生物信息学ATAC

使用R语言的正确姿势，R包干货奉献

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2020-09-11 23:00

【AWS征文】[大数据][Hadoop] 使用EMR做大数据分析

AmazonEMR可用于各种应用程序中，包括日志分析、Web索引、数据仓库、机器学习、财务分析、科学模拟和生物信息学。具体的功能特性可以直接到官网查阅。
栗子哥·2020-09-11 14:00

生物信息学期刊与会议

生物信息学、系统生物学是交叉学科，可选择期刊比较广泛，这里只列举一些平时关注的刊物：--------------------------------------------NatureBiotechnologyNatureMethods
mitedu·2020-09-10 15:12

Prism 8:分析，作图， 展示你的科研数据-- 得心应手

InsightfulScience还有另外一个快速发展的生物信息学产品部门提供GeneiousDNA、GeneiousPrime、GeneiousBiologics、SnapGene以及nQuery等数据分析解决方案
哲想软件·2020-09-08 00:00

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哲想软件·2020-09-07 00:00

生信课程资源推荐

https://www.coursera.org/image.png2.rosalind：收集了与生物信息学相关的问题，从编程开始学习生物信息学，熟悉之后就可以解决自己的生物问题。
生信编程日常·2020-09-06 19:51

干货 | 一文教会你如何使用VMware安装CentOS虚拟机

在学习生物信息学的过程中，不可避免的会经常接触到Linux系统，毕竟生物信息学软件大多都是基于Linux系统开发的，尤其对于生物大数据的处理如原始FastQ数据的比对、组装以及图形绘制等等，都需要用到Linux
拾柒Zzz·2020-09-04 11:13

ATAC-seq原理与步骤

ATAC-seq,英文全称AssayforTargetingAccessible-Chromatinwithhigh-throughoutsequencing。用于研究染色质可及性/开放性的方法。
Brickvstar·2020-08-30 17:05

跑通GWAS，用这些脚本就够了

先把代码整理分享出来mark一下前期准备1.理论知识强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生物信息培训课程或者可以看看我的gwas相关文章GWAS基本分析内容（课程学习笔记）常用GWAS统计方法和模型简介（课程学习笔记）临床生物信息学中的
rapunzel0103·2020-08-26 23:25

算法思想之动态规划(一)——绪论

基本概念动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法[1]。
复旦猿·2020-08-26 11:53

我的软件

下载工具迅雷Advanceduninstaller：高级软件卸载工具DiskGenius：分区工具Teamviewer：远程协助工具Inphic：鼠标驱动软媒魔方金山毒霸windowspowerShell生物信息学
了尘兰若·2020-08-24 12:10

【e医疗原创】衡反修：精准医疗所需的那些数据库落地有多难？

它是指在大样本研究获得疾病分子机制的知识体系基础上，以生物医学特别是组学数据为依据，根据患者个体在基因型、环境和生活方式等各方面的特异性，应用现代遗传学、分子影像学、生物信息学和临床医学等方法与手段，制定个性化精准预防
e医疗·2020-08-24 04:46

推荐！自学成才的数据科学家告诉要学习数据科学的10件事(附学习资源链接)

本文转载于微信公众号Datawhale，译文作者Datewhale，原文作者为KenJee，KenJee的研究方向为数据挖掘和生物医学，目前是一所大学的全职生物信息学副教授，通过自学数据科学家。
暮雨潇潇_·2020-08-24 04:47

SMITH WATERMAN算法

1.1序列相似性比较生物信息学中，对各种生物大分子序列进行分析是一件非常基本的工作。
iteye_8260·2020-08-24 00:18

生物信息学数据库

[b]综合数据库[/b]★INSD,国际核酸序列数据库（InternationalNucleotideSequenceDatabank）。由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护。★EMBL库，欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA序列库。http://www.ebi.ac.uk/embl.html★GenBank，美国国家生物技术信息中心（NCBI）所维护的供公
iteye_8260·2020-08-24 00:47

生物信息学所用的方法和技术

一、数学统计方法数学统计在生物信息学中是一种最常用的方法。例如，在分析DNA语言中的语义、分析密码子使用频率、利用马尔可夫模型进行基因识别。
iteye_8260·2020-08-24 00:47

生物信息学网站

[b]通用的生物信息学门户[/b]www.ncbi.nlm.nih.gov美国国家生物技术信息中心主页。
iteye_8260·2020-08-24 00:47

2016-TCGA数据挖掘系列文章之癌症男女有别

这是TCGA数据挖掘系列文章之一，是安德森癌症研究中心的HanLiang主导的，纯粹的生物信息学数据分析文章。
生信技能树·2020-08-24 00:16

第2篇：原始数据的质控、比对和过滤

ATAC-Seq与其他方法不同的一点是需要过滤去除线粒体（如果是植物，还需要过滤叶绿体），因为线粒体DNA是裸露的，也可以被Tn5酶识别切割。
六六_ryx·2020-08-23 20:12

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十五章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
徐洲更hoptop·2020-08-23 12:22

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十六章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
徐洲更hoptop·2020-08-23 12:22

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十四章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
徐洲更hoptop·2020-08-23 12:22

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十三章)

本文首发于我的个人博客，http://xuzhougeng.top/往期回顾:使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞
徐洲更hoptop·2020-08-23 12:21

动态规划算法

简介动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。
又坏又迷人·2020-08-23 11:57

【机器学习实战】第14章 利用 SVD 简化数据

从生物信息学到金融学，SVD是提取信息的强大工具。
chimoren0700·2020-08-23 10:01

动态规划算法

简介动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。
又坏又迷人·2020-08-23 09:21

TCGA数据挖掘系列文章之-pseudogene假基因探究

这是TCGA数据挖掘系列文章之一，是安德森癌症研究中心的HanLiang主导的，纯粹的生物信息学数据分析文章。
生信技能树·2020-08-23 07:47

BIO-C 的第一篇jekyll博客

关于博客关于博客的主题，主要涉及生物学、计算机以及两者的交叉生物信息学，偶尔还会穿插一些设计之类的皮毛。开垦这一亩三分地踩了不少的坑，这些坑简要
钡氪·2020-08-23 03:20

生信投文章经验积累总结

Bioinformatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。
云仄·2020-08-22 17:07

条件随机场——文献解读《Conditional Random Fields: An Introduction》

ConditionalRandomFields:AnIntroduction》条件随机场介绍HannaM.Wallach2004.2.241、标签序列数据将标签序列分配给一组观察序列的任务出现在许多领域，包括生物信息学
菜鸟的宝宝·2020-08-22 14:32

我们为什么需要条件随机场CRF？

在计算机视觉、生物信息学、计算语言学和语音识别等诸多领域，都出现了为一组观测序列分
ronghuaiyang·2020-08-22 14:52

译文Deep Learning in Bioinformatics --深度学习在生物信息学领域的应用（2）

译文DeepLearninginBioinformatics--深度学习在生物信息学领域的应用(2)深度学习在生物信息学领域的应用(2)原文链接：https://arxiv.org/abs/1903.00342
Pineconek·2020-08-22 12:51

动态规划简介

介绍介绍来自LeetCode动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP）是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法
Aeilot·2020-08-22 12:08

生信脚本代写

3，R语言R的安装（有/无root权限），R包的安装，死磕各种疑难杂症--ggplot2画图等--bioconductor包等--生物统计类分析(ANOV等)4，linux系统相关的生物信息学软件安装，
巴拉巴拉11·2020-08-22 10:25

从人类基因组到人造生命：克雷格·文特尔领路生命科学

原文发布于2010-6-12自人类基因组计划(HumanGenomeProject，HGP)完成以后，生命科学进入“后基因组时代”，生物信息学、计算生物学、系统生物学以及合成生物学等崭新学科不断出现，并得到快速发展
原文链接·2020-08-22 01:56

数据科学入门前需要知道的10件事

本文作者是研究数据挖掘和生物医学方向，目前就职于泰国的一所研究大学的全职生物信息学副教授。他在22岁时开始
数据派THU·2020-08-21 17:07

conda使用说明

生物信息学软件错综复杂，平台依赖，库依赖导致各种软件安装bug，为此我们这里介绍下比较常用软件控制工具condaconda主要有两种版本，anaconda和miniconda，这里主要介绍miniconda3.1
zhusitao·2020-08-21 13:56

python的UML类图自动生成工具--pyreverse安装和使用

是常用的用来分析Python代码和类关系的工具将两者结合起来使用可以绘制Python的UML类图1.linux环境下graphviz安装graphviz是一个开源做图软件，她能画结构化的抽象和网络图形，在网络，生物信息学
zhnlion·2020-08-21 10:17

ATAC-Seq入门加高阶传送门

最近看到小伙伴们很希望看到完整的ATAC-Seq分析教程，甚至在某群里呼吁众筹。
六六_ryx·2020-08-20 19:36

Linux入门1：远程登录服务器

然而，在常规的生物信息学
曹务强·2020-08-20 14:17

生物信息学 第一课 什么是生物信息学

什么是生物信息学?
weixin_30539835·2020-08-20 12:37

中国人终于拥有自己的综合性基因组数据库！

生物科班出身，后专攻生物信息学，已不下十年。
基因空间·2020-08-20 11:33

生物信息学相关网站

生物信息学与生物计算：http://bioinformatics.weizmann.ac.il/这是生物信息学和生物计算学的网站，由Weizmann科学研究所，生物服务部和Crown人类基因组学中心支持
weixin_33904756·2020-08-20 08:23

2018-12-02

突然之间被加进实验室，而且方向还是生物信息学，有点不知所措。自己最开始感兴趣的是深度学习，但是实验室没有这方面的项目，便投了机器学习和数据挖掘，现在回想觉得自己没投图像分析有点傻，但是又不敢去反悔。
渣叉子·2020-08-19 09:11

“突发性死亡”的终结者

该论文在2017年IEEE生物信息学和生物医学国际会议上获得最佳学习论文奖。改善住院病人临终关怀的质量是医疗保健机构的首要任务。
阿里云云栖号·2020-08-19 07:38

#3D基因组 #表观遗传

本篇简单介绍3D基因组在近期主流的两个获得数据的手段：Hi-C及ATAC-seq。
土豆_leah·2020-08-18 23:04

ATAC-seq基础知识（资源整理）

ATAC-seq全名AssayforTransposaseAccessibleChromatinwithhigh-throughputsequencing(基于高通量测序的染色质转座酶可接近性实验)，该技术使用改造后的
皈依yyy·2020-08-18 23:55

Nomogram（诺莫图） | Logistic、Cox生存分析结果可视化

本文首发于“生信补给站”公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/BWpy3F-nEKXCdVXmY3GYZg当然还有更多R语言，生物信息学相关知识。。。?
生信补给站·2020-08-18 12:22

关联规则

今天，关联规则已广泛应用于金融、营销以及生物信息学等领域。2、概念1）基本概念：项集：一个或多个项目的集合。例如:{Milk,Bread,Diaper}，包含k个项目的项集称为k-
aizhouqian5537·2020-08-18 10:01

图计算系统小调研

一.费马科技五篇知乎文图计算系统发展简史https://zhuanlan.zhihu.com/p/83202666社交网络分析、网页排序、社区发现、天体物理学、计算化学、生物信息学、超大规模集成电路的设计
叶子心情你不懂·2020-08-18 09:07
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