15:20
Redis面试题41
它可以分析医学影像、病历数据和
基因组
数据,识别疾病特征和风险因素,并提供准确的诊断和预测结果。医疗影像分析:人工智能可以利用深度学习网络,自动分析和解读医学影像,如CT扫描、X射线和病理切
CrazyMax_zh
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2024-02-06 13:16
redis
GenVisR包:突变类型不在waterfall函数指定范围?
GenVisR包是一个用于
基因组
可视化的包。为我们提供了多种用于展示
基因组
突变、基因突变等图像,包括我们熟知的基因突变瀑布图等。今天介绍该包中的waterfall函数功能。
jlyq617
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2024-02-06 12:09
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