富集

何演婷和她的兄弟姐妹

何演婷,云享富集团董事长,80后创业者,以亲民守法。诚信经营的宗旨。赢得了政府部门的支持，也赢得了社会的赞誉。她所到之处都能跟团队成员打成一片，亲如兄弟姐妹。
趋势动车组·2023-04-14 20:54

线下门店留不住老客户，再怎么拓客都白搭！

19世纪末20世纪初意大利经济学家巴莱多发现，80%的社会财富集中在20%的人手里，而80%的人只拥有社会财富的20%，这就是著名的“二八法则”。
君子兰企业管理·2023-04-14 13:50

学习g：Profiler基因功能富集分析软件

g：Profiler主要有四个可选工具：g：GOSt用于分析flatorrankedgenelists以获得富集特征；g:Conver用于转换不同类别的基因标识符；g：Orth用于将基因映射到相关物种中的直系同源基因
Mingyan_C·2023-04-13 23:49

RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程

今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤，最终获得基因表达信息。
生信分析笔记·2023-04-13 16:10

“穷人思维”的伤害有多大？如果不改变，你将一辈子难成大器！

很多的时候，人们都说，穷不可怕，可怕的是“穷人思维”，虽然社会的进步让越来越多的财富集中在少数人的手里，但同时，“中产阶级”群体的规模也在不断地扩大，历史经验告诉我们，社会的力量会自动调节财富的分配，从而朝着最有利于社会发展的方向
偶然会想起你·2023-04-13 04:33

GEO挖掘实战三、GSVA

7、GSVAGSEA是研究差异基因在基因集的富集情况；GSVA是根据每个样本的基因表达量，研究基因集在样本中的表达情况。7.1去重由于存在多个探针对应一个基因的情况，因此需要去重。
小贝学生信·2023-04-12 09:45

【R画图学习9.1】双向柱状图

普通的柱状图，在做GO/Pathway富集分析的时候测试过了。命令也很简单，就是ggplot()+geom_bar()就可以实现了。
jjjscuedu·2023-04-12 09:17

多组学方案｜外泌体转录组学与质谱蛋白组学强势来袭！

诺禾致源外泌体测序产品结合自身平台优势，提供外泌体富集、鉴定、测序、多组学生信分析、个性化分析作图、售后云平台一系列服务，利用全面技术手段、多样化测序平台助力外泌体研究。
诺禾致源·2023-04-12 03:33

百用不厌的基质-免疫分析又来啦

今天跟大家分享的是发表在FrontiersinOncology（IF:4.8483）上的一篇文章，主要是基于TCGA和CGGA中胶质瘤数据集，利用单样本基因集合富集分析(ssGSEA)算法根据胶质瘤基质细胞
概普生信·2023-04-11 18:05

【R语言】dplyr对数据分组取各组前几行

前面我们介绍过GO富集分析和结果可视化1.GO和KEGG富集分析视频讲解2.GO富集分析四种风格展示结果—柱形图，气泡图3.GO和KEGG富集结果如何显示基因symbol4.GO和KEGG富集倍数（FoldEnrichment
生信交流平台·2023-04-11 13:15

非模式生物基因GO富集分析：以水稻为例

模式生物做什么都简单，非模式生物则很多缺少注释，没有注释你就没法做，只能是借助于各种软件比如blastgo，自己跑电子注释。但今天要讲的不是这种情况，很多物种还是有注释的，只是你有时候不知道该去那里下载，或者你有数据，却不知道该怎么用！很多的软件都是针对模式生物的，或者针对某一些类型的非模式生物，能够支持多种非模式生物，能够支持用户自己的注释文件的软件相对来讲，就非常少有了，然而clusterPr
sober01·2023-04-11 03:22

RNA-seq学习：No.6富集分析--GESA

如前所说，过表达富集分析有不少缺点。因此以GSEA为代表的FCS方法也是人们所倾向的选择。
小贝学生信·2023-04-11 00:46

单样本基因集富集分析 --- ssGSEA

1.概述单样本基因集富集分析（singlesamplegenesetenrichmentanalysis,ssGSEA），是GSEA方法的扩展，主要是针对单个样本无法做GSEA而设计。
林枫bioinfo·2023-04-11 00:43

R语言获取 GO/KEGG 中某一通路的基因集

有时候我们想看某一特定通路的富集情况，这时就需要获取该通路的基因集。
正经昵称征集中·2023-04-10 03:29

python从基因组注释文件中提取GO信息

问题在转录组或基因组注释文件中有基因的GO注释，为了做GO富集分析，需要从中提取每个有GO注释的基因对应的GO号。
wangsb_2020·2023-04-09 22:54

信息爆炸的时代，我们至少应该做什么？

全球化的加深，会让全球财富集中在20%的人手里，那剩下的80%的人，不满、抗争、造成冲突怎么半？有人想到一个办法，给那80%的人塞上奶嘴。这个奶嘴，就是发泄型产业，包括游戏、娱乐、赌博等等。
池照·2023-04-09 12:06

网络游戏的危害——崔释文2020-04-01

1.游戏的原理：因为在未来的全球化会加剧贫富差距，会使财富集中在全球20%的人手上，而另外80%的人被「边缘化」。那么，如何化解这80%的人和20%精英之间的冲突？
崔竣喆·2023-04-08 15:12

【R语言】clusterProfiler富集分析，物种注释数据库

相信大家对Y叔的clusterprofiler这个R包并不陌生，一般做基因富集分析的时候都会用到这个R包。这个包非常实用，并且画出来的图也很不错。
生信交流平台·2023-04-08 00:40

快捷查找KEGG里的通路和基因

如果是要做KEGG的富集分析，clusterProfiler可以搞定：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/clusterProfiler
小洁忘了怎么分身·2023-04-07 11:05

一起学画图：气泡图—常用于富集分析

在实际使用中，气泡图常用于展示基因富集分析的结果。本期使用R包gapminder中现有数据集，基于ggplot2制作气泡图Part2：图像与代码在加载数据并对
生信小书生·2023-04-07 09:49

GO和Pathway富集分析的背景基因集

功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时，都会涉及到Background;做分析时，分析工具会提供一些数据供使用者选择或者使用自定义的genelist。
JeremyL·2023-04-06 18:34

利用DAIVD网页进行富集分析，以及结果的可视化展示

1、进入DAVID网站https://david.ncifcrf.gov/summary.jsp2、下面实战开始①，点击“Upload”，准备上传所感兴趣的基因集②，复制粘贴所感兴趣的geneset，，也可以选择文件③，这个一般都是官方标准的genesymbol④，选择Genelist⑤，点击SubmitList点完提交基因之后，弹出这个页面，我这里选的是人类的这一步我个人认为应该是和上一步的li
单纯的学生信·2023-04-06 16:43

非模式生物如何做富集分析

这次是水稻的富集分析，参考网上的资料，记录一下学习过程1.KEGG分析（以水稻为例）因为网上有hoptop师兄的教程，所以先讲它。
不玩手机的蛇佬腔·2023-04-06 10:24

单细胞108篇文献解读之12---Promotion of cholangiocarcinoma growth by diverse cancer-associated fibroblast s...

单细胞RNA测序将CAF分为炎性和生长因子富集(iCAF)和
Seurat_Satija·2023-04-06 03:17

2021-03-03 基于lncRNA的功能富集分析——lncSEA

GO，KEGG，GSEA等久负盛名的功能富集分析方法对于解析各种基因的调控功能和互作网络起到非常重要的作用。但这些方法的一个很大的局限性就是只能针对蛋白质编码进行进行分析。
NAome·2023-04-05 16:54

10X单细胞（10X空间转录组）基因集打分方法汇总

但校正批次效应后的数据是否能用于基因集富集分析，以及样本之间的批次效应是否会影
Evil_Genius·2023-04-05 06:25

展示DAVID富集分析结果中感兴趣的GO条目和KEGG通路

相信大家对GO和KEGG富集分析并不陌生，有时候富集分析会得到很多显著的结果。全部展示，版面不够。但是如果只展示前几个显著的GO条目或者KEGG通路的话，跟自己研究的对象相关的又不在里面。
生信交流平台·2023-04-05 02:34

促进早期的父母-婴儿情感联系可以改善早产儿的皮质网络

在这里，我们研究了通过促进母婴情感连接的多模态环境富集是否可以改善早产儿皮质活动网络的发育。我们使用高密度脑电图记录参加家庭养育干预(FNI)随机对照试验的婴儿，检查了足月龄时的功能性连通性。
思影科技·2023-04-04 19:33

RNA-seq入门实战（七）：GSEA——基因集富集分析

本节概览：1.GSEA简单介绍2.创建GSEA分析所需的geneList，包含log2FoldChange和ENTREZID信息3.利用clusterProfiler进行GSEA富集GO与KEGG通路4
嘿嘿嘿嘿哈·2023-04-04 14:38

若灬秋《戒糖》读书笔记及感悟

游离糖游离糖指所有人为添加的单糖、二糖，以及天然存在于蜂蜜、天然糖浆、果汁中富集而“游离”的糖为什么要戒糖？
若灬秋·2023-04-04 09:15

【R画图学习12】三元图（Ternary Plot）

下面这个图是微生物paper中的一个图，反映了细菌OTUs在植物（Arabisalpina）根系区域的富集信息
jjjscuedu·2023-04-03 12:30

GEO挖掘实战二、差异分析及富集分析

「生信技能树」三阴性乳腺癌表达矩阵探索系列笔记GEO挖掘实战一、初步探索数据-GEO挖掘实战二、差异分析及富集分析-GEO挖掘实战三、GSVA-GEO挖掘实战四、TNBC相关探索-在之前的步骤中，已经准备好表达矩阵与分组信息
小贝学生信·2023-04-03 06:38

GSVA + limma进行差异通路分析

GSVA将表达矩阵转换成通路富集分数(ES)矩阵，再借用limma包的lmFit分析得
BeeBee生信·2023-04-02 20:45

Cell子刊：成年同卵双胞胎的病毒组多样性与肠道微生物组多样性相关

成年同卵双胞胎的病毒组多样性与肠道微生物组多样性相关热心肠日报研究总结研究背景研究结果选择微生物组一致或者不一致的同卵双胞胎类病毒颗粒（VLPs）的鸟枪法宏基因组测序识别推定的细菌污染功能组成支持病毒在类病毒颗粒纯化中的富集病毒组是个体独特的微生物组具有一致性的双胞胎共享病毒类型在肠道病毒组中噬菌体占优势病毒多样性与微生物多样性相关
斗战胜佛oh·2023-04-02 13:43

R更新后无法安装bioconductor

上周用回了旧电脑，然后更新了R到4.0.5昨天做富集分析时要用bioconductor的包，发现需要更新3.9到3.11可是安装时总是提示ErrorinreadRDS(dest):errorreadingfromconnection
Musketeer·2023-04-01 06:54

【实战】R语言绘制GO富集分析弦图

前面通过视频给大家讲解了☞GO富集分析弦图怎么看也通过GOplot这个R包自带的数据给大家演示了。
生信交流平台·2023-04-01 02:33

转录组分析(11) - GO/KEGG富集分析(1)

简介bioconductor介绍Github介绍clusterProfiler-book分析模式生物clusterProfiler提供20种模式物种的GO与KEGG功能富集与注释，可直接下载使用。
半夜一更·2023-04-01 01:50

比较基因组学分析2：基因家族收缩与扩张分析

比较基因组学分析目录1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间2：基因家族收缩与扩张分析3：特异节点富集分析前言上篇推文中介绍到比较基因组学分析常用套路的第一步，利用单拷贝基因构建具有分化时间的物种树，补充一点
周小钊·2023-03-31 10:16

改善人居环境黑科技，谱写乡村振兴新篇章——第六届清华校友三创大赛专访

福州高新区前瞻谋划中国东南（福建）科学城，大力富集创新资源，厚植“三创”热土，以“三创园”建设为主抓手，以特色载体升级为契机，围绕促进高水
移动新媒体·2023-03-30 15:48

Biological Psychiatry：人脑转录组成像的最佳实践

本文回顾了最近的研究工作，探索了不同方法选择如何影响成像转录组分析的三个主要阶段，包括①转录图谱数据的处理；②将转录测量与独立衍生的神经影像学表型联系起来；③通过基因富集分析评估已识别关联的功能意义。
茗创科技·2023-03-30 04:30

根据Knumbers注释爬取KEGG对应KO号和pathway name

背景手头有KEGG对应各个基因的注释文件（注释可以参考KAAS注释流程)，但没有对应的KO号，需要得到相应的KO号做富集分析Pythonscript用selenium+xpath爬取，试了下发现KEGG
精神秃头生信小伙儿·2023-03-30 02:34

GSEA背后的统计学原理

GSEA简介基因集富集分析（GSEA）是一种计算方法，可确定先验定义的基因集是否在统计上显示两种生物学状态之间存在显着一致的差异。来自官网：GSEAGSEA首先由Mootha等人描述。
小潤澤·2023-03-30 01:13

神经网络架构搜索——可微分搜索（Noisy DARTS）

小米实验室AutoML团队的NAS工作，针对现有DARTS框架在搜索阶段训练过程中存在skip-connection富集现象，导致最终模型出现大幅度的性能损失的问题，提出了通过向skip-connection
AI异构·2023-03-29 22:30

吃海参前不可忽视的小问题

因为鲜活海参中会富集一定的海洋微生物和细菌，而且有的耐热性很强，需要高温才能杀灭。无论是白酒或者食醋、酱油等，都无法完全灭菌，所以直接吃鲜活海参有可能对身体造成负担。其次，海参的食用价值很高
海参菌·2023-03-29 18:07

蜈蚣草

蜈蚣草又名百足草，据说很能富集砷等重金属。河岸边石缝里的蜈蚣草倔强的生长着一棵小草，几颗爬山虎的种子，它的朋友。哦，我来咯向上，向上！毛绒绒知道我这是在哪里吗？高高的树，是我的家！
智慧自然·2023-03-29 14:44

circleplot展示GO富集分析结果

小编前面给大家介绍过☞GO简介及GO富集结果解读☞四种GO富集柱形图、气泡图解读☞GO富集分析四种风格展示结果—柱形图，气泡图☞GO和KEGG富集分析视频讲解小编前面也用了好几期的内容来给大家介绍。
生信交流平台·2023-03-29 09:07

求助关于GO富集分析可视化代码问题

：library(dplyr)#数据清洗library(stringr)library(org.Hs.eg.db)#物种注释(Homosapiens)library(clusterProfiler)#富集分析
weixin_55021421·2023-03-29 05:53

R中函数enrichKEGG报错Error in download.KEGG.Path(species) :‘species‘ should be one of organisms listed in

在R中用enrichKEGG函数进行富集分析时，发现一直报错，尝试修改网络，导入library(DO.db)等网上的解决方法时都没有用，还是出现如下报错，>kegg=enrichKEGG(genes$ENTREZID
小羊小羊，遇事不难·2023-03-29 05:22

【R语言】——基因GO/KEGG富集分析!超级简单的保姆级教程！

上期“干货预警——原来基因功能富集分析这么简单！”
在打豆豆的小潘学长·2023-03-29 05:22

R语言：GO富集和KEGG富集、可视化教程，附代码

R语言：GO富集和KEGG富集、可视化教程，附代码小白一枚，博客仅用于记录自己的学习历程，参考了很多代码，感觉有些代码太复杂了，根据自己的喜欢进行了部分改动。
是二月啊·2023-03-29 05:20
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